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VCY通过液-液相分离参与mRNA剪接增强NCCIT细胞迁移和侵袭能力的研究
1
作者
高帆
田爽
+5 位作者
王琬瑶
熊昌欢
刘小萌
周一平
李鲲鹏
时文涛
《天津医科大学学报》
2025年第4期349-357,共9页
目的:探究可变电荷Y(VCY)的液-液相分离特性及其对畸胎瘤细胞系NCCIT细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,并探索其发挥作用的分子机制。方法:应用原核表达系统表达VCY蛋白,蛋白纯化后在缓冲液中检测其相分离特性。在NCCIT细胞中外源性表达V...
目的:探究可变电荷Y(VCY)的液-液相分离特性及其对畸胎瘤细胞系NCCIT细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,并探索其发挥作用的分子机制。方法:应用原核表达系统表达VCY蛋白,蛋白纯化后在缓冲液中检测其相分离特性。在NCCIT细胞中外源性表达VCY(记作NCCIT VCY组),并设NCCIT Vector组和NCCIT组为对照组。通过免疫荧光技术检测细胞内VCY定位及相分离能力。应用基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析VCY对NCCIT细胞转录组的影响;通过CCK8实验和Transwell实验检测VCY对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。应用rMATS软件分析转录组测序数据,探索VCY对选择性剪接的调控;设计外显子特异性引物,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证VCY对STMN2 pre-mRNA选择性剪接的具体影响。结果:VCY的氨基酸序列中包含固有无序区域,在缓冲液和NCCIT细胞中均可发生液-液相分离;外源性VCY表达在转录组水平引起NCCIT细胞的38个基因表达上调(|log2FC|>1,q<0.05),50个基因表达下调(|log2FC|>1,q<0.05);GO和KEGG富集分析发现VCY主要参与调控细胞增殖、细胞黏附等信号通路(q<0.01);与NCCIT组和NCCIT Vector组细胞相比,NCCIT VCY组细胞增殖(F=92.79,P<0.0001)、迁移(F=42.57,P<0.001)和侵袭(F=206.10,P<0.0001)能力显著提高。VCY参与STMN2基因的选择性剪接过程,使细胞中STMN2-001转录本水平提高,对STMN2-007和STMN2-008转录本无影响。结论:VCY作为一种癌-睾丸抗原,通过液-液相分离参与STMN2等基因的选择性剪接,促进NCCIT细胞的增殖、迁移和侵袭。
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关键词
癌-睾丸抗原
vcy
液-液相分离
畸胎瘤
选择性剪接
暂未订购
基于MRI影像的膀胱肿瘤三维形态变化的初步研究
2
作者
张曦
刘洋
+1 位作者
张国鹏
卢虹冰
《医疗卫生装备》
CAS
2014年第3期1-6,共6页
目的:从膀胱的MRI影像中挖掘膀胱壁的厚度变化信息和形状变化信息,为膀胱肿瘤的计算机辅助诊断提供理论依据。方法:获取膀胱核磁共振图像并进行膀胱壁的手工分割,计算与分析膀胱壁的三维厚度值、相对厚度值及其导数变化,并结合形状指数...
