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番茄HD-Zip家族基因鉴定及非生物胁迫下HD-ZipⅢ亚家族基因的表达分析
1
作者 张鑫 郭旭东 +4 位作者 藏日娜 张顺智 朱文莹 王富 王辉 《山东农业科学》 北大核心 2025年第2期11-21,共11页
为探究番茄HD-Zip家族成员的特征及HD-ZipⅢ亚家族成员在非生物胁迫响应中的作用,我们对番茄HD-Zip家族进行了全基因组鉴定与非生物胁迫下的表达分析。结果显示,从番茄中共筛选出56个HD-Zip家族基因,不均匀地分布在12条染色体上;这些基... 为探究番茄HD-Zip家族成员的特征及HD-ZipⅢ亚家族成员在非生物胁迫响应中的作用,我们对番茄HD-Zip家族进行了全基因组鉴定与非生物胁迫下的表达分析。结果显示,从番茄中共筛选出56个HD-Zip家族基因,不均匀地分布在12条染色体上;这些基因被分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚家族,同一亚家族的基因具有相似的理化性质、基因结构、保守基序和保守结构域。对番茄HD-Zip家族基因主要顺式作用元件的预测结果显示,MeJA响应元件出现的频率最高,MeJA能诱导防御性化合物的合成并启动与全身获得性抗性和局部抗性有关的发病机制相关基因的表达,推测这些基因可能在番茄抗逆性中发挥重要作用。共线性分析发现,番茄HD-Zip家族基因中有30个基因存在共线性,而番茄与拟南芥HD-Zip家族基因间有34对基因存在共线性。基因表达分析结果显示,HD-ZipⅢ亚家族基因均在番茄植株根中表达,而且对冷、盐、干旱、ABA等非生物胁迫均有响应,但不同基因受各胁迫诱导的表现不同,其中,Soly03g120910在冷胁迫下表达量显著提高,处理6 h时达到最高,与0 h相比上调了10.3倍,同时该基因也受干旱胁迫诱导上调表达,处理6 h时的表达量与0 h相比提高了1.6倍;Solyc11g069470对盐胁迫响应最强,处理3 h时表达量最高,与0 h相比上调1.0倍;Soly08g066500对ABA处理响应最强,处理6 h时的表达量与0 h相比上调了5.4倍。本研究结果可为深入研究HD-Zip家族基因在植物逆境响应中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 HD-zip家族 生物信息学分析 基因表达 非生物胁迫
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ZIP4促进H3K4me3修饰激活MYCN转录增强胆管癌细胞糖酵解
2
作者 王吉文 张程 +3 位作者 张德祥 倪晓凌 范坤 刘厚宝 《中国临床医学》 2025年第3期410-420,共11页
目的 探讨ZIP4在胆管癌中调控糖酵解的作用机制及对肿瘤进展的影响,为胆管癌的靶向治疗提供依据。方法 分析GEPIA数据库中ZIP4在胆管癌中的表达数据。采用免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)检测20对胆管癌及癌旁样本中ZIP4表达。... 目的 探讨ZIP4在胆管癌中调控糖酵解的作用机制及对肿瘤进展的影响,为胆管癌的靶向治疗提供依据。方法 分析GEPIA数据库中ZIP4在胆管癌中的表达数据。采用免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)检测20对胆管癌及癌旁样本中ZIP4表达。构建ZIP4过表达(ZIP4-OE)稳转胆管癌细胞系,采用基因集富集分析筛选ZIP4-OE胆管癌细胞中的差异基因与通路。分别用小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)敲低ZIP4、MYCN和KMT2E,通过实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测糖酵解相关基因(Glut1、HK2和LDHA)的表达,通过细胞外酸化率(extracellular acidification rate,ECAR)检测糖酵解。使用克隆形成实验检测细胞增殖活性,Transwell实验检测细胞迁移活性,并构建异种移植小鼠模型评估ZIP4对胆管癌进展的影响。采用蛋白质印迹法检测ZIP4、KMT2E、H3K4me3和MYCN表达水平。结果 GEPIA数据库分析和IHC检测结果均证实,胆管癌组织中ZIP4表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05)。与对照组相比,ZIP4-OE组ECAR显著升高(P<0.01),胆管癌细胞增殖和迁移活性显著增强(P<0.01)。ZIP4敲低的胆管癌细胞增殖和迁移活性下降(P<0.01)。GEPIA数据库分析显示,ZIP4上调癌基因MYCN表达,从而促进糖酵解相关基因转录。敲低MYCN后,ZIP4过表达上调的Glut1、HK2与LDHA基因表达下降,糖酵解作用减弱,胆管癌细胞增殖和迁移活性被显著抑制(P<0.05)。机制分析表明,ZIP4通过KMT2E引起H3K4me3水平升高,激活MYCN转录。敲低KMT2E抑制了ZIP4-OE胆管癌细胞内上调的H3K4me3水平,导致MYCN转录被抑制,胆管癌细胞增殖和迁移活性显著降低(P<0.05)。结论 ZIP4通过KMT2E上调H3K4me3修饰,招募转录因子激活癌基因MYCN转录,进而增强细胞糖酵解,促进胆管癌细胞增殖迁移。 展开更多
