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基于叶状枝形态学特征和trnH-psbA序列的15份天门冬属种质资源鉴定
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作者 王辉 FARDOUS Mohammad Safiul Azam +5 位作者 MUHAMMAD Idrees 江心雨 钱干瑞 龙海林 李雪芹 王芊芊 《草业科学》 北大核心 2025年第4期1024-1035,共12页
以采自西南地区的15份天门冬属(Asparagus)植物为试材,开展基于叶状枝形态学特征和叶绿体trnH-psbA序列的综合分析,为该属种质资源鉴定及遗传多样性分析提供理论依据。形态学结果表明,15份样本间的15个形态学特征有一定相关性,主成分分... 以采自西南地区的15份天门冬属(Asparagus)植物为试材,开展基于叶状枝形态学特征和叶绿体trnH-psbA序列的综合分析,为该属种质资源鉴定及遗传多样性分析提供理论依据。形态学结果表明,15份样本间的15个形态学特征有一定相关性,主成分分析将所有形态特征值转化为4个主成分(特征值>1),累计贡献率81.42%,其中,主成分1反映叶状枝粗细,主成分2反映保卫细胞大小,主成分3、4反映表皮细胞大小。在主成分分析的基础上进行聚类分析,在遗传距离阈值12.5处将供试材料聚为3大类群:类群Ⅰ包含样本数11种,占参试材料的73.33%,特征表现为叶状枝直线型,多数形态特征值介于类群Ⅱ、Ⅲ之间;类群Ⅱ3种,特征表现为叶状枝新月形、数量少、宽度值大;类群Ⅲ包含1个样本,占参试材料的6.67%,特征表现为叶状枝针状,数量多,长度和宽度值小,气孔小而少,表皮细胞短而多。trnH-psbA序列测序结果进一步表明,15份样本的trnH-psbA序列全长约750 bp,对位排列后共有691个位点,其中保守位点591个,变异位点124个,简约信息位点55个,单突变位点41个,种间遗传差异大;进化树显示15份天门冬属物种均处于独立分支,除大理天门冬外,其余种均能利用trnH-psbA序列条形码对其进行区分。研究结果为进一步开展天门冬属植物种质资源保护和开发利用提供了必要的理论和实践基础。 展开更多
关键词 天门冬属 叶状枝 形态学特征 trnh-psba序列 主成分分析 聚类分析 鉴定
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中国石蒜属种间关系的trnH-psbA序列分析 被引量:13
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作者 全妙华 欧立军 +2 位作者 佘朝文 陈东明 叶威 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1589-1594,共6页
利用叶绿体基因trnH-psbA序列对石蒜属16种(含1变种)的种间关系进行了分析。结果表明:所测物种的序列全长在546~641bp,GC含量为35.86%~36.41%,其核苷酸变异位点14个,信息位点5个,这些位点可以区分石蒜属物种;供试材料聚为3类,除中国... 利用叶绿体基因trnH-psbA序列对石蒜属16种(含1变种)的种间关系进行了分析。结果表明:所测物种的序列全长在546~641bp,GC含量为35.86%~36.41%,其核苷酸变异位点14个,信息位点5个,这些位点可以区分石蒜属物种;供试材料聚为3类,除中国石蒜、忽地笑和玫瑰石蒜的系统位置有所不同外,与经典分类基本一致。叶绿体基因trnH-psbA序列可以有效地鉴别石蒜属物种及分类,是一种有效分子标记。 展开更多
关键词 石蒜属 trnh-psba序列 序列变异 种间关系 中国
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基于ITS2、trnH-psbA条形码的不同产地连翘及其伪品DNA分子鉴定 被引量:8
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作者 冯帅 李峰 +3 位作者 刘杨 万鹏 刘辰 王晓燕 《中药材》 CAS 北大核心 2018年第3期556-558,共3页
目的:研究探讨基于ITS2、trnH-psbA条形码的不同产地连翘及其伪品DNA分子鉴定新技术。方法:采用植物DNA条形码候选序列中的ITS2、trnH-psbA作为目标条形码,探讨了其对不同产地连翘、正品连翘与其易混伪品金钟花的鉴别。结果:从聚类树形... 目的:研究探讨基于ITS2、trnH-psbA条形码的不同产地连翘及其伪品DNA分子鉴定新技术。方法:采用植物DNA条形码候选序列中的ITS2、trnH-psbA作为目标条形码,探讨了其对不同产地连翘、正品连翘与其易混伪品金钟花的鉴别。结果:从聚类树形图可见,连翘与金钟花能够明显地分为两支,不同产地的连翘也表现出了一定的区域相似性。结论:基于ITS2序列、trnH-psbA序列可以作为连翘药材真伪鉴别的一种有效的分子鉴定手段。其中trnH-psbA序列构建的NJ树、UP树不仅能实现连翘真伪鉴别,而且可以用于不同产地连翘区域性的鉴别。 展开更多
关键词 ITS2 trnh-psba 连翘 产地 分子鉴定
