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基于转录组的芍药WOX基因家族鉴定及PlWOX5在盐胁迫下的功能分析
1
作者 彭波 马梦梅 赵苹 《河南农业科学》 北大核心 2025年第4期57-65,共9页
为了明晰芍药WOX基因家族的功能、进化关系及其在生物学过程中的作用,基于转录组数据鉴定芍药WOX(PlWOX)家族成员,并对其蛋白质理化性质、结构、进化关系、基因表达模式等进行生物信息学分析。结果表明,基于芍药转录组数据共鉴定出5个Pl... 为了明晰芍药WOX基因家族的功能、进化关系及其在生物学过程中的作用,基于转录组数据鉴定芍药WOX(PlWOX)家族成员,并对其蛋白质理化性质、结构、进化关系、基因表达模式等进行生物信息学分析。结果表明,基于芍药转录组数据共鉴定出5个PlWOX基因,其编码的氨基酸以疏水不稳定的碱性核蛋白为主。系统进化分析结果显示,PlWOX基因分布在WUS/现代支系和古老支系上,中间支系无PlWOX基因分布。蛋白质结构分析结果表明,不同PlWOX基因上Motif的分布和数量均存在差异,并且其表达具有明显的组织特异性,其中PlWOX2和PlWOX5主要在芍药叶中高表达。qRT-PCR检测结果表明,PlWOX基因对盐胁迫均具有响应,但PlWOX5对盐胁迫的响应程度更高。过表达PlWOX5基因可以通过增强抗氧化酶活性(超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶)和提高渗透调节物质(可溶性蛋白)含量促进活性氧(ROS)清除,进而增强拟南芥的耐盐性。综上,PlWOX5基因通过提高抗氧化酶活性和渗透调节物质的含量,提高芍药的耐盐性。 展开更多
关键词 wox基因家族 芍药 盐胁迫 抗氧化酶活性 渗透调节物质
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普通菜豆WOX基因家族全基因组鉴定与出愈率相关分析
2
作者 叶宗茂 谢迅 +1 位作者 侯思宇 武晶 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第7期1384-1397,I0024-I0026,共17页
出愈率是影响遗传转化效率的关键因素,WOX基因能促进细胞增值和芽分化。本研究对普通菜豆WOX基因家族进行了全基因组鉴定,鉴定到18个普通菜豆WOX基因,编码177~847个氨基酸,其蛋白序列均包含保守的HD结构域,亚细胞定位于细胞核中,启动子... 出愈率是影响遗传转化效率的关键因素,WOX基因能促进细胞增值和芽分化。本研究对普通菜豆WOX基因家族进行了全基因组鉴定,鉴定到18个普通菜豆WOX基因,编码177~847个氨基酸,其蛋白序列均包含保守的HD结构域,亚细胞定位于细胞核中,启动子顺式作用元件主要为分生组织形成相关及生长素反应相关。并与绿豆、大豆和拟南芥WOX基因家族成员进行了共线性和系统进化树分析,124个WOX基因可分为三大类群,4个物种间的WOX同源基因受纯化选择作用。通过筛选不同浓度6-BA和2,4-D激素配比的培养基,成功建立了两个普通菜豆品种的愈伤组织诱导体系。通过转录组结合qRTPCR分析,鉴定到8个WOX差异表达基因,其中PvWOX1、PvWOX15和PvWOX16基因与出愈率显著相关。qRT-PCR验证了这3个基因表达模式与转录组结果一致。以上结果表明PvWOX1、PvWOX15和PvWOX16基因可作为潜在的靶基因用于提高普通菜豆遗传转化效率。 展开更多
关键词 普通菜豆 wox基因 愈伤组织 转录组
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拟南芥WOX5功能依赖突变体的筛选和遗传分析
3
作者 南文斌 李均瑶 +7 位作者 赵滢滢 陈雪梅 黄东惠 赵紫薇 秦小健 梁永书 李明 张汉马 《植物生理学报》 北大核心 2025年第1期29-36,共8页
拟南芥WUSCHEL RELATED HOMEOBOX 5 (WOX5)在根尖静止中心(QC)特异性表达,其蛋白能从QC细胞移动至小柱干细胞(columella stem cells, CSCs),在根尖干细胞维持中发挥着关键的调控作用。本研究构建了受地塞米松(DEX)诱导控制的WOX5过表达... 拟南芥WUSCHEL RELATED HOMEOBOX 5 (WOX5)在根尖静止中心(QC)特异性表达,其蛋白能从QC细胞移动至小柱干细胞(columella stem cells, CSCs),在根尖干细胞维持中发挥着关键的调控作用。本研究构建了受地塞米松(DEX)诱导控制的WOX5过表达株系,以此建立甲基磺酸乙酯(EMS)诱变的突变体库,并进行了突变体的筛选。结果显示WOX5过表达不仅能诱导根尖产生多层CSC类似细胞,而且还能抑制拟南芥幼苗主根的生长发育。此外,通过筛选获得了46个WOX5过表达表型减弱或不能实现的突变体,其中10个为显性突变体、36个为隐性突变体。通过基因表达分析,我们发现隐性突变体中有些能维持WOX5的过表达状态,而有些WOX5表达量则显著下降。以上研究结果和获得的突变体材料为后续基因定位和WOX5调控机制的研究奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 拟南芥 wox5 突变体筛选 遗传分析 根尖干细胞维持
