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肺腺癌细胞恶性T细胞扩增序列1调控CXCL1表达介导MDSCs趋化作用及机制初探
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作者 王文心 周禹同 +4 位作者 穆原 杨盛润 蔡可滢 阮浩宇 金岳心子 《临床检验杂志》 2026年第1期41-47,共7页
目的探讨肺腺癌细胞恶性T细胞扩增序列1(MCTS1)介导骨髓源性抑制细胞(MDSCs)趋化的作用机制。方法利用生物信息学(http://timer.cistrome.org/#tab-8258-2)分析癌症基因组图谱(TCGA)中肺腺癌组织(n=515)MCTS1的表达水平与MDSCs浸润之间... 目的探讨肺腺癌细胞恶性T细胞扩增序列1(MCTS1)介导骨髓源性抑制细胞(MDSCs)趋化的作用机制。方法利用生物信息学(http://timer.cistrome.org/#tab-8258-2)分析癌症基因组图谱(TCGA)中肺腺癌组织(n=515)MCTS1的表达水平与MDSCs浸润之间的相关性;利用IL-6+粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)共同诱导人外周血单个核细胞(PBMCs)中MDSCs的生成,流式细胞术检测MDSCs生成比例,CD33磁珠分选MDSCs;收集肺腺癌SPC-A1细胞野生型以及MCTS1敲减和过表达SPC-A1细胞的无血清细胞上清液,利用Transwell小室进行MDSCs的趋化试验并计算趋化指数;羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯(CFSE)标记CD8^(+)T细胞与发生趋化的MDSCs细胞共培养,流式细胞术检测CD8^(+)T细胞的增殖水平;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)测定MDSCs相关趋化因子的mRNA水平;流式多因子芯片技术检测细胞上清液中C-X-C基序趋化因子配体1(CXCL1)的含量;Western blot检测janus激酶2(JAK2)的表达水平以及信号转导子和转录激活子1(STAT1)的活化水平。结果肺腺癌组织MCTS1与MDSCs浸润程度呈正相关(Spearmanρ=0.226,P<0.001);与空白对照组比较,IL-6和GM-CSF共同诱导PBMCs后可显著增加MDSCs的比例(4.95±1.03 vs 0.97±0.24,t=6.54,P<0.01);MCTS1过表达的SPC-A1细胞上清液对MDSCs的趋化指数较对照组显著升高(4.88±0.99 vs 2.94±0.27,q=6.29,P<0.01),而经MCTS1敲减的细胞上清液可使MDSCs的趋化指数显著降低(1.50±0.17 vs 2.94±0.27,q=4.69,P<0.05);MCTS1过表达的SPC-A1细胞中CXCL1 mRNA(2.79±0.16 vs 1.00±0.08,q=28.94,P<0.001)和上清液中蛋白质水平(78.20±6.16 vs 37.50±3.31,q=16.83,P<0.001)均显著升高,而敲减MCTS1则可抑制CXCL1 mRNA(0.53±0.03 vs 1.00±0.08,q=7.64,P<0.01)和蛋白质水平(17.33±1.96 vs 37.50±3.31,q=8.34,P<0.01);此外,与对照组比较,MCTS1过表达组JAK2蛋白的表达水平(2.11±0.15 vs 1.00±0.05,q=19.48,P<0.001)和STAT1的活化水平(2.10±0.19 vs 1.00±0.10,q=15.02,P<0.001)显著升高,而MCTS1敲减组JAK2蛋白水平(0.56±0.06 vs 1.00±0.05,q=7.61,P<0.01)和STAT1的活化水平均显著降低(0.46±0.07 vs 1.00±0.05,q=7.45,P<0.01)。结论肺腺癌细胞MCTS1通过JAK2-STAT1信号通路调控CXCL1的表达,并介导MDSCs的趋化。 展开更多
关键词 肺腺癌 恶性t细胞扩增序列 骨髓源性抑制细胞 趋化作用 C-X-C基序趋化因子配体1
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TRANSPORTATION INEQUALITIES FOR WEAKLY DEPENDENT SEQUENCES
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作者 马宇韬 《Acta Mathematica Scientia》 SCIE CSCD 2011年第4期1494-1502,共9页
In [3], they gave necessary and sufficient condition for T 1 C and then as applications T 1 C for weakly dependent sequences was established. In this note, based on Gozlan-L′eonard characterization for W 1 H -inequal... In [3], they gave necessary and sufficient condition for T 1 C and then as applications T 1 C for weakly dependent sequences was established. In this note, based on Gozlan-L′eonard characterization for W 1 H -inequalities, we extends this result to W 1 H inequalities. 展开更多
关键词 W 1 H inequality t p (C)-inequality weakly dependent sequences tensorization
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hPARP-1基因cDNA翻译起始区域的T载体克隆 被引量:1
