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杨树TCP基因家族生物信息学与盐胁迫应答表达分析
1
作者 刘德麒 何家劲 +1 位作者 程紫涵 张雪梅 《西北林学院学报》 北大核心 2026年第1期93-106,118,共15页
TCPs是植物所特有的转录因子,本研究旨在探究杨树TCP基因家族的结构特征及其在盐胁迫下的表达特性,以期为杨树优良基因选育工作提供思路。通过生物信息学手段,分析杨树TCP基因家族的理化性质、基因结构、顺式作用元件、蛋白相互作用以... TCPs是植物所特有的转录因子,本研究旨在探究杨树TCP基因家族的结构特征及其在盐胁迫下的表达特性,以期为杨树优良基因选育工作提供思路。通过生物信息学手段,分析杨树TCP基因家族的理化性质、基因结构、顺式作用元件、蛋白相互作用以及物种内和物种间的共线性,并通过RNA-seq数据分析其在高盐胁迫下的表达模式。杨树中共有37个非冗余的TCP家族成员,其中20个属于ClassⅠ亚家族,17个属于ClassⅡ亚家族(CYC和CIN 2个亚类分别包含7和10个);同一亚族的TCP基因结构、保守基序分布、保守结构域以及蛋白三级结构高度相似;TCPs基因启动子序列中含有各种激素响应元件、胁迫响应元件、发育过程特定元件等;互作蛋白分析表明,37个TCP成员中存在26个关键枢纽蛋白,其中Potri.008G115800.1、Potri.003 G120200.1、Potri.001G111800.1在细胞内起中心调控作用;共线性分析表明,物种内共存在8对共线性关系,相互有共线的2个基因在不同的染色体上具有相似的基因序列;通过转录组数据分析发现,杨树的叶、茎、根中分别有6、1、7个TCPs基因在盐胁迫处理后显著差异表达,并通过qRT-PCR得以验证。本研究系统分析了杨树TCP基因家族的结构特征和表达特性,为后期研究杨树TCP转录因子在高盐胁迫下的调控机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 杨树 tcp 生物信息学 盐胁迫
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花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
2
作者 王苗苗 赵相龙 +2 位作者 王召明 刘志鹏 闫龙凤 《生物技术通报》 北大核心 2025年第6期179-190,共12页
【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供... 【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供基因资源。【方法】基于全基因组水平鉴定花苜蓿TCP基因,对其进行生物信息学分析和干旱胁迫下的表达模式分析。【结果】在花苜蓿中共鉴定到20个TCP基因,分布在7条染色体上。系统进化分析结果表明,MruTCP蛋白分为3个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1,各类蛋白的Motif种类和排列顺序有所差异,均含有一个共同的保守基序Motif 1,家族成员间的结构较为简单。共线性分析结果表明,花苜蓿TCP家族内存在2个片段重复事件,且与大豆之间的亲缘关系最近。启动子顺式作用元件分析的结果表明,MruTCP家族成员功能较为复杂,在信号传递、响应非生物胁迫、光信号响应、激素调节等方面均发挥作用。干旱胁迫下的转录组数据和RT-qPCR的结果表明,花苜蓿TCP基因家族成员在不同时间点和不同浓度干旱处理下的表达模式不同。其中,MruTCP05和MruTCP09包含了丰富的激素响应元件和胁迫响应元件,并且受干旱胁迫的强烈诱导。【结论】结合TCP基因家族的生物信息学分析和表达模式分析结果,推测MruTCP05和MruTCP09是调控花苜蓿耐旱性的候选基因。 展开更多
关键词 花苜蓿 tcp基因 干旱胁迫 转录表达分析
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沙棘TCP基因家族鉴定与HrTCP12的功能初探
3
作者 王婷 秦德彬 安新民 《中国细胞生物学学报》 2025年第8期1795-1811,共17页
沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为药食同源的重要植物,其果实在多个领域都有极高的利用价值。近年来,对经济树种的分枝进行改良是提高果实产量的一个重要途径。而TCP基因家族在调控生长发育及逆境响应中具有关键作用,其家族成员在植... 沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为药食同源的重要植物,其果实在多个领域都有极高的利用价值。近年来,对经济树种的分枝进行改良是提高果实产量的一个重要途径。而TCP基因家族在调控生长发育及逆境响应中具有关键作用,其家族成员在植物分枝发育中有着重要作用。该研究通过生物信息学结合实验验证,系统鉴定了沙棘的TCP基因家族,并解析了其功能特性。