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鸭肠炎病毒UL51和UL52基因的克隆及序列分析
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作者 李阳 安瑞 +4 位作者 李慧昕 韩宗玺 邵昱昊 刘胜旺 孔宪刚 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期689-693,共5页
利用靶基因步行PCR方法扩增得到鸭肠炎病毒(DEV Clone-03)5352bp基因片段,并进行克隆和测序。序列分析发现,该片段包含2个ORF。Blast分析表明,这2个ORF分别与单纯疱疹病毒1型(HSV-1)UL51和UL52基因同源,命名为DEV Clone-03UL51和UL52,... 利用靶基因步行PCR方法扩增得到鸭肠炎病毒(DEV Clone-03)5352bp基因片段,并进行克隆和测序。序列分析发现,该片段包含2个ORF。Blast分析表明,这2个ORF分别与单纯疱疹病毒1型(HSV-1)UL51和UL52基因同源,命名为DEV Clone-03UL51和UL52,分别编码252和1124个氨基酸。DEV Clone-03UL51和UL52基因排列方式与HSV-1同源基因相一致,为"头对头"的转录方向,两个ORF间有236bp间隔序列。用DNAStar(Megalign)软件分别对这2个ORF和11株α-疱疹病毒参考毒株进行分析,发现DEV Clone-03UL51与HSV-1的氨基酸序列有相对较高同源性,DEV Clone-03UL52与EHV-4同源性相对较高。并且DEV Clone-03UL51基因在α-疱疹病毒中比较保守。与HSV-1UL52蛋白相似,DEV Clone-03UL52蛋白C末端存在锌指结构。系统发育分析表明,DEV Clone-03与α疱疹病毒亚科成员的关系比较保守,与Mardivirus属的成员具有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 鸭肠炎病毒 靶基因步行PCR UL51 ul52 序列分析
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