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CRISPR-Cas9介导的TRIM3基因敲除细胞系的建立及其应用
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作者 裴丹诗 范许许 +7 位作者 朱兆宇 王一卓 何路 任青峰 李熙忠 郑海学 李伟伟 万博 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第6期725-731,共7页
本研究旨在探究宿主蛋白TRIM3对口蹄疫病毒(FMDV)复制的影响。利用CRISPR/Cas9系统构建了TRIM3基因敲除的BHK21细胞系,并借助CCK8试剂盒检测了该基因的缺失对细胞活力的影响,结果表明,TRIM3敲除对细胞生长状态无明显影响。将FMDV分别感... 本研究旨在探究宿主蛋白TRIM3对口蹄疫病毒(FMDV)复制的影响。利用CRISPR/Cas9系统构建了TRIM3基因敲除的BHK21细胞系,并借助CCK8试剂盒检测了该基因的缺失对细胞活力的影响,结果表明,TRIM3敲除对细胞生长状态无明显影响。将FMDV分别感染野生型和TRIM3敲除型的BHK21细胞,通过Q-PCR、Western-blot和TCID50等多种方法检测FMDV在上述2株细胞中的复制情况,结果表明,TRIM3缺失能够显著抑制FMDV的复制。为了进一步验证TRIM3的表型功能,用慢病毒包装系统构建了TRIM3过表达细胞系。结果显示,过量表达TRIM3能够促进FMDV的复制。综上所述,本研究通过CRISPR/Cas9系统成功构建了TRIM3基因敲除细胞系和过表达细胞系,首次证明了TRIM3能够正向调控FMDV的复制,为后续探究TRIM3调控FMDV复制的具体机制奠定了基础。 展开更多
关键词 trim3 口蹄疫病毒 细胞系
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TRIM3通过调控PIAS1-STAT1轴抑制胶质瘤发生发展
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作者 陈昱宁 焦建同 +3 位作者 郭卉 计巍 何其晟 邵君飞 《临床神经外科杂志》 2025年第2期149-157,165,共10页
目的 探究TRIM3通过PIAS1-STAT1在胶质母细胞瘤(GBM)形成与发展中发挥的作用及其分子机制。方法 构建TRIM3的过表达慢病毒与shRNA转染的GBM细胞系U251与U87细胞,同时设置相应的对照组CON335和CON313。使用FLAG-TRIM3质粒转染GBM细胞与2... 目的 探究TRIM3通过PIAS1-STAT1在胶质母细胞瘤(GBM)形成与发展中发挥的作用及其分子机制。方法 构建TRIM3的过表达慢病毒与shRNA转染的GBM细胞系U251与U87细胞,同时设置相应的对照组CON335和CON313。使用FLAG-TRIM3质粒转染GBM细胞与293T细胞,构建过表达细胞系。活细胞计数(CCK-8)、平板克隆实验、Transwell小室及流式细胞术对胶质瘤细胞的增殖活性、成团、迁移能力以及凋亡情况进行分析。Western blot和免疫共沉淀实验(Co-IP)用于检测TRIM3与PIAS1蛋白互作情况以及具体分子机制。实时定量荧光聚合酶链反应(PCR)检测TRIM3和PIAS1的mRNA表达。双荧光素酶报告基因试验检测TRIM3对STAT1的活性影响。裸鼠颅内成瘤模型证明TRIM3在体内对胶质瘤形成的影响。结果 与正常脑组织细胞相比,TRIM3的表达在GBM组织中明显降低,并且TRIM3的表达水平随着胶质瘤WHO病理分级增高而降低。与对照组相比,在过表达了TRIM3之后,胶质瘤细胞的增殖、成团与迁移能力明显降低,并且可诱导GBM细胞的凋亡。Western blot结果显示,TRIM3在GBM细胞中过表达会导致PIAS1蛋白水平的降低,且浓度越高趋势越明显。实时定量荧光PCR结果提示TRIM3对PIAS1和STAT1的mRNA水平无影响。双荧光素酶报告基因试验证明TRIM3提高STAT1的转录活性。此外,TRIM3通过促进PIAS1在K48位点的多聚泛素化介导其降解,从而解除PIAS1对STAT1转录效应的抑制。在裸鼠体内同样证明与对照组相比,TRIM3过表达组小鼠颅内成瘤速度与大小明显下降。结论 TRIM3拮抗PIAS1-TRIM3通路,抑制胶质瘤发生发展,为肿瘤治疗提供新的靶点。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 trim3 PIAS1 STAT1 泛素化
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猪TRIM3基因克隆、生物信息学及组织表达分析 被引量:5
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作者 张航 沙惠阳 +2 位作者 李华玮 黄良宗 赵孟孟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第7期2474-2483,共10页
