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TET2与变态反应性疾病的研究进展
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作者 邓智锋 朱霆 《中国医药导报》 2025年第2期61-65,共5页
TET2通过催化5-羟甲基胞嘧啶的氧化反应完成DNA去甲基化,参与基因表观遗传调控。变态反应性疾病涉及多种免疫细胞的功能失调,TET2能调节这些免疫细胞的分化和功能,并调控变应性炎症。本文综述TET2的结构和调节免疫细胞的功能,并探讨TET... TET2通过催化5-羟甲基胞嘧啶的氧化反应完成DNA去甲基化,参与基因表观遗传调控。变态反应性疾病涉及多种免疫细胞的功能失调,TET2能调节这些免疫细胞的分化和功能,并调控变应性炎症。本文综述TET2的结构和调节免疫细胞的功能,并探讨TET2在变态反应性疾病中的作用,以期为变态反应性疾病的治疗提供新思路。 展开更多
关键词 tet2 5-羟甲基胞嘧啶 免疫细胞 变态反应性疾病
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TET蛋白和氧化甲基胞嘧啶在变态反应相关免疫中的作用研究进展
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作者 谭路 许昱 《武汉大学学报(医学版)》 2025年第7期927-934,共8页
TET蛋白通过催化完成DNA去甲基化过程中5甲基胞嘧啶的氧化反应从而调控基因表达。免疫细胞在参与变态反应的过程中发生了一系列以转录重编程为特征的分化与再分化,TET蛋白和氧化甲基胞嘧啶与此密切相关。通过影响免疫细胞功能转变,TET... TET蛋白通过催化完成DNA去甲基化过程中5甲基胞嘧啶的氧化反应从而调控基因表达。免疫细胞在参与变态反应的过程中发生了一系列以转录重编程为特征的分化与再分化,TET蛋白和氧化甲基胞嘧啶与此密切相关。通过影响免疫细胞功能转变,TET蛋白在变应性炎症调控中存在重要作用。本文将综述TET蛋白和氧化甲基胞嘧啶在变态反应相关免疫细胞及变应性疾病中的作用,介绍携带TET蛋白的表观遗传编辑的研究进展,以期为研究变应性疾病的发病机制和探索创新治疗方式提供新思路。 展开更多
关键词 tet蛋白 5‑甲基胞嘧啶 5‑羟甲基胞嘧啶 免疫细胞 变态反应
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基于DNA甲基化组学技术分析TET 1基因对小鼠uNK细胞DNA甲基化的影响
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作者 赵静贤 杨晓伟 +3 位作者 刘言言 赵自亮 赵光伟 赵永聚 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第2期912-924,共13页
本研究旨在探究去甲基化酶1(ten eleven translocation,TET 1)对小鼠子宫内自然杀伤细胞(uterine natural killer,uNK)DNA甲基化的影响,深入了解其分子调控机制。无菌采集妊娠10 d小鼠子宫蜕膜,分离纯化uNK细胞进行培养,利用RNA干扰技... 本研究旨在探究去甲基化酶1(ten eleven translocation,TET 1)对小鼠子宫内自然杀伤细胞(uterine natural killer,uNK)DNA甲基化的影响,深入了解其分子调控机制。无菌采集妊娠10 d小鼠子宫蜕膜,分离纯化uNK细胞进行培养,利用RNA干扰技术敲低TET 1基因的表达,提取TET 1干扰组和正常对照组细胞的总DNA,利用简化基因组DNA甲基化测序(reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)技术进行测序,测序结果经生物信息学软件分析进行两组样本差异甲基化区域(differentially methylated region,DMR)的统计与注释,并进一步对DMR相关基因进行GO数据库分析及注释,了解相关基因的功能,利用KEGG数据库对其调控的信号通路进行富集分析。结果显示,TET 1干扰组相较对照组共有14120个DMRs,其中高甲基化的DMR有4897个,低甲基化的DMR有9223个,分布在基因体(genebody)上的DMR最多,共9762个,占总数的69.14%。DMR广泛分布于基因组的不同元件,且有些基因不同元件同时存在高甲基化和低甲基化的DMR。GO注释结果显示,存在DMR的基因主要集中在ATP结合、核酸结合、细胞组建、细胞分化、胚胎发育、RNA聚合酶Ⅱ转录调控、细胞增殖负调控等方面。KEGG数据库分析显示,DMR主要在代谢通路呈现显著富集,其中丙酮酸代谢通路共有12个参与代谢的关键分子出现了54个DMR,是出现DMR显著富集的代谢通路,其中乙酰辅酶A合成酶(Acss)、乳酸脱氢酶B(Ldhb)和丙酮酸激酶(Pklr)的DMR呈现单一高甲基化状态。此外,PI3K/AKT信号通路和HIF-1信号通路在介导丙酮酸代谢过程中发挥重要作用,且在基因体和启动子上的DMR也出现显著富集。综上,TET 1对小鼠uNK细胞具有甲基化调控作用,丙酮酸代谢是其发挥调控作用的主要途径,Acss、Ldhb和Pklr是其潜在的调控靶分子,PI3K/AKT和HIF-1是参与调控的重要信号通路。 展开更多
关键词 tet 1基因 UNK细胞 甲基化组学 丙酮酸 小鼠
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针灸对溃疡性结肠炎大鼠DNA羟甲基化酶TETs介导免疫调节的影响
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作者 张玥 沈亚 +9 位作者 朱璐 徐静 杨玲 赵继梦 马喆 祁琴 冯格格 李峰 吴焕淦 黄艳 《上海针灸杂志》 2025年第6期750-759,共10页
目的溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)反复发作的慢性炎症可引起癌变,本研究观察温和灸和电针干预对UC大鼠肠黏膜的保护效应及其免疫调节机制。方法将SD大鼠随机分为正常组、模型组、温和灸组、电针组和西药组。腹腔注射氧化偶氮甲... 目的溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)反复发作的慢性炎症可引起癌变,本研究观察温和灸和电针干预对UC大鼠肠黏膜的保护效应及其免疫调节机制。方法将SD大鼠随机分为正常组、模型组、温和灸组、电针组和西药组。腹腔注射氧化偶氮甲烷10 mg/kg,再连续5 d自由饮用5%葡聚糖硫酸钠溶液建立UC模型。观察一般情况、结肠长度、结肠组织病理学及其评分。采用酶联免疫吸附测定(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)法检测各组血清中白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、转化生长因子-β1(transforming growth factor beta 1,TGF-β1)的浓度,免疫荧光(immunofluorescence,IF)技术检测结肠组织5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5-mC)、5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5-hmC)、10-11易位(ten-eleven translocation,TET)蛋白家族和组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylase 2,HDAC2)蛋白定位及表达。