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实时荧光定量PCR扩增特异性vapA基因检测杀鲑气单胞菌 被引量:7
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作者 刘帅 王荻 +4 位作者 卢彤岩 曹永生 杨晨 朱国建 李绍戊 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1928-1935,共8页
为实现杀鲑气单胞菌早期快速准确定量检测,研究旨在建立杀鲑气单胞菌的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测方法。根据GenBank中杀鲑气单胞菌毒力阵列蛋白基因(vapA)保守序列设计并合成一对特异性引物,对其特异性、灵敏度... 为实现杀鲑气单胞菌早期快速准确定量检测,研究旨在建立杀鲑气单胞菌的SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测方法。根据GenBank中杀鲑气单胞菌毒力阵列蛋白基因(vapA)保守序列设计并合成一对特异性引物,对其特异性、灵敏度、可重复性和应用性进行评价。结果显示,研究设计的引物具有良好的种间特异性,仅对杀鲑气单胞菌及其亚种有阳性扩增,与其他细菌不发生交叉反应。构建的Real-time PCR标准曲线质粒拷贝数与循环阈值呈良好的线性关系,扩增所得标准曲线分别为y=–4.8345x+42.535,相关系数R^2为0.998,最低检测限为34拷贝/μL,较常规PCR的灵敏度高出约1000倍。应用建立的方法检测人工感染的虹鳟病样,15个被检样品呈阳性反应,与细菌常规鉴定方法结果一致。研究表明,所建立的基于实时荧光定量PCR技术的杀鲑气单胞菌检测方法快速、特异、灵敏,可用于临床诊断和疫病监测。 展开更多
关键词 虹鳟 杀鲑气单胞菌 vapa基因 实时荧光定量PCR
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海氏迪茨菌株中VapA/VapB基因质粒子的表达及临床药敏试验结果分析
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作者 周翔 梁剑平 +3 位作者 冉茂胜 陆锡宏 李雪虎 王曙阳 《兰州大学学报(医学版)》 CAS 2012年第2期10-14,共5页
目的探讨海氏迪茨菌株中VapA/VapB基因质粒子的表达及临床药物敏感性。方法利用16SrRNA技术,采用马红球菌株ATCC133701p+为应变标准,评价海氏迪茨菌株分子性状,纸片扩散法进行药敏试验。结果海氏迪茨菌株与马红球菌株的相似度为80%,对... 目的探讨海氏迪茨菌株中VapA/VapB基因质粒子的表达及临床药物敏感性。方法利用16SrRNA技术,采用马红球菌株ATCC133701p+为应变标准,评价海氏迪茨菌株分子性状,纸片扩散法进行药敏试验。结果海氏迪茨菌株与马红球菌株的相似度为80%,对万古霉素、利福平、环丙沙星、氧氟沙星、氯霉素、头孢三嗪的耐药率为0,对复方磺胺甲嗯唑、青霉素G的耐药率为100%,红霉素耐药率为7.3%,头孢他定耐药率为11.5%,阿米卡星耐药率为23.7%,头孢噻吩耐药率为32.7%,头孢唑啉、苯唑西林、氨苄西林耐药率为65.5%~91.8%。结论海氏迪茨菌株与马红球菌株的相似性为80%,是马、猪、牛等动物的致病菌,也是人类罕见的致病菌,能够引起呼吸道、尿道感染和败血症等。在临床应用抗生素时,应根据药敏试验结果选用,可延缓该菌耐药性的产生。 展开更多
关键词 海氏迪茨菌株 vapa/VapB基因质粒子 药敏试验
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稳定表达马红球菌VapA蛋白细胞系的建立及其对巨噬细胞自噬的影响 被引量:1
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作者 冯婷婷 郝秀静 +2 位作者 徐兆坤 李敏 罗海霞 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期601-607,共7页