【目的】克隆大白猪三基序结合蛋白3(tripartite motif-containing 3,TRIM3)基因,并对其进行生物信息学和组织表达分析。【方法】采用PCR技术扩增并克隆大白猪TRIM3基因CDS全长序列,连接pMD18-T载体并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,通过... 【目的】克隆大白猪三基序结合蛋白3(tripartite motif-containing 3,TRIM3)基因,并对其进行生物信息学和组织表达分析。【方法】采用PCR技术扩增并克隆大白猪TRIM3基因CDS全长序列,连接pMD18-T载体并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,通过蓝白斑筛选阳性克隆,菌液PCR鉴定后测序,与不同物种TRIM3基因序列比对并构建系统进化树;应用多种在线软件对其编码蛋白进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR方法检测TRIM3基因在大白猪不同组织中的相对表达量。【结果】大白猪TRIM3基因CDS序列全长2235 bp,编码744个氨基酸。相似性和遗传进化分析结果显示,大白猪与野猪的相似性最高,达99.7%,与鸭的相似性最低,为75.1%;大白猪TRIM3基因与野猪先聚为一类,与牛和山羊亲缘关系较近。生物信息学分析显示,大白猪TRIM3蛋白分子质量为80.58 ku,理论等电点(pI)为8.32,不稳定系数为40.85,为亲水性蛋白,但不是分泌蛋白,无糖基化位点,预测其有60个磷酸化位点,主要存在于细胞质内;在TRIM3蛋白二级结构中以无规则卷曲为主,占41.67%,三级结构模型预测结果与二级结构一致。组织表达分析表明,大白猪TRIM3基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、气管、结肠中均有分布,肺脏中表达量最多且显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆大白猪TRIM3基因CDS全长序列,并进行了生物信息学和组织表达分析,为进一步研究大白猪TRIM3蛋白的免疫学功能提供理论依据,对探究大白猪TRIM3基因参与先天性免疫和抗病毒感染分子机制具有重要意义。 展开更多
关键词 大白猪 trim3基因 克隆 表达分析
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TRIM3在肿瘤中的研究进展 被引量:4
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作者 从雨 徐娟(综述) 贾雪梅(审校) 《临床与病理杂志》 2020年第3期728-733,共6页
TRIM家族是一类大多具有E3泛素连接酶活性的蛋白,参与许多重要的生物学过程,包括细胞内信号转导、蛋白的质量控制、先天免疫、自噬和癌变。近年来的研究发现,TRIM蛋白表达的失调会导致多种疾病,例如:肿瘤、免疫性疾病、神经精神疾病、... TRIM家族是一类大多具有E3泛素连接酶活性的蛋白,参与许多重要的生物学过程,包括细胞内信号转导、蛋白的质量控制、先天免疫、自噬和癌变。近年来的研究发现,TRIM蛋白表达的失调会导致多种疾病,例如:肿瘤、免疫性疾病、神经精神疾病、传染性疾病、染色体异常及发育性疾病等。TRIM3是TRIM家族成员之一,主要由N末端的RING结构域、B-BOX结构域、卷曲螺旋结构域和C-末端结构域组成,它在多种肿瘤的发生及进展过程中发挥着重要的抑癌作用,如胶质母细胞瘤,肝癌和结直肠癌(colorectal cancer,CRC)等。目前主要认为TRIM3是一种候选肿瘤抑制基因,它可以抑制肿瘤细胞生长、侵袭与转移,与肿瘤的临床分期及预后关系密切。其作用机制涉及NF-κB信号通路、Musashi-Notch信号通路、P38信号通路等多条信号通路。 展开更多
关键词 trim3 结构 肿瘤 抑癌作用
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Tripartite motif.containing 3(TRIM3)inhibits tumor growth and metastasis of liver cancer 被引量:13
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作者 Xu.Qiong Huang Xiao.Fei Zhang +9 位作者 Jin.Hua Xia Jie Chao Qiu.Zhong Pan Jing.Jing Zhao Zi.Qi Zhou Chang.Long Chen Yan Tang De.Sheng Weng Jian.Hua Zhang Jian.Chuan Xia 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2017年第9期407-419,共13页
Background:Reduced expression of tripartite motif-containing 3(TRIM3) has been reported to be involved in the pathogenesis of human glioblastoma.In our previous research,we found that TRIM3 expression was markedly red... Background:Reduced expression of tripartite motif-containing 3(TRIM3) has been reported to be involved in the pathogenesis of human glioblastoma.In our previous research,we found that TRIM3 expression was markedly reduced in human primary hepatocellular carcinoma(HCC) tissues and that low TRIM3 expression was associated with short survival of HCC patients.However,the role of TRIM3 