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Aberrant expression of alternative isoforms of transcription factors in hepatocellular carcinoma 被引量:3
1
作者 Olga Krivtsova Anna Makarova Natalia Lazarevich 《World Journal of Hepatology》 CAS 2018年第10期645-661,共17页
Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most prevalent malignancies worldwide and the second leading cause of death among all cancer types. Deregulation of the networks of tissue-specific transcription factors(TFs... Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most prevalent malignancies worldwide and the second leading cause of death among all cancer types. Deregulation of the networks of tissue-specific transcription factors(TFs) observed in HCC leads to profound changes in the hepatic transcriptional program that facilitates tumor progression. In addition, recent reports suggest that substantial aberrations in the production of TF isoforms occur in HCC. In vitro experiments have identified distinct isoform-specific regulatory functions and related biological effects of liver-specific TFs that are implicated in carcinogenesis, which may be relevant for tumor progression and clinical outcome. This study reviews available data on the expression of isoforms of liver-specific and ubiquitous TFs in the liver and HCC and their effects, including HNF4α, C/EBPs, p73 and TCF7 L2, and indicates that assessment of the ratio of isoforms and targeting specific TF variants may be beneficial for the prognosis and treatment of HCC. 展开更多
关键词 alternative isoforms TRANSCRIPTION factors HEPATOCELLULAR carcinoma alternative SPLICING Hepatic differentiation Personalized treatment
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Role of PRMTs in cancer: Could minor isoforms be leaving a mark? 被引量:14
2
作者 R Mitchell Baldwin Alan Morettin Jocelyn C té 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2014年第2期115-129,共15页
Protein arginine methyltransferases(PRMTs) catalyze the methylation of a variety of protein substrates, many of which have been linked to the development, progression and aggressiveness of different types of cancer. M... Protein arginine methyltransferases(PRMTs) catalyze the methylation of a variety of protein substrates, many of which have been linked to the development, progression and aggressiveness of different types of cancer. Moreover, aberrant expression of PRMTs has been observed in several cancer types. While the link between PRMTs and cancer is a relatively new area of interest, the functional implications documented thus far warrant further investigations into its therapeutic potential. However, the expression of these enzymes