通过构建稳定表达VapA蛋白的J774A.1巨噬细胞系,探究马红球菌VapA蛋白对巨噬细胞自噬的影响。构建vapA基因的重组慢病毒载体pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro-vapA,将其转染J774A.1细胞,经过嘌呤霉素筛选重组细胞,利用RT-PCR、Western-blot和免疫... 通过构建稳定表达VapA蛋白的J774A.1巨噬细胞系,探究马红球菌VapA蛋白对巨噬细胞自噬的影响。构建vapA基因的重组慢病毒载体pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro-vapA,将其转染J774A.1细胞,经过嘌呤霉素筛选重组细胞,利用RT-PCR、Western-blot和免疫荧光鉴定重组细胞系中VapA蛋白的表达;利用RT-PCR检测自噬相关基因LC3-Ⅱ、p62、Beclin1、Atg5及Atg7的表达情况,明确VapA蛋白对巨噬细胞自噬的影响。结果显示,本研究成功构建了稳定表达VapA蛋白的J774A.1巨噬细胞系;与对照组相比,Vap A蛋白稳转细胞系中自噬相关基因LC3-Ⅱ、Beclin1、Atg5及Atg7的m RNA表达量显著降低,p62无显著差异。上述结果表明,本研究通过VapA蛋白的体外细胞模型发现,VapA在转录水平抑制巨噬细胞自噬,为VapA蛋白在巨噬细胞内的功能研究及马红球菌的致病机制研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 马红球菌 vapa蛋白 稳转细胞株 巨噬细胞 自噬
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circVAPA通过miR-101a-3p/TEAD3轴促进Hippo通路抑制肝再生的机制研究
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作者 赵健 代云红 党彦丽 《重庆医学》 2025年第5期1050-1058,共9页
目的探讨环状RNA(circ)VAPA通过miR-101 a-3p/TEAD3轴促进Hippo通路抑制肝再生的分子机制。方法构建70%肝切除再生小鼠模型,分析circVAPA、miR-101 a-3p、TEAD3表达;利用siRNA或过表达质粒转染小鼠胚胎肝细胞BNL CL.2细胞,分为VAPA-NC组... 目的探讨环状RNA(circ)VAPA通过miR-101 a-3p/TEAD3轴促进Hippo通路抑制肝再生的分子机制。方法构建70%肝切除再生小鼠模型,分析circVAPA、miR-101 a-3p、TEAD3表达;利用siRNA或过表达质粒转染小鼠胚胎肝细胞BNL CL.2细胞,分为VAPA-NC组、VAPA-NC+miR-101a-3p mimic组、VAPA-NC+miR-101a-3p mimic-NC组、VAPA-OE组、VAPA-OE+miR-101a-3p mimic组和VAPA-OE+miR-101 a-3p mimic-NC组。CCK-8法和流式细胞术分析肝细胞增殖、凋亡和细胞周期变化,免疫荧光染色分析YAP1核移位,实时荧光定量逆转录-PCR(q RT-PCR)分析Hippo通路关键基因表达,双荧光素酶报告基因实验验证circVAPA与miR-101 a-3p、miR-101 a-3p与TEAD3的靶向关系。结果肝再生过程中circVAPA水平逐渐升高(P<0.05),miR-101 a-3p则先升高后下降(P<0.05)。miR-101 a-3p过表达时细胞增殖速率最高(P<0.05),但不影响细胞凋亡率(P>0.05);过表达circVAPA对增殖速率和细胞凋亡无影响(P>0.05),同时过表达circVAPA和miR-101 a-3p时细胞增殖速率明显下降,而细胞凋亡明显增加(P<0.05);过表达miR-101 a-3p时细胞大量进入S期,同时过表达circVAPA和miR-101 a-3p时细胞大量阻滞于G2/M期。Hippo上游基因YAP1磷酸化水平在肝再生6 h明显升高(P<0.05),随后快速下降,但过表达circVAPA和miR-101a-3p不影响p-YAP1水平和YAP1核移位情况(P>0.05)。Hippo下游基因CTGF和转录因子TEAD3表达水平在肝再生过程中先升高后下降(P<0.05),CYR61无明显变化(P>0.05);同时过表达circVAPA和miR-101 a-3p后CTGF表达水平升高(P<0.05);敲低或过表达circVAPA均不影响TEAD3的表达(P>0.05),而过表达miR-101 a-3p可明显抑制TEAD3表达水平(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验证实circVAPA与miR-101 a-3p、miR-101 a-3p与TEAD3存在靶向关系。结论circVAPA通过miR-101 a-3p/TEAD3轴促进Hippo通路抑制肝再生。 展开更多
关键词 环状RNA circ vapa miR-101 a-3p/TEAD3轴 Hippo通路 肝再生
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内质网蛋白VAPA影响小鼠精子顶体生成的机制研究
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作者 李瑾瑜 汤宁远 +1 位作者 丁之德 刘悦 《中国男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第4期10-14,32,共6页
