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蒌蒿DNA提取、RAPD优化及引物筛选初报 被引量:7
1
作者 李双梅 郭宏波 +1 位作者 黄新芳 柯卫东 《中国农学通报》 CSCD 2006年第4期78-80,共3页
为了能从分子水平探讨蒌蒿资源的遗传多样性、蒿属的系统分类和种质资源的鉴定,在此,报道采用小量法(SDS法)和大量法(CTAB法)提取蒌蒿DNA,建立优化的RAPD-PCR体系,并进行引物初步筛选。结果显示,两种抽提方法都可有效抽提出高质量的DNA... 为了能从分子水平探讨蒌蒿资源的遗传多样性、蒿属的系统分类和种质资源的鉴定,在此,报道采用小量法(SDS法)和大量法(CTAB法)提取蒌蒿DNA,建立优化的RAPD-PCR体系,并进行引物初步筛选。结果显示,两种抽提方法都可有效抽提出高质量的DNA,大量法得率要明显高于小量法,但小量法抽提的DNA也足够RAPD-PCR反应几十至上百次,不同的实验室可根据实验的需要进行选择。对两种方法抽提的DNA,都进行PCR扩增体系梯度摸索,最优的RAPD-PCR反应条件为:25μl反应体系中,含DNA模板约20ng,10×TaqDNA聚合酶缓冲液2.5μl,2μldNTPs(2.5mM),Mg2+2μl(25mM),TaqDNA聚合酶0.15μl(5U/μl),引物0.5μl(25μM),其余以双蒸水补充。在剔除了重复性差,条带模糊和单态的引物后,有九个引物表现稳定,扩增出来的条带清晰、多态性高。 展开更多
关键词 萎蒿 DNA提取 RAPD-PCR体系优化 引物筛选 Anemisia selengensis turez.
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防风多糖的抗氧化活性研究 被引量:74
2
作者 张泽庆 田应娟 张静 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期268-272,共5页
目的:研究防风多糖的抗氧化活性。方法:采用水提醇沉法提取防风多糖,利用CTAB沉淀法对防风多糖进行分离,得到酸性防风多糖(A-SPS)和中性防风多糖(N-SPS)。在体外化学模拟条件下,研究不同防风多糖的总还原能力以及对超氧阴离子(O2-.)、... 目的:研究防风多糖的抗氧化活性。方法:采用水提醇沉法提取防风多糖,利用CTAB沉淀法对防风多糖进行分离,得到酸性防风多糖(A-SPS)和中性防风多糖(N-SPS)。在体外化学模拟条件下,研究不同防风多糖的总还原能力以及对超氧阴离子(O2-.)、羟基自由基(.OH)、1,1-二苯基-2苦苯肼自由基(DPPH.)的清除作用和对Fe2-诱导的脂质过氧化反应的抑制作用。结果:防风多糖具有一定的清除自由基、抑制脂质过氧化的能力,其中对.OH和DPPH.具有较强的清除作用。在几种防风多糖中,以A-SPS的效果较好,当实验浓度为8 mg/m l时,对.OH和DPPH.的清除率均接近于70%。结论:A-SPS具有较强的抗氧化作用,可能是防风多糖的主要活性组分,可作为潜在天然抗氧化剂应用于食品和医药工业中。 展开更多
关键词 防风 多糖 抗氧化
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气相色谱-质谱法测定北五味子中挥发油成分 被引量:12
3
作者 朱凤妹 杜彬 +2 位作者 李军 高海生 刘长江 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期149-152,共4页
采用同时蒸馏浸提的方法提取北五味子中挥发油成分,测得其挥发油的含量为6.30%。利用气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法从北五味子挥发油中分离并确认出39种化学成分,用峰面积归一化法通过G1710BA化学站数据处理系统得出各化学成分在挥发油... 采用同时蒸馏浸提的方法提取北五味子中挥发油成分,测得其挥发油的含量为6.30%。利用气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法从北五味子挥发油中分离并确认出39种化学成分,用峰面积归一化法通过G1710BA化学站数据处理系统得出各化学成分在挥发油中的相对百分含量,其中主要成分为:衣兰烯、2,6-二甲基-双环[3.1.1]庚-2-烯、3-甲醇,1-甲基-8(1-甲撑)-三环[4.4.0.02,7]脱氢-3-烯。 展开更多
