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Deficiency of LncRNA-CIRBIL promotes J-wave syndrome by enhancing transmural heterogeneity of I_(to)current:LncCIRBIL regulates J-wave syndrome via UPF1
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作者 Xuexin Jin Wenbo Ma +13 位作者 Jinyun Guo Yueying Qu Haiyu Gao Dechun Yin Desheng Li Ling Shi Jialiang Li Jiudong Ma Lingmin Zhang Hongli Shan Yanjie Lu Yue Li Dongmei Gong Zhenwei Pan 《Frigid Zone Medicine》 2025年第3期157-169,I0005-I0023,共32页
Background:Transmural heterogeneity of the transient outward potassium current(I_(to))is a major contributor to J-wave syndrome(JWS).However,the underlying molecular mechanisms remain elusive.The present study aimed t... Background:Transmural heterogeneity of the transient outward potassium current(I_(to))is a major contributor to J-wave syndrome(JWS).However,the underlying molecular mechanisms remain elusive.The present study aimed to investigate the role of cardiac injury-related bclaf1-interacting lncRNA(lncCIRBIL)in JWS and to delineate the molecular mechanisms.Methods:Whole-cell patch-clamp techniques were used to record ionic currents and action potentials(APs).Protein and mRNA expression related to I_(to)current were assessed.RNA immunoprecipitation,RNA Pulldown,mRNA stability,and decapping assays were performed to dissect the underlying mechanisms.Results:Plasma lncCIRBIL levels were significantly reduced in JWS patients and cold-induced JWS mice.Knockout of lncCIRBIL increased the incidence of J-wave and the susceptibility to ventricular arrhythmia in mice.In lncCIRBIL-deficient mice,the transmural gradient of Kv4.2 expression and I_(to)current density was markedly enhanced in the right ventricle,but not the left ventricle.In contrast,cardiomyocyte-specific transgenic overexpression of lncCIRBIL produced the opposite effects.In human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes(hiPSC-CMs),the conserved human homologous fragment of lncCIRBIL(hcf-CIRBIL)suppressed I_(to),attenuated the AP notch,and prolonged APD20.Mechanistically,lncCIRBIL directly binds to up-frameshift protein1(UPF1),promoting KCND2 mRNA decay by enhancing its decapping.Conclusions:LncCIRBIL modulates the transmural heterogeneity of KCND2 expression by regulating UPF1-mediated mRNA decay.Inhibition of lncCIRBIL exacerbates JWS by enhancing right ventricular I_(to)heterogeneity,whereas its overexpression exerts protective effects.These findings identify lncCIRBIL as a potential therapeutic target for J-wave syndrome. 展开更多
关键词 long noncoding RNA J-wave syndrome KCND2 up-frameshift protein1 ARRHYTHMIA
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二甲双胍下调上游移码蛋白1表达抑制结直肠癌细胞增殖的机制