目的探究内质网蛋白VAPA(Vesicle-associated membrane protein-associated protein A)对小鼠精子形成的影响。方法通过loxP-cre策略构建生精细胞特异的Vapa条件性基因敲除(Vapa CKO)小鼠模型;野生型和Vapa CKO成年雄性小鼠睾丸进行称... 目的探究内质网蛋白VAPA(Vesicle-associated membrane protein-associated protein A)对小鼠精子形成的影响。方法通过loxP-cre策略构建生精细胞特异的Vapa条件性基因敲除(Vapa CKO)小鼠模型;野生型和Vapa CKO成年雄性小鼠睾丸进行称重并统计分析;HE染色观察野生型和Vapa CKO成年雄性小鼠生精上皮形态;免疫荧光染色和透射电镜观察检测野生型和Vapa CKO成年雄性小鼠顶体的生成状况。结果生精细胞VAPA蛋白缺失时,小鼠睾丸重量明显减轻(P<0.0001);精子发生阻滞于圆形精子细胞,尤其是圆形精子细胞无法生成顶体。结论内质网蛋白VAPA参与小鼠的精子形成,并在顶体生成中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 内质网蛋白vapa 精子发生 顶体生成 不育 男性 小鼠
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囊泡相关膜蛋白A调控牛病毒性腹泻病毒复制 被引量:2
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作者 史慧君 袁圆圆 +4 位作者 郭妍婷 陈俊贞 杨莉 冉多良 付强 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期635-644,共10页
[背景]牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)是致犊牛腹泻的重要病原之一,而目前BVDV与宿主因子互作机理研究较少,成为限制BVDV防控的重要原因。[目的]探明囊泡相关膜蛋白A(vesicle-associated membrane protein A,VAPA)... [背景]牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)是致犊牛腹泻的重要病原之一,而目前BVDV与宿主因子互作机理研究较少,成为限制BVDV防控的重要原因。[目的]探明囊泡相关膜蛋白A(vesicle-associated membrane protein A,VAPA)对BVDV复制的影响。[方法]根据GenBank中VAPA基因,使用Benchling和CHOPCHOP等平台设计靶向VAPA的向导RNA(small guide RNA,sgRNA),融合后克隆至慢病毒lentiCRISPR v2载体中,包装慢病毒后感染牛肾细胞(Madin-Darby bovine kidney,MDBK),使用嘌呤霉素连续筛选5代,使用Western Blot检测VAPA蛋白敲除(knockout,KO)情况;BVDV感染VAPA KO细胞不同时间后,收集细胞提取总RNA,并将等质量的RNA反转录成cDNA,使用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)和免疫荧光分析(immunofluorescence assay,IFA)分别检测BVDV 5’-非翻译区(untranslated region,UTR)mRNA水平和双链RNA(double strand RNA,dsRNA)积累水平,于BVDV感染后不同时间观察致细胞病变(cytopathic effect,CPE)情况,并收集子代病毒液,使用Reed-Muench法计算子代病毒滴度变化。接种等量VAPAKO和乱码序列对照scramble细胞后不同时间进行活细胞计数,检测VAPA KO是否影响细胞活性。[结果]慢病毒感染后使用嘌呤霉素筛选,Western Blot检测VAPA蛋白明显降低,成功获得VAPAKO细胞;与对照scramble细胞相比,BVDV感染VAPAKO细胞后5’-UTR mRNA水平和dsRNA积累量均显著性降低,BVDV感染造成的CPE明显推迟并减轻,子代病毒滴度在12 h和36 h显著下降,在48 h极显著下降;与scramble细胞相比,VAPA KO细胞活性未受影响。[结论]VAPAKO后显著性抑制BVDV复制,为BVDV防控新技术的建立提供重要靶标。 展开更多
关键词 囊泡相关膜蛋白A 牛病毒性腹泻病毒 复制水平 双链RNA 病毒滴度
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