关键词 胆管癌 zip4 糖酵解 赖氨酸甲基转移酶2E MYCN
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油茶HD-Zip基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
3
作者 黄丹 彭兵阳 +2 位作者 张盼盼 焦悦 吕佳斌 《生物技术通报》 北大核心 2025年第6期191-207,共17页
【目的】鉴定油茶HD-Zip基因家族成员,分析其结构、特性和功能,解析其在盐、干旱、低温和高温等非生物胁迫下的表达模式。【方法】基于六倍体普通油茶全基因组数据,利用生物信息学方法筛选鉴定CoHDZs基因家族成员,对其基因结构、保守基... 【目的】鉴定油茶HD-Zip基因家族成员,分析其结构、特性和功能,解析其在盐、干旱、低温和高温等非生物胁迫下的表达模式。【方法】基于六倍体普通油茶全基因组数据,利用生物信息学方法筛选鉴定CoHDZs基因家族成员,对其基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位和基因共线性等进行分析;基于转录组数据分析CoHDZs基因在油茶叶、芽、花瓣、雌蕊、种子、花萼、雄蕊和果实不同发育期中的表达模式;利用实时荧光定量PCR方法解析CoHDZs在不同逆境胁迫下的瞬时表达特征。【结果】CoHDZs基因家族包含46个成员(CoHDZ1-CoHDZ46)分布在4个不同的亚家族(HD-ZipⅠ,HD-ZipⅡ,HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ)中,且同一亚家族中的CoHDZ基因具有相似的结构特征。顺式作用元件分析表明油茶HD-Zip基因家族成员广泛参与光响应、激素响应以及非生物胁迫响应。染色体定位和共线性分析可知,46个CoHDZs基因不均匀地分布在26条染色体和2条染色体骨架上,全基因组复制(WGD)事件或片段复制可能是CoHDZs基因进化的主要动力;转录组分析表明,CoHDZs基因存在明显的组织特异性表达;实时荧光定量PCR验证实验表明,油茶HD-Zip基因家族成员在盐、干旱、低温和高温胁迫下高度表达,不同CoHDZs基因在同一胁迫下的表达存在差异,且相同基因在不同胁迫下的表达情况也有不同,其中CoHDZ1、CoHDZ3、CoHDZ14、CoHDZ18、CoHDZ20、CoHDZ22、CoHDZ42、CoHDZ44和CoHDZ45这9个基因是油茶HD-Zip家族响应非生物胁迫的关键基因。【结论】CoHDZs基因广泛参与油茶的生长发育、激素信号传导和非生物胁迫响应并发挥着重要的调控作用。 展开更多
关键词 油茶 HD-zip基因家族 组织特异性 非生物胁迫
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文冠果HD-Zip基因家族成员鉴定及其对盐胁迫的响应 被引量：1
4
作者 朱华利 陈玉霞 +5 位作者 钱程 陈玉金 于涵 姜涛 李璐璐 鲁仪增 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期378-391,共14页
【目的】对文冠果同源异型域—亮氨酸拉链(Homedomain-leucine zipper,HD-Zip)基因家族成员进行鉴定,并分析其在盐胁迫条件下的表达情况,为挖掘文冠果耐盐基因及培育文冠果耐盐新品种提供理论依据。【方法】以文冠果全基因组数据为基础... 【目的】对文冠果同源异型域—亮氨酸拉链(Homedomain-leucine zipper,HD-Zip)基因家族成员进行鉴定,并分析其在盐胁迫条件下的表达情况,为挖掘文冠果耐盐基因及培育文冠果耐盐新品种提供理论依据。【方法】以文冠果全基因组数据为基础,鉴定获得HD-Zip基因家族成员,通过生物信息学工具对HD-Zip基因家族的理化性质、保守基序、基因结构、顺式作用元件、系统发育进化关系进行预测分析和双酶切法亚细胞定位。对2个月苗龄的文冠果幼苗进行盐胁迫处理(NaCl浓度为50、100、150 mmol/L),以NaCl浓度0 mmol/L为对照组(CK),并采用实时荧光定量PCR对文冠果盐胁迫下根和叶HD-Zip基因家族的组织表达模式进行分析。【结果】从文冠果全基因组中共鉴定出29个HD-Zip基因家族成员,命名为XsHB1~XsHB29,除XsHB29外,XsHB1~XsHB28基因均定位到文冠果的12条染色体上。HD-Zip家族成员编码的氨基酸数量为202~838个,分子量为23567.07~92421.90 kD,理论等电点(pI)为4.75~8.98;亚细胞定位结果显示该家族蛋白均定位于细胞核中。系统进化发育分析将29个HD-Zip基因家族成员分为4个亚家族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ),各亚家族成员基因和蛋白结构具有相似性。通过启动子顺式作用元件预测发现,HD-Zip基因家族启动子共有22种顺式作用元件,如非生物胁迫和植物激素响应元件。