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作者 唐焕文 庄志雄 +4 位作者 何云 梁海荣 江高峰 刘起展 范瑞泉 《卫生毒理学杂志》 CSCD 北大核心 2003年第4期206-208,共3页
目的 克隆及构建含限制性内切酶位点BamHⅠ、SacⅠ的人聚腺苷二磷酸核糖聚合酶 1(hPARP 1)基因cDNA翻译起始区域的pGEM T S载体 ,为以后的亚克隆和毒理学研究提供实验材料。方法 采用RT PCR方法 ,用正常人胚肺成纤维细胞 (HLF)抽提的... 目的 克隆及构建含限制性内切酶位点BamHⅠ、SacⅠ的人聚腺苷二磷酸核糖聚合酶 1(hPARP 1)基因cDNA翻译起始区域的pGEM T S载体 ,为以后的亚克隆和毒理学研究提供实验材料。方法 采用RT PCR方法 ,用正常人胚肺成纤维细胞 (HLF)抽提的总RNA逆转录成cDNA ,再以cDNA为模板 ,扩增hPARP 1基因片段 ,并直接与T载体连接后转化大肠埃希菌DH5α ,用蓝 (白 )斑试验筛选出阳性克隆 ,抽提重组质粒并进行PCR及酶切鉴定 ,再行序列分析。结果 经RT PCR获得 5 0 7bp含限制性内切酶位点的阳性产物 ,T载体克隆、PCR及酶切鉴定和序列分析后证实 ,克隆片段与Genbank中该基因的序列同源性为 99 9%。结论 该实验成功地构建了含hPARP 1基因cDNA翻译起始区域的T载体克隆 。 展开更多
关键词 基因 t载体 克隆 分子生物学
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云南元江普通野生稻群体Wx基因(CT)_n重复序列和第1内含子G/T位碱基分析 被引量:3
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作者 孙一丁 陆辉 许明辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期647-649,654,共4页
对云南元江普通野生稻90个个体Wx基因区段内的重复序列(CT)n和第1内含子供体+1位碱基G/T分别进行了比较分析。结果表明云南元江普通野生稻3个居群中的90个单株在重复序列(CT)n和G/T位点纯合一致,没有多态性;其G/T位点碱基均为G;其重复序... 对云南元江普通野生稻90个个体Wx基因区段内的重复序列(CT)n和第1内含子供体+1位碱基G/T分别进行了比较分析。结果表明云南元江普通野生稻3个居群中的90个单株在重复序列(CT)n和G/T位点纯合一致,没有多态性;其G/T位点碱基均为G;其重复序列(CT)n基因型与云南地方籼稻品种优势基因型相似但又有所区别。本研究结果为云南元江普通野生稻Wx基因利用和在稻种进化上的地位提供了信息。 展开更多
关键词 云南 普通野生稻 WX基因 微卫星重复序列 G/t碱基 遗传多样性
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核基质结合区结合蛋白SATB1上调乳腺癌干细胞表型CD44^+/CD24^-的表达 被引量:2
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作者 陈忠清 张乔安 +2 位作者 包芸 周仲文 许祖德 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期309-313,共5页
目的探讨核基质结合区结合蛋白,富含A-T序列特异性结合蛋白1(special A-T rich sequencebinding protein 1,SATB1)对乳腺癌干细胞表型CD44+/CD24-的影响及机制。方法用SATB1相关小干扰RNA(SATB1related small interfering RNA,SATB1-siR... 目的探讨核基质结合区结合蛋白,富含A-T序列特异性结合蛋白1(special A-T rich sequencebinding protein 1,SATB1)对乳腺癌干细胞表型CD44+/CD24-的影响及机制。方法用SATB1相关小干扰RNA(SATB1related small interfering RNA,SATB1-siRNA)双链寡核糖核酸干扰MDA-MB-231细胞;pEGFP-N1-SATB1-GFP真核表达质粒瞬时转染MCF7细胞后,流式细胞术检测SATB1对乳腺癌干细胞表型CD44+/CD24-表达的影响。结果 MCF7细胞转染SATB1后,表达CD44+/CD24-的细胞比例明显升高;MDA-MB-231细胞在SATB1-siRNA干扰后,表达CD44+/CD24-的细胞比例明显降低(P<0.05)。结论 SATB1可能在形成并维持乳腺癌肿瘤干细胞特性中起重要作用。 展开更多
关键词 A-t序列特异性结合蛋白1(SAtB1) 乳腺癌干细胞(BrCSC) CD44+/CD24-
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VTCN1调控结肠癌细胞长链非编码RNA和mRNA的全基因表达谱分析 被引量:2
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作者 褚以忞 周锋利 +5 位作者 徐莹 蒯榕 李吉 侯照远 杨大明 彭海霞 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期270-277,共8页
目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1... 目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1116中过表达VTCN1,抽提RNA并测序,与阴性对照组比较分析差异表达的lncRNA和m RNA,并任意选取差异表达的lncRNA(3条)和mRNA(2条)进行实时定量PCR(qRT-PCR)验证RNA测序结果的准确性。通过BLAST2GO和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析预测这些差异表达lncRNA和m RNA的相关功能。利用线上平台GEPIA18(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)分析差异表达lncRNA与结直肠癌患者生存期的相关性。结果·通过RNA测序在过表达VTCN1的SW1116细胞中发现了167条差异基因,包括39条lncRNA和128条m RNA。qRT-PCR检验结果与RNA测序结果变化趋势一致。生物信息学分析结果显示这些受VTCN1调控的差异基因可能参与了内质网中的蛋白处理、mRNA监控信号通路。另外,在过表达VTCN1的结肠癌细胞中明显上调的3条lncRNA(DNAJC9-AS1、HCG27和RP11-339B21.13),同时也是预测结直肠癌患者总生存期的独立因子。结论·在结肠癌细胞中VTCN1对下游多条lncRNA和mRNA具有调控作用,这些lncRNA和mRNA可能参与了内质网中的蛋白处理和mRNA监控信号通路。 展开更多