in liver cancer remains unknown.This study aimed to investigate the function of TRIM3 in liver cancer cells.Methods:The protein levels of TRIM3 in five liver cancer cell lines(SK-Hep1,Hep3 B,Huh7,HepG2,Bel-7402) and one normal liver cell line(L02) were detected with Western blotting.HepG2 and Bel-7402 cells with low TRIM3 expression were infected with recombinant lentiviruses overexpressing TRIM3(LV-TRIM3),whereas Huh7 and Hep3 B cells with high TRIM3 expression were transfected with TRIM3-targeted small interfering RNA(siTRIM3).The functions of TRIM3 in the proliferation,colony formation,cell cycle,migration,invasion,and apoptosis of the above cell lines were examined.The effect ofTRIM3 on tumor growth and metastases in nude mice was also investigated.Results:TRIM3 was overexpressed in HepG2 and Bel-7402 cells with LV-TRIM3 infection,which further reduced proliferation,colony formation,migration,and invasion of both cell lines.Cell cycle analysis showed that TRIM3 overexpression induced G_0/G_1 phase arrest in HepG2 and Bel-7402 cells.Moreover,apoptosis was not increased in HepG2 or Bel-7402 cells overexpressing TRIM3.Contrarily,silencing TRIM3 expression in Huh7 and Hep3 B cells by siTRIM3 led to significantly decreased percentages of both cells in the G_0/G_1 phase and promoted cell proliferation,colony formation,migration,and invasion.In vivo experiment results confirmed that TRIM3 overexpression suppressed tumor growth and metastasis.Conclusions:TRIM3 plays a tumor-suppressing role in the regulation of liver cancer development by reducing cell proliferation through cell cycle arrest at the G_0/G_1 phase. 展开更多
关键词 TRIPARTITE motif-containing 3 (trim3) Liver cancer Tumor SUPPRESSOR Cell cycle
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非洲绿猴TRIM3基因的克隆与序列分析
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作者 曾贤婷 朱庆阁 +2 位作者 曾丁蕾 杨智羽 赵孟孟 《现代牧业》 2023年第1期26-32,共7页
对非洲绿猴三基序结合蛋白3的基因(TRIM3基因)进行克隆并进行序列分析。扩增非洲绿猴TRIM3基因编码区域(CDS),应用在线软件进行生物信息学分析。非洲绿猴TRIM3基因CDS序列全长2235 bp,编码744个氨基酸。核苷酸相似性分析结果显示,非洲... 对非洲绿猴三基序结合蛋白3的基因(TRIM3基因)进行克隆并进行序列分析。扩增非洲绿猴TRIM3基因编码区域(CDS),应用在线软件进行生物信息学分析。非洲绿猴TRIM3基因CDS序列全长2235 bp,编码744个氨基酸。核苷酸相似性分析结果显示,非洲绿猴与猕猴相似性最高,相似性为99.5%,与石龟的相似性为75.3%。生物信息学分析显示,非洲绿猴三基序结合蛋白3分子质量为80.93 ku,理论等电点为8.03,不稳定系数为40.01,是不稳定蛋白。亲水性分析显示,三基序结合蛋白3为亲水性蛋白,不是分泌蛋白,预测该蛋白有22个磷酸化位点。三基序结合蛋白3二级结构以延伸链为主,占38.84%。 展开更多
关键词 非洲绿猴 trim3基因 序列分析 进化树 生物信息学
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微观模拟模型及其在社会经济政策分析中的应用
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作者 马修强 熊林平 +1 位作者 张罗漫 孟虹 《科学技术与工程》 2003年第4期386-389,共4页
