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Low WT1 transcript levels at diagnosis predicted poor outcomes of acute myeloid leukemia patients with t(8;21) who received chemotherapy or allogeneic hematopoietic stem cell transplantation 被引量:7
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作者 Ya-Zhen Qin Yu Wang +12 位作者 Hong-Hu Zhu Robert Peter Gale Mei-Jie Zhang Qian Jiang Hao Jiang Lan-Ping Xu Huan Chen Xiao-Hui Zhang Yan-Rong Liu Yue-Yun Lai Bin Jiang Kai-Yan Liu Xiao-Jun Huang 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2016年第7期350-358,共9页
Background:Acute myeloid leukemia(AML) with t(8;21) is a heterogeneous disease.Identifying AML patients with t(8;21) who have a poor prognosis despite achieving remission is important for determining the best subseque... Background:Acute myeloid leukemia(AML) with t(8;21) is a heterogeneous disease.Identifying AML patients with t(8;21) who have a poor prognosis despite achieving remission is important for determining the best subsequent therapy.This study aimed to evaluate the impact of Wilm tumor gene-1(WT1) transcript levels and cellular homolog of the viral oncogene v-KIT receptor tyrosine kinase(C-KIT) mutations at diagnosis,and RUNXTRUNX1T1 transcript levels after the second consolidation chemotherapy cycle on outcomes.Methods:Eighty-eight AML patients with t(8;21) who received chemotherapy only or allogeneic hematopoietic stem cell transplantation(allo-HSCT) were included.Patients who achieved remission,received two or more cycles of consolidation chemotherapy,and had a positive measureable residual disease(MRD) test result(defined as <3-log reduction in RUNX1-RUNX1T1 transcript levels compared to baseline) after 2-8 cycles of consolidation chemotherapy were recommended to receive allo-HSCT.Patients who had a negative MRD test result were recommended to receive further chemotherapy up to only 8 cycles.WT1 transcript levels and C-KIT mutations at diagnosis,and RUNX1-RUNX1T1 transcript levels after the second consolidation chemotherapy cycle were tested.Results:Patients who had a C-KIT mutation had significantly lower WTl transcript levels than patients who did not have a C-KIT mutation(6.7%± 10.6%vs.19.5%± 19.9%,P < 0.001).Low WTl transcript levels(<5.0%) but not C-KIT mutation at diagnosis,a positive MRD test result after the second cycle of consolidation chemotherapy,and receiving only chemotherapy were independently associated with high cumulative incidence of relapse in all patients(hazard ratio[HR]= 3.53,2.30,and 11.49;95%confidence interval[CI]1.64-7.62,1.82-7.56,and 4.43-29.82;P = 0.002,0.034,and <0.001,respectively);these conditions were also independently associated with low leukemia-free survival(HR =3.71,2.33,and 5.85;95%CI 1.82-7.56,1.17-4.64,and 2.75-12.44;P < 0.001,0.016,and <0.001,respectively) and overall survival(HR = 3.50,2.32,and 4.34;95%CI 1.56-7.82,1.09-4.97,and 1.98-9.53;P = 0.002,0.030,and <0.001,respectively) in all patients.Conclusions:Testing for WTl transcript levels at diagnosis in patients with AML and t(8;21) may predict outcomes in those who achieve remission.A randomized study is warranted to determine whether allo-HSCT can improve prognosis in these patients. 展开更多
关键词 异基因造血干细胞移植 转录水平 白血病 WT1 患者 化疗 诊断 预后