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香榧WOX基因家族的鉴定与表达分析
4
作者 王誉 姜筱雯 +1 位作者 周小红 吴家胜 《林业科学研究》 北大核心 2025年第1期160-168,共9页
[目的]本研究对香榧WOX基因家族进行鉴定并分析了体细胞胚发生相关WOX表达,以筛选香榧体细胞胚发生关键WOX基因,提升香榧体细胞胚发生效率,以期解决香榧育种工作中生长周期长的困难。[方法]用拟南芥WOX蛋白序列比对香榧基因组,鉴定出的... [目的]本研究对香榧WOX基因家族进行鉴定并分析了体细胞胚发生相关WOX表达,以筛选香榧体细胞胚发生关键WOX基因,提升香榧体细胞胚发生效率,以期解决香榧育种工作中生长周期长的困难。[方法]用拟南芥WOX蛋白序列比对香榧基因组,鉴定出的WOX基因进行蛋白理化性质、保守基序、保守结构域和染色体定等分析,进一步分析了香榧根、茎、叶、愈伤和体细胞胚中的WOX基因的表达量。[结果]本研究共鉴定出17个香榧WOX成员,系统进化分析后将其分为3个进化支:WUS进化支、中间进化支和古老进化支;不同进化支上的基因均含有特异性的保守结构域;17条基因定位在6条染色体上,其理化性质也各有不同;香榧的WOX2、WOX8、WOX9、WOX13在根、茎、叶、体胚、愈伤上均有不同程度的表达,并且在体细胞胚和愈伤中的表达量较高。[结论]基于香榧WOX2、WOX8B、WOX9A、WOX13A~D在体细胞胚和愈伤中的高表达量,推测它们可能参与香榧愈伤的形成与体细胞胚的发育。 展开更多
关键词 香榧 wox基因 体细胞胚发生 生信分析 基因表达
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丹参WOX家族成员鉴定及SmWOX8基因在盐胁迫下的功能分析
5
作者 陈春 种春斌 路雷 《河南农业科学》 北大核心 2025年第6期43-54,共12页
通过基因组数据鉴定丹参WOX(SmWOX)家族基因,并分析其蛋白质的理化性质、系统进化关系、结构及基因的组织表达模式、盐胁迫下的响应情况。结果表明,9个SmWOX家族蛋白具有不同的氨基酸序列长度、分子质量、等电点等理化性质,且均定位于... 通过基因组数据鉴定丹参WOX(SmWOX)家族基因,并分析其蛋白质的理化性质、系统进化关系、结构及基因的组织表达模式、盐胁迫下的响应情况。结果表明,9个SmWOX家族蛋白具有不同的氨基酸序列长度、分子质量、等电点等理化性质,且均定位于细胞核。系统进化分析结果显示,SmWOX家族成员分为远古、中间和WUS 3个类群,与部分拟南芥WOX蛋白存在直系同源关系。结构分析揭示了不同丹参WOX亚家族成员间的差异性,它们在不同组织中具有不同的表达模式,暗示其在生长发育中可能行使不同的功能。顺式作用元件分析结果表明,SmWOX基因在逆境胁迫、激素响应和生长发育等方面具有调控作用。此外,酵母双杂交试验证实了SmWOX8蛋白与其他蛋白质之间存在相互作用。盐胁迫下,SmWOX基因表达量变化明显,尤其是SmWOX8在高盐胁迫下表达量最高,暗示其在丹参抗盐胁迫中可能发挥重要作用,转基因拟南芥试验结果证实了SmWOX8能提高丹参的耐盐性。 展开更多
关键词 丹参 wox基因家族 表达模式 盐胁迫
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澳洲坚果WOX13基因克隆及表达分析
6
作者 莫金辉 刘媛 +4 位作者 黄炳瑜 卢源东 谭熙灵 徐增富 王翊 《广西林业科学》 2025年第2期121-130,共10页