微观模拟模型是一种新型的政策分析工具,在西万发达国家的政策分析中取得显著成绩。总结微观模拟模型的基本理论,并结合TRIM3、STINMOD、EUROMOD、SPSD/M四个主要模型介绍了微观模拟模型在国外的发展和应用情况。针对我国目前进行的各... 微观模拟模型是一种新型的政策分析工具,在西万发达国家的政策分析中取得显著成绩。总结微观模拟模型的基本理论,并结合TRIM3、STINMOD、EUROMOD、SPSD/M四个主要模型介绍了微观模拟模型在国外的发展和应用情况。针对我国目前进行的各项改革,特别是医疗卫生领域改革,探讨了微观模型在我国发展和应用前景。 展开更多
关键词 微观模拟模型 社会经济政策 政策分析 trim3模型 STINMOD模型 EUROMOD模型 SPSD/M模型
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黑色素瘤相关抗原MAGEA1的定位及其相互作用蛋白质的鉴定
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作者 李瑜颖 钟子琳 陈建军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期765-771,共7页
黑色素瘤相关抗原家族A1蛋白(melanoma associated antigen family A1,MAGEA1)在生殖细胞和多种组织学来源的肿瘤中有表达,但其作用机制尚不清楚。本研究通过构建带Flag和GFP标签的MAGEA1真核表达重组质粒,将其转染至HeLa、HEK293T细胞... 黑色素瘤相关抗原家族A1蛋白(melanoma associated antigen family A1,MAGEA1)在生殖细胞和多种组织学来源的肿瘤中有表达,但其作用机制尚不清楚。本研究通过构建带Flag和GFP标签的MAGEA1真核表达重组质粒,将其转染至HeLa、HEK293T细胞内。利用Western印迹、免疫细胞荧光法、免疫共沉淀、细胞核蛋白质与细胞质蛋白质分离和线粒体提取等技术,检测其在细胞内的表达与定位以及与其他蛋白质的相互作用情况。免疫细胞化学和蛋白质印迹结果显示,过表达的MAGEA1主要定位于细胞质,并部分与线粒体共定位。通过免疫共沉淀验证了MAGEA1与TRIM31、SNW1、HDAC1之间存在相互作用,并且发现MAGEA1可能主要与位于细胞质中的HDAC1相互作用。以上研究表明,MAGEA1可能参与不同的细胞内调节途径,部分与线粒体共定位;与TRIM31、SNW1、HDAC1相互作用,且可能主要与位于细胞质中的HDAC1蛋白相互作用,推测其可能参与到蛋白质泛素化和Notch信号通路。本研究的结果为后续深入研究MAGEA1的作用机制奠定了实验基础。 展开更多
关键词 黑色素瘤相关抗原家族A1 亚细胞定位 线粒体 E3泛素连接酶trim31 组蛋白去乙酰酶1
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抹平MP3的伤口
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作者 太子 《网友世界》 2003年第21期68-68,共1页
关键词 MP3Trim软件 MP3文件 MP3播放软件 应用软件
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MP3也能搞加工
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作者 张建华 宋志明 《电脑知识与技术(过刊)》 2004年第6期14-14,共1页
MP3是课件制作中经常到的声音素材。说起来现在在网上找个MP3文件似乎并不太难,不过,要想找到完全适合我们的课件的MP3还是很困难的。多数的情况下,找到的素材需要经过剪裁和加工,有时,需要对几个MP3文件进行适当的裁剪然后再合并... MP3是课件制作中经常到的声音素材。说起来现在在网上找个MP3文件似乎并不太难,不过,要想找到完全适合我们的课件的MP3还是很困难的。多数的情况下,找到的素材需要经过剪裁和加工,有时,需要对几个MP3文件进行适当的裁剪然后再合并成一个文件。以往的时候,这个工作是很麻烦的。 展开更多
关键词 课件制作 声音素材 MP3 文件裁剪 文件合并 MP3Trim MP3 TURBO INJECTOR
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Elevating H3K27me3 level sensitizes colorectal cancer to oxaliplatin 被引量:9
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作者 Qi Wang Xi Chen +13 位作者 Yuhang Jiang Sanhong Liu Hanshao Liu Xiaohua Sun Haohao Zhang Zhi Liu Yu Tao Cuifeng Li Yiming Hu Dandan Liu Deji Ye Yongzhong Liu Mingliang Wang Xiaoren Zhang 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期125-137,共13页
