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基于生物信息学探究UBE2S在肝细胞癌中的作用机制 被引量:1
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作者 朱招蓉 杨洁 +3 位作者 李怡梅 李欣怡 曹颖 熊林洪 《医学研究前沿》 2025年第4期51-54,共4页
肝细胞癌(HCC)是一种高致死性肿瘤,其进展与泛素结合酶UBE2S密切相关,但具体机制尚不明确。本研究通过整合分析多个公共数据库,系统解析UBE2S在HCC中的作用。基于TIMER2.0、UALCAN等数据库分析,发现UBE2S在HCC组织中表达显著升高(p<0... 肝细胞癌(HCC)是一种高致死性肿瘤,其进展与泛素结合酶UBE2S密切相关,但具体机制尚不明确。本研究通过整合分析多个公共数据库,系统解析UBE2S在HCC中的作用。基于TIMER2.0、UALCAN等数据库分析,发现UBE2S在HCC组织中表达显著升高(p<0.001),且高表达患者总生存期缩短。进一步探索发现,UBE2S表达与PD-L1、CTLA-4等免疫检查点分子显著相关。此外,利用StarBase构建的非编码RNA调控网络,筛选出非编码RNA(ncRNA)相关的潜在通路7条,这些通路可能是UBE2S在HCC中最具前景的研究方向。我们的研究结果揭示了UBE2S在HCC中的潜在作用,并为其调控机制和医学意义提供了新的见解。 展开更多
关键词 肝细胞癌 非编码RNA ube2s
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高表达UBE2S通过增加癌细胞干性促进肝癌的进程机制
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作者 陈浩 李振汉 +3 位作者 王明婷 卢林明 唐乾利 罗良平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期455-464,共10页
目的探究UBE2S在肝癌微环境不同细胞类型的特异性表达及对肝癌细胞干性的影响。方法使用TCGA数据库分析肝癌中UBE2S转录水平及其启动子甲基化水平差异,使用CPTAC数据库分析UBE2S蛋白水平差异。使用TISCH单细胞测序数据挖掘UBE2S在不同... 目的探究UBE2S在肝癌微环境不同细胞类型的特异性表达及对肝癌细胞干性的影响。方法使用TCGA数据库分析肝癌中UBE2S转录水平及其启动子甲基化水平差异,使用CPTAC数据库分析UBE2S蛋白水平差异。使用TISCH单细胞测序数据挖掘UBE2S在不同细胞类型中的表达,并分析细胞通讯的强度以及细胞群各自的关键转录因子。免疫组化验证UBE2S在肝癌组织中的表达;多色免疫荧光检测UBE2S在肝癌细胞以及T细胞的表达情况。利用shRNA敲低肝癌细胞HCC-LM3中的UBE2S,分为shCtrl(对照组)、shUBE2S-1(敲低组1)、shUBE2S-2(敲低组2)3个组,利用克隆形成实验、悬浮成球实验检测UBE2S敲低对HCC-LM3干性影响。结果UBE2S在TCGA数据库中非配对肿瘤组织中高表达(P<0.001),配对肿瘤组织中也高表达(P<0.001),随着肿瘤分级增高,转录水平逐渐增高(P<0.001);在CPTAC数据库中肝癌组织UBE2S蛋白水平表达也增高(P<0.001);肝癌中UBE2S启动子甲基化水平降低(P<0.001);TP53突变组UBE2S转录水平更高(P<0.001)。单细胞测序结果显示,UBE2S在T细胞等细胞群高表达;内皮与上皮及成纤维细胞之间的细胞交互强度较高,SMAD1等转录因子可能是Tprolif细胞关键转录因子。与正常组织相比,UBE2S在肝癌组织高表达;且在肝癌细胞和T细胞中均有较高表达。克隆形成实验显示:与shCtrl组相比,敲低UBE2S能减少肝癌细胞克隆形成数目(shUBE2S-1,P<0.05、P<0.01;shUBE2S-2,P<0.01、P<0.05);悬浮成球实验显示:与shCtrl组相比,敲低UBE2S能减少肝癌细胞肿瘤球形成数目(shUBE2S-1,P<0.05、P<0.01;shUBE2S-2,P<0.01、P<0.01)。结论UBE2S在肝癌组织T细胞中高表达,与预后不良相关,且其能促进肝癌细胞干细胞特性。 展开更多
关键词 单细胞测序 ube2s 肝癌 T细胞
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UBE2S在消化系统肿瘤中的研究进展
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作者 李湾 马遇庆 《临床医学进展》 2023年第11期17659-17664,共6页
泛素结合酶2S (UBE2S)作为泛素结合酶(E2)家族成员之一,是一种细胞周期调控的泛素结合酶,在消化系统肿瘤中特异性表达,且表达水平明显高于癌旁组织,同时UBE2S高表达患者预后较差。研究表明UBE2S在口腔鳞癌、食管癌、胃癌、肝细胞癌、胆... 泛素结合酶2S (UBE2S)作为泛素结合酶(E2)家族成员之一,是一种细胞周期调控的泛素结合酶,在消化系统肿瘤中特异性表达,且表达水平明显高于癌旁组织,同时UBE2S高表达患者预后较差。研究表明UBE2S在口腔鳞癌、食管癌、胃癌、肝细胞癌、胆囊癌和胰腺癌等消化系统肿瘤中发挥促癌的作用,因此UBE2S可能成为消化系统肿瘤早期诊断及预后预测的标志物。本文就UBE2S的结构和功能及其与消化系统肿瘤的研究进展作一综述,为诊治消化系统肿瘤提供理论依据。 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 ube2s 肿瘤标志物 诊断 预后