实时荧光定量PCR结果显示,50 mmol/L NaCl处理的叶片中,XsHB1、XsHB12、XsHB13和XsHB29基因的相对表达量均显著升高(P<0.05,下同);而XsHB5、XsHB12、XsHB13、XsHB24、XsHB29基因相对表达量在150 mmol/L NaCl处理后的根中均显著下调。亚细胞定位和瞬时转化结果显示,XsHB5是定位于细胞核上的蛋白,能负调控文冠果耐盐性。【结论】从文冠果基因组中鉴定出29个XsHD-Zip基因家族成员,分为4个亚家族,各亚家族成员基因和蛋白结构具有相似性。其中,XsHB1、XsHB5、XsHB12、XsHB13、XsHB24和XsHB29等基因在文冠果盐胁迫响应中可能发挥重要作用,文冠果HD-Zip基因家族参与调控文冠果的生长发育、新陈代谢及其他应急反应过程。 展开更多
关键词 文冠果 HD-zip基因家族 盐胁迫 基因表达
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植物特异性HD-Zip转录因子在生长发育与逆境响应中的功能研究进展
5
作者 张薇 赵礼轲 +2 位作者 张丙林 刘卫娟 邹华文 《生命科学》 2025年第6期625-634,共10页
HD-Zip是植物所特有的转录因子,其结构包含一个保守的同源结构域(HD),以及一个负责蛋白质二聚化的保守亮氨酸拉链基序(LZ),所以被命名为同源结构域亮氨酸拉链(HD-Zip)。根据它们的序列同源性、DNA结合特异性和生理功能,HD-Zip蛋白家族... HD-Zip是植物所特有的转录因子,其结构包含一个保守的同源结构域(HD),以及一个负责蛋白质二聚化的保守亮氨酸拉链基序(LZ),所以被命名为同源结构域亮氨酸拉链(HD-Zip)。根据它们的序列同源性、DNA结合特异性和生理功能,HD-Zip蛋白家族可分为4个亚家族:HD-ZipⅠ、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ。研究表明HD-Zip家族基因广泛参与植物生长发育及对各种生物(病害、虫害)和非生物(干旱、高盐、高温等)逆境胁迫的响应过程。本文综述了HD-Zip转录因子的结构、分类及生物学功能,并对今后的研究重点进行展望。 展开更多
关键词 HD-zip 转录因子 生长发育 逆境胁迫
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甘野菊HD-ZIP家族基因的鉴定及表达分析
6
作者 岳肖雨 周统均 +5 位作者 钟剑 徐玉娴 陈昱媛 盛振兴 孙明 傅学浩 《安徽农业大学学报》 2025年第3期373-385,共13页
【目的】HD-ZIP是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育过程中及胁迫响应方面发挥着重要的调控作用。本研究初步探究甘野菊(Chrysanthemum seticuspe)HD-ZIP家族基因的功能。【方法】基于甘野菊基因组数据,系统地鉴定了甘野菊HD-ZI... 【目的】HD-ZIP是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育过程中及胁迫响应方面发挥着重要的调控作用。本研究初步探究甘野菊(Chrysanthemum seticuspe)HD-ZIP家族基因的功能。【方法】基于甘野菊基因组数据,系统地鉴定了甘野菊HD-ZIP基因家族成员,通过生物信息学分析揭示了这些基因的基本特征,并利用转录组数据和实时荧光定量PCR技术分析HD-ZIP基因的表达模式。【结果】在甘野菊基因组中共鉴定到47个HD-ZIP基因,分别命名为CsHD01~CsHD47,染色体定位分析发现,47个CsHDs基因在9条染色体上的分布并不均匀,4号染色体上基因分布最多。与拟南芥的HD-ZIP基因构建系统进化树发现,47个CsHDs可以分为4个亚家族。保守结构域和基因结构分析发现,所有的CsHDs都具有HD和LZ结构域,且每个亚家族的基因都有相似的内含子数量。共线性分析发现,在CsHDs中鉴定到10个共线性基因对,且进化选择压力值均小于1,受纯化选择。顺式作用元件预测发现,CsHDs的启动子区域有大量与激素以及低温、干旱和光响应相关的元件,表明CsHDs可能受到多种途径调控。表达模式分析发现,CsHDs基因在不同组织间的表达水平存在显著差异,CsHD03、CsHD30和CsHD36的表达水平与表皮毛的数量密切相关,推测其可能参与调控表皮毛的发育。【结论】初步揭示了甘野菊HD-ZIP家族基因的基本特征和潜在功能,为后续深入解析HD-ZIP转录因子在甘野菊生长发育及胁迫响应中的具体分子机制提供了重要线索和理论依据。 展开更多
关键词 HD-zip基因 甘野菊 基因家族 系统发育 表达模式
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耦合均值-相关性的起重伤害事故致因ZIP模型研究
7
作者 晋良海 邹颂香 +2 位作者 李新哲 邵波 李晨曦 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1930-1937,共8页
