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题名中间偃麦草TiAP1基因的克隆及生物信息学分析
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作者
田秋菊
宋静
杨艳琳
许田
王洪刚
封德顺
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机构
山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室
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出处
《山东农业科学》
2017年第10期1-9,共9页
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基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0102000)
国家自然科学基金面上项目(31171552)
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文摘
本研究从烟农15和中间偃麦草杂交所得的小偃麦异附加系SN6306中克隆得到TiAP1基因的全长序列,该序列全长1 272 bp,预测编码423个氨基酸。通过Blast P分析,发现其属于天冬氨酸蛋白酶家族。生物信息学分析发现,TiAP1蛋白含有信号肽且位于第16和17个氨基酸之间,同时含有两个木聚糖酶抑制剂结构域,分别位于该蛋白的N端和C端。此外,通过TMHMM预测,发现该蛋白无跨膜螺旋结构,因此是胞外蛋白。为了检测基因的亲缘关系,构建系统进化树,发现TiAP1基因与乌拉尔图小麦以及粗山羊草相应基因有较近的亲缘关系。上述结果为研究TiAP1基因的功能奠定了基础。
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关键词
小偃麦异附加系
tiap1
基因克隆
生物信息学分析
白粉病
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Keywords
Wheat-Thinopyrum alien addition line
tiap1
Gene clone
Bioinformatics analysis
Powdery mildew
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分类号
S512.901
[农业科学—作物学]
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