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生物信息学技术分析lncRNA USP30-AS1与卵巢浆液性囊腺癌免疫细胞浸润的相关性 被引量:2
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作者 王海燕 黄守国 +2 位作者 蒙秋 张静 魏莉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期834-840,共7页
目的 研究卵巢浆液性囊腺癌(OSC)中长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(USP30-AS1)的表达及其与免疫浸润的关系,并确定其在OSC中的预后作用。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库检索了384名OSC患者的USP30-AS1表达和临床信息... 目的 研究卵巢浆液性囊腺癌(OSC)中长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(USP30-AS1)的表达及其与免疫浸润的关系,并确定其在OSC中的预后作用。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库检索了384名OSC患者的USP30-AS1表达和临床信息。Wilcoxon秩和检验用于比较OSC和正常卵巢组织中USP30-AS1的表达。采用逻辑回归分析临床病理特征与USP30-AS1的关系,进行基因集富集分析(GSEA)和单样本基因集富集分析(ssGSEA)以研究富集途径和功能,并量化USP30-AS1的免疫细胞浸润程度。根据长链非编码RNA (lncRNA) USP30-AS1的表达情况,根据表达均值将样本分为高表达组和低表达组。采用对数秩检验、单变量和多变量比例风险回归模型(Cox)用于比较不同USP30-AS1表达组之间的预后差异,lncRNA USP30-AS1的表达对其他基因组的影响也据此分析。结果 USP30-AS1高表达与肿瘤国际妇产科协会(FIGO)分期显著相关。多变量生存分析表明,USP30-AS1表达水平是OSC独立预后标志物。GSEA数据显示USP30-AS1高表达可能激活程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)信号转导、细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)通路、 B细胞受体信号通路、细胞凋亡、成纤维细胞生长因子受体(FGFR)信号通路,以及Janus激酶/信号转导子与转录激活子(JAK/STAT)信号通路。USP30-AS1表达与免疫细胞浸润呈负相关,包括B细胞、 CD4^(+)T细胞、树突状细胞、 CD8^(+)T细胞和中性粒细胞。结论 USP30-AS1有可能作为预测OSC预后的分子标志物。 展开更多
关键词 生物标志物 长链非编码RNA泛素特异性蛋白酶30-反义RNA 1(usp30-AS1) 卵巢浆液性囊腺癌 预后
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MicroRNA-137-5p靶向USP30改善阿尔茨海默病
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作者 姜扬 卞威 +5 位作者 刘婷 隋轶 任莉 曹晓攀 肖莹 徐冰 《河北医药》 CAS 2024年第19期2898-2903,共6页
目的 探索miR-137-5p对阿尔茨海默病(AD)的保护机制。方法 首先用qRT-PCR评估AD患者和健康对照组人血清中miR-137和USP30的表达。用D-半乳糖和氯化铝建立AD小鼠模型,用水迷宫试验检测小鼠的行为,确认AD小鼠模型的成功。用Aβ1-42寡聚体... 目的 探索miR-137-5p对阿尔茨海默病(AD)的保护机制。方法 首先用qRT-PCR评估AD患者和健康对照组人血清中miR-137和USP30的表达。用D-半乳糖和氯化铝建立AD小鼠模型,用水迷宫试验检测小鼠的行为,确认AD小鼠模型的成功。用Aβ1-42寡聚体诱导的SH-SY5Y细胞建立AD细胞模型,通过实时定量聚合酶链反应检测AD模型中miR-137-5p和USP30的表达。双重荧光素酶试验用于验证miR-137-5p和USP30之间的靶向结合关系。结果 miR-137-5p的表达在AD患者中与健康对照组相比有所下降(P<0.05),而USP30则明显增加(P<0.05)。miR-137-5p能改善AD细胞模型中的细胞凋亡,USP30的过表达部分废除了miR-137-5p对Aβ1-42-处理的SH-SY5Y细胞的影响,miR-137-5p通过靶向USP30改善AD小鼠的认知能力和Aβ的沉积。结论 miR-137-5p可以通过下调USP30来改善AD症状,miR-137-5p可能能成为治疗AD的一个靶点。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 miR-137-5p usp30 AΒ1-42
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USP30在肝癌组织和细胞中高表达可促进肝癌的发生发展
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作者 陈秀云 肖斌 +2 位作者 宣俊峰 陈敏 孙朝晖 《循证医学》 2023年第2期109-118,共10页
目的探讨泛素特异性肽酶30(ubiquitin-specific protease 30,USP30)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织和细胞的表达水平及其对HCC细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据... 目的探讨泛素特异性肽酶30(ubiquitin-specific protease 30,USP30)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织和细胞的表达水平及其对HCC细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析USP30在HCC和癌旁组织中的表达水平及其与TNM分级、临床分期等临床病理参数的相关性;用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)和western blot方法验证USP30在5种HCC细胞中的表达情况;用细胞计数(cell counting kit-8,CCK-8)、transwell和划痕实验研究过表达及敲低USP30对HCC细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;采用免疫荧光法确定USP30的亚细胞定位。结果USP30在HCC组织中的表达水平显著高于癌旁组织;高表达USP30与TNM分级和临床分期显著相关;USP30 mRNA和蛋白表达量在5种HCC细胞中均高于正常肝脏细胞;过表达USP30促进HCC细胞的增殖、侵袭和迁移,而敲低USP30则抑制了HCC细胞的增殖、侵袭和迁移;免疫荧光实验表明USP30定位于细胞质。结论USP30在HCC组织和细胞中高表达,高表达的USP30促进HCC细胞的增殖、侵袭和转移,USP30有望作为HCC诊断及治疗的潜在分子靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 usp30 泛素特异性肽酶 增殖转移