该研究基于基因组数据筛选出29个沙棘TCP基因,并通过进化分析将其分为Class Ⅰ(PCF亚族)和Class Ⅱ(CYC/TB1亚族及CIN亚族)。研究发现,Class Ⅱ亚族的TCP结构域碱性区比Class Ⅰ亚族多4个保守氨基酸。染色体定位显示,沙棘TCP家族成员在染色体上分布不均,理化性质分析表明沙棘TCP家族多数蛋白呈亲水性且定位于细胞核。启动子分析发现了在沙棘TCP家族成员的启动子中,光响应、激素(如ABA)及胁迫相关顺式元件富集,暗示了沙棘TCP家族参与多重调控网络。共线性分析揭示了沙棘TCP基因与拟南芥、枣存在广泛进化保守性,且家族扩张主要由全基因组复制/片段复制驱动的跨染色体重复主导。组织特异性表达显示,CYC/TB1亚族基因Hr TCP12在刺和侧芽中高表达,在其余部位表达量较低,暗示其调控分枝发育的功能。亚细胞定位证实Hr TCP12和Hr TCP18主要定位于细胞核,符合转录因子特性。在84k杨中过表达Hr TCP12显著抑制杨树分生组织活性基因Pag WUS1/2的表达,初步验证了其通过抑制侧芽生长调控植物分枝的保守机制。该研究在全基因组范围内鉴定了沙棘TCP基因家族成员,并对CYC/TB1亚族基因进行了表达模式分析,发现了其成员具有明显的组织特异性表达特征,同时发现了Hr TCP12抑制杨树分生组织活性基因表达,为利用基因工程改良沙棘分枝特性提供了候选基因。 展开更多
关键词 沙棘 tcp基因家族 生物信息学 共线性分析 表达模式分析
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薄壳山核桃TCP基因家族鉴定及表达模式分析 被引量：1
4
作者 魏璐 朱凯凯 +4 位作者 赵娟 牛牧歌 马文娟 谭鹏鹏 彭方仁 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第4期9-22,共14页
为探究TCP转录因子在薄壳山核桃[Carya illinoinensis(Wangenh.) K. Koch]生长发育和响应干旱胁迫过程中的作用,基于薄壳山核桃全基因组数据,采用生物信息学方法对其TCP基因家族成员进行了鉴定,并对其序列特征、时空表达模式和干旱胁迫... 为探究TCP转录因子在薄壳山核桃[Carya illinoinensis(Wangenh.) K. Koch]生长发育和响应干旱胁迫过程中的作用,基于薄壳山核桃全基因组数据,采用生物信息学方法对其TCP基因家族成员进行了鉴定,并对其序列特征、时空表达模式和干旱胁迫下的表达特征以及TCP进化关系等进行了分析。结果表明:从薄壳山核桃全基因组中共鉴定出33个TCP基因,命名为CiTCP1至CiTCP33,编码193~537个氨基酸,理论等电点为pI 5.85至pI 9.78;CiTCP29定位于叶绿体,其余CiTCP定位于细胞核;所有CiTCP的二级结构以无规卷曲为主。CiTCP在染色体上分布不均匀,5号、6号和11号染色体上分布的基因最多(均为4个);CiTCP间存在28对共线性关系,说明这些基因扩张主要来源于片段复制。所有CiTCP均包含保守的b-HLH结构域;33个CiTCP可分为ClassⅠ(PCF)和ClassⅡ亚族,后者进一步分为CIN和CYC/TB1亚类,并且,同一分支成员具有相似的基因结构和蛋白保守基序。CiTCP基因的启动子区域含有丰富的植物激素响应、胁迫响应和生长发育调控顺式作用元件。CIN亚类基因CiTCP5、CiTCP8、CiTCP17、CiTCP21、CiTCP25和CiTCP28为miR319的靶基因,说明这些基因的表达可能受miRNA调控。CiTCP基因在不同组织和果实发育阶段的表达模式差异明显,其中,CIN亚类大部分基因在叶中的表达量较高。与干旱胁迫0 d相比,胁迫3~15 d时CiTCP5和CiTCP23表达总体上显著下调,其余基因的表达变化各异。研究结果显示:CiTCP基因具有高度保守性和时空表达特性,且对薄壳山核桃响应干旱胁迫有一定的调控作用。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 tcp基因 生物信息学分析 表达模式 干旱胁迫
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云南栘[木衣]TCP基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量：2
5
作者 张宝月 刘国平 +1 位作者 田金红 王大玮 《生物工程学报》 北大核心 2025年第2期809-824,共16页