为探究澳洲坚果(Macadamia integrifolia)WOX13(MiWOX13)基因功能,从澳洲坚果“桂热一号”(M. integrifolia Guire1)中克隆MiWOX13a和MiWOX13b基因及可变剪接体MiWOX13aβ和MiWOX13bβ基因,通过生物信息学分析和RT-qPCR验证,初步揭示这... 为探究澳洲坚果(Macadamia integrifolia)WOX13(MiWOX13)基因功能,从澳洲坚果“桂热一号”(M. integrifolia Guire1)中克隆MiWOX13a和MiWOX13b基因及可变剪接体MiWOX13aβ和MiWOX13bβ基因,通过生物信息学分析和RT-qPCR验证,初步揭示这些基因的生物学功能。结果表明,MiWOX13a、MiWOX13b、MiWOX13aβ和MiWOX13bβ基因编码区长度分别为855、810、846和768 bp,分别编码284、270、281和256个氨基酸,蛋白分子量为29.11~32.53 kD,均为酸性亲水蛋白,均定位于细胞核。4个MiWOX13基因均与番茄(Solanum lycopersicum)、苹果(Malus domestica)、毛果杨(Populus trichocarpa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)亲缘关系较近。4个MiWOX13蛋白氨基酸序列N端均具有NTDW和HD保守结构域。受可变剪切影响,MiWOX13aβ和MiWOX13bβ蛋白氨基酸序列C端与MiWOX13a和MiWOX13b有差异。除MiWOX13bβ基因在>1~2 cm花芽时期外,4个MiWOX13基因在根、茎、叶、花芽和愈伤组织中均有表达。MiWOX13a和MiWOX13b基因相对表达量在根中均较高,可能影响根系生长发育;MiWOX13a、MiWOX13b和MiWOX13aβ基因相对表达量在嫩茎、老茎和愈伤组织形成过程中均较高,可能共同参与嫁接过程中的伤口愈合;MiWOX13a和MiWOX13aβ基因相对表达量在花芽中均较高,可能参与开花过程。 展开更多
关键词 wox13 可变剪切 开花结实 澳洲坚果
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桉树WOX转录因子家族全基因组鉴定及比较分析
7
作者 刘家璇 黄楚涵 +3 位作者 欧阳乐军 王超洪 柯梓婷 沈超 《长沙大学学报》 2025年第2期48-57,共10页
WUSCHEL相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,简称WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物的生长发育及器官形成与分化过程中发挥着重要作用。为了比较尾巨桉与巨桉WOX基因的差异,研究采用生物信息学方法分别在尾巨桉和巨桉基因... WUSCHEL相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,简称WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物的生长发育及器官形成与分化过程中发挥着重要作用。为了比较尾巨桉与巨桉WOX基因的差异,研究采用生物信息学方法分别在尾巨桉和巨桉基因组中鉴定出8个WOX基因家族成员。分析显示,这些WOX成员的氨基酸序列长度在111~377个氨基酸残基之间,其二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,均表现为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果表明,WOX基因均定位于细胞核内。系统进化分析显示,WOX基因家族可分为远古支、中间支和现代支三个进化分支。保守基序分析发现,除尾巨桉的Eug03G0133100外,其余尾巨桉和巨桉WOX蛋白均含有Motif1,表明该基序在进化过程中高度保守。染色体定位分析表明,尾巨桉的WOX基因分布于6条染色体上,而巨桉WOX基因分布于7条染色体上,并且二者共有7对同源基因。基于尾巨桉愈伤组织不同发育时期的转录组数据分析发现,在愈伤组织形成的四个阶段,有6个WOX基因具有表达活性。其中,Eug01G0190000在白色愈伤和红色愈伤阶段表现出显著的差异表达。qRT-PCR分析结果显示,在1 mg/L PBU处理下,WOX基因的表达显著上调,并有效促进愈伤组织的分化,尤以Eug02G0065500的表达量最高。综合分析表明,这两个基因可能作为候选基因,参与尾巨桉愈伤组织的形成和分化。 展开更多
关键词 尾巨桉 巨桉 wox转录因子家族 愈伤组织
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WOX5在拟南芥根尖的调控功能:组织与器官之间的落差
8
作者 钟正钰 周鹭 +1 位作者 王爽 张汉马 《植物学研究》 2025年第3期145-150,共6页
WOX5是拟南芥根尖干细胞调控网络中的一个关键因子,正常时空表达时主要在静止中心和柱干细胞中发挥作用,在细胞与组织层面具有促进干细胞特性维持和抑制细胞分化的功能,但WOX5功能完全缺失的突变体在器官与个体水平没有明显的表型,弄清... WOX5是拟南芥根尖干细胞调控网络中的一个关键因子,正常时空表达时主要在静止中心和柱干细胞中发挥作用,在细胞与组织层面具有促进干细胞特性维持和抑制细胞分化的功能,但WOX5功能完全缺失的突变体在器官与个体水平没有明显的表型,弄清引起WOX5在细胞组织和器官个体之间功能差异的原因可能会刷新我们目前有关根干细胞调控的认识。 展开更多