目的:从膀胱的MRI影像中挖掘膀胱壁的厚度变化信息和形状变化信息,为膀胱肿瘤的计算机辅助诊断提供理论依据。方法:获取膀胱核磁共振图像并进行膀胱壁的手工分割,计算与分析膀胱壁的三维厚度值、相对厚度值及其导数变化,并结合形状指数找出膀胱壁组织与肿瘤组织的形状变化趋势。结果:患者与志愿者之间的膀胱壁的三维厚度值存在统计学差异:当某体素的相对厚度值NBWT>1.5时,位于肿瘤主体区域的可能性很大;当某体素的相对厚度值的导数为>0.1或<-0.1的任意一种情况时,位于肿瘤组织与正常壁组织的过渡区域的可能性很大。利用SI也可达到筛选肿瘤疑似区域的目的。结论:膀胱壁的三维厚度、相对厚度和形状指数可作为区分膀胱壁的正常组织和肿瘤组织的特征指标。
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关键词
膀胱肿瘤
MRI
虚拟膀胱镜
三维形态特征
暂未订购
题名
VCY通过液-液相分离参与mRNA剪接增强NCCIT细胞迁移和侵袭能力的研究
1
作者
高帆
田爽
王琬瑶
熊昌欢
刘小萌
周一平
李鲲鹏
时文涛
机构
天津医科大学基础医学院遗传学系
出处
《天津医科大学学报》
2025年第4期349-357,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32170649)。
文摘
目的:探究可变电荷Y(VCY)的液-液相分离特性及其对畸胎瘤细胞系NCCIT细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响,并探索其发挥作用的分子机制。方法:应用原核表达系统表达VCY蛋白,蛋白纯化后在缓冲液中检测其相分离特性。在NCCIT细胞中外源性表达VCY(记作NCCIT VCY组),并设NCCIT Vector组和NCCIT组为对照组。通过免疫荧光技术检测细胞内VCY定位及相分离能力。应用基因本体(GO)功能分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析VCY对NCCIT细胞转录组的影响;通过CCK8实验和Transwell实验检测VCY对细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。应用rMATS软件分析转录组测序数据,探索VCY对选择性剪接的调控;设计外显子特异性引物,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)验证VCY对STMN2 pre-mRNA选择性剪接的具体影响。结果:VCY的氨基酸序列中包含固有无序区域,在缓冲液和NCCIT细胞中均可发生液-液相分离;外源性VCY表达在转录组水平引起NCCIT细胞的38个基因表达上调(|log2FC|>1,q<0.05),50个基因表达下调(|log2FC|>1,q<0.05);GO和KEGG富集分析发现VCY主要参与调控细胞增殖、细胞黏附等信号通路(q<0.01);与NCCIT组和NCCIT Vector组细胞相比,NCCIT VCY组细胞增殖(F=92.79,P<0.0001)、迁移(F=42.57,P<0.001)和侵袭(F=206.10,P<0.0001)能力显著提高。VCY参与STMN2基因的选择性剪接过程,使细胞中STMN2-001转录本水平提高,对STMN2-007和STMN2-008转录本无影响。结论:VCY作为一种癌-睾丸抗原,通过液-液相分离参与STMN2等基因的选择性剪接,促进NCCIT细胞的增殖、迁移和侵袭。
关键词
癌-睾丸抗原
vcy
液-液相分离
畸胎瘤
选择性剪接
Keywords
cancer-testis antigen
vcy
liquid-liquid separation
embryonal carcinoma
alternative splicing
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
暂未订购
题名
基于MRI影像的膀胱肿瘤三维形态变化的初步研究
2
作者
张曦
刘洋
张国鹏
卢虹冰
机构
第四军医大学生物医学工程学院
出处
《医疗卫生装备》
CAS
2014年第3期1-6,共6页
基金
国家自然科学基金(81230035
81071220)
文摘
目的:从膀胱的MRI影像中挖掘膀胱壁的厚度变化信息和形状变化信息,为膀胱肿瘤的计算机辅助诊断提供理论依据。方法:获取膀胱核磁共振图像并进行膀胱壁的手工分割,计算与分析膀胱壁的三维厚度值、相对厚度值及其导数变化,并结合形状指数找出膀胱壁组织与肿瘤组织的形状变化趋势。结果:患者与志愿者之间的膀胱壁的三维厚度值存在统计学差异:当某体素的相对厚度值NBWT>1.5时,位于肿瘤主体区域的可能性很大;当某体素的相对厚度值的导数为>0.1或<-0.1的任意一种情况时,位于肿瘤组织与正常壁组织的过渡区域的可能性很大。利用SI也可达到筛选肿瘤疑似区域的目的。结论:膀胱壁的三维厚度、相对厚度和形状指数可作为区分膀胱壁的正常组织和肿瘤组织的特征指标。
关键词
膀胱肿瘤
MRI
虚拟膀胱镜
三维形态特征
Keywords
bladder tumor
MRI
vcy
3D morphological feature
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
R445.2 [医药卫生—影像医学与核医学]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
VCY通过液-液相分离参与mRNA剪接增强NCCIT细胞迁移和侵袭能力的研究
高帆
田爽
王琬瑶
熊昌欢
刘小萌
周一平
李鲲鹏
时文涛
《天津医科大学学报》
2025
0
暂未订购
2
基于MRI影像的膀胱肿瘤三维形态变化的初步研究
张曦
刘洋
张国鹏
卢虹冰
《医疗卫生装备》
CAS
2014
0
暂未订购
已选择
0
条
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引证文献
统计分析
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