关键词 北五味子 挥发油 蒸馏 GC/MS
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观音草的化学成分研究 被引量:12
4
作者 戴胜军 唐文照 丁杏苞 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期97-98,共2页
目的:研究观音草的化学成分。方法:利用硅胶柱层析和薄层层析进行分离和纯化,根据化合物的理化性质和光谱数据鉴定其结构。结果:从观音草中分离和鉴定出6个化合物,分别为正三十三烷醇(n-Tritriacontanol,Ⅰ),正三十二烷酸(n-dotriaconta... 目的:研究观音草的化学成分。方法:利用硅胶柱层析和薄层层析进行分离和纯化,根据化合物的理化性质和光谱数据鉴定其结构。结果:从观音草中分离和鉴定出6个化合物,分别为正三十三烷醇(n-Tritriacontanol,Ⅰ),正三十二烷酸(n-dotriacontanoic acid,Ⅱ),β-谷甾醇(β-sitosterol,Ⅲ),大豆苷(daidzin,Ⅳ),肌醇(L-chiroinositol,Ⅴ),6-羟基-3-吡啶羧酸(6-hydroxy-3-pyridinecarboxylic acid,Ⅵ)。结论:化合物Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ为首次从该植物中分离得到。 展开更多
关键词 化学成分 首次 大豆苷 Β-谷甾醇 硅胶柱层析 薄层层析 鉴定 化合物 十二烷酸 研究
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GC法同时测定五味子挥发油中α-蒎烯、β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯的含量 被引量:8
5
作者 沈振铎 陈晓辉 +2 位作者 刘玉磊 倪蕊婷 毕开顺 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1470-1473,共4页
目的:建立同时测定五味子挥发油中α-蒎烯、β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯4种成分含量的气相色谱方法。方法:采用水蒸气蒸馏法进行挥发油的提取,采用 GC 法对挥发油中α-蒎烯β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯4种成分进行含量测定。气相色谱条... 目的:建立同时测定五味子挥发油中α-蒎烯、β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯4种成分含量的气相色谱方法。方法:采用水蒸气蒸馏法进行挥发油的提取,采用 GC 法对挥发油中α-蒎烯β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯4种成分进行含量测定。气相色谱条件:DB-17石英毛细管色谱柱(30 m×0.25 mm×0.25 μm);氢火焰离子化检测器(FID);进样口温度230℃;检测器温度250℃;柱温以50℃为起始温度,保持2 min,以10℃·min^(-1)升温至130℃,保持5 min;载气为氮气,流速为1.2 mL·min^(-1);进样方式为分流进样,分流比10:1;进样量为1μL。结果:α-蒎烯、β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯进样浓度分别在0.02~0.21mg·mL^(-1)(r=0.9998),0.006~0.10 mg·mL^(-1)(r=0.9993),0.006~0.16 mg·mL^(-1)(r=0.9994),0.04~1.00 mg·mL^(-1)(r=0.9993)范围内呈良好线性关系;平均回收率(n=3)分别为99.5%~101.6%,96.3%~101.9%,98.6%~100.4%,96.1%~96.8%。结论:方法简便快速,可用于五味子挥发油中α-蒎烯β-蒎烯、柠檬烯和乙酸龙脑酯4种成分的含量测定。 展开更多
关键词 五味子 挥发油 Α-蒎烯 Β-蒎烯 柠檬烯 乙酸龙脑酯 气相色谱法
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地笋生长发育规律及营养成分的初步研究 被引量:14
6
作者 李蕾 王永 云兴福 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2005年第5期50-53,共4页
