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基于生物信息学分析TRIB2与结肠癌预后和免疫浸润相关性
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作者 万璐颖 李静宜 谢贤和 《广州医药》 2025年第6期766-774,共9页
目的 探讨TRIB2在结肠癌中的表达水平及与预后及免疫浸润之间的关系。方法 TIMER数据库分析TRIB2在泛癌种中的表达;TCGA、GSE17538下载结肠癌患者RNA-seq数据和临床信息,评估其与临床病理特征的相关性;生存曲线、单因素和多因素Cox分析... 目的 探讨TRIB2在结肠癌中的表达水平及与预后及免疫浸润之间的关系。方法 TIMER数据库分析TRIB2在泛癌种中的表达;TCGA、GSE17538下载结肠癌患者RNA-seq数据和临床信息,评估其与临床病理特征的相关性;生存曲线、单因素和多因素Cox分析探讨TRIB2与预后的相关性,并构建列线图;对TRIB2进行差异基因的富集分析;分析TRIB2表达水平与免疫细胞浸润、免疫检查点、肿瘤突变负荷(TMB)以及免疫治疗敏感性之间的相关性。结果 TRIB2在结肠癌组织中高表达(P<0.05);CMS1结肠癌患者TRIB2 mRNA表达水平最高;TRIB2是结肠癌患者的独立预后因素(单因素Cox回归分析:HR=1.397,95%CI:1.100~1.774,P=0.006;多因素Cox回归分析:HR=1.502,95%CI:1.158~1.947,P=0.002);TRIB2与免疫细胞的浸润密切相关,并且与免疫检查点分子表达水平以及TMB正相关(r=0.39,P<0.001);TRIB2的表达水平与免疫检查点抑制剂的疗效相关。结论 TRIB2在结肠癌中高表达且与结肠癌患者预后差和免疫微环境密切相关。 展开更多
关键词 结肠癌 trib2 预后 免疫
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宿主蛋白TRIB2与流感病毒NP蛋白相互作用的研究 被引量:1
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作者 周圆 赵玉辉 +8 位作者 张杰 赵青青 周陈陈 王广文 梁立滨 李俊平 姜丽 陈化兰 李呈军 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期85-89,共5页
流感病毒的核衣壳蛋白(NP)是病毒粒子中重要的结构蛋白,参与流感病毒生命周期的多个过程。为筛选与流感病毒NP相互作用的宿主蛋白,本研究应用酵母双杂交技术(Y2H)技术从A549细胞cDNA文库中筛选到与其相互作用的宿主蛋白Tribble 2(TRIB2)... 流感病毒的核衣壳蛋白(NP)是病毒粒子中重要的结构蛋白,参与流感病毒生命周期的多个过程。为筛选与流感病毒NP相互作用的宿主蛋白,本研究应用酵母双杂交技术(Y2H)技术从A549细胞cDNA文库中筛选到与其相互作用的宿主蛋白Tribble 2(TRIB2),并通过免疫共沉淀技术(Co-IP)试验和GST pull down试验进一步证实NP与TRIB2之间存在特异性的直接相互作用。此外,利用激光共聚焦试验证实NP与TRIB2共定位于A549细胞的细胞质内。在A549细胞中过表达TRIB2蛋白后,能够降低流感病毒的滴度,表明TRIB2具有抑制流感病毒的复制功能。本实验为研究流感病毒的复制机理奠定了基础,完善了病毒与宿主相互作用网络。 展开更多
关键词 酵母双杂交 NP蛋白 trib2蛋白 流感病毒
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吴茱萸碱通过TRIB2/AKT信号通路诱导人白血病细胞K562凋亡 被引量:1
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作者 牟凤林 刘北忠 +5 位作者 余莉华 但文冉 李健 熊玲 钟梁 叶娇 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期118-124,共7页
目的探讨吴茱萸碱(evodiamine,EVO)对人白血病细胞K562增殖与凋亡的影响,并初步探究其潜在的分子机制。方法以CCK-8法测定不同浓度的EVO处理K652细胞不同时间后的增殖抑制作用,流式细胞术检测细胞凋亡,qRT-PCR检测TRIB2 mRNA表达,Wester... 目的探讨吴茱萸碱(evodiamine,EVO)对人白血病细胞K562增殖与凋亡的影响,并初步探究其潜在的分子机制。方法以CCK-8法测定不同浓度的EVO处理K652细胞不同时间后的增殖抑制作用,流式细胞术检测细胞凋亡,qRT-PCR检测TRIB2 mRNA表达,Western blot检测TRIB2/AKT信号通路;以EVO作用于AKT激活剂SC79预处理后的K562细胞,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot检测TRIB2/AKT信号通路。以EVO作用于Wnt激活剂SKL2001预处理后的K562细胞,Western blot检测TRIB2/AKT信号通路。结果EVO对K562细胞的增殖抑制作用呈时间及浓度依赖性;流式结果显示EVO体外可促细胞凋亡且呈浓度依赖性;EVO处理后,TRIB2mRNA的表达降低,TRIB2/AKT信号通路被抑制;SC79削弱了由EVO诱导的K562细胞凋亡,且SC79和SKL2001均能逆转EVO对AKT信号通路的抑制作用。结论EVO可诱导人白血病细胞K562凋亡,从而抑制其增殖,其机制可能是通过抑制TRIB2的表达,进而抑制AKT的磷酸化,最终抑制下游基因NF-κB p65的磷酸化,从而诱导细胞凋亡并抑制其生长。 展开更多
关键词 K562细胞 吴茱萸碱 trib2 AKT 凋亡 增殖抑制
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CML细胞eIF4E和Trib2基因mRNA表达分析
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作者 黄莲芬 冯文莉 +1 位作者 万根平 罗红伟 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1358-1360,共3页