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Transcript Level Analysis of Lignin and Flavonoid Biosynthesis Related Genes in <i>Eucalyptus globulus</i>
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作者 Tomotaka Shinya Kazunori Hayashi +1 位作者 Shinichi Onogi Akiyoshi Kawaoka 《American Journal of Plant Sciences》 2014年第18期2764-2772,共9页
We have investigated a correlation of transcript abundances of key genes that influence the quality of wood and flavonoid biosynthesis, such as the two p-hydroxycinnamoyl-CoA:quinate shikimate p-hydroxycinnamoyl trans... We have investigated a correlation of transcript abundances of key genes that influence the quality of wood and flavonoid biosynthesis, such as the two p-hydroxycinnamoyl-CoA:quinate shikimate p-hydroxycinnamoyl transferase (HCT) and the two chalcone synthases (CHS) from Eucalyptus globulus grown in a greenhouse. The EglHCT1 and EglHCT2 transcripts accumulated in stems of all ages, but to a lesser extent in leaves. On the other hand, EglCHS3 and EglCHS4 exhibited high transcript levels in leaves, roots and shoots, but low levels in the stem. A positive correlation (R2 > 0.70) was observed between the transcript levels of the EglHCT1, EglHCT2 genes and Klason lignin (KL) content. In addition, the sum of transcript levels of EglHCT1 and EglHCT2 genes were highly correlated to KL contents (R2 > 0.85). However, there is no relationship between transcript levels of two CHS genes and, KL or flavonoid contents. This may imply that lignin biosynthesis and flavonoid biosynthesis are independently regulated in E. globulus. 展开更多
关键词 HCT CHS 4CL transcript level LIGNIN Content Eucalyptus GLOBULUS
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Polypropylene crisper and 1-MCP delay the softening,lignification and transcription levels of related enzyme genes of golden needle mushrooms(Flammulina velutipes) 被引量:7
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作者 WANG Wen-jun LI Yao +2 位作者 LI Fu-hua ZENG Kai-fang MING Jian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期249-260,共12页
The fresh postharvest golden needle mushroom(Flammulina velutipes) sporocarp has a high moisture content and crisp texture, but it still has high physiological activity and respiration, leading to senescence and quali... The fresh postharvest golden needle mushroom(Flammulina velutipes) sporocarp has a high moisture content and crisp texture, but it still has high physiological activity and respiration, leading to senescence and quality deterioration.Treatments with 1-methylcyclopropene(1-MCP) and polypropylene(PP) crispers were used to study the changes of lignification and softening of F. velutipes during storage. The main findings were as follows: the crisper packaging could effectively prolong the storage time of F. velutipes;either the 1-MCP treatment, crisper packaging or the combination of the two treatments could significantly inhibit the accumulation of lignin and the decreases in the contents of cellulose and pectin, and had certain inhibitory effects on the activities of enzymes involved in lignification and softening including phenylalanine ammonia-lyase(PAL), cinnamyl alcohol dehydrogenase(CAD), cellulase(Cx), pectin methylesterase(PME) and polygalacturonase(PG). Among them, the inhibitory effect of the crisper packaging was higher than the 1-MCP treatment, while the combination of the two