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ULK3基因在前列腺癌中的生物信息学分析及其在DU145中的表达 被引量：1
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作者 邹雨轩 张云博 +2 位作者 孙梦 李梦佳 韩洋洋 《基因组学与应用生物学》 北大核心 2025年第1期80-91,共12页
本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STR... 本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STRING数据库分析与ULK3相关的互作蛋白质,并对ULK3差异表达基因进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA);通过GO、KEGG分析,探讨ULK3的潜在作用机制;通过miRNet平台预测调控ULK3的微RNA(miRNA),并构建PCa中潜在的ULK3-miRNA-mRNA调控网络;利用TIMER 2.0数据库分析ULK3在PCa中与免疫浸润的关系。基于上述生物信息学分析,对PCa细胞DU145进行ULK3敲降处理,并通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)和Western blot检测ULK3下调效率;通过划痕实验和MTT法检测ULK3稳定下调对前列腺癌细胞增殖的影响。结果显示,ULK3在PCa癌组织中比在正常前列腺组织中高表达;通过富集分析发现ULK3的表达与多种生物学功能有关,其中主要作用的通路有范可尼贫血途径和Notch信号通路;通过免疫浸润分析发现ULK3高表达时多种免疫细胞的浸润水平显著下降。此外,成功构建敲降ULK3的前列腺癌细胞系DU145,通过划痕实验和MTT法发现敲降ULK3后对DU145细胞的迁移和增殖起到抑制作用。以上结果表明ULK3在前列腺癌中发挥重要生物学作用,敲降ULK3可能对PCa存在抑制作用,这为后续PCa的基础研究与临床治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 ulk3 前列腺癌(PCa) 生物信息学 慢病毒 增殖
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右美托咪定预处理激活PI3K/mTOR/ULK1通路发挥抗氧化应激和保护大鼠脑缺血/再灌注损伤的分子机制研究 被引量：6
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作者 尹顺花 金辉 +3 位作者 肖志博 葛树胜 吴小精 李媛 《脑与神经疾病杂志》 CAS 2022年第11期688-693,共6页
目的探索右美托咪定(Dex)预处理在缓解大鼠脑缺血/再灌注(CI/R)损伤中的作用及其分子机制。方法选取48只6~8w龄雄性SD大鼠,每组12只,随机分为假手术(Sham)组,大脑中动脉闭塞(MCAO)模型组,Dex预处理(MCAO+Dex)组和ULK1抑制剂(SBI-0206965... 目的探索右美托咪定(Dex)预处理在缓解大鼠脑缺血/再灌注(CI/R)损伤中的作用及其分子机制。方法选取48只6~8w龄雄性SD大鼠,每组12只,随机分为假手术(Sham)组,大脑中动脉闭塞(MCAO)模型组,Dex预处理(MCAO+Dex)组和ULK1抑制剂(SBI-0206965)联合Dex预处理(MCAO+Dex+SBI-0206965)组。TTC染色检测脑梗死体积并计算脑水肿指数;ELISA测定大鼠脑组织活性氧自由基(ROS)和超氧化物歧化酶(SOD)活性及丙二醛(MDA)水平;Western blot检测大鼠脑组织自噬标志物LC3-Ⅰ、LC3-Ⅱ、Beclin、p62的表达及PI3K/mTOR/ULK1通路p-PI3K、p-mTOR及p-ULK1的水平。结果与假手术(Sham)组相比,MCAO组大鼠脑梗死体积百分比、脑水肿指数、ROS和MDA水平、LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ的比值、Beclin的表达显著升高(P<0.01),SOD水平、p62、p-PI3K、p-mTOR及p-ULK1的水平显著下调(P<0.01)。与MCAO组相比,Dex组显著逆转了上述情况(P<0.01)。而SBI-0206965抵消了Dex预处理的保护作用,与Dex组相比,MCAO+Dex+SBI-0206965组大鼠脑梗死体积百分比和脑水肿指数显著升高(P<0.01),氧化应激水平及自噬标志物的表达显著上调(P<0.01),并下调SOD水平及抑制PI3K/mTOR/ULK1通路的活化(P<0.01)。结论Dex预处理是通过激活PI3K/mTOR/ULK1通路发挥抗氧化应激和保护大鼠脑缺血/再灌注损伤的,抑制ULK1的磷酸化,将抵消Dex的保护作用。 展开更多
关键词 右美托咪定 脑缺血/再灌注损伤 自噬 PI3K/mTOR/ULK1通路
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