关键词 含V-sett细胞激活抑制因子 结肠癌 长链非编码RNA RNA测序 生物信息学分析
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蕴含K_(r+1)-K_(1,t)可图序列的极值问题(英文) 被引量:1
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作者 赖春晖 孙玉珍 《漳州师范学院学报(自然科学版)》 2007年第1期9-12,共4页
序列S称为蕴含K_m-H可图序列如果S有一个实现包含K_m-H作为子图,本文给出了序列π∈GS_n是蕴含 K_(r+1)- K_(1,t)可图序列的充分条件.
关键词 序列 蕴含Kr+1-K1 t可图序列
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(k+1)-连通无K_(1,r)-图是Hamilton-连通的两个充分条件
8
作者 詹明权 徐新萍 《辽宁大学学报(自然科学版)》 CAS 1998年第4期301-308,共8页
一个图若不含与K1,r(r3)同构的导出子图,则称它为无K1,r-图.本文将运用T-插点方法,通过对图的独立集的邻域交的研究,给出(k+1)-连通无K1,r-图(r4)是Hamilton-连通的两个充分条件.
关键词 哈密顿连通 独立集 邻域交 连通图 充分条件
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人恶性T细胞扩增序列1在肾透明细胞癌预后中作用及其与免疫浸润关系
9
作者 杨萌 钱城 朱建国 《社区医学杂志》 CAS 2023年第16期822-829,共8页
目的探讨肾透明细胞癌组织中的人恶性T细胞扩增序列1(MCTS1/MCT1)表达情况及其与肾透明细胞癌临床病理参数之间的关系,通过各种生物信息学工具预测MCTS1靶基因及进行相关功能分析,为进一步研究MCTS1为靶点的基因治疗提供理论依据。方法... 目的探讨肾透明细胞癌组织中的人恶性T细胞扩增序列1(MCTS1/MCT1)表达情况及其与肾透明细胞癌临床病理参数之间的关系,通过各种生物信息学工具预测MCTS1靶基因及进行相关功能分析,为进一步研究MCTS1为靶点的基因治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取肾透明细胞癌患者的表达谱和临床信息。应用Wilcoxon秩和检验,比较肾透明细胞癌组织和正常肾组织中MCTS1的表达水平。为挖掘潜在的信号通路和生物学功能进行了功能富集分析。免疫细胞浸润采用单样本基因集富集分析。应用UALCAN和MethSURV数据库分析MCTS1的甲基化状态。采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析确定MCTS1的预后价值。构建诺模图预测肾透明细胞癌1、3和5年的总生存率(OS)。采用Log-rank检验对P值进行检验。结果基于HPA数据库分析肾透明细胞癌中MCTS1的组织表达水平,MCTS1在肾透明细胞癌组织中的表达水平高于邻近组织,差异有统计学意义,P<0.001;在不同的亚组中,用Kaplan-Meier方法评估MCTS1表达在肾透明细胞癌患者中的预后价值,结果显示,MCTS1的组织表达水平与M病理分期、组织学类型和年龄增长密切相关,差异有统计学意义,P<0.001;当MCTS1的过度表达时OS显著下降,差异有统计学意义,P<0.001;多因素Cox分析确定MCTS1是OS的独立阴性预后标志,合成了符合指数为0.841的OS诺模图,差异有统计学意义,OR=2.574,95%CI为1.446~4.683,P=0.005。UALCAN和MethSURV数据库分析MCTS1的甲基化状态,MCTS1的低甲基化状态与不良预后相关,肾透明细胞肿瘤组织在启动子处的DNA甲基化水平明显低于正常肾脏组织,差异有统计学意义,P<0.001。单样本基因集富集分析结果显示,MCTS1的过度表达与自然杀伤细胞、辅助性T细胞17、肥大细胞和浆细胞样树突状细胞的免疫细胞浸润水平呈负相关,差异有统计学意义,P<0.001。结论MCTS1高表达是肾透明细胞癌预后的一个独立不利因素,与肾透明细胞癌侵袭性的临床特征和不利的免疫浸润密切相关,为进一步研究MCTS1为靶点的基因治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 人恶性t细胞扩增序列1 肾透明细胞癌 甲基化 免疫浸润 生物信息学
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Assessment the Optimal Effect of Time of Repetition: Extrinsic Pulse Parameter on Gd-DTPA Enhanced, Spin-Echo T1-Weighted MR Images under Low Magnetic Field Strength
10
作者 Bimali Sanjeevani Weerakoon Toshiaki Osuga Takehisa Konishi 《International Journal of Medical Physics, Clinical Engineering and Radiation Oncology》 2016年第3期196-203,共9页