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用叶绿体trnH-psbA序列分析石杉科植物系统发育和植物条形码的初探 被引量:5
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作者 邵浩 张丽 +3 位作者 吕会芳 周吉燕 胡之璧 黎万奎 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期18-21,共4页
目的:研究石杉科17种植物的系统发育关系和石杉科植物条形码。方法:使用叶绿体trnH-psbA基因序列构建了石杉科的系统发育树。结果:表明石杉科植物高度聚类为两个分支,自展支持率达91%。结论:支持Hol-ub和秦仁昌将石杉科分为石杉属... 目的:研究石杉科17种植物的系统发育关系和石杉科植物条形码。方法:使用叶绿体trnH-psbA基因序列构建了石杉科的系统发育树。结果:表明石杉科植物高度聚类为两个分支,自展支持率达91%。结论:支持Hol-ub和秦仁昌将石杉科分为石杉属和马尾杉属的分类学观点。17种石杉科植物种具有良好的单系性,trnH-psbA基因能在种水平很好区分石杉科植物,可以作为本科分类鉴定条形码。 展开更多
关键词 trnh-psba 石杉属 植物条形码
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蒙古扁桃nrDNA ITS和cpDNA trnH-psbA序列分子进化特点研究 被引量:4
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作者 段义忠 王建武 +1 位作者 亢福仁 李娟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期3035-3041,共7页
通过对蒙古扁桃16个居群的叶绿体DNA(cpDNA)的trnH-psbA及nrDNAITS序列进行测序,对两种序列进化速率、核苷酸多样性及单倍型系统发育关系进行了初步研究。结果表明:蒙古扁桃cpDNAtrnH-psbA序列总长度为306bp,共得到52处变异位点,变... 通过对蒙古扁桃16个居群的叶绿体DNA(cpDNA)的trnH-psbA及nrDNAITS序列进行测序,对两种序列进化速率、核苷酸多样性及单倍型系统发育关系进行了初步研究。结果表明:蒙古扁桃cpDNAtrnH-psbA序列总长度为306bp,共得到52处变异位点,变异率达到17.05%,共检测到11种单倍型;nrDNAITS序列总长度为662bp,共得到6处变异位点,变异率达为0.91%,共检测到9种单倍型。经比较发现,蒙古扁桃nrDNAITS序列较cpDNAtrnH-psbA序列保守,变异速率较慢。cpDNAtrnH-psbA及nrDNAITS序列单倍型系统发育关系的各支系的支持率均较高。 展开更多
关键词 蒙古扁桃 CPDNA trnh-psba序列 NRDNA ITS序列 进化特点
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2种枇杷属植物的trnH-psbA条形码序列变异及其近缘属系统发育初步研究 被引量:5
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作者 胡文舜 蒋际谋 +3 位作者 黄爱萍 许奇志 陈秀萍 郑少泉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期12-16,共5页
选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’.对其叶绿体基因组trnH—psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序.利用生物信息学方法分析其序列特征.并构建苹果亚科内19个属的系统发育树。结果表明:trnH-psbA序列长323~3... 选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’.对其叶绿体基因组trnH—psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序.利用生物信息学方法分析其序列特征.并构建苹果亚科内19个属的系统发育树。结果表明:trnH-psbA序列长323~392bp(GenBank登录号:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10%,33.13%,共有1个核苷酸替换(SUbstitution)和2个插入/缺失(indel);基于trnH—psbADNA条形码序列的分子系统进化分析结果表明.苹果亚科内形成2个大的分支,枇杷属与石斑木属的亲缘关系最近(平均遗传距离为0.055)。此结果表明叶绿体基因trnH-psbA序列可有效地进行枇杷属内物种鉴别及属间分类,是枇杷属植物DNA条形码研究的标准基因之一。 展开更多
关键词 枇杷属 trnh-psba DNA条形码 序列分析 系统进化
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基于trnH-PsbA序列的部分苔藓植物亲缘关系分析 被引量:4