近些年来,起重伤害事故高发频发,导致了较大的直接经济损失和人员伤亡,受到行业的高度关注。为探究起重伤害事故致因的影响程度,采集2011—2021年376份起重伤害事故调查报告,依据事故致因24Model和系统安全分析法识别事故致因,构建起重... 近些年来,起重伤害事故高发频发,导致了较大的直接经济损失和人员伤亡,受到行业的高度关注。为探究起重伤害事故致因的影响程度,采集2011—2021年376份起重伤害事故调查报告,依据事故致因24Model和系统安全分析法识别事故致因,构建起重伤害事故致因的零膨胀泊松回归模型(Zero-Inflated Poisson,ZIP),并通过Vuong方法和拟合优度检验准则进行检验;综合考虑事故致因发生频次的均值、致因和事故发生的相关性,运用弹性分析方法对事故致因的影响程度进行定量排序。结果表明:ZIP回归模型拟合效果优于泊松回归模型,各事故致因对起重伤害事故的影响程度排序为安全监管不到位C_(6)(T_(k)=1.0221)、安全意识淡薄H_(1)(T_(k)=0.5117)、作业人员违规作业H_(3)(T_(k)=0.4758)、作业人员无证上岗H_(2)(T_(k)=0.2116)、专项施工方案不合格C_(7)(T_(k)=0.1234)和结构构件破坏或连接不可靠M_(3)(T_(k)=0.1045)。研究从事故致因发生频次的均值、致因和事故发生的相关性两个维度刻画事故致因对起重伤害事故的影响程度,为起重伤害事故风险分级管控提供了新的研究思路和方法。 展开更多
关键词 安全工程 起重伤害事故 零膨胀泊松(zip)回归模型 致因分析 弹性系数
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*-zip环
8
作者 王尧 李欣 任艳丽 《山东大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期1-7,共7页
提出*-zip环的概念,给出一些*-zip环的例子,研究它们的扩张性质。证明:(1)设*是环R上的一个对合,n∈N且n≥2,则R是*-zip环当且仅当Vn(R)是■环;(2)设R是一个*-斜Armendariz环,则R是*-zip环当且仅当*-斜多项式环R[x;*]是*-zip环。
关键词 对合 *-zip环 环的扩张 *-斜多项式环
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工业大麻HD-Zip基因家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析 被引量：2
9
作者 葛雯冬 王腾辉 +2 位作者 高美玲 范震宇 王玉书 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期55-62,共8页
HD-Zip在植物抗逆过程中起着重要的调节作用,为了解大麻基因组中HD-Zip基因家族的特征和潜在功能,并为进一步研究CsHDZ基因对干旱胁迫下的调控提供重要线索,根据大麻全基因组数据库中的参考序列,利用生物信息学的方法对大麻HD-Zip基因... HD-Zip在植物抗逆过程中起着重要的调节作用,为了解大麻基因组中HD-Zip基因家族的特征和潜在功能,并为进一步研究CsHDZ基因对干旱胁迫下的调控提供重要线索,根据大麻全基因组数据库中的参考序列,利用生物信息学的方法对大麻HD-Zip基因家族进行全基因组鉴定,并系统分析其理化特性、进化发育、基因结构、启动子顺式结合元件并测定干旱胁迫下的表达模式。结果表明,大麻HD-Zip基因家族共筛选出20个CsHDZs基因,分别定位在7条染色体上,属于4个亚家族,编码氨基酸204~837个,理论等电点4.54~9.04,属不稳定蛋白,亚细胞定位预测全部定位于细胞核;蛋白保守基序分析显示,CsHDZs共有10个保守基序,其中motif 1和motif 9为各成员共有;启动子调控元件分析发现,CsHDZs富含多种逆境胁迫应答相关元件。实时荧光定量分析结果显示,CsHDZ1/8/10基因转录水平在干旱前期无显著差异,而后期显著上调。研究表明CsHDZs基因参与了胁迫应答过程并能够积极响应干旱。 展开更多
关键词 大麻 HD-zip基因 干旱胁迫 表达分析
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普通烟草NtZIP基因家族鉴定及镉胁迫下其表达分析 被引量：1
10
作者 邓兆龙 孔嘉欣 +5 位作者 李俊营 吴圣江 刘磊 郭红祥 王明鑫 金维环 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1105-1118,共14页
