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斑节对虾UBE2H基因克隆及其表达 被引量:3
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作者 唐蕾 傅明骏 +3 位作者 刘文生 黄建华 周发林 江世贵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1958-1965,共8页
【目的】克隆斑节对虾(Penaeusmonodon)泛素结合酶E2 H基因(UBE2H),了解其组织特异性表达情况,为揭示UBE2H在斑节对虾卵巢发育过程的作用提供依据。【方法】PCR扩增斑节对虾UBE2H基因的开放阅读框,利用实时荧光定量PCR检测UBE2H... 【目的】克隆斑节对虾(Penaeusmonodon)泛素结合酶E2 H基因(UBE2H),了解其组织特异性表达情况,为揭示UBE2H在斑节对虾卵巢发育过程的作用提供依据。【方法】PCR扩增斑节对虾UBE2H基因的开放阅读框,利用实时荧光定量PCR检测UBE2H基因在斑节对虾各组织及不同发育期斑节对虾肝胰腺和卵巢中的表达情况;并构建pET32a-UBE2H原核表达重组质粒,进行诱导表达及蛋白纯化。【结果】克隆获得的斑节对虾UBE2H基因全长1010 bp (GenBank登录号KU870456),其中,5'非编码区77 bp,3'非编码区378 bp,开放阅读框555 bp(编码184个氨基酸)。斑节对虾UBE2H蛋白等电点(pI)4.88,分子量20.85 kD。斑节对虾UBE2H氨基酸序列与其他物种相似度很高,为78.00%-83.00%。实时荧光定量PCR检测结果显示,UBE2H基因在斑节对虾淋巴组织中表达量最高,其次为鳃;在斑节对虾不同卵巢发育期肝胰腺和卵巢中的表达量均呈先上升后下降的变化趋势,但其峰值出现时间存在差异,肝胰腺的最高表达量出现在卵巢III期,卵巢的最高表达量出现在卵巢II期。经原核表达获得的斑节对虾UBE2H融合蛋白约39.00 kD,纯化后的蛋白浓度为2.92μg/μL。【结论】斑节对虾UBE2H参与了其卵母细胞发育和肝胰腺中卵黄蛋白的转运过程,与斑节对虾的卵巢发育密切相关。 展开更多
关键词 斑节对虾 ube2h基因 克隆 实时荧光定量PCR 原核表达
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大菱鲆高温胁迫应答主效QTL候选基因的表达特性分析 被引量:6
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作者 刘晓菲 马爱军 +3 位作者 黄智慧 刘志峰 杨双双 杨凯 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1407-1415,共9页
为研究大菱鲆高温胁迫下相关应激基因的表达影响,采用Real-time PCR对本课题组已定位到的大菱鲆高温胁迫应答主效QTL中的4个候选基因(p53、UBE2H、ZNF469和MAGI2基因)在不同温度胁迫下的肝脏、鳃、脾脏、皮肤4个组织中的表达量进行检测... 为研究大菱鲆高温胁迫下相关应激基因的表达影响,采用Real-time PCR对本课题组已定位到的大菱鲆高温胁迫应答主效QTL中的4个候选基因(p53、UBE2H、ZNF469和MAGI2基因)在不同温度胁迫下的肝脏、鳃、脾脏、皮肤4个组织中的表达量进行检测。以大菱鲆正常生活水温14℃为对照组,20℃、23℃、25℃和28℃为实验组,进行数据分析。结果显示,4个基因在各个组织中均有表达,且表达量具有组织和温度特异性。其中UBE2H的表达量在4个组织中均呈现出先上升后下降的趋势,在肝脏、脾脏、皮肤组织中20℃时急剧上升并达到峰值且差异显著;在鳃组织中23℃时达峰值,差异显著。p53在4个组织中的表达量均有先上升后下降的趋势,但在鳃和皮肤组织中28℃时表达量急剧升高达到峰值且差异显著。ZNF469和MAGI2在4个组织中均在20℃时大量表达,并远高于其他温度。研究表明,在大菱鲆高温胁迫应答过程中p53基因与DNA修复和细胞凋亡密切相关,而UBE2H基因参与的泛素-蛋白酶体途径对p53基因具有反馈调节作用,是维持细胞稳态的关键基因;ZNF469和MAGI2在作为鱼类应答高温胁迫的生物标志物方面具有重要研究价值。 展开更多
关键词 大菱鲆 P53基因 ube2h基因 ZNF469基因 MAGI2基因 高温胁迫
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维甲酸诱导小鼠神经管畸形胚脑中H2BK120ub1的全基因组状态变化 被引量:1
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作者 王珊 何学佳 +3 位作者 成翕悦 林烨 裴培 占小俊 《中国儿童保健杂志》 CAS CSCD 2022年第7期731-736,共6页
目的 利用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)分析E10.5 d正常小鼠胚脑组织与维甲酸(RA)诱导神经管缺陷(NTDs)小鼠胚脑组织H2BK120单泛素化(H2BK120ub1)修饰的全基因图谱,以期发现H2BK120ub1修饰与神经管发育通路基因表达的关系,为NTD... 目的 利用染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)分析E10.5 d正常小鼠胚脑组织与维甲酸(RA)诱导神经管缺陷(NTDs)小鼠胚脑组织H2BK120单泛素化(H2BK120ub1)修饰的全基因图谱,以期发现H2BK120ub1修饰与神经管发育通路基因表达的关系,为NTDs的诊断及治疗提供生物学靶点及依据。方法 孕鼠分为随机对照组和RA诱导的NTDs组,利用ChIP-seq技术对获得的H2BK120ub1特异结合DNA片段进行序列鉴定,获取比对Reads,进行全基因组的Peak分析、基因注释(GO)以及功能富集分析peak相关基因的生物学功能。结果 E10.5 d正常小鼠脑组织和RA诱导神经管畸形小鼠脑组织两组间有306个基因有显著的H2BK120ub1差异,根据GO富集的基因个数进行统计:在cellular component中前三位为别为Cell(82个基因), Cell part(82个基因),Organelle part(52个基因);在biological process中前三位为别为celluar process(68个基因),metabolic process(47个基因),biological regulation(40个基因);KEGG通路分析的结果主要富集于刺猬因子(HH)信号通路、TGF-beta信号通路、Wnt信号通路等参与调控神经管发育的关键信号通路,有显著统计学意义(P<0.05)。结论 H2BK120ub1修饰的差异可作为NTDs的一个潜在的诊断及治疗靶点。 展开更多
关键词 维甲酸 H2BK120ub 神经管缺陷 染色质免疫共沉淀测序技术
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Genomewide decoupling of H2AK119ub1 and H3K27me3 in early mouse development 被引量:2
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作者 Yezhang Zhu Jiali Yu +6 位作者 Yan Rong Yun-Wen Wu Yang Li Lejiao Zhang Yinghao Pan Heng-Yu Fan Li Shen 《Science Bulletin》 SCIE EI CSCD 2021年第24期2489-2497,M0004,共10页