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作者 杨佳辰 李哲 +2 位作者 马芸秋 秦梓赫 杨慧科 《解剖学报》 2025年第1期11-21,共11页
目的 探讨二甲双胍通过下调上游移码蛋白1(UPF1)的表达抑制HCT116结直肠癌细胞增殖的相关机制。方法 利用TCGA和UALCAN数据库分析UPF1在结肠癌组织内的表达情况。采用Western blotting和Real-time PCR验证UPF1在结肠癌肿瘤组织和癌旁正... 目的 探讨二甲双胍通过下调上游移码蛋白1(UPF1)的表达抑制HCT116结直肠癌细胞增殖的相关机制。方法 利用TCGA和UALCAN数据库分析UPF1在结肠癌组织内的表达情况。采用Western blotting和Real-time PCR验证UPF1在结肠癌肿瘤组织和癌旁正常组织间的表达差异。应用集落形成实验、CCK-8实验、划痕实验和Transwell侵袭实验分别检测敲低UPF1对HCT116细胞增殖、迁移和侵袭的影响。从GEO数据库筛选敲低UPF1的HCT116细胞数据集进行京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路分析,Real-time PCR验证富集于Hippo通路的差异基因的表达情况。二甲双胍处理HCT116细胞,Western blotting和Real-time PCR检测UPF1的表达变化。利用孟德尔随机化分析服用二甲双胍与结直肠癌之间的因果关联。结果 TCGA和UALCAN数据库分析结果显示,UPF1 mRNA和蛋白在结肠癌组织内呈高表达并与临床病理分期和淋巴结转移密切相关。与癌旁正常组织相比,结肠癌组织内UPF1蛋白和mRNA均呈高表达。敲低UPF1表达能够抑制HCT116细胞的增殖、迁移和侵袭能力。KEGG富集分析显示,共8个差异基因影响Hippo通路,Real-time PCR实验验证CTNNB1、BMP4、TEAD2、PARD6G和FZD1 mRNA在敲低UPF1表达的HCT116细胞内呈低表达。二甲双胍作用后,HCT116细胞内UPF1蛋白和mRNA的表达均下降。孟德尔随机化分析显示,服用二甲双胍与结直肠癌之间存在负向因果关联。结论 敲低UPF1表达通过调节Hippo通路抑制HCT116细胞增殖,二甲双胍通过下调UPF1表达发挥抑制结直肠癌细胞增殖的作用。 展开更多
关键词 上游移码蛋白1 二甲双胍 结直肠癌 Hippo通路 孟德尔随机化分析
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UPF1影响AU565乳腺癌细胞侵袭、迁移及EMT的机制
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作者 张金标 苏轲 +2 位作者 徐睿 张天伟 陈冰 《西部医学》 2024年第1期29-35,共7页
目的 探讨上游移码蛋白1(UPF1)对人乳腺癌细胞AU565侵袭、迁移及上皮间充质转化(EMT)的影响及机制研究。方法 收集2021年9月—2022年3月于我院接受乳腺切除术43例乳腺癌患者新鲜癌组织及正常乳腺组织,制备石蜡块,免疫组织化学法检测UPF... 目的 探讨上游移码蛋白1(UPF1)对人乳腺癌细胞AU565侵袭、迁移及上皮间充质转化(EMT)的影响及机制研究。方法 收集2021年9月—2022年3月于我院接受乳腺切除术43例乳腺癌患者新鲜癌组织及正常乳腺组织,制备石蜡块,免疫组织化学法检测UPF1表达情况。购置人乳腺癌细胞系AU565及人乳腺上皮细胞系DU4475,激光共聚焦扫描显微镜法测定UPF1水平。采用小干扰RNA(siRNA)技术构建UPF1低表达的重组细胞,分析转染siRNA-UPF1对AU565细胞侵袭、迁移能力以及EMT相关蛋白表达和蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(Akt/mTOR)信号通路的影响。结果 乳腺癌组织UPF1的吸光度值显著高于正常乳腺组织(P<0.05)。AU565细胞UPF1荧光强度显著大于DU4475细胞(P<0.05)。与siRNA-NC组比较,转染siRNA-UPF1后AU565细胞中UPF1蛋白及mRNA表达水平均显著降低(P<0.05)。与siRNA-NC组比较,转染siRNA-UPF1后AU565细胞穿膜率和细胞迁移率均显著增加(P<0.05)。转染siRNA-UPF1后AU565细胞E-candherin蛋白表达水平显著降低,Vimentin和N-cadherin蛋白表达水平显著升高(P<0.05)。转染siRNA-UPF1后AU565细胞p-Akt和p-mTOR水平显著升高(P<0.05)。结论 UPF1在乳腺癌中表达上调,但沉默UPF1可能通过激活Akt/mTOR通路传导,促进乳腺癌细胞AU565的侵袭和迁移,并诱导EMT发生。 展开更多
关键词 乳腺癌 移码蛋白1 侵袭 迁移 上皮间充质转化 蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路
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UPF1 increases amino acid levels and promotes cell proliferation in lung adenocarcinoma via the eIF2α-ATF4 axis 被引量:2
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作者 Lei FANG Huan QI +5 位作者 Peng WANG Shiqing WANG Tianjiao LI Tian XIA Hailong PIAO Chundong GU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2022年第10期863-875,共13页
