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VPS72在肝细胞癌中的预后意义及其与免疫浸润的相关性的生物信息学分析
1
作者 陈琼 王聪聪 +1 位作者 张楠楠 杨鹏 《亚洲急诊医学病例研究》 2026年第1期28-36,共9页
背景:VPS72是EP400和Snf2相关的CBP激活蛋白(SRCAP)染色质重塑复合物的组成部分。目前,VPS72在肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, LIHC)中的预后价值尚不明确。方法:本研究利用ONCOMINE、UALCAN、GEPIA、STRING和TIMER等多个公共数据... 背景:VPS72是EP400和Snf2相关的CBP激活蛋白(SRCAP)染色质重塑复合物的组成部分。目前,VPS72在肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, LIHC)中的预后价值尚不明确。方法:本研究利用ONCOMINE、UALCAN、GEPIA、STRING和TIMER等多个公共数据库,系统分析了VPS72在肝细胞癌中的表达特征及其临床意义。结果:分析后发现,在肝细胞癌(LIHC)中,VPS72的过表达与临床分期和病理分级显著相关,且其mRNA高表达与患者总生存期缩短密切相关。此外,VPS72启动子区在肝癌中存在明显的高甲基化改变。进一步分析显示,VPS72的表达与LIHC中B细胞、CD4⁺ T细胞、CD8⁺ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平呈显著正相关。最后通过STRING数据库还构建了VPS72的蛋白质相互作用网络。结论:VPS72可能作为LIHC患者预后判断和免疫治疗靶点的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 vps72 肝细胞癌 生物信息学 预后价值
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组蛋白伴侣VPS72驱动H2AFZ的表达并协同促进肝癌进展
2
作者 吕垒 冯啸 +4 位作者 何凯明 高成立 杨洲 贾昌昌 傅斌生 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 CAS 2024年第2期220-226,共7页
目的:探讨组蛋白伴侣VPS72和H2AFZ在肝细胞癌(肝癌)的表达调控和促进肝癌发展的机制。方法:利用Lenti-shNC和Lenti-shVPS72-1、Lenti-shVPS72-2慢病毒感染相对高表达VPS72的肝癌细胞系SNU398、Hep3B、SNU449,构建VPS72稳定敲低肝癌细胞... 目的:探讨组蛋白伴侣VPS72和H2AFZ在肝细胞癌(肝癌)的表达调控和促进肝癌发展的机制。方法:利用Lenti-shNC和Lenti-shVPS72-1、Lenti-shVPS72-2慢病毒感染相对高表达VPS72的肝癌细胞系SNU398、Hep3B、SNU449,构建VPS72稳定敲低肝癌细胞系,并使用qRT-PCR和Western blot在转录水平和蛋白水平验证敲低效率。采用CCK-8实验、平板克隆实验、划痕实验、Transwell迁移实验检测各种处理下肝癌细胞的增殖迁移能力,并通过回复实验验证VPS72与H2AFZ的调控关系。使用qRT-PCR、Western blot在转录水平和蛋白水平检测不同分组肝癌细胞VPS72、H2AFZ的表达情况。多组间实验数据比较采用方差分析。结果:Lenti-shNC和Lenti-shVPS72-1、Lenti-shVPS72-2慢病毒感染相对高表达VPS72的肝癌细胞系SNU398、Hep3B、SNU449,成功构建了VPS72稳定敲低肝癌细胞系。Lenti-shVPS72-1、Lenti-shVPS72-2相较于对照组Lenti-shNC均成功干扰了VPS72的表达,并且敲低VPS72明显抑制了H2AFZ的表达,这一结果在3种细胞系中均得到验证。在SNU398细胞中,相较于对照组Lenti-shNC,Lenti-shVPS72-2组的H2A.Z红色荧光减弱,并证明H2A.Z的亚细胞定位在细胞核。细胞增殖实验和克隆形成实验证明,敲低VPS72明显抑制Hep3B、SNU449细胞的增殖能力。细胞划痕实验和Transwell迁移实验证明,与对照组Lenti-shNC相比,Hep3B、SNU449细胞的Lenti-shVPS72-1、Lenti-shVPS72-2组的迁移能力被明显抑制。H2AFZ过表达回复实验显示Hep3B、SNU449被抑制的增殖、迁移表型并未完全缓解,提示VPS72与H2AFZ之间存在潜在协同作用。结论:组蛋白伴侣VPS72可驱动肝癌组蛋白变体H2AZ1的表达,并可能与H2AFZ协同促进肝癌进展,VPS72可作为肝癌表观遗传治疗靶点。 展开更多