The contrast agent concentration, the time of repetition (TR) and magnetic field strength are significant parameters that influence for the accurate signal intensity (SI) in quantitative Magnetic Resonance Imaging (MR... The contrast agent concentration, the time of repetition (TR) and magnetic field strength are significant parameters that influence for the accurate signal intensity (SI) in quantitative Magnetic Resonance Imaging (MRI). Therefore, this study was conducted to investigate and refine the dependence and the optimal effect of Time of Repetition (TR) on the relationship between signal intensity and Gd-DTPA (Gadolinium-diethylene-triaminepenta-acetic acid) concentration, after applying two-dimensional (2D) Spin Echo (SE) pulse sequence under low-field MRI. In addition to that, the optimal concentration of Gd-DTPA at given sequence parameters at low-field MRI was also evaluated. A water-filled phantom was constructed for a range of Gd-DTPA concentrations (0 - 6 mmol/L) and the mean signal intensities (SIs) were assessed in the defined region of interest on T1-weighted images with different TR values (40 - 2000 ms). The generated signal-concentration curves for Gd-DTPA revealed that increasing TR was associated with the increase of the overall SIs and the maximum relationship between SI to concentration. Moreover, the required Gd-DTPA concentration to produce the maximum SI was associated to decrease with the increase of TR. In addition to this, the application of beyond 100 ms TR values in this study with relatively higher concentrations (beyond 1 - 2 mmol/L) has resulted predominantly non-linear patterns in the signal-concentration curves and it appears the saturation or decay of the SIs due to T2 effect. From these results, it can be suggested that the selection of relatively lower Gd-DTPA concentration ( mmol/L) with less than 800 ms (<800 ms) TR values can produce a better linear relationship between the concertation and SIs in T1-weighted SE low field contrast-enhanced MRI. Furthermore, this study also outlined the significance and necessity of the optimization of TR in SE sequence in low field MRI prior to a particular examination. 展开更多
关键词 Gd-DtPA Concentration Spin Echo Pulse sequence Signal Intensity time of Repetition t1-Weighted Images Low Field MRI
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单细胞转录组数据揭示PHLDA1是卵巢癌T细胞耗竭的关键分子
11
作者 高燕 韩晓阳 +2 位作者 程瑾 侯丽莎 岳文涛 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2024年第2期79-87,共9页