植物锌铁转运蛋白ZIP主要参与调节必需金属元素的动态平衡,也参与镉(Cd)等重金属的吸收和转运。本研究运用生物信息学方法,从普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中共鉴定出33个NtZIP基因家族成员,其中11个成员定位在7条染色体上。亚细... 植物锌铁转运蛋白ZIP主要参与调节必需金属元素的动态平衡,也参与镉(Cd)等重金属的吸收和转运。本研究运用生物信息学方法,从普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组中共鉴定出33个NtZIP基因家族成员,其中11个成员定位在7条染色体上。亚细胞定位预测表明,26个NtZIP蛋白定位于细胞膜上,7个NtZIP蛋白定位于液泡膜上。通过邻接法,将33个NtZIP家族成员分为4个亚家族。启动子分析表明,NtZIP家族基因启动子区都含有非生物胁迫和激素相关的顺式作用元件。Cd胁迫下,荧光定量PCR结果表明,烟草NtZIP基因家族有9个成员在根中对Cd显著应答,与转录组数据基本一致,但随着Cd浓度的改变,NtZIP家族成员也出现了差异化表达,推测在烟草中NtZIP参与Cd的吸收与转运。 展开更多
关键词 普通烟草 zip蛋白 基因家族分析 镉胁迫
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枇杷HD-ZipⅠ转录因子家族全基因组鉴定及表达模式分析 被引量：1
11
作者 赵双 朱静雯 +4 位作者 陈甜甜 王鹏凯 郄红丽 王化坤 尤伟忠 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期2025-2037,共13页
【目的】同源结构域-亮氨酸拉链(HD-Zip)转录因子参与多种植物的非生物胁迫响应过程。然而,在枇杷中,HD-ZipⅠ基因家族尚未被鉴定。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内枇杷HD-ZipⅠ基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PC... 【目的】同源结构域-亮氨酸拉链(HD-Zip)转录因子参与多种植物的非生物胁迫响应过程。然而,在枇杷中,HD-ZipⅠ基因家族尚未被鉴定。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内枇杷HD-ZipⅠ基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析基因家族成员在枇杷不同组织和干旱胁迫下的表达特征。【结果】在枇杷基因组中筛选出20个HD-ZipⅠ家族成员。共线性分析结果发现了3对串联复制序列和22对片段复制序列,表明串联复制和片段复制可能促进了枇杷HD-ZipⅠ基因家族的扩张。蛋白序列比对分析表明,所有的HD-ZipⅠ家族成员均具有高度保守的HD和Zip结构域。系统发育分析表明,枇杷HD-ZipⅠ家族可以分为7个分支。HD-ZipⅠ各基因在枇杷不同组织中的表达模式有所差异。启动子序列分析表明,HD-ZipⅠ家族成员的启动子上含有多个与干旱胁迫和胁迫相关激素信号响应的顺式作用元件。干旱处理能够诱导EjHB9、EjHB10、EjHB17、EjHB18和EjHB20在叶片中的表达显著上调,预示着这些基因参与枇杷对干旱胁迫的响应。【结论】鉴定出5个受干旱胁迫显著诱导表达的枇杷HD-ZipⅠ基因,为进一步研究HD-ZipⅠ基因在响应枇杷干旱胁迫中的分子功能提供理论依据。 展开更多
关键词 枇杷 HD-zipⅠ转录因子 全基因组鉴定 表达分析
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锌转运体Zip1在糖尿病缺血再灌注大鼠七氟烷后处理心肌保护中的作用 被引量：1
12
作者 方雨露 李佳颖 +1 位作者 贺建东 韩冲芳 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第5期615-620,共6页
目的探讨糖尿病大鼠心肌缺血再灌注时锌转运体Zip1的表达变化与七氟烷后处理心肌保护作用的关系。方法采用随机数字表法将SD大鼠分为4组:心肌缺血再灌注(I/R)组、七氟烷后处理组(I/R+SEV组)、糖尿病心肌缺血再灌注组(DM+I/R组)、糖尿病... 目的探讨糖尿病大鼠心肌缺血再灌注时锌转运体Zip1的表达变化与七氟烷后处理心肌保护作用的关系。方法采用随机数字表法将SD大鼠分为4组:心肌缺血再灌注(I/R)组、七氟烷后处理组(I/R+SEV组)、糖尿病心肌缺血再灌注组(DM+I/R组)、糖尿病七氟烷后处理组(DM+I/R+SEV组),每组15只。4组大鼠均采用缺血30 min再灌注120 min建立心肌缺血再灌注损伤模型。DM+I/R组和DM+I/R+SEV组采用高脂高糖饮食8周后腹腔注射35 mg/kg STZ建立糖尿病模型,然后再进行心肌缺血再灌注损伤。I/R+SEV组和DM+I/R+SEV组于再灌注开始前1 min,通过挥发罐持续吸入2.5%七氟烷10 min。采用ELISA法检测血清肌钙蛋白I(cTnI)浓度;然后处死大鼠取心脏,TTC染色法检测心肌梗死范围,免疫组化法检测心肌Zip1蛋白表达,蛋白免疫印迹法检测心肌Zip1、Drp1、PINK1、Parkin的表达水平。结果与I/R组比较,I/R+SEV组血清cTnI含量和心肌梗死体积百分比降低(P<0.05),Zip1表达差异无统计学意义(P>0.05),Drp1、PINK1、Parkin蛋白表达降低(P<0.05);与I/R组比较,DM+I/R组血清cTnI含量和心肌梗死体积百分比升高(P<0.05),Zip1表达显著降低(P<0.01),Drp1表达升高(P<0.05),PINK1、Parkin表达显著降低(P<0.01)。与I/R+SEV组比较,DM+I/R+SEV组血清cTnI含量和心肌梗死体积百分比升高(P<0.05),Zip1表达显著降低(P<0.01),Drp1表达显著升高(P<0.01),PINK1、Parkin表达降低(P<0.05)。与DM+I/R组相比,DM+I/R+SEV组上述指标差异均无统计学意义(P>0.05)。结论糖尿病大鼠七氟烷后处理心肌保护效应的消失可能与糖尿病大鼠心肌Zip1表达下调有关。 展开更多
