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甲状腺乳头状癌中FN1和TNFRSF11B的异常表达和预后不良及肿瘤微环境变化有关
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作者 高建 郑子芳 张国烈 《武汉大学学报(医学版)》 2025年第8期1000-1008,共9页
目的:分析FN1和TNFRSF11B在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其临床病理意义和与肿瘤微环境(TME)评分的关系。方法:使用R和R包分析TCGA⁃THCA和GSE3678数据,探索FN1和TNFRSF11B的表达和临床病理参数的关系。随后从基质细胞、免疫细胞浸润... 目的:分析FN1和TNFRSF11B在甲状腺乳头状癌(PTC)中的表达及其临床病理意义和与肿瘤微环境(TME)评分的关系。方法:使用R和R包分析TCGA⁃THCA和GSE3678数据,探索FN1和TNFRSF11B的表达和临床病理参数的关系。随后从基质细胞、免疫细胞浸润评分和肿瘤纯度分析PTC的TME,并分析靶向免疫治疗检查点。最后通过免疫组织化学方法验证FN1和TNFRSF11B在PTC的表达及临床意义。结果:TCGA⁃THCA、GSE3678以及临床样本中,一致性检出PTC中FN1高表达(P<0.001)和TNFRSF11B低表达(P<0.05);高表达的FN1和淋巴转移以及无进展生存显著相关(P<0.05);FN1高表达和TNFRSF11B低表达可显著影响TME(P<0.05);FN1和TNFRSF11B异常表达可用于靶向免疫治疗评估。结论:PTC患者FN1和TNFRSF11B的异常表达和预后不良及肿瘤微环境变化有关,可用于靶向免疫治疗评估,是有价值的诊断和治疗靶点。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 FN1 tnfrsf11b 预后 肿瘤微环境
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TNFRSF11B基因多态性与肌肉量的关系 被引量:1
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作者 王静 李响 +2 位作者 解端阳 陈艳 蒋晓燕 《中国康复理论与实践》 CSCD 北大核心 2012年第11期1029-1032,共4页
目的研究TNFRSF11B基因多态性对人肌肉量的影响。方法对419名汉族健康志愿者测量全身、躯干、上肢、下肢的肌肉量,采用标签单核苷酸多态性(tSNP)策略选择8个tSNP,进行基因分型。结果 TNFRSF11B基因rs2875845位点AA、AG和GG以及rs148528... 目的研究TNFRSF11B基因多态性对人肌肉量的影响。方法对419名汉族健康志愿者测量全身、躯干、上肢、下肢的肌肉量,采用标签单核苷酸多态性(tSNP)策略选择8个tSNP,进行基因分型。结果 TNFRSF11B基因rs2875845位点AA、AG和GG以及rs1485288位点CC、CT和TT基因型携带者个体左右侧上肢、下肢、躯干肌肉量和全身肌肉量依次增加(P<0.05)。结论TNFRSF11B基因rs2875845位点的G等位基因及rs1485288位点的T等位基因增加汉族人肌肉量的水平。 展开更多
关键词 tnfrsf11b基因 单核苷酸多态性 肌肉量
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人Tnfrsf11b-N端多肽的原核表达、纯化及其初步分析 被引量:1
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作者 季韶洋 张祥雪 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 2008年第3期154-158,共5页
目的对原核表达和可溶性纯化后的Tnfrsf11b蛋白氨基端的24.106位肽段进行二级结构分析。方法根据已经发表的人Tnfrsf11b氨基酸序列,利用BLAST程序进行同源性分析,确定所要构建的Tnfrsf11bN端CRD功能结构域;将目的基因片段克隆入表... 目的对原核表达和可溶性纯化后的Tnfrsf11b蛋白氨基端的24.106位肽段进行二级结构分析。方法根据已经发表的人Tnfrsf11b氨基酸序列,利用BLAST程序进行同源性分析,确定所要构建的Tnfrsf11bN端CRD功能结构域;将目的基因片段克隆入表达载体pGEX-6P-1并转化大肠杆菌BL21(DE3),于16℃、0.1mmol/LIPTG诱导25—30h可获得可溶性融合蛋白,经过Glutathione Sepharose^TM 4B亲和层析纯化和PreScission Protease酶切,洗脱的蛋白样品经过Superdex75凝胶预装柱进一步纯化,最终获得可溶性、高纯度的蛋白;对目标蛋白进行圆二色谱分析。结果获得重组质粒pGEX-6P-1-tnfrsf11b并在大肠杆菌中可溶性表达,经亲和层析、酶切、分子筛层析后获得了可溶的、高纯度的Tnfrsf11bN端功能结构域蛋白并对其进行了圆二色谱分析,发现目标蛋白富含β-sheet。结论高含量的β—sheet更有利于蛋白质参与与相互作用,这对其功能的发挥有着重要意义;对此进行研究可以更好的理解这种相互作用,并为进一步研究Tnfrsf11bN端的结构和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 tnfrsf11b 骨保护素 原核表达 蛋白质纯化 圆二色谱