and the regulation of their activity in cancer are still significantly understudied. Currently there are nine main members of the PRMT family. Further, the existence of alternatively spliced isoforms for several of these family members provides an additional layer of complexity. Specifically, PRMT1, PRMT2, CARM1 and PRMT7 have been shown to have alternative isoforms and others may be currently unrealized. Our knowledge with respect to the relative expression and the specific functions of these isoforms is largely lacking and needs attention. Here we present a review of the current knowledge of theknown alternative PRMT isoforms and provide a rationale for how they may impact on cancer and represent potentially useful targets for the development of novel therapeutic strategies. 展开更多
关键词 Protein ARGININE METHYLTRANSFERASE ARGININE methylation Cancer alternative SPLICING isoforms
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Roles of PTBP1 in alternative splicing, glycolysis, and oncogensis 被引量:14
3
作者 Wei ZHU Bo-lun ZHOU +9 位作者 Li-juan RONG Li YE Hong-juan XU Yao ZHOU Xue-jun YAN Wei-dong LIU Bin ZHU Lei WANG Xing-jun JIANG Cai-ping REN 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期122-136,共15页
Polypyrimidine tract-binding protein 1(PTBP1)plays an essential role in splicing and is expressed in almost all cell types in humans,unlike the other proteins of the PTBP family.PTBP1 mediates several cellular process... Polypyrimidine tract-binding protein 1(PTBP1)plays an essential role in splicing and is expressed in almost all cell types in humans,unlike the other proteins of the PTBP family.PTBP1 mediates several cellular processes in certain types of cells,including the growth and differentiation of neuronal cells and activation of immune cells.Its function is regulated by various molecules,including micro RNAs(mi RNAs),long non-coding RNAs(lnc RNAs),and RNA-binding proteins.PTBP1 plays roles in various diseases,particularly in some cancers,including colorectal cancer,renal cell cancer,breast cancer,and glioma.In cancers,it acts mainly as a regulator of glycolysis,apoptosis,proliferation,tumorigenesis,invasion,and migration.The role of PTBP1 in cancer has become a popular research topic in recent years,and this research has contributed greatly to the formulation of a useful therapeutic strategy for cancer.In this review,we summarize recent findings related to PTBP1 and discuss how it regulates the development of cancer cells. 展开更多
关键词 Polypyrimidine tract-binding protein 1(PTBP1) alternative splicing GLYCOLYSIS M2 isoform of pyruvate kinase(PKM2) CANCER