结果与正常组比较,模型组结肠长度明显缩短、结肠组织病理学评分增加(P<0.05),血清中IL-6浓度增加、TGF-β1浓度降低(P<0.05),5-mC蛋白表达增加(P<0.05),5-hmC、TET1、TET2、TET3、HDAC2蛋白表达均减少(P<0.05)。与模型组比较,温和灸组、电针组、西药组结肠长度缩短均改善、病理学评分均降低(P<0.05),血清中TGF-β1浓度均升高、IL-6浓度均降低(P<0.05),结肠5-hmC、TET1、TET2、TET3、HDAC2蛋白表达均明显升高(P<0.05),温和灸组结肠5-mC蛋白表达降低(P<0.05)。温和灸组结肠TET1、TET2和TET3与HDAC2均有共表达,电针组TET2和TET3与HDAC2有共表达,西药组TET1和TET3与HDAC2有共表达。结论温和灸和电针对UC结肠黏膜均有保护效应,其机制与温和灸和电针均上调DNA羟甲基化酶TETs、组蛋白去乙酰化酶HDAC2的蛋白表达,维持5-mC/5-hmC平衡有关,其中温和灸能通过TET1、TET2和TET3招募HDAC2,而电针仅能通过TET2和TET3招募HDAC2发挥免疫调节作用。 展开更多
关键词 结肠炎 溃疡 温和灸 电针 DNA羟甲基化酶tets 白介素6 5-甲基胞嘧啶 大鼠
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桑树四跨膜蛋白(TET)基因家族的克隆及功能分析
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作者 黄笑利 胡佳悦 +1 位作者 刘伟富 刘吉平 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第3期12-23,34,共13页
为探究桑树(Morus alba Linn.)四跨膜蛋白(TET)基因家族的功能,从桑树全基因组中筛选并克隆了9个MaTET基因(MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10、MaTET 11、MaTET 18、MaTET 19 A和MaTET 19 B),通过生物信息学和分子生物学... 为探究桑树(Morus alba Linn.)四跨膜蛋白(TET)基因家族的功能,从桑树全基因组中筛选并克隆了9个MaTET基因(MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10、MaTET 11、MaTET 18、MaTET 19 A和MaTET 19 B),通过生物信息学和分子生物学技术分析了其理化性质、保守基序、结构域、系统进化及顺式作用元件,利用实时荧光定量PCR技术检测了这9个基因在低温胁迫、脱落酸和茉莉酸甲酯处理及茄科劳尔氏菌(Ralstonia solanacearum)侵染下的表达模式,并结合原核表达和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行了检测验证。结果显示:桑树MaTET基因家族9个成员的碱基长度为813~1520 bp;除MaTET18、MaTET19A和MaTET19B外,其他6个MaTET蛋白的理论等电点高于pI 7.0;MaTET蛋白均为疏水蛋白,且均具有跨膜结构域,共有12个保守基序,且保守结构域基本一致。系统进化分析表明:MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 11与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕同源蛋白亲缘关系较近。9个MaTET基因启动子共有15种与非生物胁迫、激素响应和生长发育相关的顺式作用元件。基因表达分析结果显示:低温胁迫下MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 18的相对表达量显著(P<0.05)变化;脱落酸处理1 h,MaTET 2、MaTET 3、MaTET 11、MaTET 19 A和MaTET 19 B的相对表达量显著上调;茉莉酸甲酯处理1 h,9个MaTET基因的相对表达量均显著升高;茄科劳尔氏菌侵染72 h,除MaTET 2和MaTET 18外,其他7个MaTET的相对表达量不同程度地升高。原核表达及SDS-PAGE检测结果显示:桑树MaTET基因家族的9个成员中7个成员编码蛋白在相对分子质量处检测到条带,而MaTET3和MaTET6在更换表达条件后均未成功表达。综上所述,桑树MaTET基因家族在响应非生物胁迫、激素响应和病原菌侵染中发挥重要作用。 展开更多
关键词 桑树 四跨膜蛋白(tet) 基因家族 生物信息学 原核表达
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毕赤酵母中Tet-on诱导系统的开发与优化
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作者 邹弘毅 梁书利 《现代食品科技》 北大核心 2025年第4期163-171,共9页
基因表达精准调控对于高效能细胞工厂构建至关重要,基于非营养源的小分子诱导系统在基因表达调控具有广泛的应用潜力。该研究在巴斯德毕赤酵母中开发了基于强力霉素响应的Tet-on诱导系统,并进一步对该系统的各个元件进行优化。通过筛选... 基因表达精准调控对于高效能细胞工厂构建至关重要,基于非营养源的小分子诱导系统在基因表达调控具有广泛的应用潜力。该研究在巴斯德毕赤酵母中开发了基于强力霉素响应的Tet-on诱导系统,并进一步对该系统的各个元件进行优化。通过筛选合适的核心启动子序列、优化控制rtTA表达的启动子、转录激活结构域优化以及构建rtTA突变体,最终得到一系列的可响应强力霉素的诱导型启动子。其中基于rtTA-V10的Tet-on诱导系统拥有较低的本底水平泄露(荧光值为野生型菌株的1.05倍),而在添加强力霉素后,荧光强度的动态范围达到了52.76倍。而基于rtTA-VPR的Tet-on诱导系统在各种碳源条件下都表现出良好的表达强度,甲醇条件下达到了PAOX1的111.16%,在甘油、乙醇、葡萄糖条件下达到了PGCW14的110.65%、106.05%、112.24%。通过添加不同浓度的诱导剂即可以实现基因的精细化调控,这为毕赤酵母代谢工程和合成生物学领域中基因表达精准调控提供有力的遗传操作工具。 展开更多
关键词 tet-on系统 毕赤酵母 启动子
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TET2在骨髓增生异常综合征中的作用
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作者 张俊丽 胡可心 +1 位作者 杨馨怡 陆嘉惠 《生命的化学》 2025年第7期1295-1299,共5页
骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndrome,MDS)是一种异质性的克隆性造血疾病,以骨髓造血功能异常、外周血细胞减少及向急性髓系白血病转化风险增加为特点。TET2突变是MDS患者常见的基因突变之一。本文系统阐述了TET2突变在MDS发... 骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndrome,MDS)是一种异质性的克隆性造血疾病,以骨髓造血功能异常、外周血细胞减少及向急性髓系白血病转化风险增加为特点。TET2突变是MDS患者常见的基因突变之一。本文系统阐述了TET2突变在MDS发病中的多重作用机制,包括其介导的表观遗传学调控异常、免疫微环境改变及炎症状态形成等关键病理过程;探讨了基于TET2突变分子特征的潜在治疗策略。研究分析表明,TET2突变通过以下机制促进MDS的发生发展:(1)导致DNA去甲基化调控异常;(2)诱发免疫功能紊乱及炎症状态;(3)与其他驱动基因产生协同或拮抗效应。本文基于对现有研究证据的回顾,针对TET2突变的干预策略为MDS的靶向治疗提供了新的研究方向和治疗思路。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 tet2 骨髓造血 靶向治疗
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河北省邯郸地区鸡源tet(X4)基因阳性大肠杆菌的耐药性分析及遗传进化特征
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作者 王承业 王玮玮 +5 位作者 陈旭 伊蓝坤 白玉彬 王清 朱阵 曹明泽 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第1期69-81,共13页
为了探究河北省邯郸地区鸡源tet(X4)基因阳性大肠杆菌的耐药性及遗传进化特征,试验于2020年3—6月份和2021年5月份采集该地区3个大型商品蛋鸡养殖场鸡粪便样本400份,划线接种于含4 mg/L替加环素的麦康凯琼脂培养基上分离替加环素抗性疑... 为了探究河北省邯郸地区鸡源tet(X4)基因阳性大肠杆菌的耐药性及遗传进化特征,试验于2020年3—6月份和2021年5月份采集该地区3个大型商品蛋鸡养殖场鸡粪便样本400份,划线接种于含4 mg/L替加环素的麦康凯琼脂培养基上分离替加环素抗性疑似大肠杆菌菌株,并通过革兰氏染色、生化试验和16S rDNA基因的PCR扩增与测序对分离菌株进行进一步鉴定,随后对替加环素抗性大肠杆菌菌株进行tet(X4)基因检测,再对阳性菌株进行其他耐药基因检测、耐药性分析、血清型鉴定、系统进化群分析、质粒复制子分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分析。结果表明:共分离到96株替加环素抗性大肠杆菌,其中13株为tet(X4)基因阳性菌株,检出率为13.5%;在tet(X4)基因阳性菌株中,parC基因检出率为100%,然后从高到低依次为bla_(TEM-1)、bla_(OXA-48)、tet(C)、tet(M)、mph(A)和qnrA基因,检出率分别为84.6%、61.5%、38.5%、23.0%、23.0%和7.7%;13株tet(X4)阳性菌株对磺胺甲口恶唑/甲氧苄啶、头孢噻肟、氨苄西林、四环素、多西环素和替加环素的耐药率均为100%,对头孢吡肟、庆大霉素、多黏菌素、氨曲南、磷霉素和阿米卡星的耐药率分别为84.6%、76.9%、69.2%、69.2%、61.5%和15.4%,且均对9种及以上抗生素耐药,其中耐10种及以上抗生素的菌株有9株。13株tet(X4)基因阳性菌株分属于3种O抗原血清型,其中O119血清型有11株,占比为84.6%,为优势血清型;O112血清型和O39血清型各有1株。13株tet(X4)基因阳性菌株分属于2个系统进化群,其中A/C群有9株,占比为69.2%,为优势群;B1群有4株,占比为30.8%。13株tet(X4)基因阳性菌株共携带6种质粒(P0111、IncF、IncI1、IncFIB、IncHI2、IncX2),其中属于质粒复制子谱型IncI1+IncF+P0111的菌株最多,占比为76.9%。13株tet(X4)基因阳性菌株共分为4种序列型别(sequence type,ST),其中ST3817有10株,占比为76.9%,为优势ST;ST641、ST602和未知ST型各有1株。说明河北省邯郸地区鸡源tet(X4)基因阳性大肠杆菌多重耐药现象普遍存在,且优势血清型为O119,优势系统进化群为A/C群,优势ST为ST3817。 展开更多
关键词 大肠杆菌 耐药性 tet(X4)基因 遗传进化特征 邯郸地区
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DNA甲基化与羟甲基化在帕金森病患者中的意义及与TET蛋白的关系
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作者 周亚丽 王丽娜 赵丰丽 《中国实用神经疾病杂志》 2025年第3期336-340,共5页
目的分析DNA甲基化、羟甲基化在帕金森病患者中的意义及其与TET蛋白之间的关联。方法纳入2021-10—2023-10于运城市中心医院神经内科住院的帕金森病患者106例以及同期健康体检者106例,所有帕金森病患者分为预后良好组和预后不良组。收... 目的分析DNA甲基化、羟甲基化在帕金森病患者中的意义及其与TET蛋白之间的关联。方法纳入2021-10—2023-10于运城市中心医院神经内科住院的帕金森病患者106例以及同期健康体检者106例,所有帕金森病患者分为预后良好组和预后不良组。收集所有研究对象的外周血,提取全基因组DNA,采用双抗体夹心酶联免疫吸附法(ELISA)法进行5-mC以及5-hmC百分比的测定;提取PBMC,采用qPCR进行TET1、TET2、TET3的mRNA表达水平的测定。采用Spearman相关性分析TET1、TET2、TET3的表达水平与5-mC及5-hmC的相关性,ROC曲线分析TET1、TET2对帕金森病患者预后的预测价值。结果与对照组相比,帕金森病患者血浆5-mC以及5-hmC水平均显著升高,TET1、TET2、TET3表达水平均显著升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析显示,帕金森病患者TET1、TET2、TET3与5-mC水平之间无显著相关性,TET1、TET2表达水平与5-hmC呈显著正相关(r=0.573、0.647,P<0.01),TET3表达水平与5-hmC无明显相关性。ROC曲线提示,TET1、TET2预测不良预后的风险的AUC值分别为0.861、0.887。结论帕金森病患者DNA甲基化、羟甲基化水平显著升高,TET1、TET2介导的5-hmC表达水平上调从而促进帕金森病的发生与进展,可成为进一步研究帕金森病的重要标志物。 展开更多
关键词 帕金森病 甲基化 羟甲基化 tet蛋白 预后
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Modulation of colonic DNA methyltransferase by mild moxibustion and electroacupuncture in ulcerative colitis TET2 knockout mice
