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荣昌猪胸腺素β15A(TMSB15A)cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析 被引量：2
1
作者 龙熙 蓝静 +2 位作者 郭宗义 王金勇 赵久刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1602-1610,共9页
旨在克隆荣昌猪TMSB15A基因全长,检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征,并对其基因的结构与功能进行分析。本研究利用RCAE(Rapid-amplification of cDNA ends)-PCR以及RT-PCR(Real-time quantitative PCR)技术克隆荣昌猪TMSB15A基因mRN... 旨在克隆荣昌猪TMSB15A基因全长,检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征,并对其基因的结构与功能进行分析。本研究利用RCAE(Rapid-amplification of cDNA ends)-PCR以及RT-PCR(Real-time quantitative PCR)技术克隆荣昌猪TMSB15A基因mRNA全长序列以及检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征。结果表明,荣昌猪TMSB15A基因全长654bp,其中CDS区长138bp,编码45个氨基酸,5′UTR和3′UTR分别长86和430bp。生物信息学分析表明,TMSB15A蛋白的理论分子量为5.2ku,有10个带负电的氨基酸,9个带正电的氨基酸,蛋白理论等电点为5.3;预测TMSB15A蛋白无疏水区、信号肽结构、跨膜结构域,其主要在细胞质中发挥生理功能;TMSB15A蛋白的三级结构由α-螺旋和无规则卷曲构成。TMSB15A基因编码的氨基酸序列与人、长臂猿以及黑猩猩的同源性最高,为97.8%,其次是骆驼和兔,为93.3%,与马的同源性最低,为11.1%。TMSB15A在荣昌猪免疫相关组织脾和胸腺中表达量最高(P<0.01),在淋巴结和肺中呈中等丰度表达,在心、肝、肾和肌肉中表达量较低。本试验为研究TMSB15A基因的功能奠定了基础,也为荣昌猪抗病育种研究提供了理论支撑。 展开更多
关键词 昌猪 tmsb15a RACE 基因克隆 序列分析 组织表达
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候选生物标志物TMSB15A的鉴定及其在乳腺癌中的预后价值
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作者 王颜 李健 《数据挖掘》 2022年第1期1-7,共7页
目的:乳腺癌(BC)是女最常见的恶性肿瘤。胸腺素β 15A (TMSB15A)在多个癌症中起重要作用。本研究旨在分析TMSB15A mRNA表达在BC中的表达和预后价值。方法:我们利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型组织表达(GTEx)数据分析TMSB15A mRN... 目的:乳腺癌(BC)是女最常见的恶性肿瘤。胸腺素β 15A (TMSB15A)在多个癌症中起重要作用。本研究旨在分析TMSB15A mRNA表达在BC中的表达和预后价值。方法:我们利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型组织表达(GTEx)数据分析TMSB15A mRNA的表达。Kaplan-Meier分析用于确定TMSB15A mRNA表达在BC中的预后价值。利用TCGA数据进行基因集富集分析(GSEA)。结果:我们的结果显示TMSB15A mRNA在BC组织中的表达显著高于正常组织。TMSB15A高表达与BC的分子分型中的3个主要分子检测指标(ER, PR, HER2)有关,并且在Basal (三阴性)亚型中表达量最高。GSEA分析表明TMSB15A高表达患者中主要富集在细胞周期,DNA复制,p53通路和多个代谢通路等肿瘤增殖相关通路。结论:总之,我们的结果表明TMSB15A是一种有前途的BC预后生物标志物。 展开更多
关键词 tmsb15a TCGA 乳腺癌 预后
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