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Expression of two alternative splicing isoforms of fragile X gene in human placenta
4
作者 黄涛 沈岩 +1 位作者 范钰 吴冠芸 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1996年第5期436-437,共2页
Fragile X (Fra (X)) syndrome is the most frequent cause of inherited mentalretardation, and it is associated with the fragile site at Xq27.3. In 1991, the FMR1(fragile X mental retardation 1) gene was cloned in the vi... Fragile X (Fra (X)) syndrome is the most frequent cause of inherited mentalretardation, and it is associated with the fragile site at Xq27.3. In 1991, the FMR1(fragile X mental retardation 1) gene was cloned in the vicinity of this site. The muationand abnormal expression of FMR1 are the direct causes of Fra(X) syndrome. The 展开更多
关键词 FMR GENE Expression of two alternative splicing isoforms of fragile X gene in human placenta
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Targeting a novel inducible GPX4 alternative isoform to alleviate ferroptosis and treat metabolic-associated fatty liver disease 被引量:17
5
作者 Jie Tong Dongjie Li +20 位作者 Hongbo Meng Diyang Sun Xiuting Lan Min Ni Jiawei Ma Feiyan Zeng Sijia Sun Jiangtao Fu Guoqiang Li Qingxin Ji Guoyan Zhang Qirui Shen Yuanyuan Wang Jiahui Zhu Yi Zhao Xujie Wang Yi Liu Shenxi Ouyang Chunquan Sheng Fuming Shen Pei Wang 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2022年第9期3650-3666,共17页
Metabolic-associated fatty liver disease(MAFLD),which is previously known as non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD),represents a major health concern worldwide with limited therapy.Here,we provide evidence that ferr... Metabolic-associated fatty liver disease(MAFLD),which is previously known as non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD),represents a major health concern worldwide with limited therapy.Here,we provide evidence that ferroptosis,a novel form of regulated cell death characterized by iron-driven lipid peroxidation,was comprehensively activated in liver tissues from MAFLD patients.The canonical-GPX4(cGPX4),which is the most important negative controller of ferroptosis,is downregulated at protein but not mRNA level.Interestingly,a non-canonical GPX4 transcript-variant is induced(inducible-GPX4,iGPX4)in MAFLD condition.The high fat-fructose/sucrose diet(HFFD)and methionine/choline-deficient diet(MCD)-induced MAFLD pathologies,including hepatocellular ballooning,steatohepatitis andfibrosis,were attenuated and aggravated,respectively,in cGPX4-and iGPX4-knockin mice.cGPX4 and iGPX4 isoforms also displayed opposing effects on oxidative stress and ferroptosis in hepatocytes.Knockdown of iGPX4 by siRNA alleviated lipid stress,ferroptosis and cell