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作者 Gege FENG Yue ZHANG +4 位作者 Huangan WU Lu ZHU Hongxiao XU Zhe MA Yan HUANG 《Digital Chinese Medicine》 2025年第1期100-110,共11页
Objective To investigate the mechanism of in alleviating colonic mucosal inflammation in ten-eleven translocation(TET)protein 2 gene knockout(TET2^(-/-))mice with ulcerative colitis(UC)by regulating DNA methyltransfer... Objective To investigate the mechanism of in alleviating colonic mucosal inflammation in ten-eleven translocation(TET)protein 2 gene knockout(TET2^(-/-))mice with ulcerative colitis(UC)by regulating DNA methyltransferase(DNMT)and DNA hydroxymethylase.Methods Male specific pathogen-free(SPF)grade C57BL/6J wild-type(WT)mice(n=8)and TET2^(-/-)mice(n=20)were used to establish UC models by freely drinking 3%dextran sulfate sodium solution for 7 d.After UC model validation through histopathological examination in two mice from each type,the remaining mice were divided into four groups(n=6 in each group):WT model(WT+UC),TET2^(-/-)model(TET2^(-/-)+UC),TET2^(-/-)mild moxibustion(TET2^(-/-)+MM),and TET2^(-/-)electroacupuncture(TET2^(-/-)+EA)groups.TET2^(-/-)+MM group received mild moxibustion on Tianshu(ST25)and Qihai(CV6)for 10 min daily for 7 d.The TET2^(-/-)+EA group also applied electroacupuncture(1 mA,2/100 Hz)at the same acupoints for 10 min daily for 7 d.The disease activity index(DAI)scores of each group of mice were accessed daily.The colon lengths of mice in groups were measured following intervention.The pathological changes in the colon tissues were observed with hematoxylin and eosin(HE)staining.The concentrations of interleukin(IL)-6,C-C motif chemokine 17(CCL17),and C-X-C motif chemokine ligand 10(CXCL10)in serum were detected by enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA).The expression of DNMT proteins(DNMT1,DNMT3A,and DNMT3B)in the colon tissues was detected by immunohistochemistry.The expression of 5-methylcytosine(5-mC),5-hydroxymethylcytosine(5-hmC),histone deacetylase 2(HDAC2),and DNA hydroxymethylase family proteins(TET 1 and TET3)was detected using immunofluorescence,which also determined the co-localization of TET1 and IL-6 protein.Results Compared with WT+UC group,TET2^(-/-)+UC group exhibited significantly higher DAI scores and shorter colon lengths(P<0.01).Both mild moxibustion and electroacupuncture significantly decreased DAI scores and ameliorated colon shortening in TET2^(-/-)mice(P<0.001).Histopathological scores of TET2^(-/-)+UC mice were significantly higher than those of WT+UC group(P<0.001)and were significantly reduced after both mild moxibustion and electroacupuncture interventions(P<0.001).Serum levels of IL-6,CCL17,and CXCL10 were significantly elevated in TET2^(-/-)+UC group compared with WT+UC group(P<0.001).Mild moxibustion significantly reduced IL-6,CCL17,and CXCL10 levels(P<0.001,P<0.001,and P<0.01,respectively),while electroacupuncture also significantly reduced IL-6,CCL17,and CXCL10 levels(P<0.05,P<0.01,and P<0.01,respectively).TET2^(-/-)+UC mice showed increased expression levels of DNMT1,DNMT3A,DNMT3B,and 5-mC(P<0.05,P<0.01 and P<0.001,respectively),with