云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.)Schneid.)作为一种经济林果树,具有较高药用和食用价值。TCP(Teosinte branched1/Cycloidea/Proliferating cell factor)基因家族在植物整个生长发育过程中发挥着重要的作用。为探讨云南栘[木衣]... 云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.)Schneid.)作为一种经济林果树,具有较高药用和食用价值。TCP(Teosinte branched1/Cycloidea/Proliferating cell factor)基因家族在植物整个生长发育过程中发挥着重要的作用。为探讨云南栘[木衣]TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,本研究利用生物信息学方法对云南栘[木衣]TCP基因家族进行了全基因组鉴定,并分析了其在种子萌发和果实发育不同时期的表达水平。结果显示,云南栘[木衣]共有18个DdeTCP基因,不均匀地分布在11条染色体上。系统进化分析结果显示,DdeTCP在ClassⅠ中有3个成员,ClassⅡ类有15个成员,表明DdeTCP家族成员间出现了功能分化。基因表达模式分析显示,AtTCP14同源基因DdeTCP11在种子萌发前期具有较高的表达水平,表明其可能在种子萌发时期发挥重要作用。此外,聚类在ClassⅠ中的DdeTCP16在果实成熟期表达量较高,推测其可能与果实成熟有关。本研究为进一步探索DdeTCP基因家族在云南栘[木衣]生长发育过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 云南栘[木衣] 转录组 tcp基因家族 生物信息学 表达分析
原文传递
花魔芋AkTCP家族基因鉴定及表达分析 被引量：1
6
作者 何斐 汤鑫塬 +1 位作者 李竹梅 褚洪龙 《华北农学报》 北大核心 2025年第5期35-46,共12页
TCP家族成员是植物特有的转录因子,在植物生长、代谢活动及逆境应答等关键生物过程中发挥不可或缺的作用。为了解TCP基因家族在花魔芋基因组中的数量、分布和表达等情况,利用生物信息学技术对AkTCP家族基因进行鉴定,分析该家族成员的理... TCP家族成员是植物特有的转录因子,在植物生长、代谢活动及逆境应答等关键生物过程中发挥不可或缺的作用。为了解TCP基因家族在花魔芋基因组中的数量、分布和表达等情况,利用生物信息学技术对AkTCP家族基因进行鉴定,分析该家族成员的理化性质、亚细胞定位、共线性、基因结构及进化关系,采用qRT-PCR技术分析响应生物、非生物胁迫的基因表达情况。结果表明,花魔芋全基因组中鉴定出30个TCP家族成员,其蛋白包含135~562个氨基酸残基,分子质量为15.08~57.20 ku,等电点为4.96~11.49,大部分为碱性蛋白,均为不稳定的亲水性蛋白,主要分布在细胞核上,其基因在染色体上不均匀分布。AkTCP共线性基因仅在花魔芋8条染色体中分布,包含4个染色体间共线性事件和5个染色体内共线性事件。AkTCP基因结构较为简单,大部分不含内含子,均含有高度保守的TCP结构域,可分为ClassⅠ和ClassⅡ2个组别,ClassⅡ又分为CIN和CYC/TB1 2个亚类。启动子顺式作用元件分析结果显示,AkTCP启动子上含有多个生理响应、光响应、植物激素和逆境胁迫响应等元件。qRT-PCR分析结果表明,AkTCP家族成员参与了干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯和软腐病原菌侵染应答过程并作出积极响应。 展开更多
关键词 花魔芋 tcp基因家族 转录因子 表达分析
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甜瓜TCP基因家族全基因组的鉴定与表达分析
7
作者 李海伦 高宁宁 +7 位作者 郭姚淼 孙东玲 王月玲 谢夔熙 李鹏飞 段世享 赵卫星 杨森 《河南农业科学》 北大核心 2025年第9期127-140,共14页
TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序... TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式元件、miRNA及基因表达模式进行分析。结果表明,鉴定出29个含有TCP结构域的TCP基因家族成员,不均等地分布在9条染色体上。甜瓜TCP转录因子家族蛋白的氨基酸数在61~600 aa,分子质量在7115.16~65469.20 u,理论等电点在5.62~10.06。亚细胞定位预测分析表明,28个TCP蛋白定位在细胞核。根据系统发育分析可将家族成员划分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚家族,进一步细分为PCF、CYC/TB1、CIN 3个亚组。CmTCP基因结构都比较简单,均含有1或2个外显子,极少数基因含有内含子,29个基因都含有Motif 1,不同亚组成员含有的Motif存在差异。顺式元件预测分析显示,甜瓜TCP基因家族启动子序列以光响应、激素响应、生长发育调控等相关元件为主。miRNA预测分析得出25个miRNA与13个CmTCP基因相互作用。甜瓜基因组数据库RNASeq分析显示,26个CmTCP基因在甜瓜组织中既有明确的组织分工表达,又有特定的组织部位表达;qRT-PCR结果表明,CmTCP-CYC/TB1基因成员在甜瓜不同组织中的相对表达量差异显著。 展开更多
关键词 甜瓜 tcp基因家族 生物信息学分析 全基因组鉴定 表达分析
