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UGP2在乳腺癌中的表达意义及其促癌机制
1
作者 郑子琳 张潇珺 +4 位作者 韩建军 梁心议 郭轩池 梅向辉 何建超 《中国现代普通外科进展》 2025年第3期196-202,共7页
目的:探究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶2(UGP2)在乳腺癌(BC)组织中的表达及其促癌机制,评估其作为乳腺癌诊断及预后生物标志物的潜在价值。方法:(1)通过在线数据库分析UGP2 mRNA和蛋白在乳腺癌中的表达情况,并研究其与临床特征的关系;收... 目的:探究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶2(UGP2)在乳腺癌(BC)组织中的表达及其促癌机制,评估其作为乳腺癌诊断及预后生物标志物的潜在价值。方法:(1)通过在线数据库分析UGP2 mRNA和蛋白在乳腺癌中的表达情况,并研究其与临床特征的关系;收集114例乳腺癌患者的石蜡组织样本并制成组织芯片,采用免疫组织化学分析验证UGP2在人乳腺癌组织中的表达,并评估其与临床病理特征的关联。(2)使用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归模型分析UGP2表达对乳腺癌预后的影响。(3)采用生物信息学方法探讨UGP2与肿瘤免疫细胞浸润的相关性,并预测UGP2在乳腺癌中的生物学功能及相关信号通路。结果:(1)UGP2的mRNA和蛋白在乳腺癌组织中表达升高(均P<0.05),并与ER阳性、PR阳性状态呈负相关(OR<1,P<0.05),而与Ki-67水平和三阴性乳腺癌亚型呈正相关(OR>1,P<0.05)。(2)UGP2的表达水平升高与乳腺癌患者较差的生存率相关(均P<0.05),是乳腺癌预后的独立不良因素(HR=1.40,P<0.05)。(3)功能分析结果表明UGP2可能通过调控物质代谢、激素信号及免疫微环境促进肿瘤的进展。此外,UGP2表达与NK细胞激活状态呈负相关,与抑制状态呈正相关。结论:UGP2在乳腺癌组织中表达升高,并与患者预后不良密切相关,可能通过代谢重编程和免疫抑制等机制促进癌症的进展。UGP2有望成为乳腺癌的潜在生物标志物和治疗靶点,为个性化治疗提供依据。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 ugp2 生物信息学 免疫浸润 预后
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OsUgp2和otsAB基因共转化增强水稻抗旱抗寒能力 被引量：2
2
作者 郑彦丽 穆虹 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期265-272,共8页
本研究通过农杆菌介导的转化技术,将水稻尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(OsUgp2)与大肠杆菌海藻糖-6-磷酸合成酶/海藻糖-6-磷酸合成酶磷脂酶融合基因(otsAB)共表达载体转化水稻愈伤组织,对获得的转基因植株分别进行干旱和寒冷处理,试... 本研究通过农杆菌介导的转化技术,将水稻尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(OsUgp2)与大肠杆菌海藻糖-6-磷酸合成酶/海藻糖-6-磷酸合成酶磷脂酶融合基因(otsAB)共表达载体转化水稻愈伤组织,对获得的转基因植株分别进行干旱和寒冷处理,试图明确OsUgp2和otsAB共表达是否可以进一步提高转基因水稻植株的抗胁迫能力。表型观察结果显示OsUgp2和otsAB共表达植株(ABU)经干旱和寒冷处理后恢复生长的能力,较otsAB和OsUgp2分别过量表达的转化植株(AB和U)均有所提高。定量PCR检测结果显示:经干旱处理后,转化植株ABU中otsAB和OsUgp2的表达量较未处理植株分别提高1.92倍和1.67倍,与转化植株AB和U中otsAB和OsUgp2表达的增加量相近;而寒冷处理后,转化植株ABU中otsAB和Os-Ugp2的表达量分别增加2.68倍和2.04倍,明显高于转化植株AB和U中otsAB和OsUgp2表达的增加量。液相色谱检测结果显示:OsUgp2和otsAB共表达和单表达均可以提高转化植株中海藻糖的生物合成量,且共转化植株ABU中海藻糖的含量在干旱和寒冷处理前后均是最高的。干旱和寒冷处理后,共转化植株ABU中蔗糖含量的增加也较明显。本研究结果表明OsUgp2和otsAB共表达可以增加转基因水稻植株中海藻糖和蔗糖分子的含量,同时转基因水稻植株的抗旱和耐冷胁迫的能力也得到了一定提高。 展开更多
关键词 水稻 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 Osugp2 otsAB 共表达
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猪UGP2基因表达模式和启动子活性分析
3
作者 Yu J Y 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第5期274-274,共1页
猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-t... 猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-time RTPCR结果表明,UGP2在梅山猪肝脏和骨骼肌中高表达;在不同类型的肌纤维中,UGP2在大白猪的比目鱼肌和背最长肌中高表达。在肌纤维发展的不同阶段,UGP2在大白猪早期生长阶段发挥重要作用,而在梅山猪中起作用较晚。此外,UGP2基因5′-侧翼序列具有启动子活性,尤其转录位点上游588bp序列活性最高。 展开更多
关键词 大白猪 梅山猪 ugp2基因 表达
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基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定 被引量：2
4
作者 武乐 闵开元 +4 位作者 柳江枫 梁万丰 杨晔宏 胡刚 杨俊涛 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期147-153,共7页
目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数... 目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。 展开更多
关键词 浸润性乳腺癌 生物标志物 蛋白质编码基因 ugp2 C3orf80 SPC25
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噻菌灵诱导型水稻转化载体在花粉中的诱导条件研究
5
作者 柯建浩 廖耀平 +1 位作者 骆艺 穆虹 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期127-128,共2页
利用噻菌灵诱导pRNAi-IP-UGP2转化植株,对pRNAi-IP-UGP2载体在水稻花粉中的诱导条件及相应诱导效果进行了系统研究。结果表明,用50 mL噻菌灵溶液(0.8%)隔天喷施转化植株,需要在水稻抽穗前10 d以上诱导才能使该载体的IP启动子在花粉中具... 利用噻菌灵诱导pRNAi-IP-UGP2转化植株,对pRNAi-IP-UGP2载体在水稻花粉中的诱导条件及相应诱导效果进行了系统研究。结果表明,用50 mL噻菌灵溶液(0.8%)隔天喷施转化植株,需要在水稻抽穗前10 d以上诱导才能使该载体的IP启动子在花粉中具有较好的驱动效果。 展开更多
关键词 水稻 诱导型启动子 pRNAi-IP-ugp2
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抗尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2单克隆抗体的制备与鉴定 被引量：2
6
作者 王婉 高媛 +10 位作者 杨金菊 柳晓兰 鞠艳芳 刘莉 陈志成 刘蓉 迟俊 邢维贤 高建恩 安立国 孙启鸿 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第3期563-566,共4页
本研究制备抗人尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2(UDP-glucose pyrophosphorylase2)的单克隆抗体(mAb)并进行初步鉴定。将正常成人肝组织匀浆离心并分离肝脏胞浆总蛋白,用肝脏胞浆总蛋白免疫BALB/c小鼠,采用杂交瘤技术制备单克隆抗体,通过间... 本研究制备抗人尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2(UDP-glucose pyrophosphorylase2)的单克隆抗体(mAb)并进行初步鉴定。将正常成人肝组织匀浆离心并分离肝脏胞浆总蛋白,用肝脏胞浆总蛋白免疫BALB/c小鼠,采用杂交瘤技术制备单克隆抗体,通过间接ELISA法、Western blot及免疫组织化学的方法对单克隆抗体进行特性鉴定,通过Uni-ZAP XR肝脏cDNA表达文库筛选鉴定抗体特异性。结果表明:通过间接ELISA筛选获得1株可稳定分泌抗人UGP2mAb的杂交瘤细胞系BAD062,其分泌的单克隆抗体的Ig亚类(型)为IgG2b(κ),Western blot结果显示该抗体可以特异地识别分子量为56kD的蛋白;应用单克隆抗体BAD062对人肝脏cDNA表达文库(Uni-ZAPXR)进行筛选,阳性噬菌斑测序结果显示2个阳性克隆插入序列均为UGP2。结论:单克隆抗体BAD062特异地识别抗原UGP2,该抗体可用于ELISA检测、Western blot、免疫组织化学实验,为UGP2的研究提供了有力的工具。 展开更多
关键词 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶2 单克隆抗体 CDNA表达文库
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