紫花苜蓿MsTIFY11基因克隆及表达分析

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作者 张岩 陈崎 +3 位作者 代蕊 霍晓伟 郭娜 张志强 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第11期71-78,共8页

【目的】克隆分析紫花苜蓿MsTIFY11基因的分子特征,并探讨干旱胁迫、茉莉酸(JA)和盐胁迫对其表达水平的影响,为进一步研究MsTIFY11基因调控苜蓿抗旱性和耐盐性提供参考。【方法】培育草原4号紫花苜蓿幼苗,在45 d时分为对照组及干旱、JA... 【目的】克隆分析紫花苜蓿MsTIFY11基因的分子特征,并探讨干旱胁迫、茉莉酸(JA)和盐胁迫对其表达水平的影响,为进一步研究MsTIFY11基因调控苜蓿抗旱性和耐盐性提供参考。【方法】培育草原4号紫花苜蓿幼苗,在45 d时分为对照组及干旱、JA和盐胁迫组,对照组定时补水,在结荚期采集根、茎、老叶、嫩叶、花、荚和种子样品,用于MsTIFY11组织表达特异性分析;干旱胁迫组不浇水,于处理0,2,4,8,12和24 h采集叶片样品;JA胁迫组在植株上喷洒100μmol/L茉莉酸甲酯液,在处理0,1,3,6和12 h采集叶片样品;盐胁迫处理组浇灌250 mmol/L NaCl液,在处理0,2,4,8,12和24 h采集叶片样品。PCR克隆MsTIFY11基因,采用生物信息学方法分析基因结构、蛋白质性质以及亚细胞定位。利用RT-qPCR检测不同组织及干旱、盐、JA胁迫下MsTIFY11基因的表达量。【结果】MsTIFY11基因编码区长721 bp,编码240个氨基酸残基,含有TIFY和CCT_2结构域。氨基酸序列分析表明,MsTIFY11蛋白为不稳定蛋白;同源序列比对和系统发育分析发现,紫花苜蓿与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)、红三叶(Trifolium pratense)、鹰嘴豆(Cicer arietinum)、豌豆(Pisum sativum)、白车轴草(Trifolium repens)和地三叶(Trifolium subterraneum)的亲缘关系较近。亚细胞定位预测结果显示,MsTIFY11位于细胞核。RT-qPCR分析发现,MsTIFY11基因在各个组织中均有表达,其中在根的表达量最高;在干旱和JA胁迫下苜蓿叶片中Ms-TIFY11的表达量显著升高,在盐胁迫下其表达量总体呈上升趋势。【结论】MsTIFY11基因的表达受干旱、盐和茉莉酸诱导。 展开更多

关键词 紫花苜蓿 tify11基因 组织表达模式 非生物胁迫

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紫花苜蓿MsTIFY77基因克隆及表达分析

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作者 张岩 陈崎 +3 位作者 代蕊 李建伟 边林 张志强 《草地学报》 北大核心 2025年第3期719-727,共9页

TIFY家族蛋白是一类在植物中广泛存在的转录因子,该家族蛋白含有一个高度保守的TIFY结构域,通过参与植物内部的多种信号途径,对植物的生长发育、逆境响应以及防御机制进行调节。本研究从‘草原4号’紫花苜蓿(MedicagosativaL.)中克隆得... TIFY家族蛋白是一类在植物中广泛存在的转录因子,该家族蛋白含有一个高度保守的TIFY结构域,通过参与植物内部的多种信号途径,对植物的生长发育、逆境响应以及防御机制进行调节。本研究从‘草原4号’紫花苜蓿(MedicagosativaL.)中克隆得到MsTIFY77基因并对其进行生物学信息分析以及表达模式分析,探究MsTIFY77基因在胁迫应答中的功能。结果发现,该基因全长1101 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)编码367个氨基酸,含有TIFY和CCT-2结构域。氨基酸序列分析表明MsTIFY77蛋白为不稳定蛋白,通过系统发育树分析表明紫花苜蓿MsTIFY77蛋白与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula),豌豆(Pisum sativum),红三叶(Trifolium pratense),毛苕子(Vicia villosa),鹰嘴豆(Cicer arietinum)和白车轴草(Trifolium repens)的TIFY蛋白亲缘关系较近。亚细胞预测MsTIFY77蛋白定位于细胞核。qRT-PCR结果显示,低温和干旱胁迫诱导该基因的表达,而脱落酸胁迫对该基因表达有抑制作用。研究结果为MsTIFY77基因的功能提供参考。 展开更多

关键词 紫花苜蓿 tify77基因 基因克隆 表达分析

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苦荞TIFY基因家族分析及FtJAZ8的抗立枯丝核病功能研究

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作者 刘培林 李世娟 +3 位作者 范昱 李伟 周美亮 邵美红 《核农学报》 北大核心 2025年第11期2351-2360,共10页