关键词 wox5 根干细胞 根生长 拟南芥 干细胞维持
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油桐WOX转录因子家族的全基因组鉴定与分析 被引量：1
9
作者 王占军 李玲丽 +7 位作者 张萌 何咏欣 刘新沂 周子寒 杨妍萍 欧祖兰 张翼 张勰 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期111-117,共7页
为探索WOX转录因子在油桐生长发育中的生物学功能,通过生物信息学手段对油桐WOX家族进行鉴定和分析,为研究WOX基因家族调控油桐生长发育提供基础资料及参考。经鉴定油桐WOX基因家族共有10个成员,分布在6条染色体的不同位置,该家族成员... 为探索WOX转录因子在油桐生长发育中的生物学功能,通过生物信息学手段对油桐WOX家族进行鉴定和分析,为研究WOX基因家族调控油桐生长发育提供基础资料及参考。经鉴定油桐WOX基因家族共有10个成员,分布在6条染色体的不同位置,该家族成员的理化性质有差异。结果表明,通过系统进化分析,将油桐WOX基因家族成员分为3个组,其中油桐与大戟科中的小桐子亲缘关系较近。该家族成员的保守结构域Homeobox包含2个保守基序,组织特异性表达分析发现VfWOX10和VfWOX13在根、茎、叶、种子及花中均表达,说明它们在油桐整个发育过程中都起重要的调控作用。VfWUS在开花前10 d的雄花中表达量最高,由此推测VfWUS在雄花发育中发挥着关键的调控作用。 展开更多
关键词 油桐 wox 转录因子 生物信息学
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马铃薯WOX基因家族的鉴定及在离体再生和非生物胁迫中的表达分析 被引量：1
10
作者 张玉 石磊 +7 位作者 巩檑 聂峰杰 杨江伟 刘璇 杨文静 张国辉 颉瑞霞 张丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期170-180,共11页
【目的】WUSCHE-相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育、干细胞分化调控、逆境胁迫响应等过程中扮演重要角色。开展马铃薯WOX基因家族鉴定与功能研究,将为马铃薯遗传改良提供优良... 【目的】WUSCHE-相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育、干细胞分化调控、逆境胁迫响应等过程中扮演重要角色。开展马铃薯WOX基因家族鉴定与功能研究,将为马铃薯遗传改良提供优良基因资源与理论依据。【方法】基于拟南芥、番茄、烟草和水稻WOX蛋白序列,利用HMMER 3.0和BLASTP鉴定马铃薯WOX基因家族成员,使用MCScanX软件分析WOX基因家族成员在马铃薯种内及种间的共线性,并采用邻接法构建系统发育进化树。利用ExPASy、GSDS等软件分析马铃薯WOX基因家族成员理化性质、基因结构、蛋白motif、启动子区域转录因子结合位点。基于PGSC数据库中马铃薯转录组数据,分析StWOXs在不同组织和非生物胁迫下的表达模式;以可能参与离体再生过程的StWOX5作为候选基因,利用实时荧光定量PCR技术分析该基因在具有不同离体再生能力的4个马铃薯品种(系)再生过程中的表达情况。【结果】鉴定得到11个马铃薯WOX基因家族成员,分布在5条染色体上,分为WUS、中间和古老共3个进化分支,不同分支中StWOXs基因结构、蛋白motif组成、转录因子结合位点类型和数量存在不同程度的差异。表达模式结果表明,马铃薯WOX基因家族成员参与离体再生和非生物胁迫响应,StWOX4/5/11/13在愈伤组织中特异表达,StWUS、StWOX1/3c/4/5/13在甘露醇处理下上调表达,StWOX3a/11在NaCl处理下上调表达,StWOX4/5/13在热胁迫中上调表达,且StWOX5相对表达量与愈伤组织分化率呈正相关。【结论】不同马铃薯WOX基因具有潜在的功能多样性,StWOX5具有促进马铃薯离体再生分化的作用,参与了非生物胁迫反应。 展开更多
关键词 马铃薯 wox基因家族 愈伤组织 基因表达
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桃WOX基因家族的鉴定及分析 被引量：2
11
作者 郭彩珍 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第2期371-381,共11页
