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茶树TIDH核苷酸多样性及与咖啡碱含量的关联分析 被引量：5
1
作者 周晨阳 金基强 +2 位作者 马春雷 姚明哲 陈亮 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期981-988,共8页
咖啡碱是嘌呤碱中最重要的一种,对茶叶的滋味等品质起重要的作用,对于咖啡碱代谢途径的研究有重要意义。根据NCBI登录的TIDH基因(编码咖啡碱合成途径的一个关键酶——次黄嘌呤核苷酸脱氢酶)cDNA设计引物,克隆获得了一条基因组DNA的中间... 咖啡碱是嘌呤碱中最重要的一种,对茶叶的滋味等品质起重要的作用,对于咖啡碱代谢途径的研究有重要意义。根据NCBI登录的TIDH基因(编码咖啡碱合成途径的一个关键酶——次黄嘌呤核苷酸脱氢酶)cDNA设计引物,克隆获得了一条基因组DNA的中间片段,长4172bp(TIDH3)。从中国茶树资源核心种质中选取咖啡碱含量有代表性的95份资源进行了两个年度、春秋两季的咖啡碱含量HPLC测定,大部分材料的咖啡碱含量在2.50%～4.50%,4次重复的平均值为3.50%,变异系数在15.52%～19.25%,表明茶叶咖啡碱含量在不同年份与季节都是相对稳定的。经PCR扩增、测序和序列多态性分析,TIDH3中的一个759bp片段的总核苷酸多样性指数πT和θW分别为0.006和0.012,同义突变多样性πsyn=0.009大于非同义突变多样性πnonsyn=0.006。Ka/Ks=0.600<1,认为TIDH3基因受到负向选择作用。TIDH3基因连锁不平衡分析表明,基因内的连锁不平衡衰减速度较快,在约300bp范围内r2值降低到了0.2。通过关联分析,获得两个与咖啡碱含量显著相关的SNP位点,遗传贡献率分别为10.43%和5.68%。 展开更多
关键词 茶树 咖啡碱 次黄嘌呤核苷酸脱氢酶 tidh 基因克隆 关联分析
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茶树咖啡碱合成途径中TCS1、TIDH、SAMS的基因表达量差异及其与咖啡碱含量的相关性 被引量：9
2
作者 李金 魏艳丽 +1 位作者 庞磊 江昌俊 《江苏农业科学》 北大核心 2013年第10期21-24,共4页
通过实时荧光定量PCR方法研究10个茶树品种咖啡碱合成途径中3个关键酶基因(咖啡碱合成酶基因TCS1、次黄嘌呤核苷酸核苷酸脱氢酶基因TIDH、S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因SAMS)秋季的表达量,并与咖啡碱含量进行相关性分析,从基因转录表达水平... 通过实时荧光定量PCR方法研究10个茶树品种咖啡碱合成途径中3个关键酶基因(咖啡碱合成酶基因TCS1、次黄嘌呤核苷酸核苷酸脱氢酶基因TIDH、S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因SAMS)秋季的表达量,并与咖啡碱含量进行相关性分析,从基因转录表达水平探究其对茶树咖啡碱含量的影响。结果表明,TCS1、TIDH、SAMS基因表达量在品种间的变异系数分别为24.82%、23.97%、30.31%,即3个基因表达量在品种间的差异为TIDH<TCS1<SAMS。同时,TCS1与咖啡碱含量呈显著正相关,TIDH、SAMS与咖啡碱含量相关性不显著。因此,与TIDH、SAMS相比,TCS1对茶树咖啡碱的合成起到更为重要的作用。 展开更多
关键词 茶树 咖啡碱 TCS1 tidh SAMS 转录表达 相关性分析
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3个茶树咖啡碱合成酶基因SSR分子标记的开发及龙脊茶树遗传多样性分析
3
作者 彭靖茹 温立香 +5 位作者 陈家献 张芬 袁冬寅 欧淑琼 赵媛 黄寿辉 《分子植物育种》 2025年第24期8268-8276,共9页
龙脊茶是广西地方名茶,茶树资源遗传背景相似,有高咖啡碱含量特异种质资源。本研究基于茶树全基因组序列,利用SSR搜索软件对3个咖啡碱合成途径关键酶基因SAMS、TIDH和AMP脱氨酶基因进行SSR标记引物开发及应用于龙脊茶树等的遗传多样性... 龙脊茶是广西地方名茶,茶树资源遗传背景相似,有高咖啡碱含量特异种质资源。本研究基于茶树全基因组序列,利用SSR搜索软件对3个咖啡碱合成途径关键酶基因SAMS、TIDH和AMP脱氨酶基因进行SSR标记引物开发及应用于龙脊茶树等的遗传多样性分析。结果表明:3个酶基因开发获得61对引物,大部分分布在基因间隔区,有4种重复单元类型,经筛选有17对多态性好的引物。34份茶树种质资源的遗传相似系数为0.566~0.9811,在遗传相似系数0.760处可将茶树资源分为9类。龙脊茶树种质资源并没有单独聚在一起,而是与6个全国的名优品种分别归在不同的类中,不含咖啡碱的茶属植物‘越南抱茎茶’扩增条带为0。本研究可为开展含或不含咖啡碱的茶属植物、地理位置很近的遗传背景相似的茶树种质资源鉴别提供依据,也可为针对特定基因开发SSR分子标记提供参考方法。 展开更多
关键词 龙脊茶 SAMS tidh AMP脱氨酸酶基因 遗传多样性
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