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基于生物信息学研究Duffy血型ACKR1基因在肺腺癌中表达及临床意义
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作者 袁咏梅 周仁龙 +1 位作者 闫岩 王革非 《生物化工》 2025年第3期28-33,39,共7页
目的:基于生物信息学方法,研究Duffy血型非典型趋化因子受体1(Atypical Chemokine Receptor 1,ACKR1)基因在肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)中的表达及其临床意义。方法:利用GEPIA数据库分析ACKR1基因在LUAD中的表达水平及其与肿瘤分... 目的:基于生物信息学方法,研究Duffy血型非典型趋化因子受体1(Atypical Chemokine Receptor 1,ACKR1)基因在肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)中的表达及其临床意义。方法:利用GEPIA数据库分析ACKR1基因在LUAD中的表达水平及其与肿瘤分级等临床特征的相关性;通过Sangerbox数据库分析ACKR1表达水平与免疫细胞浸润水平的关系及其对患者预后的影响;利用STRING数据库构建ACKR1蛋白的相互作用网络,并进行GO功能富集分析。结果:与正常组织相比,ACKR1基因在多数LUAD患者中显著低表达(p<0.05)。ACKR1表达水平随LUAD临床分期的增加而逐渐降低,且与6种免疫细胞的浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析显示,ACKR1与趋化因子配体、黏附蛋白等存在相互作用。GO富集分析表明,ACKR1主要参与免疫细胞迁移、趋化作用及相关信号通路的调控。生存分析结果表明,ACKR1低表达的LUAD患者预后显著较差,其生存期明显短于ACKR1高表达组。ROC曲线分析显示,ACKR1基因在LUAD中的曲线下面积为0.922,对LUAD具有较高的诊断效能。结论:ACKR1基因在LUAD组织中普遍呈现低表达状态,且其低表达与患者不良预后显著相关,提示ACKR1可能作为LUAD患者潜在的新型肿瘤标志物。 展开更多
关键词 DUFFY血型 非典型趋化因子受体1(ackr1) 肺腺癌 生物信息学
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丙肝患者ACKR1多态性与肝纤维化及肝损伤的相关性研究 被引量:3
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作者 邵林楠 周世航 +3 位作者 王霓 张树婷 段莹 刘铭 《中国输血杂志》 CAS 2019年第10期996-999,共4页
目的研究ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。方法招募245名患有慢性HCV感染的患者参与研究,使用TaqMan探针方法进行ACKR1多态性分析,同时收集患者肝纤维化和肝功能指标。通过对比不同ACKR1基因型患者肝纤维化和肝功能指标... 目的研究ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。方法招募245名患有慢性HCV感染的患者参与研究,使用TaqMan探针方法进行ACKR1多态性分析,同时收集患者肝纤维化和肝功能指标。通过对比不同ACKR1基因型患者肝纤维化和肝功能指标来分析ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。结果通过比较FY^*A/FY^*A与FY^*A/FY^*B基因型患者血常规及血液生化指标发现,除了ALT及AST/ALT外,其余指标2组间均无统计学差异(P>0.05);比较不同基因型患者肝纤维化指标及Fibroscan检测结果发现2组间各指标均无统计学差异(P>0.05)。结论HCV患者肝纤维化进程不受ACKR1多态性影响,但肝损伤程度可以被ACKR1调控,携带有FY^*A等位基因对肝损伤有一定保护作用。 展开更多
关键词 HCV ackr1 多态性 肝纤维化 肝损伤
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CENPF通过上调ACKR3/CXCR7促进非小细胞肺癌EMT的研究 被引量:2
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作者 顾彤 姜瑜珩 +4 位作者 丁姝 陈炜 罗超 于伟勇 陈小飞 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2022年第12期1245-1251,共7页
目的探讨CENPF在非小细胞肺腺癌(LUAD)中的表达与患者临床预后的关系及其对肺腺癌细胞转移能力的影响。方法公共数据库分析CENPF在LUAD中的表达及其与患者预后的关系。免疫组织化学染色验证CENPF LUAD在组织芯片中的表达,Kaplan-Meier分... 目的探讨CENPF在非小细胞肺腺癌(LUAD)中的表达与患者临床预后的关系及其对肺腺癌细胞转移能力的影响。方法公共数据库分析CENPF在LUAD中的表达及其与患者预后的关系。免疫组织化学染色验证CENPF LUAD在组织芯片中的表达,Kaplan-Meier分析CENPF表达与肺腺癌患者预后的关系;Cox生存风险比例回归模型分析影响患者生存的因素;卡方分析CENPF表达与患者临床病理分期及分级的关系。慢病毒敲除NCI-H2126细胞中CENPF的表达,检测细胞增殖、侵袭及迁移能力的变化。RNA-seq检测CENPF敲除后细胞mRNA表达谱改变,生物信息学分析CENPF下游信号通路及靶基因,Western blot验证下游基因表达水平变化。