目的通过绘制高级别浆液性卵巢癌(High-grade serous ovarian cancer,HGSOC)单细胞转录组图谱,筛选并验证与CD8^(+)T细胞耗竭相关的关键基因。方法利用实验室前期的单细胞测序数据(SRA数据库:PRJNA756768),并整合数据库中5例HGSOC测序数... 目的通过绘制高级别浆液性卵巢癌(High-grade serous ovarian cancer,HGSOC)单细胞转录组图谱,筛选并验证与CD8^(+)T细胞耗竭相关的关键基因。方法利用实验室前期的单细胞测序数据(SRA数据库:PRJNA756768),并整合数据库中5例HGSOC测序数据,分析肿瘤微环境中T细胞的具体亚型,拟时序分析探究T细胞亚群分化轨迹,差异基因富集确定免疫抑制的CD8^(+)IL-2^(Low)和CD8^(+)IFN-γ^(Low)细胞亚群及差异基因,再结合患者预后筛选出与CD8^(+)T细胞耗竭密切相关的候选分子。流式分析人PBMC中的T细胞激活到耗竭过程中Pleckstrin同源样结构域家族A成员1(Pleckstrin homology-like domain,family A,member 1,PHLDA1)在CD8^(+)T、CD4^(+)T及Treg细胞上的表达,ELISA检测PHLDA1 High和PHLDA1 Low的CD8^(+)T细胞分泌IFN-γ和IL-2的水平,最后流式数据分析PHLDA1与耗竭标志物PD-1、TIM-3的关联。结果将T细胞按三种方式分群:(1)IL-2 High和IL-2^(Low);(2)IFN-γ^(High)和IFN-γ^(Low);(3)耗竭和杀伤T细胞。随后取其差异基因的交集,最终筛选到关键基因PHLDA1。流式分析提示T细胞激活到耗竭的过程中,PHLDA1在CD8^(+)T、CD4^(+)T及Treg细胞上的表达持续升高;ELISA结果显示CD8^(+)PHLDA1^(High)的T细胞分泌IFN-γ和IL-2的水平显著低于CD8^(+)PHLDA1^(Low)T细胞。同时,CD8^(+)PHLDA1^(High)T细胞亚群可同时覆盖CD8^(+)TIM-3^(+)和CD8^(+)PD-1^(+)的耗竭T细胞类型。结论本研究基于单细胞测序数据筛选到PHLDA1是卵巢癌CD8^(+)T细胞耗竭的关键分子,该研究为卵巢癌的免疫治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 单细胞测序 卵巢癌 Pleckstrin同源样结构域家族A成员1 t细胞耗竭
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基于菌群人源化模型探究温下方对非小细胞肺癌PD-1免疫治疗的调节作用
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作者 陈岭楠 张初峰 季旭明 《浙江中医药大学学报》 2025年第11期1363-1371,共9页
[目的]探究温下方对菌群人源化荷瘤小鼠非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)程序性死亡受体1(programmed death receptor 1,PD-1)免疫治疗的影响。[方法]通过粪菌移植和皮下注射Lewis肺癌细胞,构建菌群人源化荷瘤小鼠模型,... [目的]探究温下方对菌群人源化荷瘤小鼠非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)程序性死亡受体1(programmed death receptor 1,PD-1)免疫治疗的影响。[方法]通过粪菌移植和皮下注射Lewis肺癌细胞,构建菌群人源化荷瘤小鼠模型,随机分为移植PD-1应答者菌群(fecal microbiota transplantation from PD-1 responders,R-FMT)组,移植PD-1无应答者菌群(fecal microbiota transplantation from PD-1 non-responders,N-FMT)组,N-FMT+温下方低、中、高剂量组(10、20、40 g·kg^(-1))。5组均给予PD-1单抗300μg腹腔注射,2次/周,温下方组同时联合温下方水煎液灌胃给药,1次/d,干预持续15 d,其间记录小鼠肿瘤体积。15 d后处死小鼠,称量肿瘤质量;16S核糖体RNA测序技术(16S ribosomal RNA sequencing technology,16S rRNA)检测肠道菌群变化;苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色观察肿瘤组织病理情况;免疫组化检测肿瘤组织中树突状细胞(dendritic cells,DCs)、CD8阳性T细胞(CD8 positive T cells,CD8^(+)T cells)和调节性T细胞(regulatory T cells,Tregs)标志物S-100(S-100 protein,S-100)、分化簇8(cluster of differentiation 8,CD8)和叉头框蛋白P3(forkhead box protein P3,FoxP3)蛋白表达;酶联免疫吸附试验(enzymelinked immunosorbent assay,ELISA)检测血清中干扰素-α(interferon-α,IFN-α)、IFN-β、IFN-γ及白细胞介素-12(interleukin-12,IL-12)水平。[结果]与N-FMT组比较,温下方各剂量组小鼠肿瘤体积和肿瘤质量显著降低(P<0.01)。16S rRNA测序显示,温下方干预后小鼠肠道菌群α多样性明显增加(P<0.05),双歧杆菌、另枝菌及粪杆菌等菌属丰度显著增加(P<0.001)。HE染色显示,N-FMT组肿瘤细胞坏死不明显,温下方干预后肿瘤细胞坏死较明显。免疫组化显示,与N-FMT组比较,温下方干预后DCs和CD8^(+)T细胞标志蛋白S-100和CD8表达均明显升高,而Treg细胞标志蛋白FoxP3明显下降(P<0.05,P<0.01)。ELISA显示,与N-FMT组比较,温下方干预后血清中IFN-α、IFN-β、IFN-γ、IL-12水平显著增高(P<0.05,P<0.01)。[结论]温下方可通过提升肠道菌群α多样性,增加双歧杆菌、另枝菌和粪杆菌等有利菌属丰度,促进DCs、CD8^(+)T细胞浸润,减少Treg细胞数量,提升IFN和IL-12水平,从而改善菌群人源化荷瘤小鼠PD-1免疫治疗效果。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 PD-1免疫治疗 肠道菌群 温下方 16SrRNA测序 菌群人源化 树突状细胞 调节性t细胞
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黑色素瘤抗原-1基因的克隆与序列分析 被引量:1
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作者 何炜 李克 +1 位作者 朱涵 樊青霞 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2008年第1期65-67,共3页