关键词 锌转运蛋白zip1 缺血再灌注损伤 自噬 七氟烷后处理 糖尿病
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丹参HD-ZIP基因家族的鉴定与表达分析 被引量：1
13
作者 李万 成瑞星 党鑫 《河南农业科学》 北大核心 2024年第7期66-78,共13页
为筛选丹参(Salvia miltiorrhiza)中响应高温胁迫的HD-ZIP基因,利用生物信息学研究方法,对丹参全基因组的HD-ZIP基因进行了鉴定和分析,并以天丹1号为材料,通过qPCR技术检测了丹参HDZIP基因在高温胁迫下的表达模式。结果表明,丹参全基因... 为筛选丹参(Salvia miltiorrhiza)中响应高温胁迫的HD-ZIP基因,利用生物信息学研究方法,对丹参全基因组的HD-ZIP基因进行了鉴定和分析,并以天丹1号为材料,通过qPCR技术检测了丹参HDZIP基因在高温胁迫下的表达模式。结果表明,丹参全基因组中包含44个HD-ZIP基因(SmHD-ZIP),不均匀地分布于8条染色体上。SmHD-ZIP可分为HD-ZIPⅠ、HD-ZIPⅡ、HD-ZIPⅢ和HD-ZIPⅣ4个亚家族,序列分析结果表明,这些蛋白质的氨基酸残基数为180~982个,相对分子质量为20.947~109.620 ku。SmHD-ZIP均为亲水蛋白,无跨膜结构域,绝大多数不含信号肽,等电点为4.48~10.91,且几乎都在细胞核表达,蛋白质稳定性较差。44个SmHD-ZIP基因中有10个基因复制事件,均为纯化选择。结构和模体分析结果表明,同一亚家族成员的外显子数目基本一致,HD-ZIPⅢ亚家族成员的外显子数目最多,模体数也最多。模体1、6是SmHD-ZIP的保守模体,模体10、11、12、13、15为HD-ZIPⅢ亚家族特有,模体5为HD-ZIPⅣ亚家族特有。通过分析高温(37℃)胁迫下SmHD-ZIP的表达模式发现,表达量升高和下降的基因数基本一致,在上调表达的基因中,SmHD-ZIP1.11、SmHD-ZIP1.13、SmHD-ZIP2.2、SmHD-ZIP2.5、SmHD-ZIP3.1、SmHD-ZIP3.4、SmHD-ZIP4.9、SmHD-ZIP4.10和SmHD-ZIP4.12的表达量提高了10倍以上,可作为提高丹参耐热性的候选基因资源。 展开更多
关键词 丹参 HD-zip家族 系统进化树 qPCR 高温胁迫
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锌转运体ZIP13与疾病
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作者 李欢欢 马婧 +2 位作者 邓佩佩 刘璇 王树松 《基础医学与临床》 CAS 2024年第12期1712-1716,共5页
锌是蛋白质合成、细胞增殖、迁移和自噬等多种生物过程的重要调节因子。锌转运体ZIP13(SLC39A13)是一种同源二聚体的金属转运蛋白,参与机体锌、铁和钙等离子的转运。ZIP13通过调节锌稳态参与疾病调控,如ZIP13在结缔组织发育中的关键作... 锌是蛋白质合成、细胞增殖、迁移和自噬等多种生物过程的重要调节因子。锌转运体ZIP13(SLC39A13)是一种同源二聚体的金属转运蛋白,参与机体锌、铁和钙等离子的转运。ZIP13通过调节锌稳态参与疾病调控,如ZIP13在结缔组织发育中的关键作用至少部分是因为它参与了BMP/TGF-β信号通路,ZIP13通过激活Src/FAK信号通路促进人卵巢癌细胞的转移和ZIP13通过调节C/EBP-β表达来抑制米色脂肪细胞的生物发生和能量消耗等。 展开更多
关键词 锌转运体 zip13 Ehlers-Danlos综合症 金属离子转运
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棉花bZIP转录因子基因GhbZIP15的克隆与表达分析 被引量：10
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作者 李月 许朋斐 +4 位作者 陈全家 代培红 刘超 曲延英 刘晓东 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期515-523,共9页
b ZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。本研究依据生物信息学分析,采用RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)方法从棉花中克隆了一个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP15(Gen Bank登录号为KP938299)。... b ZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。本研究依据生物信息学分析,采用RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)方法从棉花中克隆了一个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP15(Gen Bank登录号为KP938299)。该基因c DNA全长1980 bp,其开放阅读框为966 bp,编码321个氨基酸的蛋白,预测分子量为37.1 k D,等电点为7.44。SMART蛋白结构预测发现,该蛋白含有b ZIP家族典型的BRLZ碱性结构域和亮氨酸拉链,属于B-zip1家族。系统进化树分析表明Ghb ZIP15属于b ZIP转录因子AREB亚家族,和拟南芥A亚家族的Atb ZIP12,At ABF1和At ABF2亲缘关系最近。洋葱表皮细胞中瞬时表达分析表明,Ghb ZIP15主要定位于细胞核中。RT-PCR分析表明Ghb ZIP15对干旱、高盐、低温等处理都有一定程度的响应,推测该基因对棉花非生物胁迫的调控起重要作用。 展开更多
关键词 棉花 b zip转录因子 非生物胁迫 GHB zip15 克隆表达
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棉花GhZIP4基因的克隆及表达分析 被引量：3
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作者 巩元勇 郭书巧 +1 位作者 束红梅 倪万潮 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期27-33,共7页
根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR和PCR方法,从陆地棉‘苏棉18’-cDNA和基因组DNA中分别克隆获得了GhZIP4基因片段。结果表明:(1)GhZIP4基因cDNA序列全长1 487bp,包含1 269bp ORF,编码422个氨基酸残基,其氨基酸序列具有典型的ZIP... 根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR和PCR方法,从陆地棉‘苏棉18’-cDNA和基因组DNA中分别克隆获得了GhZIP4基因片段。结果表明:(1)GhZIP4基因cDNA序列全长1 487bp,包含1 269bp ORF,编码422个氨基酸残基,其氨基酸序列具有典型的ZIP蛋白特征,预测具有8个跨膜结构域,第Ⅲ和第Ⅳ跨膜结构域间存在可变区,在可变区有2个富含His的结构域"HRHSHPHG"和"HSHGHGHD"。(2)氨基酸进化树分析显示,GhZIP4同拟南芥ZIP家族AtZIP4的相似性较高。(3)GhZIP4DNA序列编码区全长1 778bp,包含4个外显子和3个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则。(4)半定量分析显示,GhZIP4基因在茎中表达量最高,表明该基因有可能在某些金属离子地上部和根部的动态平衡分布过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 陆地棉 zip Ghzip4 表达序列标签
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紫云英丛枝菌根共生锌转运蛋白基因AsZIP2的克隆与表达调控 被引量：3
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作者 韩亚超 谢贤安 +3 位作者 范晓宁 普明宇 林会 赵斌 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期610-621,共12页
土壤中锌的缺乏已成为农业中普遍存在的问题,会导致粮食的减产减质。ZIP家族蛋白质对农作物吸收Zn与Fe起着关键作用。本研究利用RACE技术从豆科植物紫云英中分离到一个全长的ZIP家族Zn转运基因,命名为AsZIP2;利用热不对称交错PCR与反向... 土壤中锌的缺乏已成为农业中普遍存在的问题,会导致粮食的减产减质。ZIP家族蛋白质对农作物吸收Zn与Fe起着关键作用。本研究利用RACE技术从豆科植物紫云英中分离到一个全长的ZIP家族Zn转运基因,命名为AsZIP2;利用热不对称交错PCR与反向PCR方法获取了AsZIP2基因上游长度为1.6 kb的启动子序列。生物信息学分析表明AsZIP2基因编码339个氨基酸;预测的AsZIP2蛋白质含有保守的ZIP结构域并由9个跨膜结构域构成;序列比对与系统进化分析表明AsZIP2与蒺藜苜蓿及日本百脉根的Zn转运蛋白ZIP2的亲缘关系密切。利用RT-PCR与定量PCR方法检测紫云英AsZIP2基因在丛枝菌根中的表达,结果显示AM真菌的侵染强烈地抑制AsZIP2的表达。与已知的Mt ZIP2基因一致,施加Zn会诱导AsZIP2的表达。有趣地是,在低磷条件下,AsZIP2在根中的表达显著地增强。研究结果表明,AM真菌,Zn或Pi水平均影响Zn转运基因AsZIP2在根中的表达水平。对AsZIP2基因在分子特征与表达谱方面的初步研究将有利于进一步功能性鉴定该基因参与植物生长和发育。 展开更多
