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基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法 被引量：2
1
作者 侯维岩 刘超 +1 位作者 宋杨 孙燚 《安徽大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2020年第1期37-43,共7页
为解决癌症基因组图谱中DNA甲基化数据不平衡导致假阴率上升的问题,提出一种基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法.使用合成少数类过采样技术和Tomek Link算法进行混合采样,解决数据不平衡问题.在此基础上,将经特征选择后的训练集数... 为解决癌症基因组图谱中DNA甲基化数据不平衡导致假阴率上升的问题,提出一种基于TCGA数据库不平衡数据的改进分类方法.使用合成少数类过采样技术和Tomek Link算法进行混合采样,解决数据不平衡问题.在此基础上,将经特征选择后的训练集数据输入改进模型进行训练、学习及分类.基于TCGA数据库6种癌症DNA甲基化数据的实验结果表明:改进方法对少数类样本的分类性能有显著提高,对多数类样本的分类性能也有一定的提升. 展开更多
关键词 DNA甲基化 数据不平衡 TCGA tomek link算法
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基于深度森林和DNA甲基化的癌症分类研究 被引量：8
2
作者 刘超 吴申 +1 位作者 郑一超 侯维岩 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2020年第13期189-193,共5页
作为人类基因组重要的表观遗传现象,DNA甲基化对基因的表达发挥着重要的调控作用,与癌症的关系密切。针对癌症基因组图谱(TCGA)庞大数据的类不平衡和高维度,致使假阴率大幅增加的问题,提出了一种混合采样的不平衡数据集成分类算法,使用... 作为人类基因组重要的表观遗传现象,DNA甲基化对基因的表达发挥着重要的调控作用,与癌症的关系密切。针对癌症基因组图谱(TCGA)庞大数据的类不平衡和高维度,致使假阴率大幅增加的问题,提出了一种混合采样的不平衡数据集成分类算法,使用合成少数过采样(SMOTE)算法生成新的少数类样本,得到扩充后的数据集,通过Tomek Link算法剔除样本扩充过程中引入的噪声,得到相对平衡的数据集。在此基础上,利用深度森林(gcForest)算法的级联森林结构,每一层选取两种随机森林结构,以增强模型的泛化能力,得到最终的分类模型。对6种癌症的DNA甲基化数据实验表明混合采样的不平衡数据集成分类算法在保证多数类分类精度的前提下,有效地提高了对于少数类的灵敏度。 展开更多
关键词 DNA甲基化 癌症基因组图谱(TCGA) 合成少数类采样技术(SMOTE) tomek link算法 gcForest算法
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基于CNN与BiGRU融合神经网络的入侵检测模型 被引量：31
3
作者 张安琳 张启坤 +3 位作者 黄道颖 刘江豪 李建春 陈孝文 《郑州大学学报（工学版）》 CAS 北大核心 2022年第3期37-43,共7页
针对深度学习入侵检测中出现的数据类不平衡及特征学习不全面等问题,提出了一种基于卷积神经网络(CNN)与双向门控循环单元(BiGRU)融合的神经网络入侵检测模型。通过SMOTE-Tomek算法完成对数据集的平衡处理,使用基于平均不纯度减少的特... 针对深度学习入侵检测中出现的数据类不平衡及特征学习不全面等问题,提出了一种基于卷积神经网络(CNN)与双向门控循环单元(BiGRU)融合的神经网络入侵检测模型。通过SMOTE-Tomek算法完成对数据集的平衡处理,使用基于平均不纯度减少的特征重要性算法实现特征选择,将CNN和BiGRU模型进行特征融合并引入注意力机制进行特征提取,从而提高模型的总体检测性能。使用入侵检测数据集CSE-CIC-IDS2018进行多分类实验,并与经典单一深度学习模型进行对比。实验结果表明:在数据集平衡方面,经SMOTE-Tomek算法处理,DoS attacks-Slow HTTP Test识别准确率从0提升至34.66%,SQL Injection识别准确率从0提升至100%,DDoS attack-LOIC-UDP、Brute Force-Web和Brute Force-XSS分别提升了5.22百分点、6.55百分点和35.71百分点,证明了平衡后的数据集较未经过处理的数据集在少数类的识别精度上提升明显。在模型的总体检测性能方面,在多分类实验对比中,所提模型总的分类精确率、召回率以及F1值均高于其他几种单一神经网络模型。其中各攻击流量类别的总评精确率比LSTM模型提升了2.10百分点;总评召回率比LSTM模型提升了1.50百分点;总评F1值比GRU模型提升了1.97百分点,从而证明了该模型具有更好的检测效果。 展开更多
关键词 入侵检测 卷积神经网络 双向门控循环单元 SMOTE算法 tomek links算法
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面向不平衡工业大数据集的SVM-tree分类算法研究 被引量：1
4
作者 林君萍 《长春师范大学学报》 2022年第2期40-46,共7页
针对不平衡率较高的工业大数据分类问题,提出一种基于SVM-tree的不平衡大数据分类算法研究。利用Tomek-links对清除系统噪声的影响,基于K-means算法对不平衡数据集做分簇处理,降低数据分类的复杂度,构建SVM-tree模型,将不平衡数据样本... 针对不平衡率较高的工业大数据分类问题,提出一种基于SVM-tree的不平衡大数据分类算法研究。利用Tomek-links对清除系统噪声的影响,基于K-means算法对不平衡数据集做分簇处理,降低数据分类的复杂度,构建SVM-tree模型,将不平衡数据样本映射到高维空间,根据数据集的规模和数据不平衡程度,调整SVM-tree的树形结构,在保证数据分类准确率的同时,也降低了算法模型的代价成本。实验分析结果表明,SVM-tree算法模型具有良好数据聚类性能,算法运行时间较短,且不平衡大数据分类准确率高。 展开更多
关键词 不平衡大数据 tomek-links K-MEANS算法 SVM-tree模型
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