Polycomb group(Pc G)proteins are crucial chromatin regulators during development.H2 AK119 ub1(H2 Aub)and H3 K27 me3 are catalyzed by Polycomb-repressive complex 1 and 2(PRC1/2)respectively,and they largely overlap in ... Polycomb group(Pc G)proteins are crucial chromatin regulators during development.H2 AK119 ub1(H2 Aub)and H3 K27 me3 are catalyzed by Polycomb-repressive complex 1 and 2(PRC1/2)respectively,and they largely overlap in the genome due to mutual recruitment of the two complexes.However,it is unclear whether PRC1/H2 Aub and PRC2/H3 K27 me3 can also function independently.By developing an ultra-sensitive carrier-DNA-assisted chromatin immunoprecipitation sequencing method termed CATCH-Seq,we generated allelic H2 Aub profiles in mouse gametes and early embryos.Our results revealed an unexpected genomewide decoupling of H2 Aub and H3 K27 me3 in mouse preimplantation embryos,where H2 Aub but not H3 K27 me3 was enriched at Pc G targets while only H3 K27 me3 was deposited in the broad distal domains associated with DNA methylation-independent non-canonical imprinting.These observations suggest that H2 Aub represses future bivalent genes during early embryogenesis without H3 K27 me3,but it is not required for the maintenance of non-canonical imprinting,which is mediated by maternal H3 K27 me3.Thus,our study reveals the distinct depositions and independent functions of H2 Aub and H3 K27 me3 during early mammalian development. 展开更多
关键词 POLYCOMB H2AK119ub1 H3K27me3 Preimplantation development Non-canonical imprinting
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Intracellular HSP70L1 inhibits human dendritic cell maturation by promoting suppressive H3K27me3 and H2AK119Ub1 histone modifications 被引量:1
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作者 Lin Yi Zhiqing Li +4 位作者 Tianju Hu Juan Liu Nan Li Xuetao Cao Shuxun Liu 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期85-94,共10页
Epigenetic regulation has been attracting increasing attention due to its role in cell differentiation and behaviors.However,the epigenetic mechanisms that regulate human dendritic cell(DC)differentiation and developm... Epigenetic regulation has been attracting increasing attention due to its role in cell differentiation and behaviors.However,the epigenetic mechanisms that regulate human dendritic cell(DC)differentiation and development remain poorly understood.Our previous studies show that extracellular heat shock protein 70-like protein(HSP70L1)is a potent adjuvant of Th1 responses via stimulating DCs when released from cells;however,the role of intracellular HSP70L1 in DC differentiation and maturation remains unknown.Herein,we demonstrate that intracellular HSP70L1 inhibits human DC maturation by suppressing MHC and costimulatory molecule expression,in contrast to the adjuvant activity of extracellular HSP70L1.The stability of intracellular HSP70L1 is dependent on DNAJC2,a known epigenetic regulator.Mechanistically,intracellular HSP70L1 inhibits the recruitment of Ash1l to and maintains the repressive H3K27me3 and H2AK119Ub1 modifications on the promoter regions of costimulatory,MHC and STAT3 genes.Thus,intracellular HSP70L1 is an inhibitor of human DC maturation.Our results provide new insights into the epigenetic regulation of cell development by intracellular HSP70L1. 展开更多
关键词 HSP70L1 DNAJC2 Monocyte-derived dendritic cell Histone modification H3K27me3 H2AK119Ub1 H3K4me3
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