TIFY基因家族是植物特有的转录调控因子,广泛参与生长发育、激素信号传导及抗逆反应等过程,其中JAZ亚家族在茉莉酸(JA)信号通路中具有关键功能。为深入解析TIFY家族在苦荞(Fagopyrum tataricum)中的演化规律与功能作用,本研究整合苦荞... TIFY基因家族是植物特有的转录调控因子,广泛参与生长发育、激素信号传导及抗逆反应等过程,其中JAZ亚家族在茉莉酸(JA)信号通路中具有关键功能。为深入解析TIFY家族在苦荞(Fagopyrum tataricum)中的演化规律与功能作用,本研究整合苦荞的全基因组信息,系统鉴定出17个TIFY基因成员,结合系统发育分析、保守结构域、顺式作用元件、染色体定位及共线性分析,揭示该家族成员在亚家族分布、结构特征及表达调控上的多样性和保守性。通过全基因组关联分析(GWAS)筛选出与立枯丝核病抗性显著相关的FtJAZ8基因,构建其过表达载体并转化拟南芥及苦荞毛状根,开展离体接菌试验和生理指标检测。结果表明,FtJAZ8的过表达植株在立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)侵染下表现出更低的病情指数和丙二醛(MDA)含量,且叶片二氨基联苯胺(DAB)染色与抗菌响应基因PR1表达水平均显示其防御能力增强。毛状根体系中过表达FtJAZ8亦显著缓解了病原侵染引起的细胞损伤,进一步验证其在调控植物抗病性中的关键作用。本研究不仅构建了苦荞TIFY基因家族的系统框架,明确了FtJAZ8的功能机制,还为荞麦抗病分子育种提供了理论基础和候选基因资源。 展开更多

关键词 苦荞 tify基因家族 FtJAZ8 立枯丝核菌(Rhizoctonia solani) 抗病

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观赏海棠“阿达克”MbTIFY基因家族鉴定与表达分析

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作者 邹姬垚 沈文欣 +6 位作者 李欣天 陈佳辉 桂许顺 陈子怡 荆亚楠 王子华 张国君 《河北科技师范学院学报》 2025年第3期31-39,共9页

TIFY转录因子在调节植物多种胁迫及防御反应过程中发挥着重要作用,鉴定海棠TIFY基因家族成员,分析家族成员在抗蚜过程中的表达模式,为海棠TIFY家族功能研究和育种应用奠定基础并为挖掘海棠抗蚜基因提供理论依据。本研究以苹果属山丁子... TIFY转录因子在调节植物多种胁迫及防御反应过程中发挥着重要作用,鉴定海棠TIFY基因家族成员,分析家族成员在抗蚜过程中的表达模式,为海棠TIFY家族功能研究和育种应用奠定基础并为挖掘海棠抗蚜基因提供理论依据。本研究以苹果属山丁子基因组为基础,对TIFY蛋白家族进行鉴定,分析其蛋白理化性质、系统进化关系、染色体定位、保守基序、保守结构域及基因表达模式。结果表明,在山丁子基因组中共鉴定到31个TIFY蛋白,通过构建进化树将其分为JAZ、PPD、ZML和TIFY等4个亚家族:20个JAZ蛋白、7个PPD蛋白、2个ZML蛋白以及2个TIFY蛋白。染色体定位分析表明,31个TIFY蛋白分布在26条染色体上。氨基酸序列分析表明,所有MbTIFY基因均含有一段相同的TIFY基序,且同一个亚家族内的成员表现出相似的基序和保守结构域。顺式作用元件分析表明,MbTIFY启动子中激素响应元件较多,且参与JA、茉莉酸甲酯、水杨酸、脱落酸、生长素调控反应。qRT-PCR分析表明,31个MbTIFY基因在观赏海棠蚜害高峰期表达水平有显著差异,其中,MbTIFY9基因和MbTIFY12基因在蚜害高峰期具有较高的表达水平,表明它们可能作为潜在的抗蚜基因在观赏海棠叶片抗蚜途径中发挥作用。 展开更多

关键词 观赏海棠 基因家族 tify:植物抗蚜

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香蕉MaTIFY1转录因子特性及其在成熟过程中基因表达分析 被引量：11

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作者 罗冬兰 巴良杰 +3 位作者 陈建业 陆旺金 单伟 邝健飞 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期43-52,共10页

从香蕉果实中分离获得1个TIFY亚族的转录因子基因,命名为MaTIFY1。该基因含有一个681 bp的ORF,编码一条长度为227 aa,分子量为24.97 kD,等电点为7.85的氨基酸多肽链。MaTIFY1定位于细胞核,并且具有转录激活活性。荧光定量PCR分析表明,Ma... 从香蕉果实中分离获得1个TIFY亚族的转录因子基因,命名为MaTIFY1。该基因含有一个681 bp的ORF,编码一条长度为227 aa,分子量为24.97 kD,等电点为7.85的氨基酸多肽链。MaTIFY1定位于细胞核,并且具有转录激活活性。荧光定量PCR分析表明,MaTIFY1随着香蕉果实成熟进程表达明显增强,并且外源丙烯处理可诱导其表达。此外,MaTIFY1启动子活性受乙烯利诱导激活,进一步表明MaTIFY1可能参与香蕉果实成熟的调控。原核表达并纯化了MaTIFY1重组蛋白。 展开更多