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垂穗披碱草TCP转录因子家族鉴定及激素响应模式分析
8
作者 彭晓梅 孟晨 +3 位作者 GARC A-CAPARR S Pedro 张宇 杨永平 孙旭东 《广西植物》 北大核心 2025年第5期916-930,共15页
垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究... 垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究利用单分子实时(SMRT)测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组数据,并对4种激素处理后的垂穗披碱草叶片进行Illumina测序,以探究EnTCP s基因在不同激素处理下的表达模式。结果表明:(1)垂穗披碱草全长转录组测序共获得90956条非冗余转录本。(2)基于全长转录组数据共鉴定到26个EnTCP s,氨基酸数为186~575 aa,亚细胞定位预测显示TCP蛋白均位于细胞核。(3)根据进化树的分支情况可将26个EnTCP s分为Class I、ClassⅡ-a(CIN)和ClassⅡ-b(CYC/TB1)3个亚家族,保守结构域分析表明EnTCPs均含有TCP结构域。(4)不同激素处理后的表达模式分析显示,7个EnTCP s家族成员(En108950、En35573、En10347、En16325、En128790、En10346和En14028)在激素处理后上调/下调表达,它们可能参与了激素合成与信号转导通路;qRT-PCR分析结果显示,En35573和En14028参与生长素响应,En108950、En10347、En128790、En10346和En14028均参与细胞分裂素响应,En14028参与脱落酸响应,En108950参与茉莉酸响应,而En16325可能参与多种激素信号转导通路。该研究结果为后续EnTCP s基因功能研究奠定了基础,为研究EnTCP s对激素响应的分子机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 垂穗披碱草 tcp转录因子家族 全长转录组 外源植物激素 表达模式
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枫香树TCP基因家族鉴定与表达分析 被引量：1
9
作者 赵金涛 叶兴状 +3 位作者 王安邦 陈志云 翁慧莹 张国防 《亚热带植物科学》 2025年第2期109-120,共12页
枫香树Liquidambar formosana是蕈树科落叶型代表树种,具有较高的经济价值和生态价值。TCP基因家族在植物生长发育及逆境适应中扮演着关键角色。基于枫香树基因组数据和转录组数据,利用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定LfTCP基因家... 枫香树Liquidambar formosana是蕈树科落叶型代表树种,具有较高的经济价值和生态价值。TCP基因家族在植物生长发育及逆境适应中扮演着关键角色。基于枫香树基因组数据和转录组数据,利用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定LfTCP基因家族,并对其蛋白质理化性质、基因位置、系统发育进化关系、种内种间共线性关系、启动子顺式作用元件以及组织表达量进行分析。结果表明,枫香树TCP基因家族共有22个成员,编码蛋白长度介于197~552 AA之间;22个LfTCPs基因非均匀分布于12条染色体;LfTCPs在Class Ⅰ中有12个成员,在Class Ⅱ中有10个成员,其中CIN亚家族有7个成员,CYC/TB1亚家族有3个成员。LfTCP基因家族启动子顺式元件可能与光、激素和胁迫响应有关。LfTCPs基因具有组织表达特异性,LfTCP6、LfTCP7和LfTCP17在叶中特异性高表达,可作为研究枫香树叶片生长和形态建成的重要候选基因。该研究结果可为枫香树TCP家族基因的功能及调控机制提供参考。 展开更多
关键词 枫香树 tcp基因家族 生物信息学 组织表达
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罗汉果SgTCP6基因克隆、生物信息学分析及转录激活研究
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作者 林孝东 莫长明 +7 位作者 穆德添 赵欢 黄华学 邵瑛瑛 陈文强 刘代 梁任繁 唐其 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期33-41,共9页