treatments was the best. The results of transmission electron microscopy(TEM) and scanning electron microscopy(SEM) showed that the crisper packaging in combination with the 1-MCP treatment could effectively maintain the integrity and stability of the F. velutipes cellular structure and inhibit the emergence of plasmolysis to prevent cell membrane rupture. The transcription levels showed that the crisper packaging and the combination of the 1-MCP treatment and crisper packing could effectively affect the expression of genes for enzymes related to lignification and softening of F. velutipes. In conclusion, 1-MCP and PP crispers could delay the lignification and softening of F. velutipes during storage. 展开更多
关键词 Flammulina velutipes polypropylene crisper 1-MCP softening and lignification transcription levels
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ABO血型系统的分子生物学研究进展 被引量:2
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作者 宋文倩 周世航 《临床血液学杂志》 2025年第2期157-160,共4页
ABO血型系统作为输血医学、器官移植和法医学等领域中至关重要的血型系统之一,一直备受关注。文章介绍了ABO血型抗原的生化合成机制,包括前体物质H抗原、A、B和O抗原的合成过程;详细描述了ABO基因编码区的等位基因突变,并阐述了这些突... ABO血型系统作为输血医学、器官移植和法医学等领域中至关重要的血型系统之一,一直备受关注。文章介绍了ABO血型抗原的生化合成机制,包括前体物质H抗原、A、B和O抗原的合成过程;详细描述了ABO基因编码区的等位基因突变,并阐述了这些突变对糖基转移酶功能的影响;讨论了ABO基因非编码区转录水平的调控,以及转录因子与启动子和增强子的相互作用;还涉及了ABO基因蛋白水平的研究,包括糖基转移酶的结构和功能。总之,文章总结了ABO血型系统的基础知识及相关研究进展,认为对ABO血型系统的研究需要跨越血清学水平,深入了解基因编码区突变、转录调控、翻译和蛋白表达等方面,以促进临床研究和治疗的发展。 展开更多
关键词 ABO血型系统 血型抗原 基因突变 转录调控 蛋白水平
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甘薯KNOX基因家族成员鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析
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作者 薛薇 张会永 +1 位作者 周玶吉 徐豪峰 《西南农业学报》 北大核心 2025年第5期976-986,共11页
【目的】挖掘甘薯KNOX基因家族并探究其在干旱胁迫条件下的功能。【方法】采用生物信息学方法研究甘薯KNOX基因家族的蛋白理化性质、系统进化、保守结构、顺势作用元件、蛋白互作等,并通过转录组数据分析KNOX基因在甘薯不同组织部位的... 【目的】挖掘甘薯KNOX基因家族并探究其在干旱胁迫条件下的功能。【方法】采用生物信息学方法研究甘薯KNOX基因家族的蛋白理化性质、系统进化、保守结构、顺势作用元件、蛋白互作等,并通过转录组数据分析KNOX基因在甘薯不同组织部位的表达模式,同时使用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)研究甘薯IbKNOXs基因在干旱胁迫下的响应程度。【结果】从甘薯基因组中鉴定出16个KNOX基因,IbKNOX蛋白均含有4个典型的保守结构域,但在Motif类型和数量上呈现差异。IbKNOX蛋白主要以酸性、亲水不稳定核蛋白为主。甘薯KNOX基因在染色体上分布较为均匀,除3号染色体外,其余染色体均只含有1个KNOX基因,且与水稻和拟南芥存在多对共线基因对。启动子分析显示,甘薯IbKNOX基因存在多种顺式作用元件,涉及光、激素、生长及胁迫响应元件,其中光响应元件的数量最多。IbKNOX基因在甘薯不同组织部位具有典型的组织表达特异性,甘薯IbKNOX6与IbKNOX14和IbKNOX3蛋白存在相互作用;qRT-PCR结果显示,干旱胁迫后甘薯IbKNOX基因的表达水平发生变化,大多数基因表达上调。【结论】甘薯IbKNOX基因具有响应干旱胁迫的功能,为其在干旱胁迫中的响应机制提供理论基础。 展开更多
关键词 KNOX转录因子 甘薯 干旱胁迫 表达水平
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铜离子对黑木耳漆酶活性及其基因转录水平的影响 被引量:1
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作者 米昊雨 耿楠楠 +2 位作者 杜鹏禹 刘增才 邹莉 《菌物学报》 北大核心 2025年第4期68-80,共13页
以黑木耳“黑厚圆”为研究对象,探究铜离子对黑木耳漆酶活性及漆酶基因转录表达的影响。结果表明,铜离子浓度在100–700μmol/L范围内,黑木耳的胞外漆酶活性随着浓度的增加显著提高;同时,铜离子浓度显著影响漆酶基因的转录水平,其中AhL... 以黑木耳“黑厚圆”为研究对象,探究铜离子对黑木耳漆酶活性及漆酶基因转录表达的影响。结果表明,铜离子浓度在100–700μmol/L范围内,黑木耳的胞外漆酶活性随着浓度的增加显著提高;同时,铜离子浓度显著影响漆酶基因的转录水平,其中AhLac1、AhLac3、AhLac6基因转录水平随铜离子浓度增加显著上调,AhLac2、AhLac4和AhLac5基因表达量在500μmol/L时达到最高值,分别上调了3.38、1.29和1.59倍。不同诱导时间下,AhLac1、AhLac3和AhLac6基因转录水平随诱导时间延长呈现不同程度的上调趋势。进一步的相关性分析显示,漆酶活性与AhLac1、AhLac3、AhLac6基因的转录水平之间存在正相关关系。研究结果为提高黑木耳产量及漆酶基因的分子调控机制研究提供科学依据。 展开更多
关键词 黑木耳 铜离子 漆酶活性 转录表达
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细粒棘球绦虫MAPⅡ生物信息学分析及其在虫体不同阶段表达差异研究
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作者 陈旭珂 普娜 +8 位作者 张玉霞 赵文卿 赵家欣 黄俊程 魏琳颖 张艳艳 孙艳 薄新文 王正荣 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第7期3286-3296,共11页