关键词 香蕉 tify 转录因子 果实成熟 基因表达

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番茄与马铃薯TIFY家族基因的鉴定与比较分析 被引量：7

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作者 胡利宗 王俊生 +3 位作者 赵锦慧 王秋霞 韩娇月 纪秀娥 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期1192-1203,共12页

TIFY蛋白是一类植物特有的转录因子,在植物的生长发育、信号传导以及胁迫反应中起重要作用。尽管一些模式植物TIFY家族基因已经被鉴定,但在茄科植物中有关TIFY家族基因的研究却很少。本研究利用生物信息学手段分别从番茄与马铃薯中挖掘... TIFY蛋白是一类植物特有的转录因子,在植物的生长发育、信号传导以及胁迫反应中起重要作用。尽管一些模式植物TIFY家族基因已经被鉴定,但在茄科植物中有关TIFY家族基因的研究却很少。本研究利用生物信息学手段分别从番茄与马铃薯中挖掘到21个Sl TIFY和21个St TIFY基因,并系统性分析这些TIFY基因的序列、表达以及进化特性。染色体定位与扩增模式分析显示,番茄和马铃薯的TIFY基因散落分布在不同染色体上,家族成员扩增主要由串联和片段重复产生。序列分析表明:番茄TIFY基因结构被分为12种,马铃薯TIFY基因结构被分为8种;番茄和马铃薯TIFY蛋白共享了保守基序1,其它保守基序显示不同程度基因特异性,保守基序组成模式表现出高度多样化。系统进化分析显示,番茄和马铃薯TIFY蛋白被分为7大类群,同类群内结构与序列相似性较高。选择压力检测表明,番茄的10对同源基因和马铃薯的19对同源基因均受到负选择作用。表达谱结果表明,番茄和马铃薯TIFY基因的表达呈现较高的多样性,这可能与多样化的功能相关。这些研究结果为功能解析番茄和马铃薯TIFY基因提供理论指导。 展开更多

关键词 番茄 tify家族 基因 马铃薯 进化

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苹果TIFY家族基因鉴定及其在虫害胁迫下的表达分析 被引量：6

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作者 梅闯 张小燕 +6 位作者 闫鹏 艾沙江·买买提 冯贝贝 马凯 韩立群 董连新 王继勋 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期233-242,共10页

利用生物信息学方法在苹果全基因组中鉴定了TIFY转录因子家族基因,对基因结构、蛋白保守基序和进化关系进行了分析,同时基于新疆野苹果(Malus sieversii)转录组数据分析,明确了苹果TIFY家族基因在虫害胁迫条件下的差异表达情况。共鉴定... 利用生物信息学方法在苹果全基因组中鉴定了TIFY转录因子家族基因,对基因结构、蛋白保守基序和进化关系进行了分析,同时基于新疆野苹果(Malus sieversii)转录组数据分析,明确了苹果TIFY家族基因在虫害胁迫条件下的差异表达情况。共鉴定到了16个苹果TIFY基因,其蛋白质大小介于209~449 aa之间。16个TIFY基因分布于苹果8条染色体中,所有的MdTIFY蛋白都具有保守的TIFY结构域。其中8个苹果MdTIFY与新疆野苹果转录组测序拼接转录本对应,这些基因均含有保守的TIFY功能域,多物种进化分析表明该类蛋白可聚类成7个组。7个TIFY基因的表达量在不同处理间表现出显著差异,虫害侵染后,抗虫株系中MsTIFY10B-a表达量升高34倍,MsTIFY9-c上升5.2倍。同时抗虫株系在自然条件下茉莉酸—异亮氨酸含量显著高于敏感株系。新疆野苹果中重要抗虫响应基因MsTIFY10B-a和MsTIFY9-c位于预测关联网络节点中心位置,使它们在调节植物对生物胁迫的响应中发挥重要作用。 展开更多

关键词 新疆野苹果 基因家族 tify 表达分析 茉莉素

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江西铅山红芽芋TIFY 9基因克隆与功能分析

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作者 赵红 邓雨晴 +7 位作者 曾淑琴 曾荧 张彩霞 张慧博 张丽佳 张玲 张妮 尹明华 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第5期41-49,共9页