基于罗汉果基因组和转录组信息,筛选得到罗汉果TCP转录因子家族SgTCP6基因,对其进行生物信息学分析,并结合酵母单杂交实验验证其是否参与罗汉果甜苷合成关键酶基因SgUGT94的调控。结果显示:SgTCP6基因编码序列(CDS)全长为618 bp,编码20... 基于罗汉果基因组和转录组信息,筛选得到罗汉果TCP转录因子家族SgTCP6基因,对其进行生物信息学分析,并结合酵母单杂交实验验证其是否参与罗汉果甜苷合成关键酶基因SgUGT94的调控。结果显示:SgTCP6基因编码序列(CDS)全长为618 bp,编码205个氨基酸残基,相对分子质量为21 942,定位于细胞核中,是一种不稳定的亲水蛋白,且不含信号肽和跨膜区,为非分泌蛋白。多序列比对结果显示该基因与葫芦科苦瓜TCP基因的亲缘关系较近。罗汉果不同时期果实基因共表达关联分析结果显示,SgTCP6与SgUGT94表达存在极显著相关性。SgUGT94上游2 000 bp启动子区域含有4个TCP顺式作用元件。酵母单杂交结果表明,SgTCP6可能参与罗汉果甜苷V合成关键酶基因SgUGT94的调控。 展开更多
关键词 罗汉果 tcp转录因子 生物信息学 酵母单杂交 葡萄糖基转移酶
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文冠果TCP基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析 被引量：1
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作者 陈玉金 于涵 +6 位作者 朱华利 姜涛 刘博 李伟 赵永军 鲁仪增 解孝满 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期441-451,共11页
【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白... 【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白理化性质、系统发育进化和保守基序分析,以及基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件分析。采用实时荧光定量PCR检测盐胁迫下文冠果TCP基因(XsTCPs)在叶片和根部的表达情况。【结果】共鉴定出24个文冠果TCP基因家族成员(XsTCP1~XsTCP24),编码的氨基酸残基数量为185~576个,蛋白分子量为20576.21~63366.92 kD,理论等电点为4.62~10.25,均属于亲水性蛋白且定位于细胞核。基于系统发育进化分析结果,可将24个XsTCPs蛋白划分到3个亚家族,其中PCF亚家族包含14个成员、CIN亚家族包含6个成员、CYC/TB1亚家族包含4个成员。除XsTCP23和XsTCP24基因无法定位到染色体外,其余文冠果TCP基因家族成员以单个基因或基因簇的形式不均匀地分布在11条染色体上。在24个XsTCPs蛋白中共发现10个保守基序,其中Motif 1为所有蛋白共有。文冠果TCP基因家族成员含有光响应元件、激素反应元件、应激反应元件和植物生长发育作用元件,其中XsTCP4、XsTCP6、XsTCP7、XsTCP10、XsTCP12、XsTCP13、XsTCP21和XsTCP22基因含有干旱诱导的MYB结合元件;实时荧光定量PCR检测结果表明,盐胁迫下上述基因在文冠果叶片和根部的表达情况均发生明显变化,推测上述8个XsTCPs基因参与盐胁迫响应过程。【结论】XsTCPs蛋白可能通过调控涉及生长发育、新陈代谢和应激反应的多种靶基因参与生物学过程,推测含有干旱诱导的MYB结合元件的8个XsTCPs基因有助于提高文冠果对盐胁迫的抵御能力。 展开更多
关键词 文冠果 tcp基因家族 盐胁迫 表达分析
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铁皮石斛DoTCP2基因克隆及非生物胁迫下的表达分析
12
作者 刘羽佳 卓来凤 +5 位作者 马立钦 黄秋妮 张勇 张颖智 李翔 刘博婷 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第3期588-598,共11页
TCP转录因子是植物特有的一类调控生长发育和逆境胁迫反应的重要调控因子。为探究铁皮石斛(Dendrobium officinale)TCP2基因(DoTCP2)的表达特性和抗逆响应能力,通过同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛品种的叶组织中成功分离出DoTCP2基因,... TCP转录因子是植物特有的一类调控生长发育和逆境胁迫反应的重要调控因子。为探究铁皮石斛(Dendrobium officinale)TCP2基因(DoTCP2)的表达特性和抗逆响应能力,通过同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛品种的叶组织中成功分离出DoTCP2基因,并对该基因序列进行生物信息学分析及表达模式探究。结果显示,DoTCP2(GenBank登录号:PP534463)cDNA全长1 122 bp,位于第7号染色体,含有4个外显子和3个内含子,编码长度为373个氨基酸的多肽链,与参考序列(序列号:LOC110114709)进行比对分析,发现存在4个碱基差异,其中3个为同义替换。