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TNFRSF11B基因rs2073618和rs3102735多态性与胃癌易感性的相关性
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作者 唐璇 龚丹丹 +2 位作者 张诗琪 王晓燕 范钰 《中华医学遗传学杂志》 2025年第5期579-586,共8页
目的:探讨TNFRSF11B基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2073618和rs3102735与胃癌易感性间的关系。方法:招募2013年5月至2017年6月于镇江市第一人民医院就诊的577例原发性胃癌患者为病例组,678例健康体检者为对照组。采集2组人群的血液样品... 目的:探讨TNFRSF11B基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2073618和rs3102735与胃癌易感性间的关系。方法:招募2013年5月至2017年6月于镇江市第一人民医院就诊的577例原发性胃癌患者为病例组,678例健康体检者为对照组。采集2组人群的血液样品并提取DNA,通过PCR扩增目标基因片段,使用Snapshot技术进行基因分型,并通过SPSS v2.0软件进行统计与分析。本研究已通过镇江市第一人民医院医学伦理委员会的审查(批准号:20150083)。结果:①病例组吸烟率显著高于对照组(P=0.006)。②TNFRSF11B基因rs3102735位点T>C多态性显著与胃癌风险增加相关(CC vs.TT:OR=2.164,95%CI=1.063~4.406,P=0.030),而rs2073618位点的变异等位基因与胃癌易感性之间无显著关联(P>0.05)。③在不同年龄、性别、吸烟情况和饮酒情况的分层分析中,TNFRSF11B基因rs2073618多态性与胃癌易感性之间无显著关联(P>0.05);rs3102735多态性在62岁以上人群中CC基因型与胃癌风险显著相关(CC vs.TT:OR=5.44,95%CI=1.54~19.21,P=0.003)。结论:TNFRSF11B基因rs3102735多态性与胃癌易感性可能存在关联,特别是在高龄人群中,可作为胃癌高风险人群的指标。 展开更多
关键词 胃癌 tnfrsf11b基因 单核苷酸多态性 rs2073618 rs3102735。
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泛素结合酶2S参与调控黑素瘤行为机制的生物信息学分析
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作者 朱蒙燕 黎钊 +3 位作者 王佳琦 马阳阳 张小燕 王平 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期300-307,共8页
目的揭示黑素瘤中可能与泛素结合酶2S(UBE2S)存在相互作用的基因,探讨UBE2S参与调控黑素瘤细胞生物学行为的分子机制。方法将A375黑素瘤细胞分为基因敲降组和阴性对照组,分别用含LV-UBE2S-RNAi(14011-1)的慢病毒和CON053慢病毒转染细胞... 目的揭示黑素瘤中可能与泛素结合酶2S(UBE2S)存在相互作用的基因,探讨UBE2S参与调控黑素瘤细胞生物学行为的分子机制。方法将A375黑素瘤细胞分为基因敲降组和阴性对照组,分别用含LV-UBE2S-RNAi(14011-1)的慢病毒和CON053慢病毒转染细胞构建UBE2S敲降细胞株和阴性对照细胞株。提取两组细胞株RNA,并将其纯化及片段化,与芯片探针杂交洗染获取芯片数据。采用Ingenuity路径分析软件对获得的差异表达基因的芯片数据进行进一步解析,鉴定可能与UBE2S存在相互作用的基因,应用免疫印迹法对UBE2S调控的下游分子进行验证。采用双尾t检验筛选差异基因。结果在基因敲降组与阴性对照组之间共筛选出差异倍数绝对值>2且P<0.05的差异基因512个,其中上调基因247个,下调基因265个。差异基因信息的Ingenuity路径分析结果证实,干扰素信号和肝X受体/视网膜X受体活化通路显著激活,真核起始因子2和核因子κB信号通路则被抑制。预测上游调控因子中IFNA2为强烈激活,核因子κB(复合物)被抑制。综合以上生物信息学分析结果,推测黑素瘤细胞UBE2S基因可通过调节IFITM1、STAT1、ISG15和TNFRSF11B基因的表达发挥功能。免疫印迹显示,A375细胞UBE2S基因敲降前后,IFITM1蛋白均未表达,敲降后ISG15蛋白表达上调19.94倍,STAT1蛋白表达上调1.47倍,TNFRSF11B蛋白表达下调79.1%。结论UBE2S可能通过与STAT1、ISG15和TNFRSF11B的相互作用,共同调控黑素瘤肿瘤细胞生物学行为。 展开更多