目的:克隆黑色素瘤抗原-1(MAGE-1)基因并进行序列分析。方法:从人肝细胞性肝癌(HCC)组织中提取总RNA,通过RT-PCR扩增出MAGE-1基因,酶切鉴定后将其插入pGEM-Teasy载体,对其进行序列测定并与GenBank中已知序列进行同源性分析。结果:所克隆... 目的:克隆黑色素瘤抗原-1(MAGE-1)基因并进行序列分析。方法:从人肝细胞性肝癌(HCC)组织中提取总RNA,通过RT-PCR扩增出MAGE-1基因,酶切鉴定后将其插入pGEM-Teasy载体,对其进行序列测定并与GenBank中已知序列进行同源性分析。结果:所克隆的MAGE-1基因与GenBank中的MAGE-1基因序列相比较,仅有4个碱基存在差异,同源性为99.7%,而且仅有1处碱基差异引起了氨基酸改变。结论:从人HCC组织中成功克隆了MAGE-1基因。 展开更多
关键词 MAGE-1 t载体 基因克隆 序列分析
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牛金属硫蛋白素bMTcin编码区的克隆及其在大肠杆菌中的表达研究
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作者 袁静 唐兴芳 +1 位作者 刘变芳 李元瑞 《西北农业学报》 CAS CSCD 2002年第4期28-31,87,共5页
以本实验室由RT—PCR扩增得到的含有牛金属硫蛋白(bMT)cDNA的重组质粒pYJ101为模板,PCR扩增出牛金属硫蛋白素bMTcin的编码区,将其克隆到pGEM—T载体上并进行DNA序列测定。利用融合表达载体pGEX4T—1,在E.coli中诱导表达bMTcin,经过Gluta... 以本实验室由RT—PCR扩增得到的含有牛金属硫蛋白(bMT)cDNA的重组质粒pYJ101为模板,PCR扩增出牛金属硫蛋白素bMTcin的编码区,将其克隆到pGEM—T载体上并进行DNA序列测定。利用融合表达载体pGEX4T—1,在E.coli中诱导表达bMTcin,经过Glutathine Sepharose 4B亲和层析纯化后,SDS—PAGE检测GST:bMTcin的条带。结果表明,所克隆的bMTcin序列全长为141bp,其DNA序列与原模板中的序列完全相同,与GenBank中另外5个bMTcin DNA相比,第31位和86位与Conneely的序列为A和G,导致第11位(Thr)和29位(Arg)的氨基酸不同于其他4个序列(11位为Ala,29位为Lys)。融合表达产物亲和层析纯化后,用SDS-PAGE检测可见融合蛋白GST:bMTcin的条带,紫外分光光度计测定,融合蛋白GST:bMTcin的表达量大约为1.1mg/L发酵液。 展开更多
关键词 牛金属硫蛋白素bMtcin 编码区 克隆 大肠杆菌 表达 pGEM-t载体 DNA序列分析 pGEX4t-1
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Chryseobacterium chengduensis sp. nov. isolated from the air of captive giant panda enclosures in Chengdu, China 被引量:1
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作者 Cai-fang WEN Li-xin XI +10 位作者 Shan ZHAO Zhong-xiang HAO Lu LUO Hong LIAO Zhen-rong CHEN Rong SHE Guo-quan HAN San-jie CAO Rui WU Qi-gui YAN Rong HOU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2016年第8期610-618,共9页
A Gram-negative, aerobic, non-motile, rod-shaped bacterial strain, designated 25-1T, was isolated from the air inside giant panda enclosures at the Chengdu Research Base of Giant Panda Breeding, China. Strain 25-1T gr... A Gram-negative, aerobic, non-motile, rod-shaped bacterial strain, designated 25-1T, was isolated from the air inside giant panda enclosures at the Chengdu Research Base of Giant Panda Breeding, China. Strain 25-1T grew optimally at pH 7.0-8.0, at 28-30 ℃ and in the presence of NaCI concentrations from 0.0% to 0.5%. 16S rRNA gene sequence analysis indicated that strain 25-1m belongs to the genus Chryseobacterium within the family Flavo- bacteriaceae and is related most closely to C. camis G81m (96.4% similarity), C. lathyri RBA2-6T (95.8% similarity), and C. zeae JM1085T (95.8% similarity). Its genomic DNA G+C molar composition was 36.2%. The major cellular fatty acids were iso-C15:0 (44.0%), iso-C17:0 3OH (19.8%) and C16:1 ω7c/16:1 ω6c (12.7%). The only isoprenoid quinone was menaquinone 