DoTCP2蛋白理论相对分子量为40 600,理论等电点为8.94,为亲水性稳定蛋白质,具有TCP保守结构域,定位于细胞核,无信号肽和跨膜结构域,含有46个磷酸化位点。DoTCP2与鼓槌石斛(Dendrobium chrysotoxum)TCP蛋白序列同源性高达97.87%,且遗传距离最近。DoTCP2基因具有组织表达特异性,在根组织中的相对表达量极显著高于其他组织,可能在根发育和营养物质的吸收以及运输等过程中发挥作用。DoTCP2基因在低温胁迫处理6 h时的相对表达量极显著上调(P<0.01),暗示DoTCP2可能在低温胁迫响应中发挥重要作用;在模拟干旱和外源脱落酸(ABA)处理下,DoTCP2基因的相对表达量呈现下降趋势,且在处理24 h后相对表达量最低,与处理前差异达到极显著水平(P<0.01),推测该基因可能通过ABA信号通路在调控铁皮石斛应答干旱胁迫中发挥负调控作用。本研究结果可为深入探究DoTCP2基因的抗逆功能及其在植物应对非生物胁迫响应中的潜在作用机制提供前期研究基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 tcp转录因子 Dotcp2基因 非生物胁迫 表达模式
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‘红阳’猕猴桃TCP基因家族鉴定及其在果实中的表达分析 被引量：1
13
作者 宋姝熠 蒋开秀 +2 位作者 刘欢艳 黄亚成 刘林娅 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期190-201,共12页
【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’... 【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’猕猴桃TCP转录因子的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件及物种间共线性关系等。利用转录组数据和RT-qPCR分析‘红阳’猕猴桃中AcTCPs在果实不同发育时期、不同组织中和激素处理下的表达模式。【结果】在‘红阳’猕猴桃中鉴定出分布于19条染色体上的40个含有完整TCP结构域的AcTCPs基因,分别命名为AcTCP1-AcTCP40。系统发育分析、保守基序和基因结构分析将它们分为PCF(21)、CIN(12)和CYC/TB1(7),且全基因复制或片段复制在‘红阳’猕猴桃TCP基因家族的扩展中发挥了重要作用。组织特异性分析表明,6个候选基因在雄花和果实中高表达,果实不同发育时期RT-qRCR结果显示,AcTCP1在果实发育后期高表达,AcTCP11、AcTCP1、AcTCP35、AcTCP10和AcTCP32在果实发育前期高表达,且表达模式与转录组结果一致。对果实进行外源激素处理结果表明,脱落酸(ABA)和乙烯(ET)处理下调了6个候选AcTCPs的表达;赤霉素(GA_(3))处理初期上调了AcTCP1、AcTCP35和AcTCP32的表达,氯吡苯脲(CPPU)处理初期上调了Ac TCP35和AcTCP32的表达,其余AcTCPs的表达均被GA_(3)和CPPU下调。【结论】从‘红阳’猕猴桃全基因组中系统鉴定出40个TCP基因,6个候选基因在果实和雄花中高表达。在果实中AcTCP35、AcTCP32、AcTCP1、AcTCP10、AcTCP11和AcTCP20的表达与果实发育密切相关且受到外源激素(ABA、ET、GA_(3)和CPPU)的调控。 展开更多
关键词 ‘红阳’猕猴桃 tcp转录因子 全基因组鉴定 生物信息学 组织差异 表达模式分析 激素处理
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基于ARM和TCP/IP Lean的智能家居控制器的研究 被引量：7
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作者 娄伟 施国英 +1 位作者 吴德军 卢正杰 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2010年第7期1484-1487,共4页
为了进一步提高人们的生活质量,设计了一种成本低廉、面向家庭的远程智能家居控制器,主要用于控制电灯、电冰箱、空调等家用电器的运行状态。采用ARM处理器S3C44B0作为核心处理单元,硬件平台由S3C44B0和以太网控制器CS8900等器件组成,... 为了进一步提高人们的生活质量,设计了一种成本低廉、面向家庭的远程智能家居控制器,主要用于控制电灯、电冰箱、空调等家用电器的运行状态。采用ARM处理器S3C44B0作为核心处理单元,硬件平台由S3C44B0和以太网控制器CS8900等器件组成,软件主要以精简TCP/IP协议栈为核心,两者共同组建了嵌入式智能家居Web服务器。在网络畅通的情况下,用户通过点击嵌入在硬件平台的Web页面上的按钮来控制相应的家用电器。 展开更多
关键词 ARM tcp/iplean S3C44B0 以太网控制器 智能家居