对野生蔬菜--地笋生育规律及产品(根状茎)的营养成分进行观测研究.结果表明:地笋根状茎萌发的最低10 cm地温为3.5℃;出苗期的最适10 cm地温范围为3.5~11.0℃;幼苗期的最适10 cm地温范围为11.0~26.2℃;根据植株生长动态,可将其生育时... 对野生蔬菜--地笋生育规律及产品(根状茎)的营养成分进行观测研究.结果表明:地笋根状茎萌发的最低10 cm地温为3.5℃;出苗期的最适10 cm地温范围为3.5~11.0℃;幼苗期的最适10 cm地温范围为11.0~26.2℃;根据植株生长动态,可将其生育时期划分为出苗期(24 d)、幼苗期(40 d)、成株期(或为植株快速生长期)(50 d)、根状茎膨大期(50 d)和植株衰老期(30 d);系统观测了地笋植株的植物学性状;测定了地笋根状茎的营养成分含量;用其直立茎和匍匐茎进行扦插繁殖,成活率均为100%. 展开更多
关键词 野生蔬菜 地笋 生育规律 营养成分
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中空纤维膜超滤技术在百蕊草水提液中的研究 被引量:4
7
作者 刘洋 邓玉林 +2 位作者 徐志慧 戴荣继 禹玉洪 《功能材料》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1887-1889,1897,共4页
研究了聚偏氟(PVDF)及聚砜(PS)中空纤维膜在百蕊草提取液初分离过程中的应用。在超滤过程中,从温度、操作压力、预处理方法及膜清洗方法等因素对膜通量的影响进行了考察,并与传统的醇沉方法相比较,以提取物得率和总黄酮含量两个指标进... 研究了聚偏氟(PVDF)及聚砜(PS)中空纤维膜在百蕊草提取液初分离过程中的应用。在超滤过程中,从温度、操作压力、预处理方法及膜清洗方法等因素对膜通量的影响进行了考察,并与传统的醇沉方法相比较,以提取物得率和总黄酮含量两个指标进行评价。结果表明,超滤可以有效地除去蛋白等大分子物质和富集有效物质,使用中空纤维膜超滤技术在百蕊草的分离中是可行的。 展开更多
关键词 超滤 膜通量 百蕊草
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佩兰的化学成分 被引量:10
8
作者 杨锦强 杨念云 吴啟南 《中国药业》 CAS 2017年第21期4-6,共3页
目的研究佩兰Eupatorium fortunei Turez的化学成分。方法采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20凝胶柱色谱,以及重结晶等技术,对佩兰的化学成分进行分离纯化,并通过~1H-NMR,^(13)C-NMR,质谱等技术对化合物进行结构鉴定。结果从佩兰中分离得到... 目的研究佩兰Eupatorium fortunei Turez的化学成分。方法采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20凝胶柱色谱,以及重结晶等技术,对佩兰的化学成分进行分离纯化,并通过~1H-NMR,^(13)C-NMR,质谱等技术对化合物进行结构鉴定。结果从佩兰中分离得到8个化合物,分别为1-O-β-D-吡喃葡萄糖基-(2 S,3 S,4 R,8 E)-2-[(2'-R)-2'-羟基棕榈酰胺]-8-十八烯-1,3,4-三醇(化合物1),1-O-β-D-吡喃葡萄糖-(2 S,3 S,4 R,8 E)-2-[(2'-R)-2'-羟基二十四烷酰胺]-8-十八烯-1,3,4-三醇(化合物2),蒲公英甾醇(化合物3),蒲公英甾醇乙酸酯(化合物4),2-O-β-D-吡喃葡萄糖基反式肉桂酸(化合物5),异鼠李素-3-O-芸香糖苷(化合物6),尿嘧啶(化合物7),3,5-二羟基苯甲酸(化合物8)。化合物1和化合物2为脑苷脂类化合物。结论所有化合物均为首次从该佩兰中分离得到。 展开更多
关键词 佩兰 脑苷脂类 蒲公英甾醇 2-O-β-D-吡喃葡萄糖基反式肉桂酸
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五味子护肝片对小鼠急性酒精性肝损伤的保护作用 被引量:7
9
作者 杨黎彬 贾敏 +4 位作者 刘少静 刁颖博 张玉琪 肖秋茹 秦蓓 《贵州医药》 CAS 2014年第4期315-317,共3页
