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XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制
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作者 卜国森 马建华 +1 位作者 康志东 木胡牙提 《山西医科大学学报》 2025年第11期1252-1259,共8页
目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采... 目的通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞(PBMC)进行RNA-seq测序,探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法分别收集10例缺血性脑卒中患者(缺血性脑卒中组)和10例健康对照者(对照组)的新鲜全血样本,所有血液样本均使用抗凝管采集,提取PBMC的RNA,使用String Tie处理转录本进行筛选和过滤,DESeq2获取差异表达的lncRNA,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证lncRNA生物学靶点在缺血性脑卒中患者PBMC中mRNA的表达情况。采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索。结果通过对候选lncRNA进行筛选,缺血性脑卒中组与对照组共获得1391个表达转录本。采用DESeq2进行差异表达分析,共鉴定出408个显著差异表达的lncRNA,其中262个显著上调,146个显著下调。通过对测序结果的深入分析,确定lncRNA XIST和TSIX为缺血性脑卒中潜在的新型生物学靶点。与对照组相比,缺血性脑卒中组中XIST的mRNA表达水平下降,而TSIX的mRNA表达水平升高(均P<0.05)。进一步对差异表达的lncRNA与mRNA进行共表达分析发现,反式调控的差异lncRNA在分子功能上主要富集于蛋白结合,在生物过程中核心调控细胞黏附,且这些功能与细胞外囊泡密切相关。顺式调控的lncRNA则主要参与蛋白结合,在生物过程中以免疫反应为核心,且多位于细胞膜。KEGG通路富集分析表明,这两类调控方式均显著富集于细胞外基质-受体相互作用通路。结论XIST和TSIX lncRNA可能为缺血性脑卒中临床诊断的生物学标志物,通过调控细胞外基质-受体相互作用通路诱导缺血性脑卒中。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 lncRNA 转录组测序 生物标志物 XIST tsix
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lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌细胞增殖和侵袭的机制研究 被引量:2
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作者 王佳乐 李琤 李广明 《肝脏》 2022年第2期213-217,共5页
目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目... 目的 探讨lncRNA TSIX通过靶向miR-548-a-3p抑制肝细胞癌(HCC)细胞增殖和侵袭的机制。方法 设肝癌Huh7细胞组、lncRNA TSIX mimics组、lncRNA TSIX inhibitor组;各组细胞培养48 h后,采用MTT法测定细胞活力,结晶紫染色测定单克隆形成数目,流式细胞仪测定细胞凋亡水平,transwell腔室测定细胞侵袭水平,RT-PCR法测定细胞lncRNA TSIX、miR-548-a-3p水平。结果 lncRNA TSIX mimics组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数低于Huh7细胞组(t=8.725、5.437、120.834、64.321,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组OD值、存活率、单克隆形成数目、穿膜数高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组(t=4.124、3.784、10.462、7.965、37.192、174.632、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组细胞凋亡率、lncRNA TSIX高于Huh7细胞组[(18.52±2.45)vs(15.63±2.13),(4.47±0.22)vs(2.89±0.21)](t=10.531、12.372,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组细胞凋亡率、lncRNA TSIX低于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(8.14±2.45)vs(15.63±2.13)、(18.52±2.45),(1.58±0.25)vs(2.89±0.21)、(4.47±0.22)](t=37.385、48.021、30.703、104.562,P<0.05)。