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番茄SYTA的克隆及表达分析
被引量:
7
1
作者
潘琪
刘旭旭
+6 位作者
彭浩然
蒲运丹
张永至
叶思涵
吴根土
青玲
孙现超
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第15期2936-2945,共10页
【目的】克隆获得番茄 SYTA (Solanum lycopersicum SYTA,S.l SYTA),分析其基因序列生物信息学特征和预测蛋白的结构特征,明确S.l SYTA亚细胞定位和组织表达,并分析其在绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)标记的烟草花叶病...
【目的】克隆获得番茄 SYTA (Solanum lycopersicum SYTA,S.l SYTA),分析其基因序列生物信息学特征和预测蛋白的结构特征,明确S.l SYTA亚细胞定位和组织表达,并分析其在绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)标记的烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染下的表达变化及其对TMV移动的影响,为明确S.l SYTA在植物病毒侵染致病过程中的作用提供理论依据。【方法】根据番茄基因组含有的SYTA同源基因序列,利用Primer Premier 5.0软件设计克隆引物,采用RT-PCR技术克隆S.l SYTA全长序列;应用生物信息学方法分析该基因的序列特征;使用MEGA 7.0对S.l SYTA蛋白序列及其同源序列进行多序列比对,并构建同源物种间系统进化树;通过与GFP蛋白融合进行亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测番茄各部位S.l SYTA的表达量以及在TMV胁迫的番茄中S.l SYTA的表达变化;构建植物瞬时表达载体p CV-SYTA-m GFP,通过农杆菌介导在本氏烟草中瞬时表达,TMV-GFP攻毒,利用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA时TMV-GFP的积累和移动情况。【结果】克隆得到1 620 bp的S.l SYTA基因开放阅读框全长,序列比对及生物信息学分析表明,其编码的氨基酸序列具有SYTs家族的典型特征,含有N端的跨膜区、胞间连接区和C端的两个C2结构域;多序列对比及系统进化树分析发现,与茄科林生烟草、绒毛状烟草等植物亲缘关系较近,与黄瓜较远;亚细胞定位显示S.l SYTA定位于细胞质膜。在番茄的根、茎和叶中S.l SYTA的表达量从高到低依次为根>叶>茎;TMV-GFP侵染番茄导致其S.l SYTA表达量在接种后第1天显著上调,在第7天降至正常水平。在S.l SYTA瞬时表达的本氏烟叶片部位接种TMV-GFP,TMV-GFP在接种第5天时已经到达新叶,而接种部位仅表达空载体对照的本氏烟新叶中未观察到TMV-GFP,且接种第5天时TMV-GFP在接种叶和新叶中的积累量均明显高于其在空载体对照处理的叶片。【结论】获得的S.l SYTA具有SYTs家族的典型特征。S.l SYTA定位于细胞质膜,S.l SYTA在番茄根中表达量最高。在TMV-GFP胁迫下,番茄中S.l SYTA表达呈现先上升后下降至正常水平。在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA有利于TMV-GFP侵染初期的积累和移动。
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关键词
番茄
S.l
SYTA
克隆
表达分析
tmv-gfp
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职称材料
蛋白激发子PeaT1与井冈霉素混合使用诱导烟草对TMV抗性的研究
2
作者
彭智超
仝赞华
邱德文
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期92-100,共9页
烟草病毒可侵染危害烟草、番茄、辣椒和土豆等多种作物导致病毒病发生,是生产上难以防治的病害。为了探索蛋白激发子Pea T1与井冈霉素混合使用对烟草病毒病防治的最佳混配比例,本研究选用3-7片真叶的本生烟(Nicotiana benthamiana cv.Hu...