目的观察五味子护肝片对急性酒精性肝损伤小鼠肝脏的保护作用。方法通过急性酒精性肝损伤小鼠模型,观察五味子护肝片连续给小鼠灌胃30d后小鼠血清谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、甘油三酯(TG)、极低密度脂蛋白(VLDL)和肝组织中超氧... 目的观察五味子护肝片对急性酒精性肝损伤小鼠肝脏的保护作用。方法通过急性酒精性肝损伤小鼠模型,观察五味子护肝片连续给小鼠灌胃30d后小鼠血清谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、甘油三酯(TG)、极低密度脂蛋白(VLDL)和肝组织中超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)水平的变化。结果五味子护肝片中、高剂量组均可降低血清中ALT、AST、TG、VLDL活性或含量,升高肝脏组织SOD活性、降低MDA含量,与肝损伤模型组比较差异有显著性(P<0.05或0.01);肝组织病理学改变较肝损伤模型组显著减轻(P<0.05)。结论五味子护肝片对急性酒精性肝损伤小鼠肝脏有保护作用。 展开更多
关键词 五味子 玉米肽 急性酒精性肝损伤小鼠
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防风大、小孢子发生与雌、雄配子体发育的研究 被引量:9
10
作者 袁秋红 申家恒 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期1065-1071,共7页
利用常规石蜡制片法研究了防风大、小孢子发生及其雌、雄配子体的发育过程.主要结果是: 1 小孢子母细胞减数分裂过程中的胞质分裂为同时型,小孢子四分体为四面体形; 2 成熟的花粉粒为三细胞型,具3个孔沟; 3 花药壁发育类型为双子叶型.... 利用常规石蜡制片法研究了防风大、小孢子发生及其雌、雄配子体的发育过程.主要结果是: 1 小孢子母细胞减数分裂过程中的胞质分裂为同时型,小孢子四分体为四面体形; 2 成熟的花粉粒为三细胞型,具3个孔沟; 3 花药壁发育类型为双子叶型.花药壁由4层结构组成:最外层为表皮,其内分别为药室内壁、1层中层、绒毡层,绒毡层为分泌型; 4 防风的子房为2室,每室1胚珠,单珠被,薄珠心,倒生型胚珠.大孢子母细胞经减数分裂形成线形排列的4个大孢子,合点端大孢子具功能; 5 大孢子发生过程中,具有多个孢原细胞及多个大孢子母细胞的现象,但通常只有一个大孢子母细胞能继续发育; 6 胚囊发育属于蓼型; 7 防风的花为极端的雌雄蕊异熟,雄蕊的发育早于雌蕊的发育. 展开更多
关键词 防风 大孢子发生 小孢子发生 雌配子体 雄配子体
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白鲜药用价值研究进展 被引量:4
11
作者 李然红 王立凤 +1 位作者 纪春艳 柴军红 《安徽农业科学》 CAS 2013年第1期81-82,共2页
白鲜为芸香科白鲜属植物,以根部入药,是一种传统中药,主要用于消炎杀菌。白鲜的主要药用成分是生物碱类、柠檬苦素类和内酯类物质等。随着研究的深入,白鲜的药用价值正在被逐步开发,展现出良好的应用前景。该文综合目前国内外的研究成果... 白鲜为芸香科白鲜属植物,以根部入药,是一种传统中药,主要用于消炎杀菌。白鲜的主要药用成分是生物碱类、柠檬苦素类和内酯类物质等。随着研究的深入,白鲜的药用价值正在被逐步开发,展现出良好的应用前景。该文综合目前国内外的研究成果,对白鲜的药用价值进行了综述。 展开更多
关键词 白鲜(Dictamnus dasycarps Turcz) 成分 药用价值
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提取防风多糖的工艺优化 被引量:3
12
作者 张泽庆 张静 白海群 《生物加工过程》 CAS CSCD 2008年第3期34-38,共5页
采用超声波强化和微波辅助提取2种方法提取防风多糖,并与传统热水浸提法在多糖的提取率上进行比较。防风多糖超声提取的最佳工艺条件为超声功率1 000 W、提取时间25 min、液固体积质量比为25,防风多糖微波提取的最佳工艺条件为微波功率5... 采用超声波强化和微波辅助提取2种方法提取防风多糖,并与传统热水浸提法在多糖的提取率上进行比较。防风多糖超声提取的最佳工艺条件为超声功率1 000 W、提取时间25 min、液固体积质量比为25,防风多糖微波提取的最佳工艺条件为微波功率560 W、液固体积质量比为30、提取时间10 min,在最佳提取工艺下,2种方法的提取率分别为6.103%和7.639%。与传统热水浸提法相比,超声法和微波法提取防风多糖具有迅速、节能、高效、提取率高等诸多优点。 展开更多