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作者 刘莹 张安世 赵利新 《湖北农业科学》 北大核心 2013年第20期5057-5059,共3页
以毛地钱(Dumortiera hirsuta)为外类群,利用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对13种苔藓植物的trnH-PsbA基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明,13种苔藓植物的trnH-PsbA序列长度为174-186 bp,排序后总长度为191 bp,其中变异位... 以毛地钱(Dumortiera hirsuta)为外类群,利用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对13种苔藓植物的trnH-PsbA基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明,13种苔藓植物的trnH-PsbA序列长度为174-186 bp,排序后总长度为191 bp,其中变异位点51个,信息位点30个。遗传距离在0.006-0.200,平均遗传距离为0.103。利用非加权组平均数UPGMA(Unweight pair group method with arithmetic mean)法建立的系统树显示,13种苔藓植物分为3组。在科间水平上,序列分析结果与形态学结果一致,trnH-PsbA序列对于苔藓植物的系统发育研究有一定的参考价值。 展开更多
关键词 苔藓 DNA条形码 trnh-psba 亲缘关系 系统发育分析
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基于叶绿体基因trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL序列的甘薯种质遗传多样性分析 被引量:7
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作者 王崇 焦春海 +5 位作者 杨新笋 张文英 雷剑 柴沙沙 王连军 田小海 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1536-1544,共9页
【目的】利用叶绿体基因组(cpDNA)的间隔区序列(trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL)对甘薯种质进行遗传多样性分析,为其种质保护及开发利用提供理论依据。【方法】以从我国12个省份收集的52份甘薯种质为材料,从10个cpDNA间隔区序列的引... 【目的】利用叶绿体基因组(cpDNA)的间隔区序列(trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL)对甘薯种质进行遗传多样性分析,为其种质保护及开发利用提供理论依据。【方法】以从我国12个省份收集的52份甘薯种质为材料,从10个cpDNA间隔区序列的引物中筛选出能扩增单一、清晰明亮且稳定的序列引物,利用其PCR扩增筛选出间隔区序列,并进行测序及序列拼接。利用DnaSP 5.0进行序列特征分析,采用MEGA X计算52份甘薯种质材料的遗传距离,并构建系统发育进化树。【结果】筛选获得7对扩增结果较理想的引物,其PCR扩增产物经测序分析,共获得3个有效标记(trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL)。三者的拼接序列长度为2239 bp,共有7个变异位点,2个单一突变位点,5个简约信息位点,11个插入/缺失位点。在52份甘薯种质材料中,trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL序列的变异位点数量(Vs)分别为1、1和5个,单倍型数目(H)分别为2、4和5个,拼接序列的单倍型数目为10个;核苷酸多样性(π)和单倍型多样性(Hd)最高的序列分别为trnT-trnL(π=0.00052)和trnH-psbA(Hd=0.535)。trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL序列的Tajima’s D、Fu and Li’s D*和Fu and Li’s F*均无显著差异(P>0.05),符合中性进化模式。基于拼接序列构建的系统发育进化树显示,52份甘薯种质材料的遗传距离为0~1.1848,平均遗传距离0.1018,其分为五大类,其中第Ⅰ类~Ⅳ类仅含有少量种质,其余41份种质归为第Ⅴ类。【结论】52份甘薯种质材料的遗传变异较为丰富,但种质材料间的遗传多样性低,与cpDNA特性和甘薯遗传背景狭窄有关。基于trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL的拼接序列更能准确分析甘薯种质的遗传多样性,且有效划分不同类群,为甘薯集团育种提供候选材料。 展开更多
关键词 甘薯 叶绿体基因组(cpDNA) TRNL-TRNF trnh-psba trnT-trnL 遗传多样性 系统发育进化树
