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玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析 被引量:1
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作者 路媛媛 孙承龙 +5 位作者 谭玉琴 魏文杰 史咸春 宋艳波 李丽 刘振宇 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第2期56-64,共9页
[目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体,为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢菌致病性的分子机制奠定基础。[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列,对其进行生物信息学分析,包括蛋白质的性质、保守区域、磷酸化位... [目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体,为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢菌致病性的分子机制奠定基础。[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列,对其进行生物信息学分析,包括蛋白质的性质、保守区域、磷酸化位点、亚细胞定位、跨膜结构域和聚类分析,分析其基因功能。并采用同源互补原理构建CzVelB基因敲除载体,最终采用农杆菌介导遗传转化技术进行基因敲除。[结果]CzVelB基因编码385 AA,预测pI和MW分别为9.05和42.13645 kDa,是亲水性蛋白,无跨膜结构域。在亚细胞水平上,CzVelB定位在细胞核中。在氨基酸序列方面,具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;在功能上具有2个Velevt的保守结构域,并与Aspergillus flavus、A.niger亲缘关系较近,具有较高同源性。根据CzVelB基因序列设计特异性引物,扩增侧翼片段和标记基因,分别连入骨架载体pPZP100中,成功构建CzVelB基因的敲除载体,最终利用ATMT技术获得其敲除转化子。[结论]本文系统研究玉蜀黍尾孢菌VelB基因功能,并成功构建其敲除载体,获得敲除转化子,为后续研究CzVelB基因功能提供基础材料。 展开更多
关键词 玉蜀黍尾孢菌 velb 生物信息学 敲除载体 敲除突变体
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VeA、VelB蛋白在真菌中的研究进展 被引量:4
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作者 何霞 黄汇惠 +1 位作者 马鹏 王丽玲 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2023年第7期163-168,共6页
天然的丝状真菌是我国重要的微生物资源,能产生大量有益的初生、次生代谢产物,其代谢受到各类调控因子的调控。天鹅绒(Velvet)蛋白家族是真菌中最独特且高度保守的一类特殊调控蛋白,可调控真菌的生长、分化和次生代谢物的生物合成。该... 天然的丝状真菌是我国重要的微生物资源,能产生大量有益的初生、次生代谢产物,其代谢受到各类调控因子的调控。天鹅绒(Velvet)蛋白家族是真菌中最独特且高度保守的一类特殊调控蛋白,可调控真菌的生长、分化和次生代谢物的生物合成。该文结合国内外的研究进展综述Velvet蛋白家族Velvet A(VeA)、Velvet like B(VelB)在真菌中的结构及其蛋白复合物对生长发育和次生代谢的调控作用,可为进一步探索Velvet蛋白家族调控真菌次生代谢物的生物合成通路、激活沉默基因簇、挖掘新的化合物提供参考。 展开更多
关键词 天鹅绒蛋白家族 丝绒蛋白 次生代谢 Velvet A(VeA) Velvet like B(velb)
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基于比较基因组学的红曲霉VeA、VelB生物信息学分析
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作者 黄汇惠 何霞 +4 位作者 王丽玲 冉珍艳 王文华 何毅 李牧 《食品研究与开发》 CAS 2024年第20期191-201,共11页
红曲霉(Monascus spp.)是一种可产生红曲色素(monascus pigments,MPs)、莫纳可林K(moncolin K,MK)、γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)等多种有益代谢产物的工业用重要生产菌种。该文对4株高产红色素的红曲霉(M7、NRRL 1597、NRRL... 红曲霉(Monascus spp.)是一种可产生红曲色素(monascus pigments,MPs)、莫纳可林K(moncolin K,MK)、γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)等多种有益代谢产物的工业用重要生产菌种。该文对4株高产红色素的红曲霉(M7、NRRL 1597、NRRL 1596、YY-1)全局调控因子VeA、VelB进行基因组学分析。结果表明:4株红曲霉VeA基因编码的蛋白均含有1个天鹅绒(velvet)结构域、核定位信号(nuclear localization signal,NLS)和不稳定的富脯氨酸区域(proline-,glutamic acid-,serine-,and threonine-rich sequence,PEST);VelB基因编码的蛋白含有2个velvet结构域,不含NLS区域。VeA蛋白与典型丝状真菌的VeA蛋白相似度为37.4%~62.5%;红曲霉VelB蛋白与典型丝状真菌相似度为51.2%~84.1%,这说明红曲霉VeA蛋白和VelB蛋白具有类似于其它丝状真菌的功能。红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白的一级结构主要由脯氨酸和丝氨酸组成,不含明显跨膜结构域和信号肽;红曲霉VeA蛋白主要位于细胞核内,VelB蛋白在细胞核和细胞质均有分布;VeA蛋白和VelB蛋白均具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;VeA蛋白二级结构主要为β-折叠和无规则卷曲结构,VelB蛋白主要为α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构;红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白三级结构模型与典型丝状真菌VeA蛋白、VelB蛋白三级结构模型相似,蛋白相互作用网络预测VeA蛋白和VelB蛋白间可以相互作用。上述分析结果推测红曲霉VeA蛋白、VelB蛋白的功能及作用机理可能与其它真菌相似,具有调控菌株的生长发育、次级代谢等功能。 展开更多
关键词 红曲霉 VeA蛋白 velb蛋白 生物信息学 全局调控因子
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