为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定... 为了深入探究江西铅山红芽芋TIFY 9基因的功能,通过江西铅山红芽芋试管苗转录组数据库筛选到江西铅山红芽芋TIFY 9基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆该基因,并采用生物信息学方法、转基因瞬时表达和实时定量PCR进行序列分析、亚细胞定位、器官表达分析和功能分析。结果表明:江西铅山红芽芋TIFY 9基因cDNA总长度为522 bp,G+C含量为58.62%;由174个氨基酸组成,分子量19073.87 u,等电点9.30,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(31.61%)、β-片层(12.64%)、无规则卷曲(55.75%)构成,三级结构为单体;主要存在细胞核中;在进化上与Colocasia esculenta(芋)的亲缘关系较近,与Colocasia esculenta(芋)hypothetical protein Taro_030839(MQL98131.1)在进化上具有最高的亲缘关系。江西铅山红芽芋TIFY 9蛋白具有典型植物TIFY 9的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种同源性高达100%,在进化上高度保守。烟草叶片亚细胞定位分析表明,TIFY 9定位于细胞质和细胞核中。实时定量PCR结果显示,TIFY 9基因在江西铅山红芽芋中的表达存在器官特异性,在江西铅山红芽芋不同组织部位均有表达,且在叶中和球茎膨大初期表达量最高。在烟草花叶病毒胁迫下,与TIFY 9非转基因烟草相比较,TIFY 9转基因烟草的净光合速率(P_(n))、气孔导度(G_(s))、蒸腾速率(T_(r))、最大光化学效率(F_(v)/F_(m))、实际光化学量子效率(Φ_(PSⅡ))、光化学淬灭系数(q_(P))及电子传递效率(ETR)显著增加,而非光化学淬灭系数(NPQ)显著下降,表明TIFY 9基因响应病毒胁迫应答可能是依赖光合作用的提高。 展开更多

关键词 江西铅山红芽芋 tify 9基因 基因克隆 功能分析 转基因表达

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茶树CsTIFY家族全基因组鉴定及非生物胁迫和激素处理中主要基因表达分析 被引量：8

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作者 谢思艺 周承哲 +5 位作者 朱晨 詹冬梅 陈兰 吴祖春 赖钟雄 郭玉琼 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期100-116,共17页

TIFY转录因子是陆地植物特有的转录因子,按照结构域特征共分为4个亚家族TIFY、PPD、JAZ、ZML,调控植物的生长发育过程。以茶树TIFY转录因子为研究对象,从茶树基因组数据库中共鉴定了22个CsTIFY转录因子家族成员,都包含了TIFY结构域。基... TIFY转录因子是陆地植物特有的转录因子,按照结构域特征共分为4个亚家族TIFY、PPD、JAZ、ZML,调控植物的生长发育过程。以茶树TIFY转录因子为研究对象,从茶树基因组数据库中共鉴定了22个CsTIFY转录因子家族成员,都包含了TIFY结构域。基因结构分析发现,大部分CsTIFY家族成员外显子数在5到12之间,同一亚家族所含Motif和外显子数相似。系统进化树表明,6个物种122个TIFY家族基因分为4个组,其中茶树与葡萄和杨树亲缘关系更近。启动子顺式作用元件分析发现CsTIFY家族含有大量响应SA、ABA、低温和干旱等的元件。亚细胞定位试验结果表明CsTIFY1、CsJAZ1和CsJAZ5定位于细胞核。不同茶树品种的组织表达量分析发现,大部分CsTIFY在成熟叶、根和果实中相对表达量较高。在外源ABA、SA和MeJA处理下,大部分CsHAZ上调表达,而CsZML的表达量下降;低温和干旱处理下,CsZML1表达量都极显著上升。 展开更多

关键词 茶树 tify转录因子 全基因组鉴定 ABA SA MEJA 非生物胁迫 亚细胞定位

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中药火麻仁基原植物大麻的TIFY基因家族鉴定及功能分析 被引量：12

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作者 温东 王梦月 +3 位作者 米要磊 马伟 孙伟 师玉华 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第24期134-143,共10页

目的:从全基因组层面对大麻(Cannabis sativa)TIFY基因家族进行鉴定与功能分析,为解析大麻TIFY家族基因功能及其对大麻素等次生代谢产物生物合成的调控机理奠定基础。方法:采用已有大麻基因组数据,通过NCBI,PlantTFDB,MEME及TBtools等... 目的:从全基因组层面对大麻(Cannabis sativa)TIFY基因家族进行鉴定与功能分析,为解析大麻TIFY家族基因功能及其对大麻素等次生代谢产物生物合成的调控机理奠定基础。方法:采用已有大麻基因组数据,通过NCBI,PlantTFDB,MEME及TBtools等生物信息学分析工具,鉴定大麻中的TIFY家族基因,并对其编码蛋白的理化性质、系统进化、基因结构、染色体定位及组织差异表达模式等进行分析和可视化作图。结果:该研究共鉴定到大麻TIFY家族基因成员14个(CsTIFY1~CsTIFY14),分属于TIFY,JAZ,ZML和PPD共4个亚家族,其核酸序列长度为365~1 369 bp,编码氨基酸长度为118~442 aa,等电点为4.64~9.96。14个CsTIFYs不均匀的分布在8条染色体上,亚细胞定位预测其蛋白均定位细胞核中。CsTIFYs基因的启动子区具有多种非生物胁迫响应的顺式作用元件,可参与植物的不同生长发育和非生物胁迫调控。转录组表达热图分析表明,CsTIFYs在不同大麻品种的雌花及同一品种的花、苞片、茎、叶中均存在表达差异。结论:该研究从全基因组水平鉴定到大麻CsTIFY家族转录因子14个,并对其结构特点和表达模式进行研究,预测大麻CsTIFYs可能在大麻的JA信号转导通路、非生物胁迫及大麻素生物合成中发挥重要调控作用,将对大麻中TIFY家族的基因功能研究以及大麻优质品种选育提供科学参考。 展开更多