WOX基因家族是植物特有转录因子,具有调控植物的生长发育、植物的胚胎发育、激素信号转导、抗逆代谢等作用。本研究利用桃全基因组数据,首次对桃全基因组中的WOX基因家族进行鉴定和生物学分析。结果表明:桃WOX基因家族共有67个成员,8条... WOX基因家族是植物特有转录因子,具有调控植物的生长发育、植物的胚胎发育、激素信号转导、抗逆代谢等作用。本研究利用桃全基因组数据,首次对桃全基因组中的WOX基因家族进行鉴定和生物学分析。结果表明:桃WOX基因家族共有67个成员,8条染色体上都有分布,不同成员的氨基酸数、分子量和等电点差异较大,大部分WOX蛋白富含酸性氨基酸且稳定性较差,所有WOX成员都为亲水性蛋白;桃WOX蛋白二级结构均由α-螺旋、β-折叠、延伸链和无规则卷曲四部分组成;桃WOX基因家族97%的成员都定位于细胞核中;系统进化树将桃WOX基因家族分为3个组,只有第Ⅰ组包含40个PpWOX蛋白和15个拟南芥WOX蛋白,其他两组都没有拟南芥的WOX蛋白;桃WOX基因结构中都含有外显子和内含子结构,但是数量差异较大;保守基序分析表明,共有10个保守基序(motif 1~motif 10)且所有WOX成员都含有motif 1,同一分支中motif的数目和种类更为相似而不同分支间有其特异的motif,与系统进化树分析具有一致性。该研究结果将为进一步分析WOX基因家族各个成员在桃的生长发育和抗逆胁迫等方面的应用提供一定的基础数据和参考依据。 展开更多
关键词 桃 wox基因家族 鉴定 分析
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云南栘[木衣]WOX基因家族的鉴定与表达分析 被引量：1
12
作者 何雨衡 王大玮 《种子》 北大核心 2024年第8期36-45,共10页
为探究云南栘[木衣]WOX基因家族成员的功能和表达模式,本研究通过生物信息学方法对云南栘[木衣]WOX基因进行全基因组鉴定。结果表明,云南栘[木衣]基因组中共有20个DdeWOX基因,且不均匀地分布在12条染色体上;家族成员的长度在176~877个... 为探究云南栘[木衣]WOX基因家族成员的功能和表达模式,本研究通过生物信息学方法对云南栘[木衣]WOX基因进行全基因组鉴定。结果表明,云南栘[木衣]基因组中共有20个DdeWOX基因,且不均匀地分布在12条染色体上;家族成员的长度在176~877个氨基酸之间,含有2~9个内含子,编码17~50个氨基酸;系统进化结果显示DdeWOX基因可分为3个进化分支。分析4个果实发育时期及5个种子萌发阶段的转录组数据,并从中随机挑选6个基因进行RT-qPCR测定以验证转录组的整体准确性。发现DdeWOX13a/DdeWOX11在果实发育的不同时期内具有较高表达量,推测这两个基因可能参与云南栘[木衣]的果实发育过程,且二者可能存在功能冗余;另外DdeWOX2在种子萌发的成苗期内具有较高表达,推测其可能参与调控种子萌发过程;值得注意的是DdeWOX13a在种子萌发阶段也有较高表达,推测该基因可能同时对种子萌发及果实发育具有调控作用。 展开更多
关键词 云南栘[木衣] wox基因家族 生物信息学 表达分析
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生菜WOX基因家族的鉴定与分析 被引量：1
13
作者 罗康胜 张米欢 +4 位作者 翟兆东 刘雪 李大勇 张彬 张德春 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第6期1795-1806,共12页
WOX转录因子是植物特异性转录因子。已有研究表明,WOX家族成员在植物生长发育和非生物胁迫响应中起着重要作用,但在生菜(Lactuca sativa L.)中,WOX基因家族的生物学功能研究还很少。本研究在生菜中鉴定到14个可能的LsaWOX基因,分析了他... WOX转录因子是植物特异性转录因子。已有研究表明,WOX家族成员在植物生长发育和非生物胁迫响应中起着重要作用,但在生菜(Lactuca sativa L.)中,WOX基因家族的生物学功能研究还很少。本研究在生菜中鉴定到14个可能的LsaWOX基因,分析了他们的基因结构、蛋白保守基序、三级结构、染色体定位和顺式作用元件等,并将其划分为三个主要分支(如远古支系,中间支系和WUS支系)。本研究对生菜中WOX家族成员进行了鉴定和初步分析,为进一步研究生菜中WOX基因家族的生物学功能提供理论依据。 展开更多
关键词 生菜(Lactuca sativa) wox基因家族 生物信息学分析
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氧空位驱动制备AuPd/WOx复合材料及其催化性能研究