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Nuclear and cytoplasmic USP30-AS1 coordinately regulate breast cancer progression through HnRNPF/p21 and EZH2/c-Myc/p21 axes
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作者 Yapei Jiang Weijie Liao +11 位作者 Qilei Xin Ruonan Wang Guanglan Lin Jia Li Zijian Yang Shiyue Yang Haowei Zhang Xiaolin Li Qian Peng Yaou Zhang Weidong Xie Naihan Xu 《Genes & Diseases》 2026年第2期610-626,共17页
Emerging evidence suggests that aberrant expression of long non-coding RNAs (lncRNAs) is strongly associated with the occurrence and progression of breast cancer. Herein, we identified ubiquitin specific peptidase 30 ... Emerging evidence suggests that aberrant expression of long non-coding RNAs (lncRNAs) is strongly associated with the occurrence and progression of breast cancer. Herein, we identified ubiquitin specific peptidase 30 antisense RNA 1 (USP30-AS1) as a markedly upregulated lncRNA in breast cancer tissues, and the transcription factor SPI1 functions upstream to regulate the expression of USP30-AS1. Gene set enrichment analysis suggests that USP30-AS1 may regulate cell proliferation. Knockdown of USP30-AS1 suppresses breast cancer cell proliferation and tumor growth by up-regulating CDKN1A/p21. Mechanistically, USP30-AS1 exhibits dual localization within breast cancer cells. In the cytoplasm, it interacts with HnRNPF, disrupting its binding to the p21 3′UTR, which destabilizes p21 mRNA and ultimately reduces p21 expression. In the nucleus, USP30-AS1 suppresses p21 transcription by enhancing the activity of c-Myc, a known transcriptional repressor of p21. USP30-AS1 binds to enhancer of zeste homolog 2 (EZH2), a histone methyltransferase, and prevents EZH2 from binding to the c-Myc promoter. This promotes epigenetic up-regulation of c-Myc by reducing H3K27 trimethylation. Together, these findings demonstrate the critical role of USP30-AS1 in breast cancer progression through HnRNPF/p21 and EZH2/c-Myc/p21 axes, highlighting its potential as a therapeutic target for breast cancer treatment. 展开更多
关键词 Breast cancer C-MYC CDKN1A/p21 HnRNPF usp30-AS1
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艾灸“风府”“关元”“足三里”对帕金森病模型大鼠脑黑质Parkin、USP30表达的影响 被引量:16
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作者 王述菊 翁晓彦 +2 位作者 马骏 袁利 柳默涵 《北京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期338-344,共7页