关键词 生物信息学 大麻 tify基因家族 成员鉴定 功能分析

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杜仲TIFY转录因子鉴定与表达分析 被引量：11

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作者 刘俊 陈玉龙 +1 位作者 刘燕 司富春 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第19期165-174,共10页

目的:从全基因组水平对杜仲(Eucommia ulmoides)TIFY基因家族进行鉴定与表达分析,以期为EuTIFYs基因功能深入研究奠定基础。方法:以杜仲基因组数据库为基础,通过美国国立生物技术信息中心(NCBI),MEME,PlantCare,白质分析专家系统(ExPASy... 目的:从全基因组水平对杜仲(Eucommia ulmoides)TIFY基因家族进行鉴定与表达分析,以期为EuTIFYs基因功能深入研究奠定基础。方法:以杜仲基因组数据库为基础,通过美国国立生物技术信息中心(NCBI),MEME,PlantCare,白质分析专家系统(ExPASy)及TBtools等生物信息学分析软件,对杜仲TIFY基因家族进行鉴定,系统分析该基因家族的理化性质、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及其在叶片发育及杜仲胶形成中的表达模式。结果:该研究从杜仲基因组中共鉴定到14个EuTIFYs(EuTIFY1~EuTIFY14),氨基酸数目介于102~357,理论等电点分布在4.99~10.06,相对分子质量区域为10.8~39.14 kDa,亚细胞定位预测在细胞核中,均为亲水性蛋白,14个EuTIFYs分布在13条染色体上。系统进化分为TIFY,JAZ,ZML和PPD 4个亚家族,分别包含3个,4个,5个和2个EuTIFYs蛋白。EuTIFYs启动子区域含有多种光周期及非生物胁迫响应元件,参与植物杜仲生长发育和非生物胁迫。表达模式分析显示,EuTIFYs在杜仲叶片不同发育时期存在表达差异,大部分基因在叶片发育的早期阶段表达量较高,正调控杜仲胶的形成,EuTIFYs蛋白间存在多种互作关系。结论:该研究从杜仲全基因组水平鉴定到14个EuTIFYs,对其结构特点和表达模式进行全面的生物信息学分析,为进一步研究杜仲TIFYs基因功能提供参考。 展开更多

关键词 杜仲 tify转录因子 系统进化 表达分析

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柑桔TIFY基因结构特征及响应低温表达分析 被引量：7

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作者 张沪 肖翠 +5 位作者 王贵元 廖晶晶 仝铸 何秀娟 邱文明 孙中海 《中国南方果树》 北大核心 2020年第2期34-39,共6页

TIFY基因家族是一类包含TIFY结构域的植物特有转录因子,与植物的生长发育密切相关,且在非生物逆境响应中起着重要作用。"龟井2501"是温州蜜柑品种"龟井"的一个抗寒芽变品种。基于华中农业大学甜橙基因组数据库(http... TIFY基因家族是一类包含TIFY结构域的植物特有转录因子,与植物的生长发育密切相关,且在非生物逆境响应中起着重要作用。"龟井2501"是温州蜜柑品种"龟井"的一个抗寒芽变品种。基于华中农业大学甜橙基因组数据库(http://citrus.hzau.edu.cn/orange/index.php)数据,分析了3个TIFY基因家族成员(Cs1g17210、Cs1g17220和Cs4g07130)的基因结构特征,并利用qRT-PCR分析了经低温诱导后这些基因在"龟井2501"植株叶片中的表达水平。结果表明,(1)3个TIFY基因含有TIFY结构域和Jas motif,属于JAZ蛋白亚家族基因;(2)3个TIFY基因的启动子含有LTR、DRE core、STRE、TC-rich repeats等逆境相关顺式作用元件以及MeJA(茉莉酸甲酯)响应元件、ABA(脱落酸)响应元件等激素响应相关元件,推测3个TIFY基因可以响应多种非生物胁迫;(3)Cs1g17220和Cs4g07130在果实中高表达,可能与果实发育相关;(4)在"龟井2501"中,3个TIFY基因受低温诱导在早期上调表达,且低温胁迫程度越大,其受诱导上调表达的倍数越高。本研究可为进一步解析TIFY基因家族在柑桔中的作用和功能提供重要线索。 展开更多