injury.Mechanistically,the triggered iGPX4 interacts with cGPX4 to facilitate the transformation of cGPX4 from enzymatic-active monomer to enzymatic-inactive oligomers upon lipid stress,and thus promotes ferroptosis.Co-immunoprecipitation and nano LC–MS/MS analyses confirmed the interaction between iGPX4 and cGPX4.Our results reveal a detrimental role of non-canonical GPX4 isoform in ferroptosis,and indicate selectively targeting iGPX4 may be a promising therapeutic strategy for MAFLD. 展开更多
关键词 Ferroptosis GPX4 alternative isoform Fatty liver OLIGOMERIZATION Methionine/choline-deficient diet High fat-fructose/sucrose diet Protein interaction
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绵羊FSHR基因可变剪接体的克隆、鉴定及表达分析 被引量:6
6
作者 吴阳升 林嘉鹏 +3 位作者 蒋香菊 汪立芹 韩冰 黄俊成 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期630-637,共8页
根据Gen Bank中绵羊促卵泡激素受体基因(FSHR)的mRNA序列(登录号:NM_001009289.1)设计引物,反转录PCR(RT-PCR)扩增蛋白编码区(CDs)区,以获取绵羊FSHR基因可变剪接体,并通过Western blot验证其在组织中的表达,通过免疫组织化学方法检测... 根据Gen Bank中绵羊促卵泡激素受体基因(FSHR)的mRNA序列(登录号:NM_001009289.1)设计引物,反转录PCR(RT-PCR)扩增蛋白编码区(CDs)区,以获取绵羊FSHR基因可变剪接体,并通过Western blot验证其在组织中的表达,通过免疫组织化学方法检测其在卵泡中的表达位置。结果表明,在绵羊卵巢中除了全长的、编码695个氨基酸的FSHR表达产物外,还鉴定到分别编码694个、633个、595个、582个和533个氨基酸的FSHR可变剪接形式的转录产物。在卵泡中主要以695(694)、633和595 3种转录本形式存在。但在颗粒细胞中绵羊促卵泡激素受体主要以经典分子即695个氨基酸的形式存在。在卵泡发育过程中,FSHR蛋白质含量发生变化:在初级卵泡中,FSHR主要在卵母细胞中表达,而不是在单层的颗粒细胞中表达,在次级卵泡中,FSHR在颗粒细胞和卵母细胞中均不表达,到三级卵泡(有腔卵泡)时,FSHR蛋白质在颗粒细胞中表达丰富。可见,绵羊FSHR基因虽然存在可变剪接体的结构,但其功能主要取决于经典型的695个氨基酸蛋白质分子,并且对初级卵泡的发育具有一定的作用。 展开更多
关键词 绵羊 FSHR基因 可变剪接体 卵泡
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IGF-1基因产物的结构和功能多样化 被引量:6
7
作者 张兵兵 王远亮 范开 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期209-213,共5页
胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因包含6个外显子,具有转录和翻译产物多样化的特点,原因在于存在多个转录起始位点的选择性应用,转录产物的选择性剪接,以及不同多聚腺苷酸化位点的使用。长期以来人们普遍关注由外显子3和4编码的循环型IGF-... 胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因包含6个外显子,具有转录和翻译产物多样化的特点,原因在于存在多个转录起始位点的选择性应用,转录产物的选择性剪接,以及不同多聚腺苷酸化位点的使用。长期以来人们普遍关注由外显子3和4编码的循环型IGF-1在生长发育中的作用,最近对肌肉、神经等组织自分泌/旁分泌的局部型IGF-1研究发现,选择性剪接产生的IGF-1变体具有外显子5和6编码的延伸肽(E肽),并表现出特殊的生物学功能,如IGF-1Ea、IGF-1Eb(MGF)及其E肽在骨骼肌、心肌、神经等组织中表现出促进生长和损伤修复的功能,这些特殊功能可能通过细胞表面的一种特殊E肽受体介导。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子-1 同源变体 选择性剪接 损伤修复
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顺铂处理后肺癌细胞剪接因子SRSF1 mRNA异构体的变化 被引量:4
8
作者 马春霞 杨梦莉 +3 位作者 李明阳 杨渊 陈香岭 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第8期879-884,892,共7页