6 (MK-6). The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, two unidentified amino lipids and two unidentified lipids. The DNA-DNA relatedness between strain 25-1m and C. lathyri RBA2-6T was 38%. Phenotypic, genotypic, and phylogenetic characteristics indicated that strain 25-1T is a novel member of the genus Chryseobacterium, for which the name C. chengduensis sp. nov. is proposed. The type strain is 25-1T (ccmoc AB2015133T=DSM 100396T). 展开更多
关键词 Chryseobacterium chengduensis Giant panda 16S rRNA sequencing Phylogenetic analysis Strain 25-1t
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ON NICE SEQUENCES CONCERNING HAMILTONICITY OF GRAPHS
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作者 LIU Yiping WU Zhengsheng Department of Mathematics, Nanjing Normal University, Nanjing 210024, China 《Systems Science and Mathematical Sciences》 SCIE EI CSCD 1993年第4期373-375,共3页
In the paper, the (k-1)-traceable-nice ((k-1)-T-nice) and k-homogeneously-traceable-nice (k-HT-nice) sequence are defined similarly to the definition of k-Hamilton-nice (k-H-nice) and (k+1)-Hamilton-connec... In the paper, the (k-1)-traceable-nice ((k-1)-T-nice) and k-homogeneously-traceable-nice (k-HT-nice) sequence are defined similarly to the definition of k-Hamilton-nice (k-H-nice) and (k+1)-Hamilton-connected-nice ((k+1)-HC-nice) sequence. Therelationships among these four nice sequences are discussed. The main results are asfollows: Let<sub>η</sub>=(a<sub>1</sub>, a<sub>2</sub>,…, a<sub>k+1</sub> be a non-negative rational sequence, k≥2. (1) If η is(k+1)-HC-nice and a<sub>k+1</sub>=2, then η is k-HT-nice, (2) If η is k-HT-nice and a<sub>k+1</sub>=2,then η is (k-1)-T-nice, (3) If η is k-H-nice, then η is k-HT-nice. Meanwhile, four unsolvedproblems on these topics are proposed. 展开更多
关键词 k-H-nice sequence (k-1)-t-nice sequence k-Ht-nice sequence (k+1)-HC-nice sequence
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A Rao-type Characterization for a Sequence to Have a Realization Containing an Arbitrary Subgraph H
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作者 Jian Hua YIN 《Acta Mathematica Sinica,English Series》 SCIE CSCD 2014年第3期389-394,共6页
Let G be an arbitrary spanning subgraph of the complete graph Kr+1 on r+1 vertices and Kr+1-E(G) be the graph obtained from Kr+1 by deleting all edges of G.A non-increasing sequence π=(d1,d2,...,dn) of nonneg... Let G be an arbitrary spanning subgraph of the complete graph Kr+1 on r+1 vertices and Kr+1-E(G) be the graph obtained from Kr+1 by deleting all edges of G.A non-increasing sequence π=(d1,d2,...,dn) of nonnegative integers is said to be potentially Kr+1-E(G)-graphic if there is a graph on n vertices that has π as its degree sequence and contains Kr+1-E(G) as a subgraph.In