关键词 柑桔 低温逆境 tify 基因结构 表达分析

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植物转录因子TIFY家族蛋白结构和功能的研究进展 被引量：20

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作者 杨锐佳 张中保 吴忠义 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期121-128,共8页

TIFY蛋白是植物中一类特异性转录因子。根据其保守结构域的不同可分为4个亚家族:TIFY、JAZ、ZML和PPD。通过回顾近年研究成果,从TIFY蛋白的结构、分布及在调控植物的生长发育,响应各种逆境胁迫和不同激素信号等方面的生物学功能进行综述... TIFY蛋白是植物中一类特异性转录因子。根据其保守结构域的不同可分为4个亚家族:TIFY、JAZ、ZML和PPD。通过回顾近年研究成果,从TIFY蛋白的结构、分布及在调控植物的生长发育,响应各种逆境胁迫和不同激素信号等方面的生物学功能进行综述,旨在为TIFY蛋白家族的深入研究与利用奠定理论基础。 展开更多

关键词 tify 转录因子 信号转导 生长发育 逆境胁迫

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柳枝稷TIFY基因家族的鉴定与分析 被引量：8

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作者 赵晓晓 谢坤良 +3 位作者 张舒梦 张超 奚亚军 孙风丽 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期1126-1137,共12页

为探究TIFY基因家族在柳枝稷(Panicum virgatum)中的生物学功能,本研究运用生物信息学手段对柳枝稷基因组中的TIFY家族成员进行了鉴定,并对其染色体定位、进化与结构特点、启动子区顺式作用元件、时空表达模式等进行了分析,且通过定量... 为探究TIFY基因家族在柳枝稷(Panicum virgatum)中的生物学功能,本研究运用生物信息学手段对柳枝稷基因组中的TIFY家族成员进行了鉴定,并对其染色体定位、进化与结构特点、启动子区顺式作用元件、时空表达模式等进行了分析,且通过定量实验验证了JAZ亚家族部分成员的激素应答与胁迫响应特性。结果表明:48个柳枝稷TIFY基因分属于ZML(7个)、TIFY(1个)与JAZ(40个)3个亚家族,分布在除染色体3以外的染色体上,且在染色体9成簇排列;柳枝稷TIFY基因按照进化关系及结构特点可分为5组,每组内的成员具有相似的基因结构与保守基序组成;柳枝稷TIFY基因启动子区存在多种胁迫响应元件与激素信号调控元件,经定量实验证实PviTIFY10各成员在茉莉酸(jasmonic acid,JA)处理及盐与干旱胁迫下反应强烈;JAZ亚家族部分成员尤其是PviTIFY10b在花序与根的发育过程中有较高表达。根据以上结果推测TIFY基因家族可能在柳枝稷激素信号调控与胁迫防御反应及生长发育等多方面发挥功能。 展开更多

关键词 柳枝稷 tify基因家族 JAZ

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海南龙血树4个DcTIFY10转录因子的鉴定和表达分析 被引量：4

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作者 丁旭坡 马纳纳 +3 位作者 庞宽壮 蔡彩虹 戴好富 梅文莉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第19期6287-6294,共8页

TIFY家族是陆生植物特有的基因家族,而TIFY10/JAZ则是植物茉莉酸信号转导的关键调控因子。本研究在海南龙血树(Dracaena cambodiana)转录组数据基础上,利用生物信息学方法首次鉴定了4个编码177~246个氨基酸的海南龙血树DcTIFY10基因,4个... TIFY家族是陆生植物特有的基因家族,而TIFY10/JAZ则是植物茉莉酸信号转导的关键调控因子。本研究在海南龙血树(Dracaena cambodiana)转录组数据基础上,利用生物信息学方法首次鉴定了4个编码177~246个氨基酸的海南龙血树DcTIFY10基因,4个DcTIFY10蛋白具有TIFY10的特征性ZIM和Jas结构域,与水稻、拟南芥的TIFY10具有较高的同源性,与水稻OsTIFY10基因家族具有较近的亲缘关系,4个DcTIFY10蛋白均无跨膜结构域,分别包含20~30个磷酸化位点,蛋白二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲为主;4个DcTIFY10基因在海南龙血树根或者茎中的表达量最高,在血竭诱导生成过程中持续上调表达,与血竭的生成部位和形成时间呈现出一致性,说明其在血竭生成过程中发挥着重要的作用,此结果为进一步研究茉莉酸信号途径在海南龙血树生长发育和血竭形成过程中的作用提供了技术支持。 展开更多