关键词 防风 多糖 提取 超声波 微波
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发酵型豆腐柴叶汁胶冻形成条件的探讨 被引量:5
13
作者 王世强 王德青 张沙沙 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期169-170,共2页
采用乳酸菌发酵糖产酸,当豆腐柴叶发酵汁的酸度在pH4~5之间时,能形成一种胶冻食品。实验结果表明:豆腐柴叶汁浓度为鲜叶比水(g/v)1∶6,发酵剂菌龄在24h,接种量为4%,发酵时间12h,蔗糖添加量为8%(g/v)形成的叶汁胶冻,胶凝强度适中,酸甜... 采用乳酸菌发酵糖产酸,当豆腐柴叶发酵汁的酸度在pH4~5之间时,能形成一种胶冻食品。实验结果表明:豆腐柴叶汁浓度为鲜叶比水(g/v)1∶6,发酵剂菌龄在24h,接种量为4%,发酵时间12h,蔗糖添加量为8%(g/v)形成的叶汁胶冻,胶凝强度适中,酸甜可口。 展开更多
关键词 豆腐柴 乳酸发酵 叶汁胶冻
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五味子化学成分及药理研究进展 被引量:68
14
作者 刘继永 王英平 刘洪章 《特产研究》 2005年第3期49-53,共5页
综述了五味子化学成分及药理作用的研究概况,为中药五味子的进一步研究、利用奠定了基础。
关键词 五味子 化学成分 药理作用
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北五味子活性成分提取工艺的研究 被引量:9
15
作者 吴艳玲 朴惠善 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期1176-1177,共2页
目的探讨北五味子活性成分的最佳提取工艺。方法以北五味子提取物出率及其五味子甲素、乙素、总木脂素等指标对北五味子乙醇回流提取法、乙醇渗滤提取和超临界流体萃取进行了对比研究。结果3种提取方法对比显示,虽五味子浸膏率无显著变... 目的探讨北五味子活性成分的最佳提取工艺。方法以北五味子提取物出率及其五味子甲素、乙素、总木脂素等指标对北五味子乙醇回流提取法、乙醇渗滤提取和超临界流体萃取进行了对比研究。结果3种提取方法对比显示,虽五味子浸膏率无显著变化,但超临界流体萃取方法总木脂素、乙素、甲素的含量均高于传统回流和渗滤提取方法。结论超临界流体萃取应用于北五味子活性成分的提取,具有省时、高效、节能等优点,可作为工业生产提取的理论依据。 展开更多
关键词 北五味子 提取工艺 高效液相色谱法
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狗舌草提取物对多发性骨髓瘤U266细胞株细胞凋亡的研究 被引量:3
16
作者 马智刚 张晓录 +1 位作者 范小莉 徐俊卿 《中华中医药学刊》 CAS 2010年第6期1278-1280,共3页
目的:研究狗舌草提取物对U266细胞的细胞凋亡作用及其机制。方法:U266细胞株与狗舌草提取物共同培养,电镜观察细胞凋亡形态,DNA琼脂糖凝胶电泳观察凋亡条带。用流式细胞仪测定细胞周期及凋亡率。结果:狗舌草提取物作用U266细胞,电镜观... 目的:研究狗舌草提取物对U266细胞的细胞凋亡作用及其机制。方法:U266细胞株与狗舌草提取物共同培养,电镜观察细胞凋亡形态,DNA琼脂糖凝胶电泳观察凋亡条带。用流式细胞仪测定细胞周期及凋亡率。结果:狗舌草提取物作用U266细胞,电镜观察到细胞凋亡,DNA琼脂糖凝胶电泳出现凋亡条带,狗舌草提取物影响U266细胞周期,G0/G1期细胞减少,S期、G2/M期细胞增加,凋亡细胞增加,用Annexin V/PI染色流式细胞仪检测,均显示细胞凋亡与狗舌草提取物有剂量依赖关系。结论:体外实验证实,狗舌草提取物对266细胞有细胞凋亡作用,存在剂量依赖关系。 展开更多
关键词 狗舌草提取物 多发性骨髓瘤 细胞凋亡
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防风多糖ASPSO溶液粘度及构象研究 被引量:2
17
作者 姜绍芬 伍乐芹 +3 位作者 戴晶晶 王艳丽 张静 孙润广 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期104-107,113,共5页