结果CENPF在LUAD肿瘤组织中显著上调(P<0.05),与病理分期显著相关(P=0.013),表达越高患者预后越差(P=0.01,P=0.027)。敲除CENPF表达后,细胞增殖、迁移及侵袭能力均显著降低(P<0.01);RNA-seq富集分析显示细胞趋化因子通路基因表达改变富集显著(P<0.001);聚类差异分析则表明,ACKR3/CXCR7及CDH2/N-cadherin显著下调,CDH1/E-cadherin则显著上调;Western blot结果证实,敲除CENPF后,ACKR3/CXCR7及N-cadherin显著下调,E-cadherin则显著上调。结论CENPF的表达与LUAD患者临床预后呈负相关,其通过ACKR3/CXCR7调控与EMT相关的N-cadherin及E-cadherin的表达促进EMT的发生。 展开更多
关键词 人类着丝粒蛋白F 肺腺癌 ackr3 上皮细胞间质转化 CXCR7
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ACKR1在尿路上皮膀胱癌组织中的表达及其与预后的相关性 被引量:1
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作者 李如鹏 罗蓉 +1 位作者 赵建 高宏飞 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第20期3942-3947,共6页
目的:探讨非典型趋化因子1(ACKR1)在尿路上皮膀胱癌(UBC)组织中的表达情况,并探讨其与预后的相关性。方法:收集428例UBC样本转录组基因表达数据进行差异基因分析并用ESTIMATE法进行肿瘤免疫微环境分析。随后,回顾性分析2019年1月至2021... 目的:探讨非典型趋化因子1(ACKR1)在尿路上皮膀胱癌(UBC)组织中的表达情况,并探讨其与预后的相关性。方法:收集428例UBC样本转录组基因表达数据进行差异基因分析并用ESTIMATE法进行肿瘤免疫微环境分析。随后,回顾性分析2019年1月至2021年12月我院泌尿外科收治的81例膀胱癌患者的临床资料,根据患者预后分为复发组(n=42)和未复发组(n=39),比较两组各临床特征的差异。采用免疫组织化学法检测组织中ACKR1表达情况,比较膀胱壁各层瘤内组织与瘤周组织ACKR1表达差异,并分析其与UBC患者临床病理特征的关系;采用乘积极限法(Kaplan-Meier)分析UBC患者预后状况,并采用Log-Rank检验进行显著性比较;采用Cox模型分析UBC患者不良预后的影响因素。结果:428例样本数据的差异表达基因分析发现ACKR1在肿瘤组织内表达下降并且与较低的免疫评分相关。81例UBC患者样本的IHC结果结合临床资料发现在未复发组中固有层瘤周组织的ACKR1表达量要高于复发组。另外,存在肿瘤细胞血管浸润者较不存在者的ACKR1表达量更低,且差异具有统计学意义。与ACKR1低表达组相比,ACKR1高表达组患者具有更长无复发生存期且P<0.001。单因素Cox回归分析表明分化级别、浸润深度、肿瘤大小、脉管浸润及ACKR1表达与患者复发相关;多因素Cox回归分析表明ACKR1表达为膀胱癌复发的独立影响因素(P<0.05),即与ACKR1低表达的患者相比,ACKR1高表达的患者复发风险较低(OR=0.032,95%CI:0.0041~0.24,P<0.05)。结论:固有层瘤周组织内毛细血管内皮细胞表面的ACKR1低表达的患者可能倾向于较短的无复发生存期。 展开更多
关键词 膀胱癌 ackr1 趋化因子 血管浸润 肿瘤免疫微环境
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Novel atypical G protein-coupled receptor(GPCR)-arrestin complexes:a structural snapshot of the barcode hypothesis
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作者 Jenny C.Filor Edda S.F.Matthees Carsten Hoffmann 《Signal Transduction and Targeted Therapy》 2025年第9期4797-4798,共2页
In a recent study published in Nature by Chen et al.,six novel cryo-EM structures of atypical chemokine receptor 3(ACKR3)complexes with Arrestin2(Arr2,also known asβ-arrestin1)and Arrestin3(Arr3,also known asβ-arres... In a recent study published in Nature by Chen et al.,six novel cryo-EM structures of atypical chemokine receptor 3(ACKR3)complexes with Arrestin2(Arr2,also known asβ-arrestin1)and Arrestin3(Arr3,also known asβ-arrestin2)were resolved using a novel nanobody,Fab7,which stabilizes active arrestin independent of the isoform,interacting receptor or its phosphorylation pattern.1 This work provides critical insights into G protein-coupled receptor(GPCR)–arrestin interactions under specific GPCR kinase(GRK)phosphorylation conditions,allowing an unprecedented direct comparison of these dynamic signaling complexes. 展开更多