Up-frameshift 1(UPF1),as the most critical factor in nonsense-mediated messenger RNA(mRNA)decay(NMD),regulates tumor-associated molecular pathways in many cancers.However,the role of UPF1 in lung adenocarcinoma(LUAD)a... Up-frameshift 1(UPF1),as the most critical factor in nonsense-mediated messenger RNA(mRNA)decay(NMD),regulates tumor-associated molecular pathways in many cancers.However,the role of UPF1 in lung adenocarcinoma(LUAD)amino acid metabolism remains largely unknown.In this study,we found that UPF1 was significantly correlated with a portion of amino acid metabolic pathways in LUAD by integrating bioinformatics and metabolomics.We further confirmed that UPF1 knockdown inhibited activating transcription factor 4(ATF4)and Ser51 phosphorylation of eukaryotic translation initiation factor 2α(eIF2α),the core proteins in amino acid metabolism reprogramming.In addition,UPF1 promotes cell proliferation by increasing the amino-acid levels of LUAD cells,which depends on the function of ATF4.Clinically,UPF1 mRNA expression is abnormal in LUAD tissues,and higher expression of UPF1 and ATF4 was significantly correlated with poor overall survival(OS)in LUAD patients.Our findings reveal that UPF1 is a potential regulator of tumor-associated amino acid metabolism and may be a therapeutic target for LUAD. 展开更多
关键词 up-frameshift 1(UPF1) Activating transcription factor 4(ATF4) Amino acid metabolism Lung adenocarcinoma
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无义介导的mRNA降解 被引量:9
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作者 贾晓波 胡剑 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期115-120,共6页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常... 无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常生理基因的表达,暗示其在真核细胞中扮演重要角色.NMD途径的关键是PTC的识别.本文通过3种模型来分别阐述发现于哺乳动物、酵母等不同有机体的识别机制.通常由NMD因子UPF1(up-frameshift)等被招募至含PTC的mRNA上,借助这些因子组装形成"功能复合体"并激活降解.但目前对于PTC识别后的过程仍认识有限,本文通过综述NMD途径的分子机制以更好地理解其生物学意义. 展开更多
关键词 提前终止密码子(PTC) 外显子连接复合体(EJC) 上游移码蛋白(UPF)
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蓝氏贾第虫无义mRNA的降解 被引量:1
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作者 吕佳 柴杨丽 +1 位作者 周宝春 柴宝峰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期212-221,共10页
无义介导的mRNA降解途径(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为细胞内的一种重要的mRNA质量监控机制,可以降解含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的异常转录本,从而避免截短蛋白质对细胞的毒害,但其详细的分子机制... 无义介导的mRNA降解途径(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为细胞内的一种重要的mRNA质量监控机制,可以降解含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的异常转录本,从而避免截短蛋白质对细胞的毒害,但其详细的分子机制有待进一步阐释。蓝氏贾第虫(Giardia lamblia)作为一种寄生性单细胞原生动物,进化地位特殊,对其NMD途径的研究有利于阐明基因表达调控的分子和进化机制。本研究通过酵母双杂交及体外pull-down实验分析了贾第虫NMD途径因子上游移码蛋白1 (Giardia lamblia up-frameshift 1,Gl UPF1)、贾第虫RNA结合蛋白(Giardia lamblia HRP1,Gl HRP1)、贾第虫核糖核酸外切酶(Giardia lamblia Ski7p,Gl Ski7p、Giardia lamblia XRN1,Gl XRN1)之间的相互作用关系。结果表明,Gl UPF1全长与Gl HRP1、Gl XRN1(1~500aa)、Gl Ski7p间均可发生相互作用。而且Gl UPF1的CH结构域和C端结构域分别与Gl HRP1、Gl XRN1(1~500 aa)、Gl Ski7p相互作用。说明Gl UPF1在贾第虫NMD途径中作为招募平台,在无义mRNA识别和降解过程中发挥重要作用。为此,结合本实验室之前的研究结果,我们提出原生动物贾第虫的NMD途径:在提前终止密码子处SURF(SMG1-UPF1-eRF1-eRF3)复合物形成后,Gl UPF1被磷脂酰肌醇3-激酶(suppressor with morphogenetic effect on genitalia 1,SMG1)磷酸化修饰,NMD途径激活,随后Gl UPF1与HRP1相互作用,将转录本标记为NMD底物; Gl UPF1进而招募下游贾第虫5'-3'核糖核酸降解酶Gl XRN1、贾第虫3'-5'核糖核酸降解因子Gl Ski7p,最终降解靶标mRNA。 展开更多