主要利用乌氏粘度计研究温度、pH、变性剂(脲)和金属离子(Na+、K+、Ca2+、Mg2+)对防风多糖ASPS0粘度的影响;采用圆二色谱、扫描电镜和刚果红实验等手段观察ASPS0在溶液中的形貌;研究了ASPS0在酸与碱中的粒度变化。研究表明不同浓度的金... 主要利用乌氏粘度计研究温度、pH、变性剂(脲)和金属离子(Na+、K+、Ca2+、Mg2+)对防风多糖ASPS0粘度的影响;采用圆二色谱、扫描电镜和刚果红实验等手段观察ASPS0在溶液中的形貌;研究了ASPS0在酸与碱中的粒度变化。研究表明不同浓度的金属离子的加入,对ASPS0溶液的粘度影响程度不同,其中K+、Ca2+及Mg2+对ASPS0溶液的粘度影响较大,而Na+对其影响程度很小;防风多糖ASPS0呈现无规卷曲状;不同pH条件粒度分布不同,pH为12时聚集体的有效直径最大,其次为pH为2以及pH为6.5。 展开更多
关键词 防风多糖 粘度 构象
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五味子花芽分化过程中的源库关系对花芽分化质量的影响 被引量:3
18
作者 艾军 李昌禹 +2 位作者 秦红艳 王振兴 张宝香 《北方园艺》 CAS 北大核心 2015年第2期136-138,共3页
以五味子6年生优系为试材,测定结果叶丛枝和营养长枝叶片中的淀粉、可溶性糖、全氮和可溶性蛋白质含量,并调查果实的生长动态。结果表明:花芽分化质量不同的枝类,其叶片的碳氮化合物动态变化存在较大差异,并与果实的生长动态具有一定的... 以五味子6年生优系为试材,测定结果叶丛枝和营养长枝叶片中的淀粉、可溶性糖、全氮和可溶性蛋白质含量,并调查果实的生长动态。结果表明:花芽分化质量不同的枝类,其叶片的碳氮化合物动态变化存在较大差异,并与果实的生长动态具有一定的相关性。在果实负载量较大的情况下,由于芽体的营养竞争能力差,营养供应不足,不能分化出较高比率的雌花芽。 展开更多
关键词 五味子 花芽分化 源库关系
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翻阳湖藜蒿的扦插繁殖观察 被引量:4
19
作者 陈学军 缪南生 +1 位作者 方荣 万新建 《江西农业学报》 1995年第2期115-119,共5页
本文以鄱阳湖藜蒿为试材,研究了不同激素不同浓度处理藜蒿的扦插效果,扦插后地上部与地下部的生长相关性以及不同部位茎枝的发根情况等。
关键词 藜蒿 扦插 繁殖
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大青转录组测序及生物信息学分析 被引量:3
20
作者 刘敏 黄炜忠 +2 位作者 何孟璐 梅瑜 王继华 《广州中医药大学学报》 CAS 2022年第1期177-183,共7页
【目的】利用高通量测序技术获得大青的转录组信息特征。【方法】通过高通量测序平台Illumina HiSeq;2500对大青进行转录组测序,采用Trinity软件de novo组装获得Unigene,并基于序列同源性对Unigene进行功能注释,得到大青转录组的遗传信... 【目的】利用高通量测序技术获得大青的转录组信息特征。【方法】通过高通量测序平台Illumina HiSeq;2500对大青进行转录组测序,采用Trinity软件de novo组装获得Unigene,并基于序列同源性对Unigene进行功能注释,得到大青转录组的遗传信息。【结果】测序数据经过质控后共获得26 394 223个高质量的Reads,通过de novo组装获得100 191个Unigene,N50长度为1 055 bp,平均长度724.4 bp。其中59 690个(59.58%)Unigene在NR、SwissProt、KOG、GO、KEGG数据库中均得到注释。其中KEGG数据库注释到38 260个Unigene,涉及136条代谢通路。在大青转录组中共鉴定到407个Unigene参与萜类化合物的生物合成,165个Unigene涉及类黄酮生物合成,29个Unigene参与黄酮和黄酮醇生物合成,37个Unigene参与异黄酮生物合成,同时,还鉴定到210类转录因子。MISA分析发现6 680个Unigene包含8 640个简单重复序列。【结论】利用高通量测序技术和生物信息分析获得了大青的转录组信息特征,这些数据可为后期开展功能基因鉴定、解析黄酮类化合物次生代谢途径及其调控机制奠定研究基础。 展开更多
关键词 大青 萜类 黄酮 转录组 简单重复序列(SSR)
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