decreased expression levels of TET1,TET3,5-hmC,and HDAC2(P<0.001).Mild moxibustion significantly reduced DNMT1,DNMT3B,and 5-mC levels(P<0.05,P<0.01,and P<0.001,respectively),while increasing expression levels of TET1,TET3,5-hmC,and HDAC2(P<0.001,P<0.001,P<0.05,and P<0.001,respectively).Electroacupuncture significantly decreased 5-mC and DNMT3B levels(P<0.001 and P<0.01,respectively)and increased 5-hmC and HDAC2 levels(P<0.05 and P<0.001,respectively),but did not significantly affect TET1 and TET3 expression(P>0.05).Compared with TET2^(-/-)+MM group,TET2^(-/-)+EA group showed significantly higher 5-mC expression(P<0.001).TET2^(-/-)+UC group exhibited markedly increased IL-6 expression and higher co-localization of TET1 and IL-6 in mucosal epithelium,whereas minimal IL-6 expression was observed in the other groups.Conclusion Mild moxibustion and electroacupuncture significantly ameliorate colonic inflammation exacerbated by TET2 deficiency in UC mice via epigenetic modulation.Distinct mechanisms exist between the two interventions:mild moxibustion regulates both DNMT and hydroxymethylase,whereas electroacupuncture primarily affects DNMT. 展开更多
关键词 Ulcerative colitis tet2 knockout Mild moxibustion ELECTROACUPUNCTURE DNA methyltransferase DNA hydroxymethylase
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Inflammatory macrophage-derived itaconate inhibits DNA demethylase TET2 to prevent excessive osteoclast activation in rheumatoid arthritis
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作者 Kewei Rong Dezheng Wang +12 位作者 Xiting Pu Cheng Zhang Pu Zhang Xiankun Cao Jinglin Zheng Xiao Yang Kexin Liu Lei ShiYin Li Peixiang Ma Dan Ye Jie Zhao Pu Wang An Qin 《Bone Research》 2025年第5期1188-1200,共13页
Itaconate,a macrophage-specific anti-inflammatory metabolite,has recently emerged as a critical regulator in rheumatoid arthritis pathogenesis.We found that itaconate is a TNF-αresponsive metabolite significantly ele... Itaconate,a macrophage-specific anti-inflammatory metabolite,has recently emerged as a critical regulator in rheumatoid arthritis pathogenesis.We found that itaconate is a TNF-αresponsive metabolite significantly elevated in the serum and synovial fluid of rheumatoid arthritis patients and we demonstrated that itaconate is primarily produced by inflammatory macrophages rather than osteoclasts or osteoblasts.In TNF-transgenic and Irg1−/−hybrid mice,a more severe bone destruction phenotype was observed. 展开更多
关键词 osteoclast activation bone destruction phenotype itaconate tet synovial fluid rheumatoid arthritis patients inflammatory macrophages rheumatoid arthritis
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Metabolite-Chromatin Interaction Network Drives Kidney Regeneration:The Coordinated Regulation of Succinate/H3K9ac andα-KG/TET Demethylation
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作者 Peng Lu Lei Zhang +3 位作者 Jing-Jing Fan Jin Xing Li Xu Yan Sun 《Asia Pacific Journal of Clinical Medical Research》 2025年第2期1-15,共15页
