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小麦籽粒大小相关基因TaGS2克隆及功能分析 被引量:4
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作者 王沙沙 黄超 +4 位作者 汪庆昌 晁岳恩 陈锋 孙建国 宋晓 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1926-1937,共12页
籽粒大小影响小麦粒重,进而影响产量。目前,对小麦籽粒大小相关基因的研究已有报道,但其潜在的分子机制尚不清楚。本研究通过同源克隆的方法从普通小麦中克隆了小麦籽粒大小相关基因TaGS2,并对其序列进行生物信息学分析。烟草亚细胞定... 籽粒大小影响小麦粒重,进而影响产量。目前,对小麦籽粒大小相关基因的研究已有报道,但其潜在的分子机制尚不清楚。本研究通过同源克隆的方法从普通小麦中克隆了小麦籽粒大小相关基因TaGS2,并对其序列进行生物信息学分析。烟草亚细胞定位结果表明,TaGS2定位在细胞核和细胞质内。不同组织材料qRT-PCR分析表明,TaGS2基因在小麦籽粒不同发育时期的表达量最高。构建TaGS2-PLGY-02-RNAi表达载体,转化小麦。研究结果表明,TaGS2基因在RNAi转基因小麦中表达量显著降低。RNAi转基因小麦的籽粒长度变短,籽粒宽度变窄,千粒重也降低。因此推测TaGS2基因可能参与小麦籽粒大小或者千粒重的调控。本研究初步揭示了TaGS2基因功能,并为小麦高产育种中千粒重的提高提供重要的基因资源。 展开更多
关键词 小麦 籽粒大小 tags2基因 亚细胞定位 表达分析 RNAi干扰
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小麦TaGS2基因等位变异与粒重之间的关系分析 被引量:4
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作者 王沙沙 裴星旭 +4 位作者 黄超 汪庆昌 陈锋 孙建国 晁岳恩 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1438-1445,共8页
粒重是小麦产量构成三要素之一,而粒重与籽粒大小高度相关。因此,开展籽粒大小相关的研究对小麦高产育种具有重要意义。小麦TaGS2基因正调控籽粒大小和粒重。为进一步探索该基因等位变异情况,本研究利用黄淮海麦区268个小麦品种,根据Ta... 粒重是小麦产量构成三要素之一,而粒重与籽粒大小高度相关。因此,开展籽粒大小相关的研究对小麦高产育种具有重要意义。小麦TaGS2基因正调控籽粒大小和粒重。为进一步探索该基因等位变异情况,本研究利用黄淮海麦区268个小麦品种,根据TaGS2三个同源基因的基因组DNA序列设计特异引物,利用PCR扩增技术对其进行了鉴定。结果发现在部分品种中TaGS2-2B基因组序列第4外显子3002 bp位有“CTT”3个碱基的缺失,导致其编码蛋白第306位苯丙氨酸(F)缺失。分别将TaGS2-2B基因无和有“CTT”缺失的变异类型命名为TaGS2-2B-a和TaGS2-2B-b。不同基因型小麦品种的籽粒性状比较分析发现,TaGS2-2B-a基因型品种的千粒重、粒长、粒宽、籽粒面积和籽粒周长均显著高于TaGS2-2B-b基因型品种。本研究结果为小麦品种千粒重的提高提供了一种优良基因型信息。 展开更多
关键词 小麦 粒型 tags2 等位变异 粒重
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融合自注意力的Bert-BiGRU-CRF的文本因果关系抽取
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作者 高宁波 张晓滨 《计算机与现代化》 2025年第7期112-118,共7页
针对自然语言文本因果关系抽取中存在的标记方案无法处理重叠关系以及长距离依赖性的问题,本文引入tag2triplet算法来处理同一句子中的多个因果三元组和嵌入式因果关系的因果三元组,并将因果性标记方案与深度学习架构相结合用以最小化... 针对自然语言文本因果关系抽取中存在的标记方案无法处理重叠关系以及长距离依赖性的问题,本文引入tag2triplet算法来处理同一句子中的多个因果三元组和嵌入式因果关系的因果三元组,并将因果性标记方案与深度学习架构相结合用以最小化特征工程,同时有效地对因果关系建模。此外,本文将自注意力机制融合到Bert-BiGRU-CRF模型中以学习因果关系之间的长距离依赖性,允许信息在网络中自由流动,从而更准确地提取因果关系。为了验证该方法的有效性,将模型与目前广泛使用的BiLSTM-softmax模型、BiLSTM-CRF模型和Flair+CLSTM-BiLSTM-CRF模型在SemEval 2010 task8数据集上进行对比实验,结果表明,本文模型的F1评价指标分数更高,达到了83.44%。 展开更多
关键词 因果关系抽取 tag2triplet算法 Bert-BiGRU-CRF 自注意力
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黄淮麦区部分小麦和国外引进小麦GS2等位基因的检测及其与农艺性状的关联分析 被引量:4
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作者 宋晓朋 王宇娟 +4 位作者 武炳瑾 马文洁 张德强 周丽敏 孙道杰 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期281-286,共6页
为明确黄淮麦区TaGS2等位基因的分布状况及其与主要农艺性状的关系,对黄淮麦区2008年之前育成的种质材料、新育成的品种(系)及国外引进材料,用TaGS2-A1、TaGS2-B1和TaGS2-D1等功能标记鉴定对应的基因,并结合相关农艺性状发掘优势单倍型... 为明确黄淮麦区TaGS2等位基因的分布状况及其与主要农艺性状的关系,对黄淮麦区2008年之前育成的种质材料、新育成的品种(系)及国外引进材料,用TaGS2-A1、TaGS2-B1和TaGS2-D1等功能标记鉴定对应的基因,并结合相关农艺性状发掘优势单倍型。结果表明,黄淮麦区2008年之前育成的种质材料和新育成品种(系)中TaGS2等位基因分布频率存在一定的差异;TaGS2-A1b、TaGS2-B1b和TaGS2-D1a是优势TaGS2等位基因,TaGS2-A1b在小麦抽穗期、株高和小穗数的改良上是优势单倍型,但在新育成的品种(系)中有下降的趋势,TaGS2-D1a能够显著增加小穗数、穗粒数和穗粒重,在各类材料中的比例都较高;TaGS2-B1b是提高千粒重的优势单倍型。因此,在黄淮麦区小麦穗部性状改良中TaGS2-B1b和TaGS2-D1a的作用显著,尤其是TaGS2-D1a,同时黄淮麦区种植小麦遗传多样性在减少,一些优势单倍型未受到重视,应对地方品种和一些国外引进材料加以利用。 展开更多