烟草病毒可侵染危害烟草、番茄、辣椒和土豆等多种作物导致病毒病发生,是生产上难以防治的病害。为了探索蛋白激发子Pea T1与井冈霉素混合使用对烟草病毒病防治的最佳混配比例,本研究选用3-7片真叶的本生烟(Nicotiana benthamiana cv.Huangmiaoyu),分别喷施清水、井冈霉素、蛋白激发子Pea T1及蛋白激发子Pea T1-井冈霉素复合制剂,采用摩擦接种的方式接种TMV-GFP病毒,在紫外光下观察病毒的侵染情况。结果表明,喷施了井冈霉素和蛋白激发子复合制剂的本生烟对TMV的抗性较单剂具有增效作用,其中蛋白激发子Pea T1-井冈霉素按3:4混配的性价比最高,共毒系数达到157.64,相对防效为73.39%。这说明井冈霉素和蛋白激发子Pea T1都能使烟草产生对TMV的系统获得抗性,而其复合制剂更有着叠加效应。
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关键词
蛋白激发子
井冈霉素
诱导抗性
tmv-gfp
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职称材料
一个特殊的顺式发夹核酶对感染烟草原生质体的影响
3
作者
王慧
林志新
+3 位作者
孙庆申
吴立刚
范济华
许政
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期810-814,818,共6页
研究一个烟草花叶病毒(TMV)cDNA3′末端被特异切割的发夹核酶对感染原生质体的作用.选用一个外源基因绿色水母荧光蛋白(GFPuv)作为报道基因,取代了大部分的CP编码区域,以研究在烟草原生质体中发夹核酶对TMV载体的复制,通过GFP的表达来...
研究一个烟草花叶病毒(TMV)cDNA3′末端被特异切割的发夹核酶对感染原生质体的作用.选用一个外源基因绿色水母荧光蛋白(GFPuv)作为报道基因,取代了大部分的CP编码区域,以研究在烟草原生质体中发夹核酶对TMV载体的复制,通过GFP的表达来确定表达量.顺式发夹核酶对TMV载体感染效率的影响通过体外转录来观察.TMVGFPRIB体外转录感染原生质体的效率比与其不含该核酶的对应物的感染效率高3~5倍.Northern杂交结果表明,包括核酶在内的3′末端非病毒序列在体外转录反应开始后就被顺式发夹核酶切除了.当直接用载体DNApST-MVGFPRIB感染原生质体时,感染原生质体的数量比与之相对应的pSTMVGFPNOS感染原生质体数多50%~80%.
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关键词
烟草花叶病毒
发夹核酶
绿色水母荧光蛋白
烟草原生质体
转染
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职称材料
题名
番茄SYTA的克隆及表达分析
被引量:
7
1
作者
潘琪
刘旭旭
彭浩然
蒲运丹
张永至
叶思涵
吴根土
青玲
孙现超
机构
西南大学植物保护学院
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第15期2936-2945,共10页
基金
国家自然科学基金(31670148)
重庆市社会事业与民生保障创新专项(cstc2015shms-ztzx80012)
+1 种基金
中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2016A009
2362015xk04)
文摘
【目的】克隆获得番茄 SYTA (Solanum lycopersicum SYTA,S.l SYTA),分析其基因序列生物信息学特征和预测蛋白的结构特征,明确S.l SYTA亚细胞定位和组织表达,并分析其在绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)标记的烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染下的表达变化及其对TMV移动的影响,为明确S.l SYTA在植物病毒侵染致病过程中的作用提供理论依据。【方法】根据番茄基因组含有的SYTA同源基因序列,利用Primer Premier 5.0软件设计克隆引物,采用RT-PCR技术克隆S.l SYTA全长序列;应用生物信息学方法分析该基因的序列特征;使用MEGA 7.0对S.l SYTA蛋白序列及其同源序列进行多序列比对,并构建同源物种间系统进化树;通过与GFP蛋白融合进行亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测番茄各部位S.l SYTA的表达量以及在TMV胁迫的番茄中S.l SYTA的表达变化;构建植物瞬时表达载体p CV-SYTA-m GFP,通过农杆菌介导在本氏烟草中瞬时表达,TMV-GFP攻毒,利用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA时TMV-GFP的积累和移动情况。【结果】克隆得到1 620 bp的S.l SYTA基因开放阅读框全长,序列比对及生物信息学分析表明,其编码的氨基酸序列具有SYTs家族的典型特征,含有N端的跨膜区、胞间连接区和C端的两个C2结构域;多序列对比及系统进化树分析发现,与茄科林生烟草、绒毛状烟草等植物亲缘关系较近,与黄瓜较远;亚细胞定位显示S.l SYTA定位于细胞质膜。在番茄的根、茎和叶中S.l SYTA的表达量从高到低依次为根>叶>茎;TMV-GFP侵染番茄导致其S.l SYTA表达量在接种后第1天显著上调,在第7天降至正常水平。在S.l SYTA瞬时表达的本氏烟叶片部位接种TMV-GFP,TMV-GFP在接种第5天时已经到达新叶,而接种部位仅表达空载体对照的本氏烟新叶中未观察到TMV-GFP,且接种第5天时TMV-GFP在接种叶和新叶中的积累量均明显高于其在空载体对照处理的叶片。【结论】获得的S.l SYTA具有SYTs家族的典型特征。S.l SYTA定位于细胞质膜,S.l SYTA在番茄根中表达量最高。在TMV-GFP胁迫下,番茄中S.l SYTA表达呈现先上升后下降至正常水平。在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA有利于TMV-GFP侵染初期的积累和移动。