As the“fourth messenger”of epigenetic regulation,metabolites playa spatiotemporally specific regulatory role in kidney regeneration by dynamically reshaping the state of chromatin modifications.This review systemati... As the“fourth messenger”of epigenetic regulation,metabolites playa spatiotemporally specific regulatory role in kidney regeneration by dynamically reshaping the state of chromatin modifications.This review systematically expounds the coordinated mechanism of the dual axes of succinate/H3K9ac andα-ketoglutarate(α-KG)/TET enzymes:Succinate activates regeneration-related genes by regulating histone acetylation(H3K9ac),whileα-KG relieves the epigenetic repression of the Wnt pathway through TET-mediated DNA demethylation.The dynamic balance between the two maintains epigenetic plasticity.Multi-omics integration strategies(such as Gaussian graphical models and deep learning frameworks)and single-cell epigenetic tracking technologies(such as spatial metabolomics)have revealed the regulation of metabolite gradients on cellular heterogeneity and the immune microenvironment.The coordinated application of metabolite precursor supplementation(such as NAD precursors)and dynamic monitoring systems(such as isotope tracing and artifi cial intelligence models)has promoted the shift of metabolic medicine from the“static replacement”paradigm to the“dynamic reshaping”paradigm.However,technical bottlenecks(such as insuffi cient multimodal integration)and clinical translation pitfalls(such as challenges in standardized production)still need to be overcome.In the future,through the development of“metabolism-immunity”co-regulatory strategies and intelligent closed-loop systems,it is expected to achieve precise interventions for kidney regeneration and disease treatment. 展开更多
关键词 Metabolite-Epigenetic Interaction Succinate/H3K9ac α-KG/tet Enzymes Renal Stem Cells
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TET2重塑CXCR4 DNA甲基化对急性心肌梗死小鼠心肌组织自噬、炎症反应及凋亡的影响 被引量:4
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作者 毛山 周明 +2 位作者 段班燕 曹政 李军 《中西医结合心脑血管病杂志》 2024年第9期1579-1584,共6页
目的:探究急性心肌梗死(AMI)过程中内皮细胞tet甲基胞嘧啶双加氧酶2(TET2)对趋化因子受体4(CXCR4)DNA甲基化的影响以及对AMI小鼠心肌组织自噬、炎症反应及组织细胞凋亡的影响机制,为临床探究AMI发展的分子机制提供理论依据。方法:8周龄... 目的:探究急性心肌梗死(AMI)过程中内皮细胞tet甲基胞嘧啶双加氧酶2(TET2)对趋化因子受体4(CXCR4)DNA甲基化的影响以及对AMI小鼠心肌组织自噬、炎症反应及组织细胞凋亡的影响机制,为临床探究AMI发展的分子机制提供理论依据。方法:8周龄雄性C57/BL6小鼠50只,制备AMI模型,尾部注射TET2、CXCR4过表达质粒;蛋白免疫印迹(Western Blot)法检测心肌组织TET2、CXCR4、微管相关蛋白3(LC3)、P62、B细胞淋巴瘤/白血病-2基因(Bcl-2)关联X蛋白(Bax)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase-3)、Bcl-2表达;甲基化检测CXCR4 DNA甲基化水平;酶联免疫吸附法(ELISA)检测心肌组织内炎性因子白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-1β(IL-1β)水平;原位末端转移酶标记技术(TUNEL)检测各组心肌组织细胞凋亡指数。结果:与假手术组比较,模型组心肌组织内TET2、CXCR4均表达上调,TET2、CXCR4均在心肌组织内过表达,TET2过表达促进CXCR4表达,差异有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,TET2 mimic组CXCR4启动子区域DNA甲基化程度降低,CXCR4蛋白表达升高,差异有统计学意义(P<0.05);与假手术组比较,模型组小鼠心肌组织自噬蛋白LC3、抑制细胞凋亡蛋白Bcl-2表达下调,炎性因子IL-6、TNF-α、IL-1β水平、自噬蛋白P62、促细胞凋亡蛋白Bax、cleaved Caspase-3表达上调,差异有统计学意义(P<0.05);TET2、CXCR4过表达进一步下调LC3、Bcl-2蛋白表达,上调炎性因子IL-6、TNF-α、IL-1β水平,P62、Bax、cleaved Caspase-3蛋白表达;TET2、CXCR4二者联合体现出最低LC3、Bcl-2蛋白表达,最高炎性因子IL-6、TNF-α、IL-1β水平以及P62、Bax、cleaved Caspase-3蛋白表达,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:AMI发展中,TET2通过降低CXCR4 DNA甲基化,促进CXCR4基因表达,进而抑制AMI小鼠心肌组织自噬,上调炎症反应及细胞凋亡程度,促进疾病发展。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 tet甲基胞嘧啶双加氧酶2 趋化因子受体4 DNA甲基化 自噬 炎症反应 凋亡
