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翘嘴鲌(Culter alburnus)TMEM-57基因的克隆、组织表达和单核苷酸多态性分析
1
作者
祁鹏志
郭宝英
+3 位作者
谢从新
吴常文
陆诗敏
段友健
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1196-1201,共6页
采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了翘嘴鲌TMEM-57蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为2822bp,其中5′-UTR区93bp,3′-UTR区731bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1998bp,编码66...
采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了翘嘴鲌TMEM-57蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为2822bp,其中5′-UTR区93bp,3′-UTR区731bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1998bp,编码665个氨基酸。NJ法系统进化分析将同科或属中TMEM-57基因分成一个分支,表现出种属间的高度保守性。利用荧光定量PCR(qPCR)技术检测了不同组织的表达量,发现在卵巢中表达量最高,其次为心脏和脑。用直接测序法对TMEM-57基因部分区段单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,寻找到11个新的SNP位点。
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关键词
翘嘴鲌
tmem-57
荧光定量PCR
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
翘嘴鲌(Culter alburnus)TMEM-57基因的克隆、组织表达和单核苷酸多态性分析
1
作者
祁鹏志
郭宝英
谢从新
吴常文
陆诗敏
段友健
机构
华中农业大学水产学院
浙江海洋学院国家海洋设施养殖工程技术研究中心
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1196-1201,共6页
基金
国家科技支撑计划,2012BAD25B06号
文摘
采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术首次克隆了翘嘴鲌TMEM-57蛋白基因的cDNA全序列,该序列全长为2822bp,其中5′-UTR区93bp,3′-UTR区731bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1998bp,编码665个氨基酸。NJ法系统进化分析将同科或属中TMEM-57基因分成一个分支,表现出种属间的高度保守性。利用荧光定量PCR(qPCR)技术检测了不同组织的表达量,发现在卵巢中表达量最高,其次为心脏和脑。用直接测序法对TMEM-57基因部分区段单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,寻找到11个新的SNP位点。
关键词
翘嘴鲌
tmem-57
荧光定量PCR
单核苷酸多态性
Keywords
Culter alburnus,
tmem-57
, Real-time fluorescence quantitative PCR, Single nucleotide polymorphism
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
翘嘴鲌(Culter alburnus)TMEM-57基因的克隆、组织表达和单核苷酸多态性分析
祁鹏志
郭宝英
谢从新
吴常文
陆诗敏
段友健
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012
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