14
作者 蔡佳萍 姚翠婷 张燕辉 《四川轻化工大学学报(自然科学版)》 2024年第6期23-30,共8页
通过水热法合成带有氧空位的WO_(x),在回流的条件下以氧空位为驱动力合成Au/WO_(x)、Pd/WO_(x)和AuPd/WO_(x)复合催化材料,且在此过程中不需要额外加入还原剂或表面活性剂。采用X-射线衍射、电子顺磁共振波谱(EPR)、傅里叶变换红外光谱... 通过水热法合成带有氧空位的WO_(x),在回流的条件下以氧空位为驱动力合成Au/WO_(x)、Pd/WO_(x)和AuPd/WO_(x)复合催化材料,且在此过程中不需要额外加入还原剂或表面活性剂。采用X-射线衍射、电子顺磁共振波谱(EPR)、傅里叶变换红外光谱、场发射扫描电子显微镜、Brunauer-Emmett-Teller(BET)、透射电子显微镜等对所制备的材料进行表征,EPR信号的测定证实了WO_(x)催化材料中氧空位的存在,其相关g值为2.003;WO_(x)纳米片层表面实现了贵金属的均匀负载。此外,将制备所得的WO_(x)、Pd/WO_(x)、Au/WO_(x)和AuPd/WO_(x)催化材料用于催化甲酸制氢(反应10 h产氢量达22.7 mL)、还原对硝基苯酚(反应60 s转化率达99%),而AuPd/WO_(x)复合材料表现出的催化活性最好。这表明负载Au、Pd、AuPd合金能调控WO_(x)的电子结构,不同程度上提高材料催化甲酸制氢、还原对硝基苯酚的活性,该研究为贵金属负载WO_(x)复合材料应用于氢能源、水处理领域提供了参考。 展开更多
关键词 AuPd/wox 催化还原 甲酸分解制氢 还原对硝基苯酚
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WOX蛋白家族调控干细胞发育分子机制的研究进展 被引量：13
15
作者 于燕杰 张大兵 袁政 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期565-574,共10页
WOX蛋白家族是植物特有的一类转录因子家族,是植物胚胎建成、干细胞维持和器官发生等发育过程中的重要调控因子。越来越多的研究表明,作为干细胞维持的关键因子之一,WOX蛋白家族通过相似或特异的调控网络参与植物初生分生组织(茎尖和根... WOX蛋白家族是植物特有的一类转录因子家族,是植物胚胎建成、干细胞维持和器官发生等发育过程中的重要调控因子。越来越多的研究表明,作为干细胞维持的关键因子之一,WOX蛋白家族通过相似或特异的调控网络参与植物初生分生组织(茎尖和根尖分生组织)和次生分生组织(维管分生组织)等各级干细胞的维持和分化。该文综述了近年来WOX蛋白家族调控干细胞发育分子机制的研究进展,并对其在单、双子叶植物中功能的保守性进行了比较和分析。 展开更多
关键词 分生组织 干细胞维持 wox CLE-wox调控途径
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番茄WOX转录因子家族的鉴定及其进化、表达分析 被引量：38
16
作者 李晓旭 刘成 +4 位作者 李伟 张增林 高晓明 周慧 郭永峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期444-460,共17页
WUSCHEL相关的同源异型盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)是一类植物特异的转录因子家族,具有调控植物干细胞分裂分化动态平衡等重要功能。本研究利用番茄(Solanum lycopersicum)基因组数据,通过建立隐马尔科夫模型并进行检索,鉴定了番... WUSCHEL相关的同源异型盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)是一类植物特异的转录因子家族,具有调控植物干细胞分裂分化动态平衡等重要功能。本研究利用番茄(Solanum lycopersicum)基因组数据,通过建立隐马尔科夫模型并进行检索,鉴定了番茄10个WOX转录因子家族成员。多序列比对发现,番茄WOX转录因子家族成员具有高度保守的同源异型结构域;以拟南芥WOX转录因子家族成员序列为参照,通过邻接法、极大似然法、贝叶斯法重建了系统发育树,三者呈现出类似的拓扑结构,番茄和拟南芥WOX转录因子家族共25个成员被分为3个进化支(Clade)和9个亚家族(Subgroup);利用MEME和GSDS对WOX转录因子家族成员的蛋白保守结构域和基因结构进行了分析,同一亚家族内的WOX转录因子家族成员的保守结构域的种类、组织形式以及基因结构具有高度的一致性;利用Perl和Orthomcl对家族成员的染色体定位和同源性关系进行分析,结果表明串联重复的Sl WOX3a和Sl WOX3b可能来源于一次复制事件;利用番茄转录组数据和q RT-PCR进行表达分析,结果显示家族成员在不同组织中的表达存在差异,暗示了WOX家族的不同成员在功能上可能具有多样性。本研究对番茄WOX转录因子家族成员进行GO(Gene Ontology)注释和比较分析,结果表明该家族成员作为转录因子,可能在组织器官发育、细胞间通讯等过程中发挥作用。 展开更多