lncRNA TSIX mimics组miR-548-a-3p低于Huh7细胞组[(2.39±0.19)vs(4.87±0.20)](t=11.265,P<0.05),lncRNA TSIX inhibitor组miR-548-a-3p高于Huh7细胞组和lncRNA TSIX mimics组[(6.32±0.19)vs(4.87±0.20)、(2.39±0.19)](t=6.612、10.058,P<0.05)。结论 lncRNA TSIX明显抑制HCC细胞增殖、侵袭,促进HCC细胞凋亡;其机制可能与lncRNA TSIX负调节miR-548-a-3p有关。 展开更多
关键词 lncRNA tsix miR-548-a-3p 肝细胞癌 细胞增殖 细胞侵袭
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TSIX与XIST在乳腺癌中表达的相关性及临床病理学价值
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作者 周英 韩玮 +2 位作者 史春桃 高小姣 顾静凤 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第24期4471-4474,共4页
目的:检测TSIX(X inactive specific transcript,antisense)与XIST(X inactive specific transcript)在乳腺癌中的表达,分析两者相关性,并评估其临床病理学价值。方法:利用BCIP数据库分析TSIX与XIST在乳腺癌及正常乳腺组织中的表达差异... 目的:检测TSIX(X inactive specific transcript,antisense)与XIST(X inactive specific transcript)在乳腺癌中的表达,分析两者相关性,并评估其临床病理学价值。方法:利用BCIP数据库分析TSIX与XIST在乳腺癌及正常乳腺组织中的表达差异。收集100例患者乳腺癌组织,应用qRT-PCR技术检测TSIX与XIST的表达,绘制ROC曲线,根据尤登指数找出截点值,进行分组,分析其与临床病理参数之间的关系。结果:数据库发现,相比于正常乳腺组织,乳腺癌组织中TSIX表达较高,而XIST表达较低。通过qRT-PCR技术检测同样发现,乳腺癌组织中TSIX表达升高,而XIST表达降低,且两者呈负相关关系(P<0.01)。根据ROC曲线尤登指数最大值,确定TSIX截点值为1.9059;XIST截点值为0.9928。进一步分析发现,TSIX与淋巴结转移(P=0.003)及TNM分期(P=0.037)呈正相关,而XIST仅与淋巴结转移呈负相关(P=0.006)。不仅如此,TSIX阳性而XIST阴性者与淋巴结转移及较晚的TNM分期密切相关。结论:乳腺癌组织中TSIX高表达,而XIST表达较低,两者呈负相关;TSIX与淋巴结转移及TNM呈正相关,而XIST仅与淋巴结转移相关;且联合检测具有更好的临床病理评估作用。 展开更多
关键词 乳腺癌 tsix XIST 临床病理 相关性
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LncRNA Tsix在NMDA诱导小鼠视网膜兴奋性毒性模型中的表达及其意义
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作者 李亚红 耿超 +4 位作者 黑凯文 刘胜男 王奇 李筱荣 张琰 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期676-685,共10页
目的研究不同剂量N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)溶液对小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)的损伤作用,并检测新型长链非编码RNA(lncRNA)Tsix在小鼠视网膜兴奋性毒性模型中的表达水平及其对视网膜和RGCs的保护作用。方法选取7~8周龄C57B6/J小鼠105只... 目的研究不同剂量N-甲基-D-天冬氨酸(NMDA)溶液对小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)的损伤作用,并检测新型长链非编码RNA(lncRNA)Tsix在小鼠视网膜兴奋性毒性模型中的表达水平及其对视网膜和RGCs的保护作用。