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基于trnH-psbA和matK序列的不同种油茶种苗DNA条形码分析 被引量:3
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作者 代佳妮 于靖 +5 位作者 戚华沙 郑蔚 王健 吴友根 赖杭桂 胡新文 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第3期611-619,共9页
为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种... 为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种间及种内遗传距离,构建系统发育树。结果表明:101份供试材料的trnH-psbA序列全长381 bp,有10个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将越南油茶聚为一支,自展支持率为64%;matK序列全长797 bp,有5个变异位点,可通过变异位点鉴别出越南油茶、红花油茶及部分普通油茶,系统发育树将红花油茶聚为一支,越南油茶聚为一支,自展支持率分别为65%和64%。因此,trnH-psbA序列可对越南油茶进行有效鉴别,而matK序列可对越南油茶和红花油茶进行有效鉴别。该研究结果对避免油茶种苗混杂、规范海南油茶种苗市场有一定的指导意义。 展开更多
关键词 trnh-psba序列 MATK序列 油茶 DNA条形码
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基于trnH-psbA和matK序列的油茶种子DNA条形码鉴定 被引量:9
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作者 戚华沙 代佳妮 +7 位作者 杨英楠 李思颖 王健 石林春 吴友根 赖杭桂 胡新文 于靖 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期5057-5065,共9页
本研究利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列对不同物种的34份油茶种子进行DNA条形码鉴定,以分析这两个序列在鉴别越南油茶(Camellia vietnamensis)和普通油茶(Camellia oleifera)的效率。结果表明:34份供试材料的trnH-psbA序列全长395... 本研究利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列对不同物种的34份油茶种子进行DNA条形码鉴定,以分析这两个序列在鉴别越南油茶(Camellia vietnamensis)和普通油茶(Camellia oleifera)的效率。结果表明:34份供试材料的trnH-psbA序列全长395 bp、11个变异位点,系统发育树将普通油茶聚为一支,支持率为72%;matK序列全长837 bp、2个变异位点,系统发育树将越南油茶与高州油茶聚为一支,支持率为64%。可见,trnH-psbA序列和mat K序列结合,可对普通油茶和越南油茶与其他供试油茶物种进行有效鉴别。 展开更多
关键词 越南油茶(Camellia vietnamensis) 普通油茶(Camellia oleifera) DNA条形码 trnh-psba序列 MATK序列
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trnH-psbA序列作为DNA条形码在苍耳属杂草鉴定中的应用 被引量:3
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作者 袁俊杰 魏霜 +4 位作者 马新华 龙阳 张娜 陈文 杨卓瑜 《杂草学报》 2016年第2期1-6,共6页
以 trnH-psbA序列作为 DNA 条形码,对从国外截获的9种苍耳属杂草及1种国内苍耳进行物种鉴定研究。采用 DNeasy Plant Mini Kit 试剂盒进行总 DNA 的提取,应用通用引物对其 trnH-psbA 基因进行PCR扩增,测序得到10种苍耳属杂草的 trn... 以 trnH-psbA序列作为 DNA 条形码,对从国外截获的9种苍耳属杂草及1种国内苍耳进行物种鉴定研究。采用 DNeasy Plant Mini Kit 试剂盒进行总 DNA 的提取,应用通用引物对其 trnH-psbA 基因进行PCR扩增,测序得到10种苍耳属杂草的 trnH-psbA序列,并利用 MEGA 7.0软件进行比对分析构建系统进化树。结果显示:苍耳属杂草 trnH-psbA基因序列共有543个位点,其中有53个变异位点,31个变异信息位点,22个单突变位点,30个碱基缺失;种间遗传距离为0~0.093,种内无遗传差异;进化树显示10个苍耳物种均处于独立分支,能够利用该条形码对苍耳属杂草进行区分鉴定。 展开更多
关键词 trnh-psba序列 DNA条形码 苍耳属 杂草鉴定
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芋种质叶绿体基因trnH-psbA序列特征及遗传多样性分析 被引量:2