目的:观察不同浓度顺铂处理后肺癌细胞中剪接因子(SRSF1)mRNA异构体的变化,并寻找其中发挥主要抗凋亡作用的异构体。方法:使用不同浓度的顺铂处理肺癌细胞系A549和H1299后提取总RNA,设计SRSF1基因不同的引物(F1∶R1、F1∶F2及F2∶R1)进... 目的:观察不同浓度顺铂处理后肺癌细胞中剪接因子(SRSF1)mRNA异构体的变化,并寻找其中发挥主要抗凋亡作用的异构体。方法:使用不同浓度的顺铂处理肺癌细胞系A549和H1299后提取总RNA,设计SRSF1基因不同的引物(F1∶R1、F1∶F2及F2∶R1)进行RT-PCR以检测其mRNA剪接异构体的变化。结果:在A549和H1299细胞中检测到了5种异构体(Isoform-a、Isoform-b、Isoform-d、Isoform-e、Isoform-f),且主要表现为随着顺铂浓度的升高,非编码蛋白的mRNA异构体的比例明显上升,主要是Isoform-d的上升;而编码蛋白的mRNA异构体所占比例明显下降,主要是Isoform-a下降;同时SRSF1的总mRNA水平也是逐渐降低的。结论:在顺铂处理下,肺癌A549和H1299细胞中的SRSF1的转录水平被下调,其mRNA选择性剪接向下调编码蛋白的mRNA异构体的方向转变,造成编码蛋白的mRNA异构体降低的主要原因为Isoform-a,该异构体可能是SRSF1基因发挥抗细胞凋亡作用的主要异构体。 展开更多
关键词 顺铂 剪接因子 mRNA剪接 选择性剪接 异构体 细胞凋亡
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人MCP cDNA的克隆、序列分析及同种型的比较 被引量:2
9
作者 黄健 李文鑫 +1 位作者 苟德明 蒋达和 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第4期355-358,共4页
以人胚胎m R N A 为模板, 采用 R T P C R 法得到了人补体调节蛋白膜辅蛋白( M C P) 的一种c D N A 全基因,序列分析结果表明, 所获得的 M C Pc D N A 为文献报道中10 种同种型中的一种, 属 M C ... 以人胚胎m R N A 为模板, 采用 R T P C R 法得到了人补体调节蛋白膜辅蛋白( M C P) 的一种c D N A 全基因,序列分析结果表明, 所获得的 M C Pc D N A 为文献报道中10 种同种型中的一种, 属 M C P C2 型, 该c D N A 含一编码369 个氨基酸的阅读框架, 其中的 S T P 区含14 个氨基酸, 由 S T P C 编码, 胞浆尾区含23 个氨基酸, 为 C Y T2 。 展开更多
关键词 膜辅蛋白 MCP CDNA 序列分析 同种型
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p53选择性剪接异构体在胃癌中表达的研究 被引量:2
10
作者 刘丹丹 高志星 +3 位作者 王婷 刘俊衡 孙娜 季万胜 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2012年第2期107-110,共4页
目的探讨p53的5种选择性剪接异构体p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况及其与胃癌发生、发展的关系。方法收集2010年3月至2010年6月15例胃癌根治术患者的手术切除标本,采用巢式RT-PCR检... 目的探讨p53的5种选择性剪接异构体p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况及其与胃癌发生、发展的关系。方法收集2010年3月至2010年6月15例胃癌根治术患者的手术切除标本,采用巢式RT-PCR检测胃癌组织与癌旁组织中p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γ共5种异构体mRNA的表达情况,并进行统计学分析。结果在15例胃癌组织与癌旁组织中均未检测出p53γ、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA的表达。Δ133p53在胃癌组织中的表达率为73.3%(11/15),在癌旁组织中为20.0%(3/15),差异有统计学意义(P=0.009)。p53β在胃癌组织中的表达率为20.0%(3/15),在癌旁组织中为66.7%(10/15),差异有统计学意义(P=0.0253)。结论Δ133p53 mRNA和p53βmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况不同,这两种异构体的差异性表达与胃癌的发生发展有关。 展开更多
关键词 胃癌 P53 选择性剪接 异构体 巢式RT-PCR
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FoxM1与癌发生的相关剪接机制的探讨 被引量:1
11
作者 吴娟 赵静 +2 位作者 杨丽娜 李郁 杨红 《现代生物医学进展》 CAS 2015年第1期171-173,共3页
FoxM1是一种原癌基因。它也是癌发生、发展密切相关的重要的转录因子。Fox M1是Forkhead Box转录因子家族重要成员,定位于染色体12p13.3,特异性表达于增殖期细胞中,在细胞终末分化时消失,是一个典型的与细胞增殖相关的转录因子,在细胞G/... FoxM1是一种原癌基因。它也是癌发生、发展密切相关的重要的转录因子。Fox M1是Forkhead Box转录因子家族重要成员,定位于染色体12p13.3,特异性表达于增殖期细胞中,在细胞终末分化时消失,是一个典型的与细胞增殖相关的转录因子,在细胞G/S及G/M期转换过程中发挥重要作用。它具有Fox M1A、B和C三种剪接异构体。Fox M1B和C在癌组织中高表达,发挥转录激活、促癌发生和发展的作用,而Fox M1A在癌组织中低表达,发挥转录抑制功能。癌组织中Fox M1B/C的优先选择对于Fox M1发挥促癌作用非常关键。因此对这一现象的成因即Fox M1癌相关选择性剪接机制的研究非常重要。 展开更多
关键词 FOXM1 剪接异构体 癌相关选择性剪接
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顺铂处理癌细胞后CDC25 mRNA剪接异构体的变化 被引量:3
12
作者 杨梦莉 陈香岭 +4 位作者 马春霞 姚宇峰 史荔 马千里 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第2期159-164,共6页