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猪场环境源大肠杆菌的耐药性调查及携带mcr-1和tet(X4)菌株的传播特征 被引量:1
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作者 马胜男 王倩倩 +6 位作者 申家兴 丁鹏云 冯一鸣 苑丽 潘玉善 胡功政 贺丹丹 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第11期1-10,共10页
养殖场中抗菌药的长期使用促使耐药菌株快速出现和传播,并可以通过粪肥和污水向环境排放,给公共卫生带来巨大威胁。为了调查猪场环境源大肠杆菌的耐药情况,评估耐药基因的传播风险,本试验采集163份猪场粪便、污水和土壤样本,通过平板划... 养殖场中抗菌药的长期使用促使耐药菌株快速出现和传播,并可以通过粪肥和污水向环境排放,给公共卫生带来巨大威胁。为了调查猪场环境源大肠杆菌的耐药情况,评估耐药基因的传播风险,本试验采集163份猪场粪便、污水和土壤样本,通过平板划线分离培养法分离大肠杆菌,通过药敏试验检测分离菌株对14种抗菌药物的耐药情况,聚合酶链式反应(PCR)检测临床重要耐药基因,脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测菌株间的亲缘关系,接合试验和质粒复制子分型检测接合子的质粒类型。结果显示,共分离获得150株大肠杆菌,其中粪便源大肠杆菌耐药情况最严重,污水源大肠杆菌次之,土壤源大肠杆菌最低;污水源大肠杆菌耐药基因检出种类最多,粪便源大肠杆菌次之,土壤源大肠杆菌最少。10株携带黏菌素耐药基因mcr-1大肠杆菌和18株携带替加环素耐药基因tet(X4)大肠杆菌分离自粪便和污水样本,且多重耐药情况较为严重。10株携带mcr-1大肠杆菌经PFGE分为9种脉冲场图谱,其中9株与大肠杆菌C600接合成功,接合子中有IncFIA、IncW、IncFIB、IncI2和IncP五种质粒类型;18株携带tet(X4)大肠杆菌经PFGE分为15种脉冲场图谱,其中16株与大肠杆菌C600接合成功,接合子中有IncFIB、IncFrepB和IncHI1三种质粒类型。结果表明,必需持续监测猪场环境中的临床重要耐药基因,特别需要关注mcr-1和tet(X4)基因的流行情况,并且在养殖中合理使用黏菌素和四环素类抗生素。 展开更多
关键词 猪场环境 大肠杆菌 药敏试验 耐药基因 mcr-1 tet(X4)
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靛玉红通过miRNA-29b-3p/TET2/5hmC轴促进骨髓增生异常综合征细胞株SKM-1细胞DNA去甲基化 被引量:1
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作者 喻丽 凌志明 +3 位作者 谷晓丽 杨秀鹏 陈朋杰 许勇钢 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期5448-5452,共5页
目的:探索青黄散有效成分靛玉红对骨髓增生异常综合征(MDS)的去甲基化作用机制。方法:以MDS细胞株SKM-1细胞为研究对象,以不同浓度的靛玉红干预细胞48 h,采用DNA斑点印记方法,检测5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲基胞嘧啶(5mC)等DNA甲基化... 目的:探索青黄散有效成分靛玉红对骨髓增生异常综合征(MDS)的去甲基化作用机制。方法:以MDS细胞株SKM-1细胞为研究对象,以不同浓度的靛玉红干预细胞48 h,采用DNA斑点印记方法,检测5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲基胞嘧啶(5mC)等DNA甲基化指标的变化情况;通过qPCR、蛋白免疫印迹检测SKM-1细胞TET2基因表达;通过转录组高通量测序分析靛玉红调控SKM-1细胞miRNA表达的情况,并通过miRNA靶基因预测工具miranda工具筛选参与靛玉红促进MDS的TET2表达的候选miRNAs,随后使用qPCR进行实验验证。结果:DNA斑点印记结果显示靛玉红显著提高了SKM-1细胞DNA中5hmC的水平而降低了5mC的表达水平。qPCR与蛋白免疫印迹结果显示靛玉红没有显著改变TET2 mRNA表达,但是显著提高了TET2蛋白表达。转录组高通量测序结果显示靛玉红干预后有35个miRNA存在表达差异,其中17个miRNA上调,18个miRNA下调。Miranda结果显示差异miRNA中miRNA-29b-3p、miRNA-125a-5p可能作用于TET2基因。qPCR结果显示,靛玉红下调了miRNA-29b-3p的表达而上调了mi RNA-125a-5p的表达。结论:靛玉红可能通过mi RNA-29b-3p/TET2/5hm C轴促进SKM-1细胞DNA去甲基化。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 SKM-1细胞 DNA甲基化 靛玉红 tet2 mi RNA
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Tet system的调控原理及其在转基因小鼠模型上的应用 被引量:1
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作者 张景锋 郭欣政 +2 位作者 卫恒习 李莉 张守全 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期90-94,共5页
基因表达的调控是分子生物学研究的一个重要问题,也是基因治疗和基因功能研究的重要手段。诱导性基因表达系统可以从时间上调控基因的表达,是基因治疗和基因功能研究的重要工具之一。其中,四环素诱导基因表达系统(tetracycline inducibl... 基因表达的调控是分子生物学研究的一个重要问题,也是基因治疗和基因功能研究的重要手段。诱导性基因表达系统可以从时间上调控基因的表达,是基因治疗和基因功能研究的重要工具之一。其中,四环素诱导基因表达系统(tetracycline inducible expression system,Tet system)是应用最广泛的一种,它可以在时间和空间上对基因进行严谨和高效地诱导表达。基于该系统获得了不同用途的转基因动物,这些模型动物的建立为研究特定基因的功能及其在疾病发生中的作用打下了实验基础。现就四环素诱导表达系统的原理和在小鼠模型上的研究应用做一综述。 展开更多
关键词 tet SYSTEM tet-off系统 tet-on系统 转基因小鼠模型
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猪源携带tet(X4)基因大肠杆菌的消毒剂抗性分析 被引量:2
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作者 潘柄霖 王思楠 +4 位作者 姚国忠 翟瑞东 宋厚辉 程昌勇 雷蕾 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期5880-5885,共6页
