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基于转录组学、网络药理学及实验验证探讨半夏泻心汤防治胃癌的作用机制
1
作者
祖国秀
孙克允
+3 位作者
刘西建
汤继芹
黄海量
韩涛
《中国现代应用药学》
北大核心
2025年第15期2598-2609,共12页
目的基于转录组学和网络药理学的方法,结合实验验证,探讨半夏泻心汤(Banxia Xiexin decoction,BXD)防治胃癌(gastric cancer,GC)的作用机制。方法利用UPLC-Q-Orbitrap MS/MS技术对BXD的活性成分进行质量控制和鉴定,并通过TCMSP、DrugBan...
目的基于转录组学和网络药理学的方法,结合实验验证,探讨半夏泻心汤(Banxia Xiexin decoction,BXD)防治胃癌(gastric cancer,GC)的作用机制。方法利用UPLC-Q-Orbitrap MS/MS技术对BXD的活性成分进行质量控制和鉴定,并通过TCMSP、DrugBank和SwissTargetPrediction平台预测药物成分的相关靶点,利用Genecards、OMIM、DisGeNet等数据库对GC基因进行鉴定,STRING数据库构建蛋白相互作用网络,Metascape数据库进行KEGG和GO富集分析,cytoscape构建“活性成分-靶点-通路”网络图。采用RNA-seq测序技术筛选GC细胞MGC-803的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),分析RNA-seq和网络药理学之间的重合靶点,获得BXD治疗GC的关键靶点,使用STRING和Metascape数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络、GO和KEGG富集分析。采用CCK8、细胞凋亡检测、细胞迁移检测进行细胞分子功能检测,利用qPCR检测关键靶点的mRNA表达。结果UPLC-Q-Orbitrap MS/MS结合网络药理学共鉴定出BXD中有29个化合物,859个潜在靶点。从Genecards、OMIM、DisGeNet等数据库中共获得7695个GC相关基因,确定BXD中569个潜在靶点参与治疗GC。RNA-seq测序结合网络药理学共显示328个DEGs;KEGG结果显示BXD可能通过PI3K-Akt信号通路防治GC,其中PIK3CA、Akt1、EGFR、TNF等被归类为枢纽基因;体外细胞实验证实,BXD含药血清和PI3K抑制剂-LY294002可以抑制GC细胞增殖,促进细胞凋亡,抑制GC细胞迁移的作用,通过降低GC细胞MGC803细胞中PI3K-Akt信号通路中EGFR、PIK3CA、TNF的表达发挥作用。结论BXD具有抑制GC增殖,延缓GC发展的作用。其作用机制可能与调节PI3K-Akt信号通路,减轻炎症反应有关。
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关键词
半夏泻心汤
胃癌
uplc-q-orbitrapms/ms
网络药理学
RNA-SEQ
PI3K-AKT信号通路
原文传递
题名
基于转录组学、网络药理学及实验验证探讨半夏泻心汤防治胃癌的作用机制
1
作者
祖国秀
孙克允
刘西建
汤继芹
黄海量
韩涛
机构
山东中医药大学
出处
《中国现代应用药学》
北大核心
2025年第15期2598-2609,共12页
基金
山东省重点研发计划(2016CYJS08A01-6)。
文摘
目的基于转录组学和网络药理学的方法,结合实验验证,探讨半夏泻心汤(Banxia Xiexin decoction,BXD)防治胃癌(gastric cancer,GC)的作用机制。方法利用UPLC-Q-Orbitrap MS/MS技术对BXD的活性成分进行质量控制和鉴定,并通过TCMSP、DrugBank和SwissTargetPrediction平台预测药物成分的相关靶点,利用Genecards、OMIM、DisGeNet等数据库对GC基因进行鉴定,STRING数据库构建蛋白相互作用网络,Metascape数据库进行KEGG和GO富集分析,cytoscape构建“活性成分-靶点-通路”网络图。采用RNA-seq测序技术筛选GC细胞MGC-803的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),分析RNA-seq和网络药理学之间的重合靶点,获得BXD治疗GC的关键靶点,使用STRING和Metascape数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络、GO和KEGG富集分析。采用CCK8、细胞凋亡检测、细胞迁移检测进行细胞分子功能检测,利用qPCR检测关键靶点的mRNA表达。结果UPLC-Q-Orbitrap MS/MS结合网络药理学共鉴定出BXD中有29个化合物,859个潜在靶点。从Genecards、OMIM、DisGeNet等数据库中共获得7695个GC相关基因,确定BXD中569个潜在靶点参与治疗GC。RNA-seq测序结合网络药理学共显示328个DEGs;KEGG结果显示BXD可能通过PI3K-Akt信号通路防治GC,其中PIK3CA、Akt1、EGFR、TNF等被归类为枢纽基因;体外细胞实验证实,BXD含药血清和PI3K抑制剂-LY294002可以抑制GC细胞增殖,促进细胞凋亡,抑制GC细胞迁移的作用,通过降低GC细胞MGC803细胞中PI3K-Akt信号通路中EGFR、PIK3CA、TNF的表达发挥作用。结论BXD具有抑制GC增殖,延缓GC发展的作用。其作用机制可能与调节PI3K-Akt信号通路,减轻炎症反应有关。
关键词
半夏泻心汤
胃癌
uplc-q-orbitrapms/ms
网络药理学
RNA-SEQ
PI3K-AKT信号通路
Keywords
Banxia Xiexin decoction
gastric cancer
UPLC-Q-Orbitrap MS/MS
network pharmacology
RNA-seq
PI3K-Akt signaling pathway
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组学、网络药理学及实验验证探讨半夏泻心汤防治胃癌的作用机制
祖国秀
孙克允
刘西建
汤继芹
黄海量
韩涛
《中国现代应用药学》
北大核心
2025
0
原文传递
已选择
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