目的:探讨顺铂(CDDP)对肺癌、宫颈癌细胞和人胚肾细胞CDC25磷酸酶mRNA的选择性剪接的影响。方法:将培养的肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa、CaSki细胞及人胚肾293FT细胞分为实验组和对照组,实验组细胞用CDDP处理,对照组细胞用DMS... 目的:探讨顺铂(CDDP)对肺癌、宫颈癌细胞和人胚肾细胞CDC25磷酸酶mRNA的选择性剪接的影响。方法:将培养的肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa、CaSki细胞及人胚肾293FT细胞分为实验组和对照组,实验组细胞用CDDP处理,对照组细胞用DMSO处理,设计CDC25A、CDC25B、CDC25C引物,利用RTPCR检测CDC25 mRNA剪接异构体的表达变化。结果:与对照组细胞比较,随着CDDP浓度的增加,肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa和CaSki细胞以及人胚肾293FT细胞中CDC25B、CDC25C mRNA剪接异构体比例有明显变化,而CDC25A mRNA剪接异构体变化不明显。结论:CDDP引起细胞DNA损伤时,可发生CDC25mRNA选择性剪接异构体的比例发生变化,这可能与肿瘤药物治疗时的抗性有关。 展开更多
关键词 CDC25磷酸酶 mRNA剪接异构体 顺铂 肿瘤细胞 培养的 聚合酶链式反应 DNA损伤
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抗血管生成作用的VEGFxxxb在缺氧视网膜色素上皮细胞中的表达 被引量:1
13
作者 范思均 何守志 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1014-1020,共7页
背景 缺氧可诱导视网膜色素上皮(RPE)细胞分泌血管内皮生长因子A(VEGF-A),从而促进脉络膜新生血管(CNV)形成.VEGF-A依选择性剪接方式的不同,可形成具有促血管生成作用的VEGFxxx和具有抗血管生成作用的VEGFxxxb,但后者在常氧和缺... 背景 缺氧可诱导视网膜色素上皮(RPE)细胞分泌血管内皮生长因子A(VEGF-A),从而促进脉络膜新生血管(CNV)形成.VEGF-A依选择性剪接方式的不同,可形成具有促血管生成作用的VEGFxxx和具有抗血管生成作用的VEGFxxxb,但后者在常氧和缺氧状态下在人RPE细胞中的表达变化及其作用尚不清楚.目的 从mRNA水平和蛋白水平检测模拟缺氧状态培养的RPE细胞中VEGFmb的表达,研究VEGFxxxb在常氧和缺氧培养的RPE细胞中的表达变化.方法 以人RPE细胞系ARPE-19为研究对象,将150 μmol/L化学诱导剂CoC12加入细胞培养液制备缺氧细胞模型,分别于0h(常氧培养)及缺氧培养3、6、12和24 h收获细胞或细胞上清液,采用逆转录PCR(RT-PCR)法检测细胞内VEGFxxxmRNA和VEGFxxxb mRNA的表达;采用Western blot法检测细胞内总VEGF-A蛋白和VEGFxxxb蛋白的表达;采用ELISA法检测细胞上清中总VEGF-A蛋白和VEGFxxxb蛋白的含量.结果 在常氧及诱导缺氧后,ARPE-19细胞中均可检测到VEGFxxxmRNA和VEGFxxxb mRNA的表达,检测出的VEGFxxxmRNA中同时出现VEGF121、VEGF165和极微弱的VEGF189条带;检出的VEGFxxxb mRNA中可见VEGF165b条带.缺氧培养的细胞中随着缺氧时间的延长,VEGFxxxmRNA显示出表达逐渐增加的趋势,而VEGFxxxb mRNA则显示出表达逐渐减少的趋势.Western blot法可检测到细胞中VEGFxxxb蛋白的表达,尤以VEGF165b表达最强,随缺氧培养时间的延长,VEGF165b蛋白表达逐渐减少.培养的细胞上清中VEGFxxxb蛋白质量浓度由常氧培养时的(166.82±2.55) pg/ml下降至缺氧培养24 h的(125.35±2.10)pg/ml,而总VEGF-A蛋白则由(294.27±11.97) pg/ml上升至(582.26±12.98) pg/ml.细胞中VEGFxxxbb蛋白占总VEGF-A蛋白的比例随缺氧培养时间的延长,由常氧培养条件下的(56.71±1.02)%逐渐下降至缺氧培养24 h的(21.53±0.08)%.结论 ARPE-19细胞在常氧和缺氧培养条件下均可检测到VEGFxxxbb mRNA和蛋白的表达.缺氧培养后ARPE-19细胞中VEGFxxx mRNA的表达水平逐渐降低.常氧培养时细胞中总VEGF-A蛋白以VEGFxxxbb占主导,而缺氧后VEGFxxxbb占总VEGF-A比例下降. 展开更多
关键词 血管内皮生长因子A/基因 选择性剪接/生理功能 细胞株/视网膜色素上皮细胞 抗血管生成因子 蛋白亚型/代谢
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神经母细胞瘤中TrkA基因三种异构体表达及其临床意义
14
作者 曹方方 刘璇 +2 位作者 张继红 王韫秀 张男 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2010年第22期1282-1285,共4页