【目的】研究甲硫氨酸氨基肽酶Ⅱ(methionine aminopeptidaseⅡ,MAPⅡ)的分子特征、反应原性及其在虫体不同发育阶段的表达情况,提供一种对终末宿主具有保护作用的疫苗候选抗原。【方法】对MAPⅡ蛋白进行生物信息学分析,包括系统进化树... 【目的】研究甲硫氨酸氨基肽酶Ⅱ(methionine aminopeptidaseⅡ,MAPⅡ)的分子特征、反应原性及其在虫体不同发育阶段的表达情况,提供一种对终末宿主具有保护作用的疫苗候选抗原。【方法】对MAPⅡ蛋白进行生物信息学分析,包括系统进化树构建、理化性质分析及信号肽、跨膜区、抗原表位、磷酸化和糖基化位点、二级结构、三级结构预测。通过原核系统表达MAPⅡ蛋白并验证重组蛋白的抗原性,同时进行虫体不同发育阶段转录水平分析。【结果】细粒棘球绦虫MAPⅡ蛋白与终末宿主犬、中间宿主绵羊中MAPⅡ蛋白亲缘关系较远。MAPⅡ蛋白由453个氨基酸组成,分子质量为51023.75 u,不稳定系数为36.6,为稳定蛋白;平均疏水性指数为-0.609,亲水性较好。不存在信号肽与跨膜区。MAPⅡ蛋白具有良好的B细胞线性表位,共有38个磷酸化位点,1个N-糖基化位点。MAPⅡ蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,占比分别为33.55%和51.88%;三级结构预测显示其为单体蛋白,GMQE值为0.85。通过原核系统表达出的MAPⅡ重组蛋白能与感染细粒棘球绦虫犬的阳性血清结合,抗原性良好。MAPⅡ蛋白在原头蚴阶段和成虫阶段均有表达,且成虫阶段表达量显著高于原头蚴阶段(P<0.05)。【结论】MAPⅡ蛋白结构稳定,具有优势抗原表位,MAPⅡ重组蛋白免疫原性良好,其在细粒棘球绦虫不同发育阶段特别是成虫阶段发挥着重要作用,可作为细粒棘球绦虫终末宿主疫苗候选抗原。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 甲硫氨酸氨基肽酶Ⅱ(MAPⅡ) 生物信息学 原核表达 转录水平
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脂滴包被蛋白2基因转录水平抑制剂筛选模型的建立和应用
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作者 丁晓添 司书毅 +1 位作者 杜郁 洪斌 《中国医药生物技术》 2025年第2期123-132,共10页
目的建立靶向脂滴包被蛋白2(PLIN2)基因转录水平的高通量筛选模型,筛选获得PLIN2抑制剂,进而寻找具有潜在抗动脉粥样硬化活性的小分子先导化合物。方法构建含有人PLIN2基因启动子区的荧光素酶报告基因重组质粒pGL4-PLIN2p。将其转染HepG... 目的建立靶向脂滴包被蛋白2(PLIN2)基因转录水平的高通量筛选模型,筛选获得PLIN2抑制剂,进而寻找具有潜在抗动脉粥样硬化活性的小分子先导化合物。方法构建含有人PLIN2基因启动子区的荧光素酶报告基因重组质粒pGL4-PLIN2p。将其转染HepG2细胞,通过G418抗性筛选获得稳定转染细胞株PLIN2p-Luc HepG2。对构建的稳转细胞筛选模型进行条件优化和评价,大规模筛选获得活性化合物,进一步利用qRT-PCR、Western blot和油红O实验检测活性化合物对泡沫化巨噬细胞中Plin2 mRNA、蛋白表达以及脂滴形成的影响。结果成功构建了含有人PLIN2启动子区的细胞模型PLIN2p-Luc HepG2,符合高通量筛选的要求。筛选8000余样次化合物,经初筛和复筛,共获得6个剂量-效应关系良好的活性化合物。其中,化合物MK8722可以剂量依赖地抑制泡沫化巨噬细胞中Plin2 mRNA和蛋白表达,并显著减少细胞内脂滴的形成。结论建立可用于抑制剂高通量筛选的PLIN2p-Luc HepG2细胞模型,筛选获得活性化合物MK8722,为基于脂滴的抗动脉粥样硬化药物发现提供了新的思路和研究手段。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 泡沫细胞 脂滴 脂滴包被蛋白2 转录水平抑制剂
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新增V元件插入位置对辣椒GWSF启动子激素应答活性的影响
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作者 杨舒媛 陈俐君 +2 位作者 许敏 吴美珠 黄真池 《广东农业科学》 2025年第4期22-30,共9页
【目的】理想的人工启动子可精确调控目的基因的时空表达,用于作物遗传改良。GWSF(4个病原诱导活性元件二聚体Gst1-box、W-box、S-box、F-box依次连接于CaMV minimal 35S启动子组成的人工启动子)是较为理想的植物病原诱导型启动子,在其... 【目的】理想的人工启动子可精确调控目的基因的时空表达,用于作物遗传改良。GWSF(4个病原诱导活性元件二聚体Gst1-box、W-box、S-box、F-box依次连接于CaMV minimal 35S启动子组成的人工启动子)是较为理想的植物病原诱导型启动子,在其序列的不同位置引入V-box元件并探讨新元件的位置效应,为人工启动子的设计与应用提供参考。【方法】分别将V-box元件的二聚体引入GWSF启动子上游、中游和下游,根据引入位置将3个改良启动子依次命名为VGWSF、GWVSF和GWSFV。用其分别替换pBI121质粒中控制gus基因表达的CaMV35S启动子,得到重组质粒后导入农杆菌GV3101。用农杆菌瞬时表达法转化辣椒叶片,侵染12 h后用ABA、SA和Eth诱导处理12 h,再用GUS染色法和实时荧光定量PCR(qPCR)检测启动子本底活性和激素诱导活性。【结果】与原启动子GWSF相比,新元件引入后得到的3个改良启动子(VGWSF、GWVSF、GWSFV)本底转录水平均明显升高。以CaMV35S转录水平为1,Pfaffl相对定量法测定结果显示,GWSF本底转录水平为0.190,而VGWSF、GWVSF和GWSFV分别为3.348、2.503和0.953,较原启动子分别提高17.613倍、13.165倍和5.011倍。在ABA的诱导下,3个改良启动子转录水平均高于自身本底水平:VGWSF诱导后达12.309(为本底的3.676倍),GWVSF为4.783(1.911倍),GWSFV为5.405(5.674倍);SA处理后,VGWSF和GWVSF转录水平分别降至0.502和0.244,较各自本底下降85%和90%,而GWSFV升高至2.464;Eth处理后,3个改良启动子转录活性均受抑制,转录水平均低于0.520。【结论】引入V-box后改良启动子本底转录水平升高。GWSFV本底转录水平相对较低,受ABA或SA诱导后,转录活性升高明显。新增V-box的位置显著影响原启动子的转录特性。 展开更多
关键词 辣椒 V元件 人工启动子 激素 GUS染色 转录水平
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Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1 molecular mechanisms in gastric cancer progression 被引量:1