关键词 海南龙血树(Dracaena cambodiana) tify10 转录因子 生物信息学 表达分析

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月季TIFY基因家族的全基因组分析 被引量：5

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作者 王昊宁 周佩 +5 位作者 刘燕 刘梦 朱晓仪 石力匀 栗燕 逯久幸 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2022年第6期990-997,1060,共9页

【目的】研究TIFY基因家族在月季(Rosa chinensis Jacq.)干旱胁迫与盐胁迫发生过程中的作用。【方法】利用生物信息学方法对月季TIFY家族成员进行全基因组鉴定、系统进化树分析、理化性质分析、染色体定位分析、基因共线性分析和基因结... 【目的】研究TIFY基因家族在月季(Rosa chinensis Jacq.)干旱胁迫与盐胁迫发生过程中的作用。【方法】利用生物信息学方法对月季TIFY家族成员进行全基因组鉴定、系统进化树分析、理化性质分析、染色体定位分析、基因共线性分析和基因结构分析,并结合转录组表达数据以及顺式元件分析筛选与盐胁迫、干旱胁迫响应相关的基因。【结果】鉴定了13个月季TIFY家族成员;通过与拟南芥、水稻共同构建的进化树,将这些成员分为4个亚家族;这些成员分布在5条染色体上,与拟南芥同源性更高;各亚家族特征结构域完整。其中6个RcTIFY成员在干旱胁迫和盐胁迫中发挥着积极作用;顺式元件结果表明,大多数RcTIFY成员可能参与了脱落酸与茉莉酸甲酯的响应。积极响应干旱胁迫或盐胁迫的TIFY家族成员RcTIFY5a、RcTIFY5b、RcTIFY6a、RcTIFY6b、RcTIFY10b均含有丰富的脱落酸、茉莉酸甲酯响应元件。【结论】月季中有13个RcTIFY基因,多个成员在干旱胁迫和盐胁迫响应中发挥着积极作用,脱落酸和茉莉酸甲酯是该家族成员的潜在调控激素。 展开更多

关键词 tify基因家族 生物信息学 干旱胁迫 盐胁迫 脱落酸 茉莉酸甲酯

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人参TIFY基因家族鉴定与分析 被引量：3

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作者 于欣欣 米要磊 +4 位作者 孟祥霄 任伟超 王思嘉 孙伟 马伟 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2022年第3期72-76,261-263,共8页

目的通过对人参TIFY基因家族的保守基序,系统进化,基因模式表达分析,深入研究TIFY基因功能,为人参优良品种选育提供理论依据。方法通过生物信息学手段对人参TIFY基因家族进行鉴定和分析,使用TAIR、ExPASy、WOLF PSORT、MEME、NCBI等在... 目的通过对人参TIFY基因家族的保守基序,系统进化,基因模式表达分析,深入研究TIFY基因功能,为人参优良品种选育提供理论依据。方法通过生物信息学手段对人参TIFY基因家族进行鉴定和分析,使用TAIR、ExPASy、WOLF PSORT、MEME、NCBI等在线网站以及TBtools、MEGA等软件进行TIFY基因表达模式分析,并进行可视化作图。结果在人参中共鉴定出33个TIFY基因成员,分别聚类为ZML、PPD、JAZ、TIFY 4个亚家族,其氨基酸数量在104~1064 aa,等电点介于4.96~9.78,分子质量在117477.88~49576.63 D之间,大部分被鉴定的基因定位于细胞核中,通过热图对基因的表达分析表明,人参TIFY基因家族在根、根茎、叶、花、果实中表达存在一定的差异性。结论通过对人参TIFY全基因组水平鉴定及生物信息学分析,推测TIFY基因家族在对人参的生长发育有重要的调控作用,并且可能参与了人参皂苷的生物合成,将为人参的优良品种选育提供理论依据。 展开更多

关键词 生物信息学 人参 tify基因 基因鉴定 基因分析

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铁皮石斛DoTIFY基因家族全基因组鉴定及在原球茎发育过程中的表达 被引量：3

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作者 胡睿 郭建秀 +2 位作者 郭小强 陈凤颖 王万军 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期53-58,共6页

在铁皮石斛基因组数据中共鉴定出20个铁皮石斛TIFY(DoTIFY)基因。根据铁皮石斛、拟南芥、水稻、向日葵、陆地棉中TIFY的系统发育分析,将DoTFY分为4类:JAZ、PPD、ZIM和TIFY。铁皮石斛原球茎发育5个时期的转录组分析表明,有11个DoTIFY基... 在铁皮石斛基因组数据中共鉴定出20个铁皮石斛TIFY(DoTIFY)基因。根据铁皮石斛、拟南芥、水稻、向日葵、陆地棉中TIFY的系统发育分析,将DoTFY分为4类:JAZ、PPD、ZIM和TIFY。铁皮石斛原球茎发育5个时期的转录组分析表明,有11个DoTIFY基因有差异性表达,表明这些基因可能参与调控铁皮石斛原球茎的发育。进一步对其中4个DoTIFY基因qPCR分析,DoJAZ3、8、5和DoJAZ6的表达水平在铁皮石斛原球茎生长发育的P1~P7时期显著增加,表明它们可能在P1~P7时期中起作用。研究结果为进一步研究铁皮石斛原球茎发育调控机制和相关的育种改良提供重要参考。 展开更多