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作者 洪霞 陈孝赏 +3 位作者 王娇阳 屈为栋 邱莉萍 陈银龙 《浙江农业科学》 2021年第11期2274-2276,2280,共4页
为探讨浙江省不同地源芋种质的分化与遗传多样性,对30份来自不同县市的地方芋种的trnH-psbA序列进行克隆、拼接,并对序列进行多态性分析和不同地源遗传距离计算以及聚类分析。结果表明:30份芋种质trnH-psbA序列的长度为730~739 bp,保守... 为探讨浙江省不同地源芋种质的分化与遗传多样性,对30份来自不同县市的地方芋种的trnH-psbA序列进行克隆、拼接,并对序列进行多态性分析和不同地源遗传距离计算以及聚类分析。结果表明:30份芋种质trnH-psbA序列的长度为730~739 bp,保守位点有717个,多态性位点13个,均为自裔位点,插入/缺失位点有3个;共有3种类型序列,可分为2种单倍型,单倍型多样性为0.45706,不同地源遗传距离变化小,为0~0.0181,平均遗传距离为0.0052;聚类分析可将所有芋资源分为2个类群,不同的芋资源存在一定的地理隔离,且与芋的类型相关。本研究对不同地源芋质进行trnH-psbA序列分析,进一步明确了地方小种存在丰富的遗传多样性,为芋种质分子标记开发与保护利用提供理论依据。 展开更多
关键词 芋种质 trnh-psba 遗传多样性 浙江
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天门冬属部分物种trnH-psbA序列比较研究 被引量:2
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作者 欧立军 孙海军 +1 位作者 危革 王梓辛 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期2678-2679,共2页
采用叶绿体trnH—psbA序列对天门冬属9个物种进行种间关系分析。结果发现,9个物种的trnH—psbA序列的长度和GC含量变异较小,序列全长在625~638bp之间;GC含量约为36%;基于trnH—psbA序列的系统发育树中,天门冬和石刁柏优先聚类,... 采用叶绿体trnH—psbA序列对天门冬属9个物种进行种间关系分析。结果发现,9个物种的trnH—psbA序列的长度和GC含量变异较小,序列全长在625~638bp之间;GC含量约为36%;基于trnH—psbA序列的系统发育树中,天门冬和石刁柏优先聚类,非洲天门冬和狐尾天门冬优先聚类后再与武竹聚类,新疆天门冬和文竹优先聚类,短梗天门冬在系统树的最外层。结果认为,trnH—psbA序列可以有效地鉴别天门属冬物种,但某些物种的划分地位值得商榷,认为trnH—psbA序列分析属内物种的系统发育结果有一定的局限性。 展开更多
关键词 天门冬属 TrnH—psbA序列 物种鉴定
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基于matK+rbcL+trnH-psbA联合分析法对罂粟属的植物鉴定 被引量:5
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作者 范豫杰 黄磊 +1 位作者 苏世达 苏少明 《昆明医科大学学报》 CAS 2023年第1期12-18,共7页
目的 利用DNA条形码技术探索罂粟的鉴定方法,寻找可靠的DNA条形码序列对罂粟属植物进行种内和种间的鉴别。方法 采用5种不同种类的虞美人和花菱草作为罂粟鉴别的种内植物、种间植物。利用叶绿体基因组matK、rbcL、trnH-psbA和核糖体基因... 目的 利用DNA条形码技术探索罂粟的鉴定方法,寻找可靠的DNA条形码序列对罂粟属植物进行种内和种间的鉴别。方法 采用5种不同种类的虞美人和花菱草作为罂粟鉴别的种内植物、种间植物。利用叶绿体基因组matK、rbcL、trnH-psbA和核糖体基因组ITS2、ITS4、ITS5引物对提取的DNA进行扩增,并双向测序拼接,利用MEGA.X.对序列进行分析比对,计算种内、种间遗传距离,同时使用该软件构建NJ系统发育树。结果 将测序结果录入Genbank中进行比对分析,结果显示单一DNA条形码序列无法有效区分虞美人与罂粟。通过Genbank下载数据使用matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建系统发育树成功,对罂粟和虞美人样本测序结果进行验证。经验证,matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建NJ发育树成功,能有效区分虞美人和罂粟。结论 matK+rbcL+trnH-psbA作为组合DNA条形码使用,可以有效鉴别罂粟属内植物。 展开更多
关键词 DNA条形码 matK+rbcL+trnh-psba 分子鉴定 罂粟
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基于matK+rbcL+trnH-psbA联合分析法对罂粟属植物鉴定的研究