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作者 Daniel Mateus de Oliveira Batista Jessica Manoelli Costa da Silva +3 位作者 Carolina de Oliveira Gigek Marilia de Arruda Cardoso Smith Paulo Pimentel de Assumpcao Danielle Queiroz Calcagno 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2023年第9期1520-1530,共11页
Gastric cancer(GC)remains among the most common cancers worldwide with a high mortality-to-incidence ratio.Accumulated evidence suggests that long noncoding RNAs(lncRNAs)are involved in gastric carcinogenesis.These tr... Gastric cancer(GC)remains among the most common cancers worldwide with a high mortality-to-incidence ratio.Accumulated evidence suggests that long noncoding RNAs(lncRNAs)are involved in gastric carcinogenesis.These transcripts are longer than 200 nucleotides and modulate gene expression at multiple molecular levels,inducing or inhibiting biological processes and diseases.Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1(MALAT1)is one of the best-studied lncRNAs with comprehensive actions contributing to cancer progression.This lncRNA regulates gene expression at the transcriptional and posttranscriptional levels through interactions with microRNAs and proteins.In the present review,we discussed the molecular mechanism of MALAT1 and summarized the current knowledge of its expression in GC.Moreover,we highlighted the potential use of MALAT1 as a biomarker,including liquid biopsy. 展开更多
关键词 Long noncoding RNA Gastric carcinogenesis transcriptional levels Posttranscriptional levels Prognostic biomarker Liquid biopsy
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Diurnal Changes in the Transcription Profiles of Genes Encoding Starch Synthesis-related Enzymes in Wheat Grains under Field Conditions
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作者 Lina WANG Qiaoxia HAN +2 位作者 Xianghong XIAO Tiancai GUO Guozhang KANG 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2017年第4期565-569,574,共6页
[Objective] During the filling stage of plant growth and development, storage starch is diurnally synthesized and accumulated in the grains from cereal crops, but the underlying molecular mechanism is unclear. [Method... [Objective] During the filling stage of plant growth and development, storage starch is diurnally synthesized and accumulated in the grains from cereal crops, but the underlying molecular mechanism is unclear. [Method] In this study, grains from the bread wheat cultivar Zhoumai 18 grown in fields were harvested at 15 d after anthesis, and quantitative real-time reverse transcription polymerase chain reaction(qPCR) was used to measure the transcriptional levels of 26 genes encoding starch synthesis-related enzymes at 2 h intervals throughout a diurnal cycle. [Result] Our findings indicated that storage starch was persistently synthesized in wheat grains throughout a 24 h period. The diurnal patterns of the transcriptional levels of 26 genes in wheat grains were classified into two groups. The 13 genes in Group 1 were temporally and highly expressed in wheat grains,and their encoded proteins could play crucial roles in starch synthesis. The other 13 genes in Group 2 were characterized by low or no transcription in wheat grains throughout a diurnal cycle, suggesting their function in the synthesis or degradation of transitory starches in wheat grains. [Conclusion] These results provide information on the molecular mechanism of storage starch synthesis in higher plants. 展开更多