关键词 铁皮石斛 tify 生物信息学分析 RNA-SEQ qPCR

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大豆胞囊线虫3号生理小种抗性相关TIFY基因生物信息学分析 被引量：2

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作者 孙浩文 曲硕 +2 位作者 刘芳 姜海鹏 韩英鹏 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期532-544,共13页

TIFY转录因子参与调节植物的生长和发育,同时参与植物应激反应,在植物生长中具有重要调控功能。为探索TIFY基因家族成员在大豆胞囊线虫病(Soybean Cyst Nematode,SCN)3号生理小种抗性反应中的作用,选择抗病品种东农L-10和感病品种黑农3... TIFY转录因子参与调节植物的生长和发育,同时参与植物应激反应,在植物生长中具有重要调控功能。为探索TIFY基因家族成员在大豆胞囊线虫病(Soybean Cyst Nematode,SCN)3号生理小种抗性反应中的作用,选择抗病品种东农L-10和感病品种黑农37进行SCN 3号生理小种胁迫处理,在转录组测序数据中分析筛选到多个与抗性相关的TIFY转录因子,并对其进行生物信息学预测和分析。结果表明:从转录组数据中鉴定和筛选到23个与SCN 3号生理小种相关的差异表达TIFY转录因子,其中18个转录因子上调表达,5个转录因子下调表达,TIFY基因在大豆的根、茎、叶均存在一定表达量,在相同的大豆胞囊线虫胁迫下,抗病品种中TIFY表达量要高于感病品种。不同TIFY转录因子之间的理化性质存在较大差异。23个转录因子均属于亲水性蛋白,多数为酸性等电点。亚细胞定位预测结果显示,TIFY转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、细胞质、线粒体。蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中。基因分布在大豆的10条染色体上,磷酸化位点丝氨酸偏多,启动子中存在很多响应激素应答和胁迫相关的顺式作用元件,说明TIFY基因所编码的蛋白中部分为响应胁迫的蛋白。研究结果说明筛选到的23个与SCN 3号生理小种相关的TIFY转录因子可为进一步了解大豆TIFY基因的功能提供重要参考。 展开更多

关键词 大豆胞囊线虫 3号生理小种 tify转录因子 生物信息学

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甘蓝型油菜耐盐相关基因BnaJAZ1的克隆及BnaTIFY基因家族分析 被引量：1

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作者 张琪 陶顺仙 +6 位作者 苏倩 张燕 李萍 曹涵铭 Aldiyar Bakirov 徐爱遐 黄镇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第14期4549-4559,共11页

TIFY是植物特有的转录因子,参与调控植物分生组织的分裂,能够减少机械损伤对植物造成的伤害,并且能提高植物的抗逆性。为了研究甘蓝型油菜中TIFY家族相关基因的功能,本研究采用同源克隆法在甘蓝型油菜品系1423和2205中克隆了BnaA06g132... TIFY是植物特有的转录因子,参与调控植物分生组织的分裂,能够减少机械损伤对植物造成的伤害,并且能提高植物的抗逆性。为了研究甘蓝型油菜中TIFY家族相关基因的功能,本研究采用同源克隆法在甘蓝型油菜品系1423和2205中克隆了BnaA06g13250D的CDS序列,在NaHCO3胁迫后12、24 h,BnaA06g13250D基因编码在耐盐品系2205中的表达量显著低于敏盐品系1423,两亲本材料的耐盐性有明显差异。该基因CDS序列全长762 bp,编码253个氨基酸,含有一个TIFY结构域;Bna2205与甘蓝型油菜BnaA06g13250D基因的氨基酸序列存在16处差异,在第114个氨基酸序列处存在1处丝氨酸的增加,其蛋白质一级与二级结构也存在差异。系统进化分析表明,Bna2205基因与黑芥遗传距离最近,与番薯、植物棉、黑枸杞、山茶等不同属的物种遗传距离较远。利用blastp对甘蓝型油菜全基因组进行鉴定与筛选,得到了68个TIFY家族基因,都含有TIFY保守结构域,该基因家族包含3个亚家族,各亚族间在基因结构上存在显著差异,分布在19条染色体上。本研究为甘蓝型油菜TIFY家族相关基因的抗逆性研究提供理论基础,为甘蓝型油菜耐碱性盐的下一步研究提供参考。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜(Brassica napus L.) 耐碱性盐 BnaJAZ1 tify家族 生物信息学分析

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