关键词
番茄
S.l
SYTA
克隆
表达分析
tmv-gfp
Keywords
Solanum lycopersicum
S.l SYTA
gene cloning
expression and analysis
tmv-gfp
分类号
S436.412 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
蛋白激发子PeaT1与井冈霉素混合使用诱导烟草对TMV抗性的研究
2
作者
彭智超
仝赞华
邱德文
机构
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期92-100,共9页
基金
北京市科技计划项目(D151100003915003)
文摘
烟草病毒可侵染危害烟草、番茄、辣椒和土豆等多种作物导致病毒病发生,是生产上难以防治的病害。为了探索蛋白激发子Pea T1与井冈霉素混合使用对烟草病毒病防治的最佳混配比例,本研究选用3-7片真叶的本生烟(Nicotiana benthamiana cv.Huangmiaoyu),分别喷施清水、井冈霉素、蛋白激发子Pea T1及蛋白激发子Pea T1-井冈霉素复合制剂,采用摩擦接种的方式接种TMV-GFP病毒,在紫外光下观察病毒的侵染情况。结果表明,喷施了井冈霉素和蛋白激发子复合制剂的本生烟对TMV的抗性较单剂具有增效作用,其中蛋白激发子Pea T1-井冈霉素按3:4混配的性价比最高,共毒系数达到157.64,相对防效为73.39%。这说明井冈霉素和蛋白激发子Pea T1都能使烟草产生对TMV的系统获得抗性,而其复合制剂更有着叠加效应。
关键词
蛋白激发子
井冈霉素
诱导抗性
tmv-gfp
Keywords
protein elicitor
Jinggangmycin
induced resistance
tmv-gfp
分类号
S435.72 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
一个特殊的顺式发夹核酶对感染烟草原生质体的影响
3
作者
王慧
林志新
孙庆申
吴立刚
范济华
许政
机构
上海交通大学生命科学技术学院
纽约大学医学院
中国科学院植物生理生态研究所
出处
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期810-814,818,共6页
文摘
研究一个烟草花叶病毒(TMV)cDNA3′末端被特异切割的发夹核酶对感染原生质体的作用.选用一个外源基因绿色水母荧光蛋白(GFPuv)作为报道基因,取代了大部分的CP编码区域,以研究在烟草原生质体中发夹核酶对TMV载体的复制,通过GFP的表达来确定表达量.顺式发夹核酶对TMV载体感染效率的影响通过体外转录来观察.TMVGFPRIB体外转录感染原生质体的效率比与其不含该核酶的对应物的感染效率高3~5倍.Northern杂交结果表明,包括核酶在内的3′末端非病毒序列在体外转录反应开始后就被顺式发夹核酶切除了.当直接用载体DNApST-MVGFPRIB感染原生质体时,感染原生质体的数量比与之相对应的pSTMVGFPNOS感染原生质体数多50%~80%.
关键词
烟草花叶病毒
发夹核酶
绿色水母荧光蛋白
烟草原生质体
转染
Keywords
tobacco mosaic virus ( TMV)
hairpin ribozyme
green fluorescent protein (GFP)
tobacco protoplast
transfection
分类号
Q557.9 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄SYTA的克隆及表达分析
潘琪
刘旭旭
彭浩然
蒲运丹
张永至
叶思涵
吴根土
青玲
孙现超
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
蛋白激发子PeaT1与井冈霉素混合使用诱导烟草对TMV抗性的研究
彭智超
仝赞华
邱德文
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
在线阅读
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职称材料
3
一个特殊的顺式发夹核酶对感染烟草原生质体的影响
王慧
林志新
孙庆申
吴立刚
范济华
许政
《上海交通大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
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职称材料
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