关键词 番茄 生物信息学分析 wox转录因子家族
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棉花WOX转录因子家族基因的全基因组鉴定与分析 被引量：15
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作者 吕有军 杨卫军 +2 位作者 赵兰杰 刘子洋 张永山 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期21-31,共11页
为了挖掘可用于棉花花器官或纤维发育研究的候选基因,基于已发布的陆地棉全基因组数据,利用生物信息学的分析方法鉴定了陆地棉WOX(WUSCHEL-related homeobox,WOX)转录因子基因家族,并从染色体分布、基因及蛋白理化性质、蛋白结构、多重... 为了挖掘可用于棉花花器官或纤维发育研究的候选基因,基于已发布的陆地棉全基因组数据,利用生物信息学的分析方法鉴定了陆地棉WOX(WUSCHEL-related homeobox,WOX)转录因子基因家族,并从染色体分布、基因及蛋白理化性质、蛋白结构、多重序列比对、系统进化树和基因表达模式等方面对该基因家族的特征进行了比较分析。结果表明,鉴定到37个陆地棉WOX转录因子家族基因,命名为GhWOX1~GhWOX37。亚基因组定位结果显示,37个陆地棉WOX转录因子家族基因分布在除了A04、A06、A09、D04、D06和D09号亚基因组以外的20个亚基因组,A亚组比D亚组多1个GhWOX转录因子家族基因。多重序列比对分析棉花WOX转录因子家族成员均具有高度保守的同源异型结构域;系统进化树分析发现棉花WOX转录因子家族可以分为3个亚家族(Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类),各亚类分别含有23,7,7个GhWOX转录因子家族基因成员。对NCBI中陆地棉的EST数据库比对分析,有11个GhWOX转录因子家族成员没有可匹配的EST序列,其他26个GhWOX转录因子家族成员在棉花的根、茎、叶、花、胚珠、纤维和种子等组织和器官中广泛表达。为深入研究棉花和其他植物中WOX家族的鉴定和功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 棉花 wox 花 纤维发育
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毛竹WUSCHEL-related homeobox(WOX)基因家族鉴定及表达分析 被引量：7
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作者 李晨曦 陈磊 +4 位作者 江涛 杨兆河 黄志明 苏军 刘伯斌 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期2003-2011,共9页
WOX基因家族是植物特有的转录因子家族,在干细胞分裂和分化的维持中发挥着关键作用。虽然在模式植物拟南芥和水稻中,WOX基因家族的功能已有深入的研究,但是毛竹Ph WOX基因家族的表达模式和功能仍属未知。本研究系统地分析毛竹Ph WOX基... WOX基因家族是植物特有的转录因子家族,在干细胞分裂和分化的维持中发挥着关键作用。虽然在模式植物拟南芥和水稻中,WOX基因家族的功能已有深入的研究,但是毛竹Ph WOX基因家族的表达模式和功能仍属未知。本研究系统地分析毛竹Ph WOX基因家族,首先在毛竹基因组数据库进行检索获取毛竹WOX基因家族,鉴定出毛竹基因组编码5个Ph WOX基因。通过遗传进化和基因结构分析,毛竹Ph WOX基因家族分为现代/WUS进化分支和古老进化分支。有趣的是毛竹Ph WOX基因家族在根、茎、叶和笋中广泛表达,并且在竹笋的发育过程中动态表达。本研究首次分析毛竹Ph WOX基因家族的功能,揭示了毛竹Ph WOX基因家族具有独特的进化模式和多样的表达模式,为后续探索毛竹发育的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 毛竹 wox 进化树 RT-PCR
原文传递
苦荞WOX家族全基因组鉴定及响应愈伤诱导率表达分析 被引量：5