关键词 atypical chemokine receptor novel gpcr arrestin complexes cryo em structures ARRESTIN stabilizes active arrestin nanobody ackr fab
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The unique structural and functional features of CXCL12 被引量:46
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作者 Rik Janssens Sofie Struyf Paul Proost 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2018年第4期299-311,共13页
The CXC chemokine CXCL12 is an important factor in physiological and pathological processes, includingembryogenesis, hematopoiesis, angiogenesis and inflammation, because it activates and/or induces migration ofhemato... The CXC chemokine CXCL12 is an important factor in physiological and pathological processes, includingembryogenesis, hematopoiesis, angiogenesis and inflammation, because it activates and/or induces migration ofhematopoietic progenitor and stem cells, endothelial cells and most leukocytes. Therefore, CXCL12 activity istightly regulated at multiple levels. CXCL12 has the unique property of existing in six splice variants in humans,each having a specific tissue distribution and in vivo activity. Controlled splice variant transcription and mRNAstability determine the CXCL12 expression profile. CXCL12 fulfills its functions in homeostatic and pathologicalconditions by interacting with its receptors CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) and atypical chemokine receptor 3(ACKR3) and by binding to glycosaminoglycans (GAGs) in tissues and on the endothelium to allow a properpresentation to passing leukocytes. Homodimerizaton and heterodimerization of CXCL12 and its receptors can altertheir signaling activity, as exemplified by the synergy between CXCL12 and other chemokines in leukocyte migrationassays. Receptor binding may also initiate CXCL12 internalization and its subsequent removal from theenvironment. Furthermore, CXCL12 activity is regulated by posttranslational modifications. Proteolytic removal ofNH2- or COOH-terminal amino acids, citrullination of arginine residues by peptidyl arginine deiminases or nitrationof tyrosine residues reduce CXCL12 activity. This review summarizes the interactions of CXCL12 with the cellularenvironment and discusses the different levels of CXCL12 activity regulation. 展开更多
关键词 ackr3 CHEMOKINE CXCL12 CXCR4 REGULATION
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