关键词 Diurnal change Gene expression Starch synthesis transcriptional level Triticum aestivum L.
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口蹄疫病毒感染后猪PD-1及其配体转录水平变化和免疫抑制机制分析
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作者 岳锋 周娟娟 +4 位作者 朱艳平 郭东光 夏黎明 祝仰钊 王选年 《河南农业科学》 北大核心 2024年第8期126-132,共7页
研究猪感染口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)后程序性死亡受体-1(Programmed death-1,PD-1)及其配体(PD-L1、PD-L2),细胞因子[IL-2(Interleukin-2)、IL-10(Interleukin-10)、IFN-γ(Interferon-γ)]mRNA转录水平和外周血... 研究猪感染口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)后程序性死亡受体-1(Programmed death-1,PD-1)及其配体(PD-L1、PD-L2),细胞因子[IL-2(Interleukin-2)、IL-10(Interleukin-10)、IFN-γ(Interferon-γ)]mRNA转录水平和外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)增殖能力,探讨PD-1/PD-Ls通路在FMDV引起免疫抑制过程中的作用机制。结果表明,猪感染FMDV后3、7、14、17 d,PD-1的mRNA转录水平显著或极显著升高,感染后7 d达到峰值,之后逐渐降低;感染FMDV后3 d和7 d,PD-L1的mRNA转录水平极显著升高;感染FMDV后3 d,PD-L2的mRNA转录水平显著升高。感染FMDV后3、7 d,IL-2的mRNA转录水平显著下降;感染FMDV后1、3 d,IFN-γ的mRNA转录水平极显著下降,IL-2和IFN-γ的mRNA转录水平与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势相反;感染FMDV后3、7、14 d,IL-10的mRNA转录水平显著或极显著升高,与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势相同。感染FMDV后,全血中FMDV的病毒载量随着感染后时间的推进逐渐升高,感染后7 d达到峰值,与PD-1及其配体mRNA转录水平变化趋势总体上相同。感染后7 d,PBMCs的增殖能力明显降低。综上,FMDV感染猪后,总体上上调了PD-1及其配体的mRNA转录水平,是FMDV感染引起机体免疫抑制的重要致病机制。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 程序性死亡受体-1 程序性死亡受体配体-1 转录水平 免疫抑制机制
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钢铁厂不同工序排放的颗粒物毒理机制探究
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作者 何剑 王召欣 +1 位作者 王珊珊 徐志嫱 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期386-395,共10页
针对钢铁厂大气污染治理主要集中在总量控制和浓度减排,本文从毒理效应的角度评估钢铁生产排放的颗粒物有机和无机成分的毒性作用.研究采用毒理基因组学法,分析了某钢铁厂烧结、干熄焦、炼铁、炼钢4个关键工序排放颗粒物的毒性模式,利... 针对钢铁厂大气污染治理主要集中在总量控制和浓度减排,本文从毒理效应的角度评估钢铁生产排放的颗粒物有机和无机成分的毒性作用.研究采用毒理基因组学法,分析了某钢铁厂烧结、干熄焦、炼铁、炼钢4个关键工序排放颗粒物的毒性模式,利用转录效应水平指数(TELI值)对其毒性水平进行了量化.结果显示,所有考察工序排放的颗粒物均能引发显著的氧化损伤和膜损伤,且其毒性随着暴露浓度的提高而增强.比较不同颗粒物发现,颗粒物无机组分的毒性普遍超过有机组分,其中以高炉排放颗粒物的无机组分毒性最为显著,其次为转炉、烧结、干熄焦.特别是,当高炉排放颗粒物的无机组分暴露浓度达到1×10^(-5)mg∙L^(-1)时,TELI_(max)为1.854.此外,在烧结工序中颗粒物有机组分主要通过膜应激诱导毒性效应,而无机组分则是通过氧化应激和膜应激产生毒性.这些发现为钢铁行业颗粒物污染治理提供了新的视角和基础依据. 展开更多
关键词 钢铁厂 颗粒物 毒性 毒理基因组学法 转录效应水平指数(TELI值)
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谷子SiNF-YB亚家族基因的单倍型与功能分析 被引量:1
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作者 王春芳 祁东梅 +2 位作者 张霈涵 林伟 史慎奎 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期28-37,共10页
谷子属于短日照植物,是我国北方重要的杂粮作物,随着对谷子的深入研究,越来越多与逆境相关的转录因子被发现,其中NF-Y家族便是一类可以与启动子中CCAAT-box相结合的转录因子,包括3个亚家族NF-YA、NF-YB、NF-YC。本研究针对谷子SiNF-YB... 谷子属于短日照植物,是我国北方重要的杂粮作物,随着对谷子的深入研究,越来越多与逆境相关的转录因子被发现,其中NF-Y家族便是一类可以与启动子中CCAAT-box相结合的转录因子,包括3个亚家族NF-YA、NF-YB、NF-YC。本研究针对谷子SiNF-YB亚家族的14个基因进行研究,通过亚细胞定位分析,发现该亚家族中除了SiNF-YB8和SiNF-YB15其余成员主要定位于细胞核中。顺式作用元件分析显示,在各成员启动子区域包含大量与非生物胁迫响应以及光周期相关的顺式作用元件。单倍型分析显示,SiNF-YB4是一个与耐旱有很强相关性的基因,有3种单倍型,其中H003是优异的抗旱单倍型;SiNF-YB12是一个与抽穗有很强相关性的基因,有H001和H002两种单倍型。转录组数据分析显示,抗旱和敏旱品种干旱处理前后,SiNF-YB5在根部的表达量存在显著性差异;在长日照与短日照条件下,SiNF-YB4在春谷和夏谷中的表达量存在显著差异。本研究结果为后续进一步探究谷子SiNF-YB亚家族基因的功能提供了重要的理论依据,同时为培育抽穗期与环境相适应的谷子抗旱品种奠定基础。 展开更多
关键词 谷子 NF-YB 转录因子 单倍型分析 表达量
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青海血蜱Haemalin基因的克隆、生物信息学及转录水平分析 被引量:1
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作者 何永彩 李增魁 +11 位作者 陈炳华 张连生 李中余 何顺福 陈继勇 耿鹏程 胡晓宇 蒋硕 陈强 徐璐瑶 康明 李英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期700-708,共9页
