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1株黄褐假单胞菌的分离鉴定及其系统进化分析
1
作者 罗晶 马克姣 +5 位作者 杨帆 谢婷 王欢 何婷婷 殷喆 李伯安 《中华医院感染学杂志》 北大核心 2025年第14期2086-2090,共5页
目的对一株多药耐药黄褐假单胞菌株进行全基因组测序分析,解析其基因组特征及其在系统进化中的意义。方法黄褐假单胞菌NY4814分离自2014年解放军总医院,经分纯保种和全基因组测序后,获得其基因组全序数据。通过平均核苷酸一致性(ANI)比... 目的对一株多药耐药黄褐假单胞菌株进行全基因组测序分析,解析其基因组特征及其在系统进化中的意义。方法黄褐假单胞菌NY4814分离自2014年解放军总医院,经分纯保种和全基因组测序后,获得其基因组全序数据。通过平均核苷酸一致性(ANI)比对核定菌种;使用VITEK 2仪器测定菌株的最小抑菌浓度(MIC)值。从国家生物技术信息中心(NCBI)的RefSeq数据库下载所有黄褐假单胞菌基因组序列构建系统进化树。结果黄褐假单胞菌NY4814对碳青霉烯类、喹诺酮类等抗菌药物耐药。染色体上携带一个新发现的Tn7675转座子,该转座子可介导氨基糖苷类和氯霉素类等抗菌药物耐药性。质粒pNY4814-IMP通过高度保守的接合转移机制驱动了blaIMP耐药基因在假单胞菌属内的广泛传播,其携带Tn6485i转座子,该转座子介导对β-内酰胺类抗菌药物耐药性。结论黄褐假单胞菌是当前碳青霉烯类及其他种类耐药基因传播的潜在载体之一,正作为少数机会致病菌引起人类的感染,本研究通过分析NY4814的基因结构和其在种群中遗传进化关系,从而增加对此菌种的认识,为预防和监控细菌感染提供理论依据。 展开更多
关键词 黄褐假单胞菌 单元转座子 抗菌药物耐药基因 系统进化树
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影响转座子介导耐药基因传播因素的研究进展 被引量：1
2
作者 郭月婷 郭玉茹 +4 位作者 谢佳彤 张杰 李志 王盈予 刘明春 《动物医学进展》 北大核心 2023年第5期81-85,共5页
转座子是一种可移动的遗传元件,它不仅是耐药基因的载体,还会使耐药基因在不同菌属之间水平转移,造成耐药多样性现象。转座子在细菌耐药性传播过程中发挥着重要的作用。因此,了解影响转座子介导细菌耐药性传播的因素,可为深度解析细菌... 转座子是一种可移动的遗传元件,它不仅是耐药基因的载体,还会使耐药基因在不同菌属之间水平转移,造成耐药多样性现象。转座子在细菌耐药性传播过程中发挥着重要的作用。因此,了解影响转座子介导细菌耐药性传播的因素,可为深度解析细菌耐药机制,从而有效遏制细菌耐药性的传递,以及研发新型抗菌药物提供思路。对不同转座子在细菌耐药性传播中发挥的作用及其影响因素进行综述,以期为细菌耐药性的防控提供参考。 展开更多
关键词 转座子 转座单元 转座酶 插入序列
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普罗维登斯菌中新型别质粒IncpPrY2001的遗传特性研究
3
作者 卢秀慧 贺家琪 +4 位作者 郑亚丽 王鹏 周冬生 高波 殷喆 《军事医学》 CAS CSCD 2024年第3期187-194,共8页
目的旨在揭示普罗维登斯菌中质粒不相容群IncpPrY2001的基因组结构和遗传特征。方法16S rDNA初步鉴定菌种后,将菌株送二代和三代测序,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对,最终核定菌种;VITEK 2仪器检测细菌的最小抑菌浓度(MIC... 目的旨在揭示普罗维登斯菌中质粒不相容群IncpPrY2001的基因组结构和遗传特征。方法16S rDNA初步鉴定菌种后,将菌株送二代和三代测序,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对,最终核定菌种;VITEK 2仪器检测细菌的最小抑菌浓度(MIC)值;随后进行全基因组测序,获得细菌的全基因组序列,通过精细注释及比较基因组学分析,确定耐药基因所在基因环境。结果该研究指定了1个新的质粒型别IncpPrY2001。IncpPrY2001型质粒与参考质粒pPrY2001具有相似的骨架保守区,但插入区存在差异。IncpPrY2001型质粒的插入区表现出了显著的多样性,这表明质粒内部存在大量的基因获得和缺失,包括5个Tn1696和1个Tn7相关的区域。在IncpPrY2001型质粒中发现了多种抗生素耐药基因(ARG),涉及对至少8类12种的抗生素的耐药性。发现包含In1806和In1807在内的2个新的可移动遗传元件(MGE)。结论IncpPrY2001型质粒中插入了大量携带耐药基因的MGE,有助于ARG的积累和分布,同时增强了普罗维登斯菌株在药物选择压力下的生存能力。 展开更多
关键词 普罗维登斯菌 IncpPrY2001型质粒 单元转座子 抗生素耐药基因 多药耐药
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