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作者 侯思宇 王欣芳 +5 位作者 杜伟 冯晋华 韩渊怀 李红英 刘龙龙 孙朝霞 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第17期3573-3586,I0001-I0004,共18页
【目的】全基因组鉴定苦荞WOX(WUSCHEL-related homeobox)基因,揭示其基因家族成员序列特征、基因表达模式及与出愈率的相关性,为突破苦荞再生及遗传转化难题提供理论基础。【方法】基于同源性搜索策略,以拟南芥WOX基因蛋白为参考序列,... 【目的】全基因组鉴定苦荞WOX(WUSCHEL-related homeobox)基因,揭示其基因家族成员序列特征、基因表达模式及与出愈率的相关性,为突破苦荞再生及遗传转化难题提供理论基础。【方法】基于同源性搜索策略,以拟南芥WOX基因蛋白为参考序列,进行苦荞全基因组比对,获得苦荞WOX基因家族成员蛋白及核酸序列。基于蛋白同源性及保守结构域分析,鉴定出苦荞WOX基因家族所有成员。同时使用TBtools软件展示FtWOXs家族成员基因结构、保守结构域及启动子顺式作用元件特征。比较分析WOX基因家族成员在苦荞与拟南芥之间的基因组共线性。基于邻近法,利用MEGA X软件构建苦荞、拟南芥和水稻WOX基因家族成员蛋白序列系统进化树。以MS+2,4-D 3.0 mg·L^(-1)+6-BA 1.0 mg·L^(-1)为愈伤诱导培养基,下胚轴为外植体,选取70份苦荞品种诱导愈伤组织,评价不同基因型的出愈率。qRT-PCR比较分析高、低出愈率苦荞品种间FtWOXs基因表达水平。基于Pearson相关系数分析出愈率与FtWOXs基因家族成员表达相关性。【结果】共鉴定出30个苦荞WOX基因成员,在苦荞8条染色体上呈现不均匀分布。系统进化树表明30个苦荞WOX基因可划分为3大类,不同类群中WOX基因包含不同的保守结构域,主要的保守结构域为HD(Homeodomain)、START和MEKHLA结构域。保守基序分析表明,FtWOXs基因家族成员所含保守基序数目的范围为2—10个。基因结构分析表明,FtWOXs基因家族成员所含外显子数目的范围为2—18个。顺式作用元件分析表明FtWOXs基因启动子富含26个不同种类的顺式作用元件。系统进化分析表明,30个苦荞、15个拟南芥和12个水稻WOX基因家族成员可分为3类,其中第3类为苦荞独有。基因组共线性分析表明,6个WOX基因在苦荞和拟南芥之间存在基因组共线性。表达模式及相关性表明,FtWOX1/FtWOX12/FtWOX22/FtWOX23/FtWOX24与苦荞出愈率存在正相关性。【结论】苦荞FtWOXs成员存在丰富的序列变异特征,不同苦荞基因型中WOX基因表达水平及出愈率存在明显差异和一定的相关性,揭示不同苦荞WOX基因具有潜在的功能多样性。 展开更多
关键词 苦荞 wox基因 愈伤组织 基因表达
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全基因组分析杨树WOX基因家族在茎部发育中的作用 被引量：6
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作者 王爽 张洋 +2 位作者 任梦轩 刘莹莹 魏志刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期568-577,共10页
WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族是植物特有的转录因子家族,参与分生组织细胞分裂分化、初生和次生物质代谢及植物激素信号转导等多个发育过程,目前尚未有从全基因组分析该基因家族参与杨树茎部发育的相关研究。本项研究旨在对杨树WO... WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族是植物特有的转录因子家族,参与分生组织细胞分裂分化、初生和次生物质代谢及植物激素信号转导等多个发育过程,目前尚未有从全基因组分析该基因家族参与杨树茎部发育的相关研究。本项研究旨在对杨树WOX基因家族进行鉴定,在杨树基因中发现18个WOX候选基因,将这些候选基因分为三组,同一分组的大多数WOX家族成员具有相似的基因结构和保守的基序。根据不同发育阶段茎部转录组数据,系统分析了WOX家族成员在茎部不同发育阶段的特异表达情况,并采用qRT-PCR对上述结果进行了验证。结果表明,杨树WOX基因家族在茎部不同发育阶段表现出不同的表达模式,为毛果杨WOX家族的功能研究与利用奠定基础。 展开更多
关键词 毛果杨 wox基因 转录因子 表达模式
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