目的:探讨神经母细胞瘤(NB)中TrkA基因三种异构体的表达及其临床意义。方法:回顾性分析随访资料较完整的首诊为NB的患儿39例。采用SYRB Green Ⅰ荧光定量PCR方法检测39例NB手术切除标本中TrkA异构体mRNA的表达。t检验比较不同临床分期中... 目的:探讨神经母细胞瘤(NB)中TrkA基因三种异构体的表达及其临床意义。方法:回顾性分析随访资料较完整的首诊为NB的患儿39例。采用SYRB Green Ⅰ荧光定量PCR方法检测39例NB手术切除标本中TrkA异构体mRNA的表达。t检验比较不同临床分期中TrkA异构体的表达差异。按首次就诊时临床资料(年龄、性别、原发部位、转移部位、临床分期),TrkA Ⅰ/Ⅱ与TrkAⅢ的表达比值等因素进行分组。Kaplan-Meier法计算5年生存率,单因素分析用Kaplan-Meier生存曲线比较组间生存率,显著性检验采用Log-Rank法。COX回归模型进行多因素分析。结果:TrkA Ⅰ/Ⅱ的表达在低分期组明显大于高分期组(P<0.01),而TrkAⅢ的表达在低分期组明显低于高分期组(P<0.01),TrkA Ⅰ/Ⅱ与TrkAⅢ的表达比值在低分期组明显高于高分期组(P<0.01)。单因素分析发现年龄>1岁、腹部原发、骨骼转移、Evans第Ⅲ/Ⅳ期、TrkA Ⅰ/Ⅱ与TrkAⅢ表达比值较低组别的5年生存率,明显低于其对照组。性别对生存率无影响。COX模型多因素分析显示骨骼转移、TrkA Ⅰ/Ⅱ与TrkAⅢ表达比值低对5年生存率产生不良影响。结论:TrkA Ⅰ/Ⅱ高表达示NB患者后良好,TrkAⅢ高表达示NB患者预后较差。早期对肿瘤行TrkA基因检测及骨骼扫描,对NB患者预后预测具有重要意义。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 TRKA 异构体 选择性剪接 预后
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基因新异构体的剪接特征及其生物学意义
15
作者 彭永德 宋怀东 +5 位作者 高国峰 李月彬 黄长辉 胡仁明 韩泽广 陈家伦 《上海第二医科大学学报》 CSCD 2001年第4期292-295,共4页
目的探讨基因新异构体的剪接特征及生物学意义。 方法对人肾上腺组织cDNA文库作大规模EST分析及全长cDNA克隆。 结果发现 7条由不同剪接方式形成的新的异构体 ,其中 4个剪接特点不符合经典的gt-ag规律 ,且剪接方式多样 ,人类固醇 5α... 目的探讨基因新异构体的剪接特征及生物学意义。 方法对人肾上腺组织cDNA文库作大规模EST分析及全长cDNA克隆。 结果发现 7条由不同剪接方式形成的新的异构体 ,其中 4个剪接特点不符合经典的gt-ag规律 ,且剪接方式多样 ,人类固醇 5α还原酶跨越两个外显子 ,KIAA0 971的异构体与KIAA0 971比较 ,有两段缺失 ,且造成编码框架移动 ,均按 gt-ag方式。人 17.9kd蛋白与从基因组序列预测的cDNA比较增加一个新外显子 ,人甲状腺激素受体相互作用蛋白 15的第 5号外显子端具有 2个 -ag的接点。  展开更多
关键词 全长CDNA克隆 异构体 剪接方式 生物学
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一种新的干扰素基因刺激因子剪接异构体STING(sv)的结构和功能
16
作者 王艳艳 金蕊 +1 位作者 周国平 徐华国 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期494-499,共6页
干扰素基因刺激因子(Stimulator of interferon genes,STING)是病毒感染后机体抗病毒固有免疫反应过程中的重要蛋白分子。为了寻找STING新的剪接异构体,我们抽提了人类胚胎肾(Human embryonic kidney,HEK)293细胞RNA,用全长STING的m... 干扰素基因刺激因子(Stimulator of interferon genes,STING)是病毒感染后机体抗病毒固有免疫反应过程中的重要蛋白分子。为了寻找STING新的剪接异构体,我们抽提了人类胚胎肾(Human embryonic kidney,HEK)293细胞RNA,用全长STING的mRNA(NM-198282.82)序列设计引物,作cDNA末端快速放大(RACE)及RTPCR,生物信息学方法比较新序列,亚克隆STING野生型(wt)及STING剪接异构体(sv)至真核表达载体pEGFPC1和pcDNA 3.1中。质粒EGFP-STING(wt)和EGFP-STING(sv)转染HEK 293细胞,用抗EGFP抗体作Western blot分析;质粒pcDNA-STING(wt)和pcDNA-STING(sv)转染HEK 293细胞,作荧光素酶功能分析以检测新剪接异构体对病毒诱导的干扰素β启动子荧光素酶活性的影响。我们发现了STING 3′端新的剪接异构体,与野生型相比,它缺失了第7外显子,导致阅读框架移位,相应蛋白质的C端30个氨基酸不同于野生型。Western blot出现相对分子质量(Mr)为58×103的STING(sv)蛋白强阳性条带。STING(sv)荧光素酶功能分析显示,该剪接异构体能明显抑制病毒诱导的干扰素β启动子活性。STING(sv)在多数组织和不同细胞系中都能表达。STING(sv)的发现为STING这一重要分子的功能调节提供了新的线索,它可能是病毒感染通路中干扰素的显性负性抑制剂,提示其为干扰素产生的精细调节成分,在人类病毒感染性疾病中的病理意义值得探究。 展开更多
关键词 干扰素基因刺激因子 剪接异构体 基因转录调节
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反义寡核苷酸处理伊马替尼耐药慢粒细胞后Bcl-x剪接异构体的变化
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作者 张静 李书琪 +7 位作者 黄波 闵清华 姜钰环 杨伟明 徐颜美 林晋 刘静 王小中 《实验与检验医学》 CAS 2019年第2期165-167,189,共4页
目的探讨反义寡核苷酸Vivo-Morpholinos(vMO)处理对伊马替尼(Imatinib,IM)耐药慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)细胞中Bcl-x基因选择性剪接的影响。方法将IM(1μM)组、荧光标记的vMO、IM联合vMO组(IM+vMO)、空白对照组... 目的探讨反义寡核苷酸Vivo-Morpholinos(vMO)处理对伊马替尼(Imatinib,IM)耐药慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)细胞中Bcl-x基因选择性剪接的影响。方法将IM(1μM)组、荧光标记的vMO、IM联合vMO组(IM+vMO)、空白对照组分别与IM耐药CML细胞株K562/G01细胞进行共培养48h,通过RT-PCR和Western Blot分别检测K562/G01细胞胞内Bcl-x剪接异构体Bcl-xL/Bcl-xS mRNA和蛋白比值变化。结果分别与IM组和vMO组处理K562/G01细胞相比,IM+vMO组的Bcl-xL mRNA和蛋白表达量显著降低,同时Bcl-xS mRNA和蛋白表达量明显升高,而对照组中Bcl-x剪接异构体变化不明显。结论 K562/G01细胞在vMO处理后Bcl-xL/Bcl-xS mRNA和蛋白比值显著下调。 展开更多