Histone methylation is a context-dependent modification that regulates gene expression,and the trimethylation of histone H3 lysine 27(H3K27me3)usually induces gene silencing.Overcoming colorectal cancer(CRC)chemoresis... Histone methylation is a context-dependent modification that regulates gene expression,and the trimethylation of histone H3 lysine 27(H3K27me3)usually induces gene silencing.Overcoming colorectal cancer(CRC)chemoresistance is currently a huge challenge,but the relationship between H3K27me3 modification and chemoresistance remains largely unclear.Here,we found that H3K27me3 levels positively correlated with the metastasis-free survival of CRC patients and a low H3K27me3 level predicted a poor outcome upon chemotherapeutic drug treatment.Oxaliplatin stimulation significantly induced the expression of H3K27 lysine demethylase 6A/6B(KDM6A/6B),thus decreasing the level of H3K27me3 in CRC cells.Elevation of H3K27me3 level through KDM6A/6B depletion or GSK-J4(a KDM6A/6B inhibitor)treatment significantly enhanced oxaliplatin-induced apoptosis.Conversely,when inhibiting the expression of H3K27me3 by EPZ-6438,an inhibitor of the histone methyltransferase EZH2,the proportion of apoptotic cells remarkably decreased.In addition,the combination of GSK-J4 and oxaliplatin significantly inhibited tumor growth in an oxaliplatin-resistant patient-derived xenograft model.Importantly,we revealed that oxaliplatin treatment dramatically induced NOTCH2 expression,which was caused by downregulation of H3K27me3 level on the NOTCH2 transcription initiation site.Thus,the activated NOTCH signaling promoted the expression of stemness-related genes,which resulted in oxaliplatin resistance.Furthermore,oxaliplatin-induced NOTCH signaling could be interrupted by GSK-J4 treatment.Collectively,our findings suggest that elevating H3K27me3 level can improve drug sensitivity in CRC patients. 展开更多
关键词 H3K27 trim ethylation colorectal cancer chem oresistance NOTCH signaling
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简单易用的MP3文件编辑利器 Mp3trim Pro
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作者 闪电精灵 《电脑时空》 2005年第3期60-61,共2页
从网络上下载的MP3常因网络的MP3文件制作人不同.其效果也不尽相同,有的爆音.有的静音时间太长.有的声音太小,在欣赏时会遇到麻烦比如需要不时地调整音量的大小。那么你想将下载的MP3文件进行整理吗,请使用Mp3trim Pro吧!
关键词 Mp3trim PRO MP3文件编辑软件 应用软件 计算机
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软件打造高音质MP3
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作者 波波仔 《电脑时空》 2004年第6期113-113,共1页
对于每一个音乐发烧友,都希望通过自己的改造使机器和人的磨合达到最佳状态。一般人都认为现实它要在硬件上下功夫,这次我们要给机器机来个“软升级”;从字面来看,大家已经猜到大半了吧,通过软件来提高MP3的音质。
关键词 软件 MP3文件 驱动程序 WINAMP5.0 Dfx6.4 MP3Trim Lame3.5 音效双响炮
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