关键词 锌 zip家族蛋白质 紫云英 Aszip2 丛枝菌根
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Zip模的扩张(英文) 被引量：1
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作者 欧阳伦群 刘金旺 向跃明 《数学进展》 CSCD 北大核心 2014年第5期683-694,共12页
本文主要证明了:(1)如果右R-模MR是(α,δ)-compatible且(α,δ)-Armendariz,则右R[x;α,δ]-模M[x]是zip模当且仅当右R-模MR是zip模;(2)如果(S,<)是可消无挠严格序幺半群且M_R是S-Armendariz模,则右[[R^S,<]]-模[[M^S,<]]_([[... 本文主要证明了:(1)如果右R-模MR是(α,δ)-compatible且(α,δ)-Armendariz,则右R[x;α,δ]-模M[x]是zip模当且仅当右R-模MR是zip模;(2)如果(S,<)是可消无挠严格序幺半群且M_R是S-Armendariz模,则右[[R^S,<]]-模[[M^S,<]]_([[R^S,<]]是zip模当且仅当右R-模M_R是zip模;(3)如果M_R是reduced且σ-compatible模,G为序群,则Malcev-Neumann环R*((G))上模M*((G))_(R*((G)))是zip模当且仅当右R-模M_R是zip模;因此一些文献中关于zip环与zip模的部分结论可以看作是本论文相关结论的推论. 展开更多
关键词 zip环 zip模 Armendariz模
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胡杨bZIP转录因子PebZIP26和PebZIP33基因的克隆及功能分析 被引量：4
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作者 张影 练从龙 +3 位作者 段卉 路信 夏新莉 尹伟伦 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期18-30,共13页
bZIP(basic region/leucine zipper motif)是一类在真核生物中分布广泛的超大转录因子家族,参与调节植物的生长发育、衰老、激素调控、能量代谢、病原防御等过程。胡杨是研究抗逆分子机制的模式木本植物,但是关于胡杨的b ZIP功能迄今未... bZIP(basic region/leucine zipper motif)是一类在真核生物中分布广泛的超大转录因子家族,参与调节植物的生长发育、衰老、激素调控、能量代谢、病原防御等过程。胡杨是研究抗逆分子机制的模式木本植物,但是关于胡杨的b ZIP功能迄今未见研究报道。本研究从胡杨中克隆得到PebZIP26和PebZIP33两个转录因子的c DNA,经分析,分别编码439与371个氨基酸且PebZIP26与PebZIP33基因的表达受干旱、脱水及盐胁迫诱导。构建植物表达载体,利用农杆菌花序侵染法转化拟南芥,获得Ca MV35S:PebZIP26和Ca MV35S:PebZIP33超表达株系和空载体对照株系。在含有150 mmol/L Na Cl及300 mmol/L甘露醇培养基上,PebZIP26和PebZIP33超表达株系根长均长于野生型,叶片嫩绿,无发黄萎蔫现象;另外,对盆土中的幼苗进行21 d的干旱处理和盐处理,超表达PebZIP26及PebZIP33株系耐旱耐盐性较强,表现为胁迫环境中植株营养生长较好,株高显著高于野生型(WT)及空载体对照株系,干旱复水后,植株存活率为61%及48%,显著高于WT的9%及空载体对照的12%。超表达PebZIP26及PebZIP33株系相比于WT和abf1及tga1(拟南芥同源基因ABF1及TGA1突变体)气孔关闭对外源ABA处理更加敏感,且对氧化胁迫的抗性较强。综上所述,胡杨PebZIP26和PebZIP33转录调节因子可能通过调控气孔开度和活性氧水平及根的生长正向调节植物抗旱耐盐性,进一步丰富了木本植物b ZIP的基因功能认识,为遗传育种提供基因资源及理论依据。 展开更多
关键词 胡杨 Peb zip26 Peb zip33 拟南芥 抗旱 抗盐
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分次zip环与SPlit-null扩张(英文)
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作者 朱彬 《怀化学院学报》 1993年第6期1-5,共5页
本文定义并讨论了分次zip环,讨论了交换环的Split—null扩张的zip性,推广了C.Faith的部分结果。
关键词 分次zip环 split-null扩张 zip环
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