关键词 癌 肝细胞 组蛋白伴侣 组蛋白变体 vps72基因 H2AFZ基因
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非洲猪瘟病毒荧光量子点检测试纸条的研制 被引量：5
3
作者 徐志远 施远国 +5 位作者 陈兵 孙洁 周华亮 秦智锋 刘宵 娄华 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期419-425,共7页
根据非洲猪瘟病毒(ASFV)VP72蛋白的氨基酸序列筛选合成多肽,并与载体蛋白BSA进行偶联,将以此得到的多肽作为抗原免疫小鼠,用来制备鼠源抗ASFV VP72蛋白的单克隆抗体。将上述方法制备的针对ASFV VP72蛋白的单抗作为荧光量子点标记的抗体... 根据非洲猪瘟病毒(ASFV)VP72蛋白的氨基酸序列筛选合成多肽,并与载体蛋白BSA进行偶联,将以此得到的多肽作为抗原免疫小鼠,用来制备鼠源抗ASFV VP72蛋白的单克隆抗体。将上述方法制备的针对ASFV VP72蛋白的单抗作为荧光量子点标记的抗体,以与这种标记单抗互相配对的另一单抗包被检测线(T线),采用山羊抗鼠二抗Ig G包被质控线(C线),建立了一种简便、快速、准确的用于ASFV抗原检测的荧光量子点免疫层析试纸条。结果表明,制备的试纸条对于猪瘟等8种猪常见疫病免疫用灭活疫苗检测时无交叉反应;可检测到8μg/m L的VP72重组蛋白;与商品化的ASFV荧光定量PCR检测试剂盒进行比对检测,其对临床样品检测的阳性符合率为82.1%(23/28),阴性符合率为93.8%(75/80)。该试纸条特异性好、灵敏度高以及稳定性好,为ASFV的现场快速初步诊断提供了一种技术支持。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 VP72 单克隆抗体 荧光量子点 试纸条
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非洲猪瘟病毒PCR检测方法的建立 被引量：7
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作者 李云灿 胡剑武 +1 位作者 赵俊龙 李家奎 《动物医学进展》 北大核心 2021年第5期5-8,共4页
非洲猪瘟给全球养猪业造成了严重危害,需要建立更加敏感的PCR检测方法。根据非洲猪瘟病毒(ASFV)的VP72基因序列,设计PCR引物,建立了ASFV PCR检测方法。以合成的VP72基因片段为阳性对照,进行敏感性试验和特异性试验。同时与世界动物卫生... 非洲猪瘟给全球养猪业造成了严重危害,需要建立更加敏感的PCR检测方法。根据非洲猪瘟病毒(ASFV)的VP72基因序列,设计PCR引物,建立了ASFV PCR检测方法。以合成的VP72基因片段为阳性对照,进行敏感性试验和特异性试验。同时与世界动物卫生组织(OIE)推荐的PCR引物进行对比试验。结果显示,建立的方法可用于ASFV检测,且对其他病毒检测时无交叉反应,特异性良好;敏感性可达到10-8,比OIE推荐的方法高10倍,为ASFV检测提供了一种新的PCR方法。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 聚合酶链反应 VP72基因
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基于VP72基因的非洲猪瘟PCR检测方法的建立与应用
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作者 张森 欧婧 《当代畜牧》 2021年第1期18-20,共3页
基层兽医快速准确诊断非洲猪瘟,可以加强地方兽医部门的疫情防控能力。笔者以非洲猪瘟结构基因VP72部分序列为检测靶基因,设计特异性引物,优化反应条件,建立常规PCR检测方法。笔者应用新建的检测方法,检测了贵州境内采集的5份病料,其中... 基层兽医快速准确诊断非洲猪瘟,可以加强地方兽医部门的疫情防控能力。笔者以非洲猪瘟结构基因VP72部分序列为检测靶基因,设计特异性引物,优化反应条件,建立常规PCR检测方法。笔者应用新建的检测方法,检测了贵州境内采集的5份病料,其中4份阴性,1份阳性,与非洲猪瘟荧光实时定量PCR复检结果一致。结果表明,笔者新建的PCR检测方法特异性好,与其他病原无交叉性,快捷便利。同时也表明,贵州非洲猪瘟疫情暴发压力较大,应加强疫情防范和扑灭工作。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 VP72 PCR
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