关键词 泛素缀合酶类 痣和黑素瘤 寡核苷酸序列分析 STAT1转录因子 泛素结合酶2S ISG15基因 tnfrsf11b基因
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Oxysophoridine Suppresses the Growth of Hepatocellular Carcinoma in Mice:In Vivo and cDNA Microarray Studies 被引量:2
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作者 姚小青 张韵慧 +1 位作者 龙伟 刘培勋 《Chinese Journal of Integrative Medicine》 SCIE CAS 2012年第3期209-213,共5页
Objective:To observe the in vivo effects of oxysophoridine on hepatocellular carcinoma in mice and to study the related mechanisms.Methods:C57BL mice were inoculated with mouse hepatoma H22 cells subcutaneously,then... Objective:To observe the in vivo effects of oxysophoridine on hepatocellular carcinoma in mice and to study the related mechanisms.Methods:C57BL mice were inoculated with mouse hepatoma H22 cells subcutaneously,then divided into 5 groups(14 per group),and treated with oxysophoridine(50,100,or 150 mg/kg) or cisplatin(4 mg/kg) for 10 days.Inhibitory rate of tumor,body weight gain,and influence indices on internal organs(liver,spleen and thymus) were evaluated.The differentially expressed genes between the oxysophoridine-treated group,and the control group were analyzed using cDNA microarray and quantitative real-time PCR(qRT-PCR) experiments.Results:Compared with the tumor weight of the control group(2.75±0.66 g),oxysophoridine significantly suppressed hepatocellular carcinoma growth in mice(P0.01),with 0.82±0.36 g,0.57±0.22 g,and 1.22±0.67 g for the tumor weight in the low,moderate,and high dose treatment group, respectively.The moderate dose led to the highest inhibitory rate,79.3%.Observation of body weight gain and influence on three organs showed that compared with cisplatin,oxysophoridine produced fewer side effects in vivo.cDNA microarray and qRT-PCR showed that the most significant differentially expressed genes in the tumor samples of oxysophoridine-treated mice were mostly involved in regulating apoptosis,with the Tnfrsf11b (osteoprotegerin) gene being the most significantly affected.Conclusion:Oxysophoridine was a promising compound for developing drugs against hepatocellular carcinoma,and its anti-hepatoma effect was probably related to osteoprotegerin activation. 展开更多
关键词 OXYSOPHORIDINE hepatocellular carcinoma cDNA microarray QRT-PCR tnfrsf11b OSTEOPROTEGERIN
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