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温州蜜柑WAT1基因家族鉴定及果实浮皮过程中的表达分析
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作者 全岚林 张艺馨 +4 位作者 余璇 刘德春 杨莉 刘勇 胡威 《核农学报》 北大核心 2025年第8期1647-1656,I0005,I0006,共12页
宽皮柑橘浮皮与果皮细胞壁密切相关,而WAT1基因在植物细胞壁合成中发挥重要作用。为研究宽皮柑橘温州蜜柑(Citrus unshiu Marc.)WAT1基因家族特征及功能,分析WAT1基因家族与果实浮皮之间的联系,通过生物信息学方法鉴定WAT1基因家族,分... 宽皮柑橘浮皮与果皮细胞壁密切相关,而WAT1基因在植物细胞壁合成中发挥重要作用。为研究宽皮柑橘温州蜜柑(Citrus unshiu Marc.)WAT1基因家族特征及功能,分析WAT1基因家族与果实浮皮之间的联系,通过生物信息学方法鉴定WAT1基因家族,分析其核苷酸、启动子及编码蛋白特性,并通过转录组测序分析基因表达特性;同时通过赤霉素(GA_(3))和二氢茉莉酸丙酯(PDJ)处理研究WAT1基因表达与果实浮皮的关系。共鉴定出35个温州蜜柑WAT1家族成员,基因外显子数量大多为6和7个,编码的氨基酸长度为125~885 aa,等电点为5.55~9.98,均为疏水蛋白,蛋白质预测主要定位于质膜、液泡膜和叶绿体。WAT1家族基因启动子含大量MYB响应元件、激素响应等元件,推测其在温州蜜柑生长发育及其他涉及细胞壁合成与代谢等生理活动中均发挥重要作用。Ⅰ类和Ⅱ类WAT1基因表达具有明显时空差异性,其表达量的变化与浮皮发生的趋势相反,表明其可能在浮皮调控中发挥关键作用。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了6个WAT1s基因在GA_(3)和PDJ处理下果皮油胞层和白皮层中的表达规律,发现2个基因(MSYJ255930和MSYJ180350)在不同组织中的表达量均显著升高且始终高于对照,同时果实浮皮指数始终低于对照。结合启动子元件分析及基因表达特点,推测MSYJ255930和MSYJ180350受GA_(3)和PDJ诱导参与温州蜜柑果实浮皮发生的调控。本研究为揭示宽皮柑橘浮皮发生分子机制奠定了理论基础,为宽皮柑橘遗传改良提供了参考依据。 展开更多
关键词 宽皮柑橘 浮皮 细胞壁 wat1基因家族 基因表达
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巨桉EgrWAT1基因克隆和功能初步分析 被引量:1
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作者 张昊楠 陈珊珊 +4 位作者 徐建民 罗萍 王晓萍 许志茹 范春节 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期601-611,共11页
为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以... 为探究WALLS ARE THIN(WAT1)在木本植物中木材形成以及响应胁迫中的作用,利用生物信息学工具进行分析,并以巨桉(Eucalyptus grandis)为材料克隆EgrWAT1S及其另一转录本EgrWAT1L,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)探究其在不同组织、节间以及响应胁迫时的表达模式。结果表明:EgrWAT1S在韧皮部表达量较高,而EgrWAT1L主要表达在根部。在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)处理和盐胁迫以及缺磷、缺硼处理时,其表达存在着明显不同的模式,在MeJA、SA处理时甚至存在着相反的表达模式。这些结果表明EgrWAT1L基因可能通过转录调控来影响EgrWAT1S表达和进一步的蛋白翻译来响应激素和胁迫处理。为进一步研究WAT1基因在巨桉生长发育过程中的作用和调控方式提供基础,也为将来桉树的分子育种提供可能。 展开更多
关键词 巨桉 wat1 可变剪切 基因克隆 表达模式
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陆地棉GHWAT1-35基因的克隆及亚细胞定位
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作者 马尚洁 李生梅 +4 位作者 杨涛 王红刚 赵康 庞博 高文伟 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1310-1317,共8页
【目的】研究陆地棉GHWAT1-35基因在棉花纤维发育过程中的作用。【方法】选用陆地棉系9花后不同时期的纤维为材料,克隆GHWAT1-35基因的全长cDNA序列,并进行生物信息学、实时荧光定量(qRT-PCR)分析及亚细胞定位。【结果】该基因全长1125 ... 【目的】研究陆地棉GHWAT1-35基因在棉花纤维发育过程中的作用。【方法】选用陆地棉系9花后不同时期的纤维为材料,克隆GHWAT1-35基因的全长cDNA序列,并进行生物信息学、实时荧光定量(qRT-PCR)分析及亚细胞定位。【结果】该基因全长1125 bp,编码374个氨基酸,相对分子量为40.231 kDa,理论等电点为8.74。GHWAT1-35蛋白与亚洲棉亲缘关系最近。GHWAT1-35基因在开花后15 d表达量显著升高,亚细胞定位预测表明该蛋白定位于细胞质膜上。将GHWAT1-35基因与pCAMIA1300-35S-YFP载体重组,构建融合表达载体,利用冻融法转化农杆菌,注射到烟草后观察到GHWAT1-35蛋白定位在细胞质膜上。【结论】陆地棉系9 GHWAT1-35基因在开花后15和20 DAP的表达量显著高于其他时期,pC1300∷35S-WAT-YFP融合蛋白定位于细胞质膜上。 展开更多
关键词 陆地棉 wat1 基因克隆 生物信息学 亚细胞定位
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