为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速... 为构建青海血蜱Haemalin基因的cDNA全长序列,并分析该基因的生物信息学特征及其在青海血蜱不同发育阶段和雌蜱不同组织中的转录水平,本研究基于青海血蜱唾液腺转录组文库中检索到的一个功能注释为Haemalin的基因片段,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)引物设计软件设计Haemalin基因3'RACE和5'RACE特异性引物,分别经RACE扩增青海血蜱Haemalin基因的3'端和5'端序列,测序后与其中间序列拼接获得该基因的cDNA全长序列。利用生物信息学软件分析该基因编码蛋白的信号肽、理化性质、跨膜结构域、结构域、蛋白质三级结构、B细胞抗原表位以及氨基酸序列比对,采用NCBI中的BLAST及MEGA 7.0软件分别分析Haemalin基因编码氨基酸序列的相似性及构建其系统进化树,采用qPCR检测Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱和雌蜱不同组织中的转录水平。结果显示,青海血蜱Haemalin基因cDNA全长583 bp,开放阅读框(ORF)423 bp,该基因编码蛋白的信号肽为N端的15个氨基酸,理论等电点4.71,属于亲水性蛋白,无跨膜结构域。该基因编码蛋白的三级结构分析结果显示,其存在两个典型的Kunitz/牛胰蛋白酶抑制剂(Kunitz/BPTI)结构域,两个结构域之间由单链连接,共包括3个α螺旋,2对反向平行的β折叠;在aa35~aa45、aa54~aa60、aa75~aa80、aa91~aa93、aa125~aa131等处可能存在潜在的B细胞抗原表位。相似性与进化树结果显示,青海血蜱Haemalin氨基酸序列与褐黄血蜱凝血酶抑制剂Haemalin氨基酸序列的相似最高达92%,并在进化树中二者处于同一进化分支。表明,青海血蜱Haemalin可能也为一种凝血酶抑制剂。qPCR结果显示,Haemalin基因在不同发育阶段青海血蜱中的转录水平为:卵>半饱血蜱>若蜱>饱血蜱>幼蜱>吸血96 h的雌成蜱>游离雌成蜱,且其在青海血蜱雌蜱中肠中的转录水平极显著高于其他组织(P<0.0001)。表明,Haemalin基因在青海血蜱成蜱吸血阶段及其在该蜱的血液消化中均发挥重要作用。本研究为进一步研究Haemalin基因的生物学功能及其在青海血蜱防控中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 青海血蜱 Haemalin基因 克隆 生物信息学 转录水平
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小檗碱消除ESBLs大肠杆菌耐药性的研究 被引量:3
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作者 左丽 旷年玲 +3 位作者 王芝超 张永英 石玉祥 王风申 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期54-58,共5页
为了研究小檗碱消除超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠杆菌耐药性的效果,试验以3株ESBLs大肠杆菌作为研究对象,采用二倍稀释法测定小檗碱作用3株ESBLs大肠杆菌前后的MIC变化,然后采用琼脂糖凝胶电泳、ELISA法和实时荧光定量PCR方法分别检测... 为了研究小檗碱消除超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠杆菌耐药性的效果,试验以3株ESBLs大肠杆菌作为研究对象,采用二倍稀释法测定小檗碱作用3株ESBLs大肠杆菌前后的MIC变化,然后采用琼脂糖凝胶电泳、ELISA法和实时荧光定量PCR方法分别检测小檗碱作用后大肠杆菌R质粒、ESBLs活性、生物被膜形成及外排系统AcrA mRNA、AcrB mRNA转录水平的变化。结果表明:3株ESBLs大肠杆菌对小檗碱的MIC均为2.00 mg/mL;经小檗碱作用后有2株ESBLs大肠杆菌对头孢噻肟的MIC从32.00 mg/mL降至8.00 mg/mL,有1株ESBLs大肠杆菌对头孢噻肟的MIC从32.00 mg/mL降至16.00 mg/mL。经小檗碱作用后有2株ESBLs大肠杆菌质粒条带消失2条,有1株ESBLs大肠杆菌质粒条带消失1条;3株ESBLs大肠杆菌的ESBLs活性均极显著降低(P<0.01),碱性磷酸酶活性均极显著升高(P<0.01);3株ESBLs大肠杆菌外排系统AcrA mRNA转录水平极显著降低(P<0.01),2株ESBLs大肠杆菌外排系统AcrB mRNA转录水平显著降低(P<0.05)。说明小檗碱对ESBLs大肠杆菌的4种耐药消除机制均具有良好的效果。 展开更多
关键词 小檗碱 超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌 消除耐药性 耐药机制 基因转录水平
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CO_(2)驱动的海水酸化对菲律宾蛤仔组织、免疫和抗氧化酶活及转录水平的影响 被引量:3
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作者 林毅 陈强 +2 位作者 周思顺 孔鲁闽 黄张帆 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期88-100,共13页
随着CO_(2)的大量排放,海洋酸化效应不断加重,为探究未来海水酸化情况对菲律宾蛤仔产生的影响,设置对照组(pH为8.1)和酸化组(pH为7.7、7.1和6.4),研究周期为42 d,测定菲律宾蛤仔在酸化条件下组织结构、免疫和抗氧化酶活性的变化情况,以... 随着CO_(2)的大量排放,海洋酸化效应不断加重,为探究未来海水酸化情况对菲律宾蛤仔产生的影响,设置对照组(pH为8.1)和酸化组(pH为7.7、7.1和6.4),研究周期为42 d,测定菲律宾蛤仔在酸化条件下组织结构、免疫和抗氧化酶活性的变化情况,以及在分子水平上产生的影响。结果表明:菲律宾蛤仔置于酸化海水环境中,鳃丝间距随pH的降低而扩大,鳃丝纤毛黏合,水管和外套膜外表皮褶皱逐渐加深;鳃组织中酸性磷酸酶(ACP)和超氧化物歧化酶(SOD)活性变化情况为先降后升,碱性磷酸酶(AKP)活性各组变化趋势不同,总抗氧化能力(T-AOC)、过氧化氢酶(CAT)和溶菌酶(LZM)活性趋势为先升后降;鳃和内脏团谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性变化规律皆为持续上升;内脏团组织中LZM活性变化趋势各不相同,ACP活性变动趋势为先降后升,AKP、SOD和CAT活性变化规律为先升后降,T-AOC趋势为持续下降;通过转录组的分析得到,鳃组织GO功能主要富集在DNA整合、膜的组成部分和RNA定向DNA聚合酶活性等条目中,KEGG通路主要富集在吞噬体和与蛋白合成的相关通路中。海水酸化使菲律宾蛤仔组织呈现不同程度的损伤,破坏其内环境稳态,改变其代谢水平和与免疫相关基因表达,引发菲律宾蛤仔染病乃至死亡的风险上升。 展开更多
关键词 二氧化碳 菲律宾蛤仔 免疫 抗氧化 转录水平
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灰飞虱冠蛋白的基因克隆与表达分析