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兰科植物TCP转录因子研究进展
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作者 陈嘉忆 黄婷婷 +3 位作者 熊龙伟 黎鹏 郭丽婷 艾叶 《亚热带植物科学》 2025年第2期229-238,共10页
TCP转录因子家族含有一个由59个氨基酸组成的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序,在植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应等方面存在广泛调控作用。兰科植物因其花型奇特、花色多样、叶艺丰富等特点,具有重要的观赏、文化和经济价值。本文概括... TCP转录因子家族含有一个由59个氨基酸组成的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序,在植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应等方面存在广泛调控作用。兰科植物因其花型奇特、花色多样、叶艺丰富等特点,具有重要的观赏、文化和经济价值。本文概括TCP转录因子的结构以及分类,并对其在兰科植物花、叶等器官形态建成中的功能进行综述,为兰科植物TCP基因功能研究提供理论依据。 展开更多
关键词 兰科植物 tcp转录因子 器官形态 细胞分化 MIRNA
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基于工业机器人的Modbus TCP通信设计与实现 被引量：1
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作者 陈霞 黄香平 《工业控制计算机》 2025年第8期20-21,24,共3页
以埃夫特工业机器人为例,设计了Modbus TCP通信客户端实现对埃夫特工业机器人内存数据的读写操作。为了兼容其他具备Modbus TCP协议通信的工业机器人,减少对工业机器人硬件地址的依赖性,采用Modbus TCP协议地址可配置方式实现对不同工... 以埃夫特工业机器人为例,设计了Modbus TCP通信客户端实现对埃夫特工业机器人内存数据的读写操作。为了兼容其他具备Modbus TCP协议通信的工业机器人,减少对工业机器人硬件地址的依赖性,采用Modbus TCP协议地址可配置方式实现对不同工业机器人的通信接入。最后针对埃夫特ER3-600系列6自由度工业机器人进行系统测试,实现对其内存数据的读写操作,达到预期效果。 展开更多
关键词 Modbus tcp协议 工业机器人 PyQt5
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蕈树TCP基因家族鉴定及组织表达分析
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作者 王安邦 叶兴状 +3 位作者 杨巧莹 刘美利 陈志云 张国防 《亚热带植物科学》 2025年第3期249-260,共12页
TCP基因家族在植物叶形建成方面具有重要调节功能。以蕈树Altingia chinensis全基因组数据为依据,利用生物信息学方法,对AcTCP基因家族进行鉴定,并对其基因结构、蛋白理化性质、染色体和蛋白亚细胞定位、共线性、启动子顺式作用元件和... TCP基因家族在植物叶形建成方面具有重要调节功能。以蕈树Altingia chinensis全基因组数据为依据,利用生物信息学方法,对AcTCP基因家族进行鉴定,并对其基因结构、蛋白理化性质、染色体和蛋白亚细胞定位、共线性、启动子顺式作用元件和转录组表达模式进行分析。结果表明,从蕈树基因组中鉴定到21个AcTCPs。所有AcTCPs均含有TCP superfamily结构域,只有AcTCP3单独具有nitrilase superfamily结构域。蕈树TCPs分为PCF(AcTCP1/2/3/4/7/8/9/11/12/17/20/21)、CIN(AcTCP5/6/13/15/16/19)和CYC/TB1(AcTCP10/14/18)3类。AcTCPs蛋白包含197~554个氨基酸,亚细胞定位除AcTCP3位于细胞膜,其余均位于细胞核,均为不稳定亲水蛋白。AcTCPs基因的启动子含有光、激素、胁迫及生长发育相关元件。转录组表达分析表明,AcTCPs基因存在组织特异性,其中AcTCP6/7/16在叶-Ⅰ(3月取样)中特异高效表达,但同一亚家族大部分成员的表达模式相似。从21个AcTCPs成员中挖掘出AcTCP16、AcTCP19和AcTCP20三个与蕈树叶形发育相关的关键潜在基因,推测蕈树TCPs在光、植物生长发育、激素和胁迫响应中发挥重要作用。 展开更多
关键词 蕈树 tcp基因家族 生物信息学 组织表达
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基于TCP/IP的FANUC机器人数据通信系统研究
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作者 许东伟 周龙祥 刘建群 《机电工程技术》 2025年第24期125-129,共5页