目的:为了探索慢性粒细胞白血病(Chronic myelogenous leukemia,CML)急变机理,寻求新的治疗靶标,我们对获得的9例CML病人骨髓标本以及CML急性红系变细胞株中K562细胞株中eIF4E基因和Trib2基因的表达水平进行初步检测,为进一步的研究奠... 目的:为了探索慢性粒细胞白血病(Chronic myelogenous leukemia,CML)急变机理,寻求新的治疗靶标,我们对获得的9例CML病人骨髓标本以及CML急性红系变细胞株中K562细胞株中eIF4E基因和Trib2基因的表达水平进行初步检测,为进一步的研究奠定基础。方法:分离骨髓单个核细胞,用Trizol裂解提取RNA,RT-PCR检测eIF4E基因和trib2基因mRNA的表达水平。结果:初步分析显示部分CML病人eIF4E基因mRNA表达水平很高,为CML疾病进展机制进一步研究奠定了基础。结论:部分CML病人骨髓标本中eIF4E和TRIB2基因mRNA表达水平较高,eIF4E和trib2有可能成为CML病人新的治疗靶点。 展开更多
关键词 慢性粒细胞白血病 真核细胞翻译起始因子4E trib2
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聚氨酯介导TRIB2-siRNA转染人源脂肪干细胞的体外成脂分化
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作者 刘娟 林超 庄志刚 《同济大学学报(医学版)》 2021年第3期306-312,共7页
目的使用阳离子型聚氨酯(cationic polyurethane,CPU)介导TRIB2-siRNA体外转染人源脂肪干细胞沉默TRIB2基因表达,研究基因沉默效率及基因沉默对干细胞成脂分化的影响。方法在氮/磷(N/P)为10∶1的条件下,混合CPU与TRIB2-siRNA或阴性对照s... 目的使用阳离子型聚氨酯(cationic polyurethane,CPU)介导TRIB2-siRNA体外转染人源脂肪干细胞沉默TRIB2基因表达,研究基因沉默效率及基因沉默对干细胞成脂分化的影响。方法在氮/磷(N/P)为10∶1的条件下,混合CPU与TRIB2-siRNA或阴性对照siRNA(NC)制备复合物,并转染人源脂肪干细胞。将CPU/TRIB2-siRNA作为实验组,CPU/NC作为阴性对照组,Lipofectamine^(TM)2000/TRIB2-siRNA作为阳性对照组,未处理的干细胞作为空白对照组,使用实时荧光定量PCR检测干细胞内TRIB2的mRNA表达;使用Alamar Blue法检测干细胞的存活率;应用激光共聚焦显微镜观察复合物的细胞吞噬情况;用油红O染色法在光学显微镜下观察干细胞的成脂情况。结果与空白对照组比,CPU/TRIB2-siRNA实验组有效沉默了TRIB2 mRNA,差异有统计学意义(P<0.001);实验组的沉默效果较阳性对照组更好(P<0.001);实验组的细胞存活率接近100%。CPU能介导TRIB2-siRNA在8 h后逃逸溶酶体。油红O染色及定量分析表明,实验组在诱导28 d后出现较多的脂滴。结论聚氨酯作为载体可有效递送TRIB2-siRNA进入脂肪干细胞并降低TRIB2 mRNA的表达,进而促进脂肪干细胞向脂肪的分化。 展开更多
关键词 人源脂肪干细胞 成脂分化 trib2基因 聚氨酯
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Enhancing m^(6)A modification in the motor cortex facilitates corticospinal tract remodeling after spinal cord injury
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作者 Tian Qin Yuxin Jin +5 位作者 Yiming Qin Feifei Yuan Hongbin Lu Jianzhong Hu Yong Cao Chengjun Li 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1749-1763,共15页
Spinal cord injury typically causes corticospinal tract disruption.Although the disrupted corticospinal tract can self-regenerate to a certain degree,the underlying mechanism of this process is still unclear.N6-methyl... Spinal cord injury typically causes corticospinal tract disruption.Although the disrupted corticospinal tract can self-regenerate to a certain degree,the underlying mechanism of this process is still unclear.N6-methyladenosine(m^(6)A)modifications are the most common form of epigenetic regulation at the RNA level and play an essential role in biological processes.However,whether m^(6)A modifications participate in corticospinal tract regeneration after spinal cord injury remains unknown.We found that expression of methyltransferase 14 protein(METTL14)in the locomotor cortex was high after spinal cord injury and accompanied by elevated m^(6)A levels.Knockdown of Mettl14 in the locomotor cortex was not favorable for corticospinal tract regeneration and neurological recovery after spinal cord injury.Through bioinformatics analysis and methylated RNA immunoprecipitation-quantitative polymerase chain reaction,we found that METTL14 regulated Trib2 expression in an m^(6)A-regulated manner,thereby activating the