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作者 钟嘉怡 李莉 +1 位作者 王锡锋 刘文文 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期178-185,共8页
灰飞虱Laodelphax striatellus冠蛋白属于WD40重复超家族成员,主要通过结合肌动蛋白调控细胞骨架的动态聚合与解聚。本研究通过RT-PCR克隆并获得了灰飞虱3个冠蛋白coronin 1A、coronin 2B和coronin 7的基因CDS区。系统进化树分析显示,这... 灰飞虱Laodelphax striatellus冠蛋白属于WD40重复超家族成员,主要通过结合肌动蛋白调控细胞骨架的动态聚合与解聚。本研究通过RT-PCR克隆并获得了灰飞虱3个冠蛋白coronin 1A、coronin 2B和coronin 7的基因CDS区。系统进化树分析显示,这3个冠蛋白分别属于3个分支,且与褐飞虱Nilaparvata lugens的3个冠蛋白同源性最高,氨基酸序列相似性分别为99.2%、88.2%和82.5%。荧光定量PCR检测结果显示,coronin 1A在成虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫,coronin 2B在雄虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫和雌虫,coronin 7在雌虫中的转录水平显著高于2龄、4龄若虫和雄虫。而3个冠蛋白基因在唾液腺中的转录水平都显著高于肠道。灰飞虱携带水稻条纹病毒(rice stripe tenuivirus,RSV)后体内3个冠蛋白基因的转录水平显著高于对照,说明冠蛋白可能在灰飞虱传播RSV过程中发挥一定作用,研究结果为深入探究冠蛋白的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 灰飞虱 水稻条纹病毒 冠蛋白 转录水平
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甘蓝型油菜苗期响应渍害胁迫的生理调控机制 被引量:11
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作者 周香玉 徐劲松 +2 位作者 谢伶俐 许本波 张学昆 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1015-1029,共15页
长江流域是中国油菜主产区,该区域常年湿润多雨,且产区实行油菜-水稻轮作制度,导致渍害频发。为明确甘蓝型油菜(Brassica napus L.)对苗期渍害的响应机制,本研究采用盆栽试验,以强耐渍品系YZ12、中等耐渍品系YZ45和不耐渍品系YZ59为试... 长江流域是中国油菜主产区,该区域常年湿润多雨,且产区实行油菜-水稻轮作制度,导致渍害频发。为明确甘蓝型油菜(Brassica napus L.)对苗期渍害的响应机制,本研究采用盆栽试验,以强耐渍品系YZ12、中等耐渍品系YZ45和不耐渍品系YZ59为试验材料,研究苗期淹水对油菜表型性状、生理特性、光合作用、相关基因相对转录水平等的影响,同时分析了外源激素抑制剂对油菜渍害胁迫的影响。结果表明,淹水胁迫严重抑制油菜生长,根系活力可作为衡量淹水胁迫对油菜生长影响的指示指标。根细胞超微结构观察发现,淹水胁迫导致油菜根系细胞发生质壁分离及细胞器破碎解体,强、中耐渍油菜的细胞器受损程度较小,能够在淹水胁迫中维持较为正常的细胞形态;淹水胁迫下根部细胞骨架相关基因Bnamicrotubule1.A3、Bnatubulin-α2.C3、Bnatubulin-β7.C6、Bnalamin-like.A2相对转录水平显著下调至对照水平(CK)的0.2~0.5倍;无氧呼吸相关基因BnaPDC.C9、BnaLDH.A1、BnaADH.A7表达量显著升高,为CK的3~6倍,且在中、强耐渍油菜中诱导表达水平更高。过氧化物酶(peroxidase,POD)、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性随淹水时间延长呈先升后降趋势,过氧化氢酶(catalase,CAT)活性和丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量呈升高趋势,其中强耐渍品系抗氧化酶活性相对较高,而MDA增幅较小。淹水胁迫严重影响油菜叶片光合效率及叶绿素含量,导致油菜叶绿素含量、光合速率、气孔导度和蒸腾速率显著下降,胞间CO_(2)浓度显著升高,且不耐渍品系变化幅度相对较大。淹水胁迫导致油菜乙烯(ethylene,ET)和脱落酸(abscisic acid,ABA)含量显著升高,其中强耐渍品系ET含量较高,不耐渍品系ABA含量较高;强耐渍品系的ET信号相关基因BnaACO1.C8、BnaERF73.C6相对转录水平显著上调,不耐渍品系ABA合成相关基因BnaZEP.A7相对转录水平上调。外源喷施激素抑制剂可改善淹水胁迫对油菜的伤害,但不同外源激素抑制剂效果差异明显。综上,不同耐渍性甘蓝型油菜苗期对淹水胁迫响应在表型、生理代谢、光合、激素和基因转录水平存在差异。甘蓝型油菜通过调控细胞骨架、无氧呼吸、激素代谢相关基因的相对转录水平,引起植株内抗氧化酶活性、激素水平、光合效率、根部超微结构及根系活力改变,进而响应淹水胁迫。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 淹水胁迫 根系超微结构 光合特性 抗氧化酶活性 激素水平 转录调控
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番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析
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作者 王祎祎 范冰丽 +4 位作者 李营 王改雪 薛东齐 李艳 高艳娜 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第8期24-33,共10页
为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG... 为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG1结构域,属于bzip转录因子中的DOG1家族成员;系统进化关系表明,SlDOGL4与马铃薯的StDOGL4蛋白亲缘关系较近。组织表达谱结果表明,SlDOGL4基因主要在根和破色期果实中表达。亚细胞定位结果表明,SlDOGL4蛋白定位于细胞核。SlDOGL4基因启动子上有多种与非生物胁迫和激素响应相关的顺式元件。构建ProSlDOGL4::GUS融合表达载体,遗传转化番茄检测启动子活性,GUS组织化学染色结果表明,SlDOGL4在根、茎、生长点、种子等组织中都有表达,表明该基因在番茄整个生长发育过程中发挥重要作用。通过公共数据库中转录组数据分析表明,SlDOGL4基因的表达受到盐、干旱、冷和热胁迫不同程度的诱导。为了进一步验证SlDOGL4基因的功能,在盐处理后,SlDOGL4基因的转录水平呈先升高后降低的趋势,且在盐处理2 h后达到最高转录水平。研究结果为探索SlDOGL4基因在番茄耐盐中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 SlDOGL4 非生物胁迫 亚细胞定位 转录水平
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