关键词 BCL-X 剪接异构体 反义寡核苷酸 慢性粒细胞白血病 伊马替尼
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选择性剪接调控的研究进展 被引量:6
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作者 徐谷峰 周承亮 黄荷凤 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期769-772,共4页
选择性剪接是剪除未成熟mRNA中的内含子、保留外显子后生成成熟mRNA的过程。在各类疾病发生和发展过程中,异常的选择性剪接起着重要作用。该文就选择性剪接的发生与调控机制、功能及其与疾病关系的研究进展进行综述。
关键词 选择性剪接 剪接因子 疾病发生 RNA 异构体
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梯度浓度顺铂处理对6种肿瘤细胞中CASP9的mRNA选择性剪接的影响 被引量:3
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作者 杨勤兴 马春霞 +7 位作者 陆成龙 杨艳波 杨梦莉 刘舒媛 李明阳 杨渊 史荔 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第9期1003-1009,共7页
目的:分析顺铂处理后多种肿瘤细胞中CASP9基因mRNA选择性剪接异构体的表达及其变化规律。方法:用梯度浓度的顺铂处理肺癌细胞(A549、H1299)、人胚肾细胞(293FT)、宫颈癌细胞(SiHa、CaSki、C33A)6种细胞,提取各细胞的总RNA,用半定量RT-PC... 目的:分析顺铂处理后多种肿瘤细胞中CASP9基因mRNA选择性剪接异构体的表达及其变化规律。方法:用梯度浓度的顺铂处理肺癌细胞(A549、H1299)、人胚肾细胞(293FT)、宫颈癌细胞(SiHa、CaSki、C33A)6种细胞,提取各细胞的总RNA,用半定量RT-PCR和琼脂糖凝胶电泳及胶图像分析软件检测分析CASP9基因mRNA异构体的组成及其比例和相对表达水平的变化。结果:6种细胞中,CASP9f∶r1引物检测到的CASP9a和c(NR-102732)两种异构体,但随着顺铂浓度的增加,两种异构体的比例在6种细胞中均无变化;而CASP9f∶r2引物可检测到的异构体CASP9a和b、a/b比例在A549、H1299、SiHa、C33A、Ca Ski中呈逐渐增加趋势,而在293FT细胞中则呈相反趋势;在A549顺铂抗性株中,顺铂处理前后CASP9a/b的比例显著差异变化明显减弱。结论:在顺铂处理下,检测的5种细胞中的Casp9是通过增加casp9a/b的比例来应对,仅293FT例外;顺铂抗性A549细胞株在顺铂处理后casp9a/b的比例比例与细胞凋亡和抗性有关,提示调节casp9a/b的比例是治疗癌症的可能的有效途径之一。 展开更多
关键词 顺铂 CASP9 mRNA选择性剪接 mRNA异构体 细胞凋亡
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肾透明细胞癌组织中转录因子19基因选择性剪接异构体的类型和表达特点 被引量:1
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作者 钱涛 林丽萍 +6 位作者 常文军 曹廷虎 徐兴兴 杨印辉 张宏伟 侯建国 曹广文 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期706-710,共5页
目的探讨人肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是否存在与细胞生长调节相关的转录因子19(TCF19)选择性剪接异构体,探索其表达特点及其与ccRCC发生的关系。方法通过选择性剪接数据库(alternative Spli-cing Database,A... 目的探讨人肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是否存在与细胞生长调节相关的转录因子19(TCF19)选择性剪接异构体,探索其表达特点及其与ccRCC发生的关系。方法通过选择性剪接数据库(alternative Spli-cing Database,ASD)对TCF19基因可能存在的选择性剪接异构体种类进行预测。设计可能存在的5种异构体引物,采用RT-PCR技术,在32例原发肾透明细胞癌的混合样本及癌旁组织的混合样本中分别检测预测异构体的表达,并对电泳所获条带进行克隆、测序。应用RT-PCR定量检测在各个组织样本中异构体TCF19-1、TCF19-3在原发肾癌及癌旁组织的表达差异。结果 ccRCC组织中存在2种新型TCF19替换剪接异构体(TCF19-1、TCF19-3)。RT-PCR检测结果发现这2种异构体在癌和癌旁组织中均表达,但TCF19-1在原发癌组织中表达率高于癌旁组织(P<0.001);TCF19-3在癌旁组织中的表达率与原发癌组织比较,差异无统计学意义(P=0.082)。结论首次发现ccRCC组织中存在2种TCF19选择性剪接异构体TCF19-1和TCF19-3,其中TCF19-1的表达可能与ccRCC有关。 展开更多
关键词 转录因子类 肾肿瘤 选择性剪接 异构体
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