关键词 小麦 tags2 功能标记 单倍型 关联分析
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乙型肝炎病毒外膜蛋白真核表达质粒的构建和表达 被引量:1
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作者 王丹 童师雯 +5 位作者 张红敏 李宏 胡鹏 杨轶轩 张大志 胡怀东 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期41-44,共4页
目的:构建乙型肝炎病毒(HBV)S基因(包括Pre-S1,Pre-S2和S)的真核表达质粒.方法:将PCR克隆获得的Large surface antigen of HBV,Middle surface antigen of HBV和Small surface antigen of HBV基因片段通过T-A克隆插入真核表达载体Pcmv-T... 目的:构建乙型肝炎病毒(HBV)S基因(包括Pre-S1,Pre-S2和S)的真核表达质粒.方法:将PCR克隆获得的Large surface antigen of HBV,Middle surface antigen of HBV和Small surface antigen of HBV基因片段通过T-A克隆插入真核表达载体Pcmv-Tag2B,构建重组质粒Tag2B-LS,Tag2B-MS和Tag2B-SS,经测序后转染293FT细胞,收取蛋白并鉴定.结果:分别双酶切构建的重组质粒,获得相应大小的DNA片段,且测序证实为有完整读码框的S基因,重组质粒分别转染293FT细胞并表达,经Western Blot鉴定证实.结论:成功构建真核表达质粒Tag2B-LS,Tag2B-MS和Tag2B-SS,并能正确表达,为进一步研究乙型肝炎病毒外膜蛋白的功能打下基础. 展开更多
关键词 外膜蛋白 乙型肝炎病毒 Tag2B 真核表达质粒
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吸虱亚目trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间独立进化和协同进化的研究 被引量:1
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作者 张艳芳 董文鸽 陈婷 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期920-930,共11页
【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa... 【目的】吸虱亚目是真兽类动物的永久专性体表寄生虫。吸虱亚目的线粒体基因组发生了剧烈的裂化,形成了不同于以往典型单一大环的多个裂化微环。本文对17种吸虱以及外群尖叫虱Bothriometopus macrocnemis的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较分析,探讨trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间的独立进化和协同进化。【方法】对云南采集到的3科3属4种吸虱(弯多板虱Polyplax reclinata、锯多板虱Polyplax serrata、太平洋甲胁虱Hoplopleura pacifica和麝鼩钩板虱Ancistroplax crocidurae),用IlluminaMiSeq PE250平台高通量测序后与GenBank中查找的其它13种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行比较,采用最大简约法(Maximumparsimony,MP)分析17种吸虱trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因的进化关系。【结果】17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因均形成典型的三叶草结构,trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因在虱属、阴虱属和猴虱属中有较长的等同序列;在甲胁虱属和钩板虱属中有很短的等同序列;在多板虱属、微胸虱属和血虱属中的等同序列介于二者之间。常见典型单一环状线粒体基因组物种的trnL_(1)(tag)和trn L_(2)(taa)基因等同序列的长度在6-10 bp之间。对17种吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列进行同源性比较分析,发现不同属吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较大,同属内吸虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因序列相似度差异较小。基于17种吸虱及尖叫虱的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因构建系统进化树,结果表明trnL_(1)(tag)、trnL_(2)(taa)及trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因间既有协同进化又有独立进化。【结论】trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列较长的吸虱易发生协同进化,等同序列较短的吸虱易发生独立进化。吸虱亚目的trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因协同进化是长期的或发生在远缘物种间,而独立进化是短期(两次重组事件间)的或发生在近缘物种间。吸虱亚目线粒体基因组的裂化模式可能影响trnL_(1)(tag)和trnL_(2)(taa)基因等同序列的长短。 展开更多
关键词 吸虱 trnL_(1)(tag) trnL_(2)(tag) 裂化线粒体基因组 协同进化 独立进化
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