目的观察艾灸"风府""关元""足三里"对帕金森病(PD)模型大鼠脑黑质E3泛素酶Parkin、独特的线粒体去泛素化酶USP30表达的影响,探讨艾灸"风府""关元""足三里"防治PD的作用机... 目的观察艾灸"风府""关元""足三里"对帕金森病(PD)模型大鼠脑黑质E3泛素酶Parkin、独特的线粒体去泛素化酶USP30表达的影响,探讨艾灸"风府""关元""足三里"防治PD的作用机制。方法将40只SPF级健康雄性SD大鼠随机分为正常组(8只)、假手术组(8只)、造模组(24只)。造模组采用颈背部皮下注射鱼藤酮造模(1 mg/kg,溶解于二甲基亚砜及0.9%NaCl溶液中),假手术组采用颈背部皮下注射等量不含鱼藤酮的二甲基亚砜及0.9%NaCl溶液混合液。造模40 d后,对各组大鼠进行行为学评分,选择行为学评分高,且分数在2~8分的大鼠14只,然后从正常组、假手术组、造模组分别随机抽取2只大鼠采用免疫组织化学法检测大鼠脑黑质酪氨酸羟化酶(TH)和α-突触核蛋白(α-syn)的表达情况以鉴别造模是否成功。模型鉴定后,造模组(12只)随机分为模型组和艾灸治疗组,每组各6只。艾灸治疗组取穴"风府""关元""足三里",每日相同时间点施灸,1次/d,每穴艾灸15 min;正常组、假手术组和模型组不加干预因素,同艾灸治疗组抓取,穿鼠衣固定。7 d为1个疗程,共治疗2个疗程。艾灸治疗结束后,再次对各组大鼠进行行为学评分。最后,采用免疫蛋白印迹法Western blot检测大鼠脑黑质Parkin、USP30相对表达量。结果免疫组织化学法检测显示模型组和艾灸治疗组较正常组、假手术组TH染色丢失明显,分布不均;模型组和艾灸治疗组较正常组、假手术组α-syn染色丰富而致密。艾灸治疗结束后,艾灸治疗组与模型组比较行为学评分降低(P<0.01);模型组较正常组、假手术组大鼠脑黑质Parkin相对表达量减少(P<0.05)、USP30相对表达量增多(P<0.05);艾灸治疗组较模型组大鼠脑黑质Parkin相对表达量增多(P<0.05)、USP30相对表达量减少(P<0.05)。结论艾灸治疗作用下帕金森病模型大鼠脑黑质Parkin介导的线粒体自噬水平升高,从而降解清除过度表达的USP30,这可能是艾灸治疗帕金森病作用机制之一。 展开更多
关键词 帕金森病 艾灸 酪氨酸羟化酶 α-突触核蛋白 PARKIN usp30 大鼠
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miRNA-137-5p improves spatial memory and cognition in Alzheimer's mice by targeting ubiquitin-specific peptidase 30 被引量:3
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作者 Yang Jiang Wei Bian +5 位作者 Jing Chen Xiaopan Cao ChunYao Dong Ying Xiao Bing Xu XiaoHong Sun 《Animal Models and Experimental Medicine》 CAS CSCD 2023年第6期526-536,共11页
Background:Alzheimer’sdisease(AD)is a prevalent neurodegenerative disorder causing progressive dementia.Research suggests that microRNAs(miRNAs)could serve as biomarkers and therapeutic targets for AD.Reduced levels ... Background:Alzheimer’sdisease(AD)is a prevalent neurodegenerative disorder causing progressive dementia.Research suggests that microRNAs(miRNAs)could serve as biomarkers and therapeutic targets for AD.Reduced levels of miR-137 have been observed in the brains of AD patients,but its specific role and down stream mechanisms remain unclear.This study sought to examine the therapeutic potential of miR-137-5p agomir in alleviating cognitive dysfunction induced in AD models and explore its potential mechanisms.Methods:This study utilized bioinformatic analysis and a dual-l uciferase reporter assay to investigate the relationship between miR-137-5p and ubiquitin-specific peptidase 30(USP30).In vitro experiments were conducted using SH-SY5Y cells to assess the impact of miR-137-5p on Aβ1-42 neurotoxicity.In vivo experiments on AD mice evaluated the effects of miR-137-5p on cognition,Aβ1-42 deposition,Tau hyperphosphorylation,and neuronal apoptosis,as well as its influence on USP30 levels.Results:It was discovered that miR-137-5p mimics efficiently counteract Aβ1-42 neurotoxicity in SH-SY5Y cells,a protective effect that is negated by USP30 overexpression.In vivo experiments demonstrated that miR-137-5p enhances the cognition and mobility of AD mice,significantly reducing Aβ1-42 deposition,Tau hyperphosphorylation,and neuronal apoptosis within the hippocampus and cortex regions.Mechanistically,miR-137-5p significantly suppresses USP30 levels in mice,though USP30 overexpression partially buffers against miR-137-5p-i nduced AD symptom improvement.Conclusion:Our study proposes that miR-137-5p,by instigating the downregulation of USP30,has the potential to act as a novel and promising therapeutic target for AD. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease AΒ1-42 miR-137-5p usp30
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