为了提高FANUC机器人与外部系统之间数据通信的效率与稳定性,针对采用ASCII编码通信时存在的报文冗长、解析效率低和系统开销大的问题,设计并实现了一种基于TCP/IP协议的二进制报文通信系统。系统构建了客户端-服务器通信框架,服务器基... 为了提高FANUC机器人与外部系统之间数据通信的效率与稳定性,针对采用ASCII编码通信时存在的报文冗长、解析效率低和系统开销大的问题,设计并实现了一种基于TCP/IP协议的二进制报文通信系统。系统构建了客户端-服务器通信框架,服务器基于Qt开发通信软件,客户端使用KAREL语言编写机器人通信程序;通信过程采用请求-响应模式,由上位机发起请求,机器人进行解析与执行并返回结果,实现完整的通信闭环;根据FANUC机器人寄存器数据类型多样的特点,设计了包含定长报文头、可变数据域及校验字段的报文模型,支持多种类型数据传输;引入了数据校验与错误反馈机制,提升了通信的准确性与可诊断性。实验在仿真及FANUC ARC Mate 120iD/35机器人浴缸打磨平台进行了测试,仿真下平均通信延时为3.6 ms,实机为10.7 ms,浮点数传输精度无损失,连续运行无异常。结果验证了系统的高效性、实时性和稳定性,为工业场景中多设备协同控制提供了可靠的通信解决方案。 展开更多
关键词 tcp/IP FANUC机器人 数据通信 KAREL语言 二进制报文
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栀子TCP基因家族鉴定及响应盐胁迫表达模式分析
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作者 林宇清 朱渊铭 +5 位作者 陈丝雨 陈德星 张琼艺 陈淑颖 张培兰 邹双全 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期126-132,共7页
为明确栀子TCP基因家族及盐胁迫响应,利用生物信息学手段对栀子TCP基因家族进行鉴定、分析和盐胁迫表达试验分析。结果表明,在栀子中共鉴定出16个TCP基因,分为PCF、CYC和CIN共3个亚家族。保守基序、基因结构和理化性质表明,同亚家族基... 为明确栀子TCP基因家族及盐胁迫响应,利用生物信息学手段对栀子TCP基因家族进行鉴定、分析和盐胁迫表达试验分析。结果表明,在栀子中共鉴定出16个TCP基因,分为PCF、CYC和CIN共3个亚家族。保守基序、基因结构和理化性质表明,同亚家族基因保守基序相似,不同亚家族的基因保守基序差异较大,16个栀子TCP基因均为亲水蛋白。染色体定位表明,16个栀子TCP基因不均匀地分布在8条染色体上,且包含多个片断段复制事件。顺式作用元件分析发现,栀子TCP基因中含有多种与植物生长发育、应激反应及激素调节相关的作用元件,以胁迫响应元件MYB和MYc最多;盐胁迫表达量显示,栀子TCP基因均能响应盐胁迫,部分基因在重度盐胁迫特异性表达,推测GjTCP13、GjTCP12和GjTCP6可能为栀子耐盐调控的关键基因。综上所述,栀子TCP基因家族成员能够积极响应盐胁迫,增强栀子的耐盐抗性。 展开更多
关键词 tcp基因家族 栀子 生物信息学 盐胁迫
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DeepSeek效应:科技创新的技术-资本-政治(TCP)范式与路径选择 被引量：8
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作者 王奔 方兴东 钟祥铭 《青年记者》 2025年第3期51-60,共10页
历次IT重大技术突破,基本上都是美国企业在引领主流化进程,直到DeepSeek颠覆了这一基本定式。“DeepSeek时刻”及其引发的“DeepSeek效应”,打破了中国企业只善于在晚期大众化阶段后来居上的固有认知,改写了中国高科技的全球叙事。这是... 历次IT重大技术突破,基本上都是美国企业在引领主流化进程,直到DeepSeek颠覆了这一基本定式。“DeepSeek时刻”及其引发的“DeepSeek效应”,打破了中国企业只善于在晚期大众化阶段后来居上的固有认知,改写了中国高科技的全球叙事。这是“DeepSeek效应”真正的力量之源。DeepSeek冲击了美国技术—资本—政治三位一体,也就是硅谷—华尔街—华盛顿三者强势的联姻模式,为人们重新理解美国对华科技战的基本策略,尤其是重估中美AI博弈未来走势的内在逻辑,提供了新的视角。全面反思自上而下、政治意识形态主导的科技战略和政策,回归自下而上、以科技创新造福人类的初心,是DeepSeek带给我们最重要,也是最容易被忽视的启示。秉承纯粹科技创新理想的DeepSeek,正在复现早期硅谷黄金时代的价值观和时代精神,为中美乃至世界各国重估科技创新政策和战略,提供宝贵的启发和参考。 展开更多
关键词 DeepSeek效应 技术—资本—政治(tcp) 科技战 科技创新 AI博弈
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