UGP2在乳腺癌中的表达意义及其促癌机制

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作者 郑子琳 张潇珺 +4 位作者 韩建军 梁心议 郭轩池 梅向辉 何建超 《中国现代普通外科进展》 2025年第3期196-202,共7页

目的:探究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶2(UGP2)在乳腺癌(BC)组织中的表达及其促癌机制,评估其作为乳腺癌诊断及预后生物标志物的潜在价值。方法:(1)通过在线数据库分析UGP2 mRNA和蛋白在乳腺癌中的表达情况,并研究其与临床特征的关系;收... 目的:探究尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶2(UGP2)在乳腺癌(BC)组织中的表达及其促癌机制,评估其作为乳腺癌诊断及预后生物标志物的潜在价值。方法:(1)通过在线数据库分析UGP2 mRNA和蛋白在乳腺癌中的表达情况,并研究其与临床特征的关系;收集114例乳腺癌患者的石蜡组织样本并制成组织芯片,采用免疫组织化学分析验证UGP2在人乳腺癌组织中的表达,并评估其与临床病理特征的关联。(2)使用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归模型分析UGP2表达对乳腺癌预后的影响。(3)采用生物信息学方法探讨UGP2与肿瘤免疫细胞浸润的相关性,并预测UGP2在乳腺癌中的生物学功能及相关信号通路。结果:(1)UGP2的mRNA和蛋白在乳腺癌组织中表达升高(均P<0.05),并与ER阳性、PR阳性状态呈负相关(OR<1,P<0.05),而与Ki-67水平和三阴性乳腺癌亚型呈正相关(OR>1,P<0.05)。(2)UGP2的表达水平升高与乳腺癌患者较差的生存率相关(均P<0.05),是乳腺癌预后的独立不良因素(HR=1.40,P<0.05)。(3)功能分析结果表明UGP2可能通过调控物质代谢、激素信号及免疫微环境促进肿瘤的进展。此外,UGP2表达与NK细胞激活状态呈负相关,与抑制状态呈正相关。结论:UGP2在乳腺癌组织中表达升高,并与患者预后不良密切相关,可能通过代谢重编程和免疫抑制等机制促进癌症的进展。UGP2有望成为乳腺癌的潜在生物标志物和治疗靶点,为个性化治疗提供依据。 展开更多

关键词 乳腺肿瘤 ugp2 生物信息学 免疫浸润 预后

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黑木耳UGP基因家族全基因组鉴定及其与菌丝生长多糖合成的相关性研究

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作者 苏世贤 吴媛 +12 位作者 刘翀 江苏燕 刘青媛 陈孟谈 龙茶 汪淘 徐彦军 田风华 韦金江 郎云龙 牟海林 徐乾城 李伟 《种子》 北大核心 2024年第4期69-80,共12页

黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,... 黑木耳多糖是具有药用价值的生物活性分子,然而黑木耳高多糖的合成分子机理尚未明确。本研究对处于多糖合成途径关键位置的UGP家族基因进行了鉴定,从黑木耳基因组中鉴定出2个AhUGPs基因,并从另外21个食用菌基因组内挖掘出39个UGPs基因,通过生物信息学分析发现,UGP基因家族成员在真菌体内具有较高的保守性,成员数量少但仍发挥着重要作用,木耳属的4个UGPs则表现出了更高的保守性。在对黑木耳AhUGPs的启动子区域分析中发现了较多的光响应元件和激素响应元件,说明AhUGPs较易受到光和激素调节。在对AhUGPs的表征中,发现AhUGP1的表达水平与菌丝生长速度、菌丝生物量、多糖含量都显著相关,相较于AhUGP2,AhUGP1在菌丝生长和多糖合成中的重要性更高。 展开更多

关键词 黑木耳 ugp基因家族 多糖合成 菌丝生长

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铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子偏好性分析 被引量：17

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作者 孙晶 何涛 +2 位作者 万闰兰 彭小凤 淳泽 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期759-766,共8页

尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主... 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主克隆的铁皮石斛UGP基因(GenBank登录号:KF711982.1)的密码子偏好性,并与其他物种的UGP基因以及基因组进行比较.结果显示,铁皮石斛UGP基因偏好使用A/T结尾的密码子,27种偏好密码子(RSCU>1)中偏好性较强的有TAA和CCU(RSCU≥2).与其他物种的UGP基因密码子使用对比后,发现不同物种UGP基因密码子使用偏好性存在一定差异.在9个所选物种的聚类分析中,发现基于UGP基因CDS序列聚类的进化树比基于RSCU的聚类更与传统的系统发育观点接近.与3种生物基因组密码子使用频率比较发现,与大肠杆菌基因组密码子使用频率差值较大的有23个,与酵母和拟南芥基因组差值较大的均有13个,这预示着铁皮石斛UGP基因在酵母和拟南芥中的表达效率较高.本研究结果为铁皮石斛UGP基因选择最佳的外源表达系统以及提高其表达水平奠定了前期的研究基础. 展开更多

关键词 铁皮石斛 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(ugp) 密码子偏好性 聚类分析

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羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株UgpB蛋白B细胞抗原表位分析

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作者 周庆安 李军 +3 位作者 潘艳 陈泽祥 杨威 许力干 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第3期26-29,共4页

为了预测羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株Ugp B蛋白B细胞抗原表位情况,试验应用PCR方法对羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株的Ugp B基因进行扩增、克隆和测序,并应用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析Ugp B蛋白的α-螺旋、β-折叠、转... 为了预测羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株Ugp B蛋白B细胞抗原表位情况,试验应用PCR方法对羊种布氏杆菌NN1202和LA1105株的Ugp B基因进行扩增、克隆和测序,并应用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析Ugp B蛋白的α-螺旋、β-折叠、转角区域和无规卷曲及应用Kyte-Doolittle方法、Karplus-Schulz方法、Emini方法和Jameson-Wolf方法分析蛋白的氨基酸亲水性、蛋白柔性区域、溶剂表面可能性和抗原指数。结果表明：NN1202和LA1105株的Ugp B蛋白在布氏杆菌种间高度保守,Ugp B蛋白的36∽41、48∽57、64∽72、78∽85、115∽19、131∽138、159∽174、180∽191、209∽221、248∽258、273∽280、293∽307、354∽372、378∽386、409∽419位氨基酸序列区域可能是优势B细胞抗原表位。说明Ugp B蛋白序列存在合成肽疫苗的靶位点。 展开更多

关键词 布氏杆菌 NN1202 LA1105 ugp B 抗原表位

原文传递

通用大型图形画面异步打印输出系统UGPS的设计与实现

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作者 沈军 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 1996年第5期21-26,共6页

在分析现有的两大类图形打印软件的缺点的基础上，提出了一种全新的图形打印输出技术——分带输出技术。开创了大型图形画面打印输出的新路子。具有一定的理论意义和实用价值。基于此技术的一个开放式、多功能、通用图形打印输出工具系... 在分析现有的两大类图形打印软件的缺点的基础上，提出了一种全新的图形打印输出技术——分带输出技术。开创了大型图形画面打印输出的新路子。具有一定的理论意义和实用价值。基于此技术的一个开放式、多功能、通用图形打印输出工具系统ＵＧＰＳ已经实现，此文论述其设计思想、特点及实现技术。 展开更多

关键词 图形格式 ugpS 图形打印 图形处理

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通用大型图形画面异步打印输出系统UGPS的设计与实现

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作者 沈军 《计算机应用与软件》 CSCD 1999年第3期44-50,共7页

本文在分析现有的两大类图形打印软件的缺点的基础上,提出了一种全新的图形打印输出技术——分带输出技术。开创了大型图形画面打印输出的新路子。具有一定的理论意义和实用价值。基于此技术,设计并实现了一个开放式、多功能、通用图形... 本文在分析现有的两大类图形打印软件的缺点的基础上,提出了一种全新的图形打印输出技术——分带输出技术。开创了大型图形画面打印输出的新路子。具有一定的理论意义和实用价值。基于此技术,设计并实现了一个开放式、多功能、通用图形打印输出工具系统UGPS。本文论述了UGPS的设计思想、特点及实现技术。 展开更多

关键词 图形格式 分带输出 ugpS 图形处理 图形打印

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梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析