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Functions of three ubiquitin-conjugating enzyme 2 genes in hepatocellular carcinoma diagnosis and prognosis 被引量:4
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作者 Chun-Ye Zhang Ming Yang 《World Journal of Hepatology》 2022年第5期956-971,共16页
BACKGROUND Liver cancer ranks the third cause of cancer-related death worldwide.The most common type of liver cancer is hepatocellular carcinoma(HCC).The survival time for HCC patients is very limited by years due to ... BACKGROUND Liver cancer ranks the third cause of cancer-related death worldwide.The most common type of liver cancer is hepatocellular carcinoma(HCC).The survival time for HCC patients is very limited by years due to the lack of efficient treatment,failure of early diagnosis,and poor prognosis.Ubiquitination plays an essential role in the biochemical processes of a variety of cellular functions.AIM To investigate three ubiquitination-associated genes in HCC.METHODS Herein,the expression levels of ubiquitin-conjugating enzymes 2(UBE2)including UBE2C,UBE2T,and UBE2S in tumor samples of HCC patients and nontumor controls at the Cancer Genome Atlas(TCGA)database,was comprehensively analyzed.The relationship of UBE2 gene expression level with cancer stage,prognostic outcome,and TP53 mutant status was studied.RESULTS Our results showed that UBE2C,UBE2T,and UBE2S genes were overexpressed in HCC samples compared to non-tumor tissues.Dependent on the cancer progression stage,three UBE2 genes showed higher expression in tumor tissues at all four stages compared to non-tumor control samples.Furthermore,a significantly higher expression of these genes was found in stage 2 and stage 3 cancers compared to stage 1 cancer.Additionally,overexpression of those genes was negatively associated with prognostic outcome and overall survival time.Patients with TP53 mutation showed a higher expression level of three UBE2 genes,indicating an association between UBE2 expression with p53 function.CONCLUSION In summary,this study shed light on the potential roles of UBE2C,UBE2T,UBE2S on diagnostic and prognostic biomarkers for HCC.Moreover,based on our findings,it is appealing to further explore the correlation of those genes with TP53 mutation in HCC and the related mechanisms. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma Ubiquitin-conjugating enzyme 2 UBE2C UBE2T ube2s TP53 mutant BIOMARKER Diagnostic PROGNOSTICS
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