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作者 范豫杰 苏少明 黄磊 《广东公安科技》 2025年第3期25-30,共6页
采用5种不同种类的虞美人和花菱草作为罂粟鉴别的种内植物、种间植物。利用叶绿体基因组matK、rbcL、trnH-psbA和核糖体基因组ITS2、ITS4、ITS5引物对提取的DNA进行扩增,并双向测序拼接,利用MEGA.X.对序列进行分析比对,计算种内、种间... 采用5种不同种类的虞美人和花菱草作为罂粟鉴别的种内植物、种间植物。利用叶绿体基因组matK、rbcL、trnH-psbA和核糖体基因组ITS2、ITS4、ITS5引物对提取的DNA进行扩增,并双向测序拼接,利用MEGA.X.对序列进行分析比对,计算种内、种间遗传距离,同时使用该软件构建N-J系统发育树。结果显示,通过对扩增结果、测序结果进行分析,并将测序结果录入Genbank中进行比对分析。同时通过Genbank下载数据使用matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建系统发育树成功,并用该方法对本研究中的罂粟和虞美人样本测序结果进行验证。matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建N-J发育树能有效区分本研究中的虞美人和罂粟。因此,matK+rbcL+trnH-psbA作为组合DNA条形码使用,可以有效鉴别罂粟属植物。 展开更多
关键词 DNA条形码 matK+rbcL+trnh-psba 分子鉴定 罂粟
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基于主要农艺性状和trnH-psbA序列的辣椒聚类分析 被引量:5
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作者 谭放军 汤冰倩 +2 位作者 吴永红 宋静爽 欧立军 《中国农学通报》 2019年第27期72-78,共7页
旨在研究辣椒种质的遗传多样性和筛选核心种质资源。对98份辣椒种质的株高、株幅和主茎高等主要农艺性状和叶绿体的trnH-psbA序列进行了调查和分析。98份辣椒种质的农艺性状有较大区别,特别是单果重、果长、叶片叶绿素、株高等性状表现... 旨在研究辣椒种质的遗传多样性和筛选核心种质资源。对98份辣椒种质的株高、株幅和主茎高等主要农艺性状和叶绿体的trnH-psbA序列进行了调查和分析。98份辣椒种质的农艺性状有较大区别,特别是单果重、果长、叶片叶绿素、株高等性状表现为显著或极显著的差异;同时,基于trnH-psbA序列可以将所有种质分成三大类,分别含种质29、31和38个;综合农艺性状和trnH-psbA序列筛选出31份核心种质。辣椒种质存在较高的遗传多样性,通过筛选的核心种质代表了98份种质的遗传多样性,可以应用于育种。 展开更多
关键词 辣椒 农艺性状 trnh-psba序列 核心种质 遗传多样性
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基于ITS2和psbA-trnH序列鉴别五味子和华中五味子 被引量:2
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作者 杨楚楚 任广喜 +6 位作者 齐玉鑫 徐庆一 田俊强 程豪杰 陈晓洲 姜丹 刘春生 《中国现代中药》 2025年第1期43-51,共9页
目的:基于核内转录间隔区2(ITS2)和psbA-trnH序列,运用DNA条形码技术对五味子和华中五味子进行序列比对分析,建立快速、准确的分子鉴定方法,筛选最佳DNA条形码序列用于鉴别五味子和华中五味子真伪。方法:以五味子和华中五味子为材料,利... 目的:基于核内转录间隔区2(ITS2)和psbA-trnH序列,运用DNA条形码技术对五味子和华中五味子进行序列比对分析,建立快速、准确的分子鉴定方法,筛选最佳DNA条形码序列用于鉴别五味子和华中五味子真伪。方法:以五味子和华中五味子为材料,利用DNA提取试剂盒,分别提取五味子和华中五味子的总DNA,对ITS2序列和psbA-trnH序列进行聚合酶链式反应扩增及测序分析,使用DNAMAN 6.0软件统计其片段长度及变异位点个数,使用MEGA 5.0软件对数据进行分析比对,计算Kimura 2-parameter遗传距离,通过数据库预测二级结构,并利用邻接法建立系统发育树进行分析。结果:五味子和华中五味子ITS2序列片段长度为231 bp,鉴别位点为腺嘌呤(A)-胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)-T、T-A;在psbA-trnH序列中,存在7个稳定的鉴别位点,分别为GA、T-G、胞嘧啶(C)-A、T-A、缺失-T、A-T、G-T,五味子和华中五味子ITS2序列二级结构存在明显差异,能将两者进行区分。结论:ITS2和psbA-trnH条形码均可以用于区分五味子和华中五味子,但psbA-trnH条形码种内遗传更稳定,种间鉴别位点更多,研究为五味子和华中五味子的快速、准确鉴定和用药安全提供科学依据。 展开更多
关键词 五味子 华中五味子 DNA条形码 内转录间隔区2序列 叶绿体基因间隔区序列
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