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作者 廖倩 黄艳 +3 位作者 胡尚连 曹颖 卢学琴 徐刚 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期498-502,共5页

以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP（Genebank：KJ525752）。测序结果显示该序列全长1561 ... 以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP（Genebank：KJ525752）。测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422 bp,编码473个氨基酸。梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均含有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NBloop环和l-loop环。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90-379氨基酸,证明Df UGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。 展开更多

关键词 梁山慈竹 ugp 克隆 生物信息学

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猪UGP2基因表达模式和启动子活性分析

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作者 Yu J Y 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第5期274-274,共1页

猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-t... 猪UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2(UGP2)基因的功能目前尚不明确。本研究从大白猪和中国地方猪种梅山猪中提取RNA,检测UGP2在肌肉组织基因表达变化中的时序调控。试验克隆了猪UGP2全基因组DNA序列和2077bp的5′-侧翼序列,拼接获得全序列。Real-time RTPCR结果表明,UGP2在梅山猪肝脏和骨骼肌中高表达;在不同类型的肌纤维中,UGP2在大白猪的比目鱼肌和背最长肌中高表达。在肌纤维发展的不同阶段,UGP2在大白猪早期生长阶段发挥重要作用,而在梅山猪中起作用较晚。此外,UGP2基因5′-侧翼序列具有启动子活性,尤其转录位点上游588bp序列活性最高。 展开更多

关键词 大白猪 梅山猪 ugp2基因 表达

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基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定 被引量：2

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作者 武乐 闵开元 +4 位作者 柳江枫 梁万丰 杨晔宏 胡刚 杨俊涛 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期147-153,共7页

目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数... 目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。 展开更多

关键词 浸润性乳腺癌 生物标志物 蛋白质编码基因 ugp2 C3orf80 SPC25

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植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶 Ⅱ.尿苷二磷酸-葡萄糖焦磷酸化酶 被引量：5

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作者 高振宇 黄大年 《生命的化学》 CAS CSCD 1998年第4期30-34,共5页

植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶Ⅱ．尿苷二磷酸┐葡萄糖焦磷酸化酶高振宇黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词ＵＧＰＵＤＰＧ负协同顺序机制基因表达调控尿苷二磷酸－葡萄糖焦磷酸化酶（ＵＧＰ，ＥＣ２．７．７．９）在植... 植物中蔗糖和淀粉合成的关键酶Ⅱ．尿苷二磷酸┐葡萄糖焦磷酸化酶高振宇黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词ＵＧＰＵＤＰＧ负协同顺序机制基因表达调控尿苷二磷酸－葡萄糖焦磷酸化酶（ＵＧＰ，ＥＣ２．７．７．９）在植物、动物和细菌中广泛分布，在植物的... 展开更多

关键词 ugp UDPG 负协同 顺序机制 基因表达调控

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UCP600的新变化对出口商的影响及对策

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作者 郑玮剑 《中国经贸》 2009年第22期12-12,共1页

本文通过对UCP600与UCP500的比较分析，针对UCP600的变化主要对我国出口商的影响进行深入、细致的研究，并对实务中应当注意的问题进行阐述。

关键词 ugp600 新变化 出口商

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基于虚拟仪器技术的水下定位导航系统

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作者 冀明 叶家玮 《广东造船》 2008年第1期24-26,共3页

在人类对水下世界进行探索和研究工作中,定位导航技术一直是一项重要的研究内容,声学定位系统和GPS系统联合组成的水下GPS系统可以获取载体在水下工作时的更多信息。水下GPS系统是一个跨多学科,包括空间物理学,水声学,GPS技术,坐标系变... 在人类对水下世界进行探索和研究工作中,定位导航技术一直是一项重要的研究内容,声学定位系统和GPS系统联合组成的水下GPS系统可以获取载体在水下工作时的更多信息。水下GPS系统是一个跨多学科,包括空间物理学,水声学,GPS技术,坐标系变化等的综合性很强的复杂系统。本文从理论和实际两方面来讨论采用短基线定位系统和GPS系统联合构成的水下GPS系统,并用虚拟仪器技术来实现。 展开更多

关键词 水下机器人 定位导航系统 水下GPS系统

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