mitogen-activated protein kinase pathway and promoting corticospinal tract regeneration.Finally,we administered syringin,a stabilizer of METTL14,using molecular docking.Results confirmed that syringin can promote corticospinal tract regeneration and facilitate neurological recovery by stabilizing METTL14.Findings from this study reveal that m^(6)A modification is involved in the regulation of corticospinal tract regeneration after spinal cord injury. 展开更多
关键词 corticospinal tract remodeling epigenetic regulations locomotor cortex m^(6)A modification methyltransferase 14 protein(METTL14) mitogen-activated protein kinase neural regeneration spinal cord injury SYRINGIN trib2
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Highlights of the 2nd International Symposium on Tribbles and Diseases: tribbles tremble in therapeutics for immunity, metabolism, fundamental cell biology and cancer 被引量:2
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作者 Bing Cui Patrick A. Eyers +30 位作者 Leonard L. Dobens Nguan Soon Tan Peter D. Mace Wolfgang A. Link Endre Kiss-Toth Karen Keeshan Takuro Nakamura Warren S. Pear Yodit Feseha Jessica Johnston Arkatiz Carracedo Marcel Scheideler Zabran llyas Robert C. Bauer Jorge D. Erusalimsky Dominika Grzesik Juan Salamanca-Viloria Xiaoxi Lv Yishi Jin Ke Li Guillermo Velasco Shuang Shang Jose M. Lizcano Xiaowei Zhang Jichao Zhou Jiaojiao Yu Fang Hua Feng Wang Shanshan Liu Jinmei Yu Zhuowei Hu 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CSCD 2019年第2期443-454,共12页
The Tribbles(TRIB) family of pseudokinase proteins has been shown to play key roles in cell cycle, metabolic diseases, chronic inflammatory disease, and cancer development. A better understanding of the mechanisms of ... The Tribbles(TRIB) family of pseudokinase proteins has been shown to play key roles in cell cycle, metabolic diseases, chronic inflammatory disease, and cancer development. A better understanding of the mechanisms of TRIB pseudokinases could provide new insights for disease development and help promote TRIB proteins as novel therapeutic targets for drug discovery. At the 2 nd International Symposium on Tribbles and Diseases held on May 7–9, 2018 in Beijing, China, a group of leading Tribbles scientists reported their findings and ongoing studies about the effects of the different TRIB proteins in the areas of immunity, metabolism, fundamental cell biology and cancer. Here, we summarize important and insightful overviews from 4 keynote lectures, 13 plenary lectures and 8 short talks that took place during this meeting. These findings may offer new insights for the understanding of the roles of TRIB pseudokinases in the development of various diseases. 展开更多
关键词 Tribbles IMMUNOLOGY METABOLISM Cell biology Kinase inhibitor TUMORIGENESIS Metastasis TRIB1 trib2 TRIB3 Pseudokinase Inflammation Atomic structure Protein quality control Ubiqutin
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