旨在分析猪源粪便样本中携带tet(X4)基因大肠杆菌的分布及其耐药性、消毒剂抗性和消毒剂抗性基因携带情况。采集浙江省杭州、诸暨、舟山生猪养殖场猪粪便样本共计440份,通过PCR检测tet(X4)基因、消毒剂基因和Enterobacterial repetitive... 旨在分析猪源粪便样本中携带tet(X4)基因大肠杆菌的分布及其耐药性、消毒剂抗性和消毒剂抗性基因携带情况。采集浙江省杭州、诸暨、舟山生猪养殖场猪粪便样本共计440份,通过PCR检测tet(X4)基因、消毒剂基因和Enterobacterial repetitive intergenic consensus(ERIC)分型;通过16S rRNA序列鉴定细菌种属,采用微量肉汤稀释法测试菌株的耐药表型和消毒剂抗性表型。结果显示,3个地区共分离到携带tet(X4)基因的大肠杆菌117株,不同地区的tet(X4)大肠杆菌分离率为24.0%~29.5%。所有菌株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、氟苯尼考、替加环素耐药率均为100%,但均对黏菌素和美罗培南敏感。菌株对次氯酸钠、过硫酸氢钾的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)值较高,均为消毒剂工作浓度的1/2。与ATCC 25922相比,仅少量菌株对过氧化氢等5种消毒剂的MIC值高于标准菌株,但92.3%的菌株对苯扎溴铵的MIC值高于标准菌株。菌株所携带的消毒剂抗性基因以sugE(c)、qacF和qacEΔ1最常见,携带率分别为100%、25.6%和11.1%。ERIC分型显示117株菌株主要分为9个类群,呈现多样性。综上,携带tet(X4)基因的大肠杆菌主要优势类群在浙江省杭州、诸暨、舟山地区均有分布且均呈现多重耐药性,菌株有消毒剂抗性基因检出但对所试消毒剂的工作浓度均不耐受,养殖场可根据消毒效果选用消毒剂阻断场内多重耐药菌的传播。 展开更多
关键词 tet(X4) 大肠杆菌 耐药性 消毒剂抗性
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ASXL1、TET2阳性急性髓系白血病免疫表型及预后研究
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作者 苏艳萍 杨艳丽 +1 位作者 朱锦锦 李佳佳 《西部医学》 2024年第10期1470-1474,1479,共6页
目的探讨ASXL1、TET2阳性急性髓系白血病(AML)患者的免疫表型及临床预后。方法纳入2019年1月1日-2022年5月31日期间于蚌埠医学院第一附属医院就诊的162例初诊AML(M3型除外)患者的临床资料,其中ASXL1和TET2双突变组(ASXL1^(+)TET2^(+)组... 目的探讨ASXL1、TET2阳性急性髓系白血病(AML)患者的免疫表型及临床预后。方法纳入2019年1月1日-2022年5月31日期间于蚌埠医学院第一附属医院就诊的162例初诊AML(M3型除外)患者的临床资料,其中ASXL1和TET2双突变组(ASXL1^(+)TET2^(+)组)患者10例,ASXL1突变组(ASXL1^(+)组,包括双突变组)患者26例,TET2突变组(TET2^(+)组,包括双突变组)患者25例,无ASXL1或TET2突变组(双阴性组)患者121例。通过对4组患者免疫表型及预后进行回顾性分析,比较4组患者的完全缓解(CR)率、中位无进展生存时间(PFS)和中位总生存时间(OS)。结果4组患者在年龄、性别、WBC、RBC、Hb、PLT计数和FAB分型上差异无统计学意义(P>0.05);与双阴性组相比,ASXL1^(+)TET2^(+)组、ASXL1^(+)组和TET2^(+)组异常染色体核型的发生频率更高(P=0.046),且初诊时骨髓原始细胞数低(P=0.037)。ASXL1^(+)组患者CD7、CD33和CD38、CD34抗原表达率低于双阴性组(均P<0.05)。CASXL1^(+)TET2^(+)组、ASXL1^(+)组和TET2^(+)组首次CR率均低于双阴性组,且ASXL1^(+)TET2+组总CR率低于双阴性组(均P<0.05)。双阴性组中位PFS和OS均较ASXL1^(+)TET2^(+)组、ASXL1^(+)组和TET2^(+)组显著延长(均P<0.05),其中ASXL1^(+)TET2^(+)组中位OS较TET2^(+)组明显缩短(P=0.019),较ASXL1^(+)组存在缩短的趋势(P=0.055)。结论ASXL1是一个不良预后的指标,合并TET2突变可能缩短了AML患者的生存时间。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 ASXL1突变 tet2突变 免疫表型
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Tet-On系统中多西环素对MBD1诱导表达的调控研究
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作者 卢茜 袁月 +1 位作者 李丹 张鹏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期47-52,共6页
【目的】构建甲基结合蛋白1(MBD1)的Tet-On可诱导表达质粒和293T细胞,探讨多西环素(Dox)对MBD1表达的影响,并通过分析细胞中质粒启动子CpG甲基化水平反映MBD1调控机制。【方法】使用MBD1引物扩增293T的MBD1表达序列,将其连接于Tet-On诱... 【目的】构建甲基结合蛋白1(MBD1)的Tet-On可诱导表达质粒和293T细胞,探讨多西环素(Dox)对MBD1表达的影响,并通过分析细胞中质粒启动子CpG甲基化水平反映MBD1调控机制。【方法】使用MBD1引物扩增293T的MBD1表达序列,将其连接于Tet-On诱导表达质粒的多克隆位点;将构建成功的质粒用电转染的方法转入MBD1 KO 293T,使用荧光显微镜及Western blot验证获得的MBD1恢复的293T(MBD1 RE 293T);使用不同浓度Dox诱导MBD1表达,利用Western blot检测单克隆细胞中MBD1的表达情况;使用同一浓度Dox诱导MBD1表达,在12、24、48、96、144、192 h收集细胞,利用Western blot检测细胞中MBD1的表达情况;使用亚硫酸氢盐测序方法检测Dox诱导后细胞内可诱导质粒启动子CpG甲基化情况。【结果】成功构建Tet-On诱导表达MBD1质粒;与未诱导细胞相比,Dox诱导后转染细胞MBD1蛋白重新表达;随着Dox浓度的升高细胞中MBD1的表达逐渐增多;相同浓度Dox诱导后,从12-96 h细胞内MBD1的表达逐渐升高,但144 h后MBD1表达下降;细胞内质粒启动子CpG甲基化检测显示,与96 h相比,144和192 h质粒启动子甲基化水平逐渐升高;在诱导144 h加入甲基转移酶抑制剂地西他滨(decitabine)后,质粒启动子甲基化水平降低,MBD1表达升高。【结论】Tet-On可诱导细胞中重新表达MBD1蛋白,并且表达量与Dox浓度正相关,但长时间诱导后细胞内质粒CpG甲基化水平升高,影响细胞中MBD1的表达。 展开更多
关键词 tet-ON MBD1 MBD1ΔCXXC3 甲基化 HEK293T
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