方法选取7~8周龄C57B6/J小鼠105只,采用随机数表法将小鼠随机分为正常对照组、2 mmol/L NMDA组、10 mmol/L NMDA组、20 mmol/L NMDA组和40 mmol/L NMDA组,每组21只。正常对照组小鼠右眼玻璃体腔内注入1μl氯化钠溶液,不同剂量NMDA组分别注射相应剂量的NMDA溶液各1μl。1周后,分别采用光相干断层扫描(OCT)、苏木精-伊红染色、视网膜铺片和免疫荧光染色法分析不同剂量NMDA组视网膜各层厚度、神经节细胞层(GCL)细胞数量和RGCs数量。采用RNAscope原位杂交技术检测不同剂量NMDA组GCL中lncRNA Tsix的表达。采用实时荧光定量PCR技术检测不同剂量NMDA组Tsix基因的转录本水平。结果OCT结果显示,2、10、20和40 mmol/L NMDA组视网膜全层厚度分别为(255.00±6.63)、(252.40±6.41)、(248.67±6.20)和(229.11±10.37)μm,较正常对照组的(269.60±20.01)μm明显变薄,差异均有统计学意义(均P<0.05)。苏木精-伊红染色结果显示,正常对照组小鼠GCL细胞排列均匀、紧密,呈单层,细胞核大而圆,NMDA注射后细胞出现体积不均和空泡,有核固缩现象。各剂量NMDA组GCL细胞数量随NMDA剂量的增加而显著降低,与正常对照组相比差异均有统计学意义(均P<0.05)。当NMDA浓度增至20 mmol/L时,GCL的细胞数量减少至正常对照组的一半。视网膜铺片结果提示,β3-微管蛋白阳性RGCs细胞数量随NMDA剂量的增加显著降低,与正常对照组比较差异均有统计学意义(均P<0.05);10 mmol/L NMDA组RGCs数量减少至正常对照组的一半。RNAscope结果显示,lncRNA Tsix主要在GCL细胞的细胞质中表达,且随着NMDA剂量的增加,表达lncRNA Tsix的阳性细胞率显著降低,各组总体比较差异有统计学意义(F=13.670,P<0.01)。实时荧光定量PCR结果验证Tsix随NMDA剂量的增加表达趋势与RNAscope结果一致。结论NMDA对视网膜厚度和RGCs的损伤呈剂量依赖性,小鼠视网膜lncRNA Tsix的表达主要集中在GCL细胞的细胞质,且转录本水平随着NMDA剂量的增加而降低,对RGCs发挥保护作用。 展开更多
关键词 视网膜兴奋性毒性 N-甲基-D-天冬氨酸 视网膜神经节细胞 tsix 长链非编码RNA
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应用不同模型分析X染色体失活机制 被引量:1
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作者 周艺华 杨育青 韦华 《中国优生与遗传杂志》 2011年第8期1-3,共3页
X染色体失活(XCI)假说的提出,引起了很多研究学者对XCI机制的不断探索,特别是X失活中心(XIC)的深入研究,不同的学者提出了不同的X染色体失活模型来对实验数据进行解释。目前主要的模型有:阻断因子模型,双因子模型,传感选择模型,随机模... X染色体失活(XCI)假说的提出,引起了很多研究学者对XCI机制的不断探索,特别是X失活中心(XIC)的深入研究,不同的学者提出了不同的X染色体失活模型来对实验数据进行解释。目前主要的模型有:阻断因子模型,双因子模型,传感选择模型,随机模型和反馈模型。这些模型的提出,使得X染色体失活机制不断得到完善,相信随着研究的深入,X染色体失活机制必将得到揭示。 展开更多
关键词 X染色体失活 X失活中心 XIST tsix
原文传递
X染色体失活的研究进展 被引量:2
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作者 梁文权 赵存友 《妇产与遗传(电子版)》 2016年第4期8-11,共4页
在胚胎发育过程中,哺乳动物雌性细胞的两条X染色体中有一条会通过X染色体失活机制随机失活。X染色体失活中心(X chromosome inactivation center,XIC)是X染色体失活的主要调控区域,而位于XIC中Xist基因已被证明为X染色体失活的主要调节... 在胚胎发育过程中,哺乳动物雌性细胞的两条X染色体中有一条会通过X染色体失活机制随机失活。X染色体失活中心(X chromosome inactivation center,XIC)是X染色体失活的主要调控区域,而位于XIC中Xist基因已被证明为X染色体失活的主要调节基因。Xist与Tsix的相互调控机制已被多方研究和证实,两者共同参与了胚胎早期发育过程中的X染色体失活的生理过程。X染色体失活异常与许多临床疾病相关,且X染色体失活的机制作为一个良好的表观遗传学研究模型,吸引越来越多研究者的关注,然而现有的关于X染色体失活机制的研究多零散且片段,现本文现将近年来关于X染色体失活机制的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 X染色体失活 早期胚胎发育 Xist基因 tsix RNA
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