关键词 蓝氏贾第虫 无义介导的mRNA降解途径 贾第虫不均一核小核糖核蛋白 贾第虫上游移码蛋白1 贾第虫5’-3’核糖核酸外切酶 贾第虫3’-5’超级杀手蛋白质
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泛素特异性蛋白酶10的互作组分析及其与UPF1相互作用分析
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作者 祁钰玲 冯振桓 +2 位作者 王旭 陈亚平 张小飞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1638-1647,共10页
细胞内泛素化调控是一个由泛素化和去泛素化协同调控的动态平衡可逆过程。去泛素酶(DUBs)是介导蛋白质去泛素化过程的蛋白质家族,它在许多复杂的细胞过程中发挥着关键作用,但其生物学特征尚未完全阐明。作为去泛素化酶的一种,USP10在许... 细胞内泛素化调控是一个由泛素化和去泛素化协同调控的动态平衡可逆过程。去泛素酶(DUBs)是介导蛋白质去泛素化过程的蛋白质家族,它在许多复杂的细胞过程中发挥着关键作用,但其生物学特征尚未完全阐明。作为去泛素化酶的一种,USP10在许多生物过程和癌症中都发挥重要的作用。为了进一步探索USP10在细胞中的功能,采用免疫沉淀与质谱联用(IP-MS)的方法鉴定USP10的相互作用蛋白质。通过Flag柱子的富集方式(Flag-USP10 IP-MS)共鉴定出165个与USP10相互作用蛋白质。通过USP10内源抗体的富集方式(USP10 antibody IP-MS)鉴定出192个USP10相互作用蛋白质。基因本体(GO)分析表明,USP10的互作蛋白质中存在一组与无义介导的mRNA降解(NMD)相关蛋白质,包括无NMD的核心因子UPF1(Up-frameshift 1)。进一步验证了USP10和UPF1在细胞质中共定位。此外,还确定了UPF1通过其HD结构域与全长的USP10相互作用。本研究提供了新的USP10相互作用蛋白质,为探索其在RNA调控和NMD通路中的重要性提供线索。 展开更多
关键词 质谱 相互作用组 泛素特异性蛋白酶10 UPF1 相互作用
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lncRNA ZFPM2-AS1在膀胱癌中的表达及对细胞迁移和增殖的影响 被引量:1
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作者 叶志华 彭伟 +1 位作者 桂定文 王小英 《中国医师杂志》 CAS 2021年第3期354-358,共5页
目的分析长链非编码RNA(lncRNA)ZFPM2-AS1在膀胱癌组织和细胞株中的表达,观察下调ZFPM2-AS1对膀胱癌细胞迁移和增殖的影响并探讨其分子机制。方法实时定量荧光聚合酶链反应(qRT-PCR)检测51对膀胱癌组织及癌旁组织、膀胱癌细胞株(j82、5... 目的分析长链非编码RNA(lncRNA)ZFPM2-AS1在膀胱癌组织和细胞株中的表达,观察下调ZFPM2-AS1对膀胱癌细胞迁移和增殖的影响并探讨其分子机制。方法实时定量荧光聚合酶链反应(qRT-PCR)检测51对膀胱癌组织及癌旁组织、膀胱癌细胞株(j82、5637、biu-87、T24)及人正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1中ZFPM2-AS1的表达。选取表达最高的膀胱癌细胞,分别转染小干扰siRNA-ZFPM2-AS1质粒和阴性对照质粒,定义为实验组和对照组,qRT-PCR检测两组细胞ZFPM2-AS1的表达。Transwell迁移实验和四甲基偶氮唑蓝(MTT)法分别检测两组细胞迁移能力和增殖能力。qRT-PCR检测两组细胞中上游移码突变体1(UPFI)mRNA的表达。Western blot检测两组细胞中UPF1和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路蛋白的表达。结果膀胱癌组织中ZFPM2-AS1的表达量明显高于癌旁组织(P<0.01),膀胱癌细胞株中ZFPM2-AS1的表达量明显高于人正常膀胱上皮细胞(P<0.01),BIU-87细胞中ZFPM2-AS1的表达量最高(P<0.01)。与对照组相比,实验组BIU-87细胞中ZFPM2-AS1表达量明显降低[(1.01±0.06)vs(0.16±0.04),t=12.28,P<0.01]。与对照组相比,实验组BIU-87细胞迁移能力降低(P<0.05),从第2天开始BIU-87细胞增殖能力明显降低(P<0.05)。与对照组相比,实验组BIU-87细胞中UPFI mRNA表达量明显降低[(1.00±0.02)vs(0.28±0.04),t=15.49,P<0.01]。Western Wot结果提示,实验组BIU-87细胞中UPF1蛋白表达量降低(P<0.05),mT0R、GRB2、IRS1和p-PI3K等tnTOR信号通路蛋白表达量降低(P<0.05).结论ZFPM2-AS1在膀胱癌组织和细胞株中高表达,下调ZFPM2-AS1可抑制BIU-87细胞的迁移能力和增殖能力,其分子机制可能与抑制UPF1基因表达有关. 展开更多
关键词 RNA 长链非编码 膀胱肿瘤 细胞迁移 细胞增殖 上游移码突变体1
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