this paper,a characterization of π that is potentially Kr+1-E(G)-graphic is given,which is analogous to the Erdo s–Gallai characterization of graphic sequences using a system of inequalities.This is a solution to an open problem due to Lai and Hu.As a corollary,a characterization of π that is potentially Ks,tgraphic can also be obtained,where Ks,t is the complete bipartite graph with partite sets of size s and t.This is a solution to an open problem due to Li and Yin. 展开更多
关键词 Degree sequence potentially Kr+1--E(G)-graphic sequence potentially Ks t-graphicsequence
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一株芽孢杆菌的分类鉴定及其抑菌产物特性 被引量:6
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作者 赵阳国 任南琪 程玉鹏 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2006年第6期1-6,共6页
为挖掘用于生物防治的微生物资源,从土壤中分离到1株芽孢杆菌,经16S rRNA基因序列及16S-23S rRNA间隔区测序比较分析,表明该菌同枯草芽孢杆菌菌株168的相似达100%。该菌株在产生水解酶、最大积累生物量方面远高于同种对照菌株,而且在发... 为挖掘用于生物防治的微生物资源,从土壤中分离到1株芽孢杆菌,经16S rRNA基因序列及16S-23S rRNA间隔区测序比较分析,表明该菌同枯草芽孢杆菌菌株168的相似达100%。该菌株在产生水解酶、最大积累生物量方面远高于同种对照菌株,而且在发酵过程中能够产生抗生素类物质,对农林业危害真菌链格孢具有强烈的抑制作用。研究表明,在Martin液体培养基中发酵时,进入稳定生长期后开始产生抑菌物质,72 h时积累达到最大值。这种抑菌物质的特性为外泌型、脂溶性,可透过孔径0.22μm的微孔滤膜,可耐受100℃5 min,80℃10 min的高温,微碱性条件不影响其生物活性。 展开更多
关键词 芽孢杆菌t-1 16S rDNA测序 抑菌物质 链格孢
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分数阶FGM(p,1,t^(α))模型及其应用 被引量:2
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作者 许泽东 党耀国 丁松 《数学的实践与认识》 2023年第8期267-276,共10页
针对传统GM(1,1)模型预测局限性,以灰色GM(1,1,t^(α))模型为基础,构建了分数阶灰色FGM(p,1,t^(α))预测模型.在已有经典GM(1,1,t^(α))模型的基础上,将一阶累加灰生成拓展为分数阶累加灰生成,使得构建的模型更加符合新信息优先原理.另... 针对传统GM(1,1)模型预测局限性,以灰色GM(1,1,t^(α))模型为基础,构建了分数阶灰色FGM(p,1,t^(α))预测模型.在已有经典GM(1,1,t^(α))模型的基础上,将一阶累加灰生成拓展为分数阶累加灰生成,使得构建的模型更加符合新信息优先原理.另外,依据分数阶微积分理论,将整数阶导数灰色模型推广到分数阶导数灰色模型,并对模型进行求解.其次,讨论了参数几种特殊取值下的该模型的性质及适用范围.以平均相对误差为目标函数,利用粒子群优化算法求解模型最优参数.实际案例结果表明,所建立的模型能够较好的模拟常见振荡数据序列的波动趋势和特征,具有较强的适应性和拟合性能. 展开更多
关键词 振荡序列 分数阶FGM(p 1 t^(α))模型 分数阶导数 粒子群算法
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BTFE与e-THRIVE序列在后颅窝微血管减压术前的应用价值 被引量:2
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作者 曾少庆 江桂华 田军章 《中华神经医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1037-1041,共5页
目的 探讨双激发式稳态A由进动序列(BTFE)与增强T1高分辨率各向同性容积激发序列(e-HRIVE)联合应用在原发性三叉神经痛与面肌痉挛微血管减压术前MR成像中的临床应用价值。方法 回顾性分析自2009年4月至2011年12月广东省第二人民医... 目的 探讨双激发式稳态A由进动序列(BTFE)与增强T1高分辨率各向同性容积激发序列(e-HRIVE)联合应用在原发性三叉神经痛与面肌痉挛微血管减压术前MR成像中的临床应用价值。方法 回顾性分析自2009年4月至2011年12月广东省第二人民医院收治的121例神经微血管压迫患者(三叉神经痛74例,面肌痉挛47例)的影像资料,患者均采用PHILIPS公司ACHIEVA NOVA DUALA-serial 1.5T磁共振扫描仪成像,成像序列除头颅常规序列外,特别进行了BTFE序列及e-THRTVE序列成像。结果 全部患者均经微血管减压术证实。74例患者的三叉神经及47例患者的面神经全部显示清楚。121例患者中共118例(98%)找到责任微血管:74例三叉神经痛患者中有52例(70%1为小脑上动脉压迫;47例面肌痉挛患者中有29例(62%)为小脑前下动脉压迫;压迫方式多呈斜行交叉、平行及垂直交叉相贴。结论 联合应用BTFE、e-THRIVE序列可清楚显示三叉神经、面神经及后颅窝微血管,再结合空间Link功能及多平面重建技术,可以找寻到责任微血管,为三叉神经痛及面肌痉挛患者行微血管减压术提供术前影像学指导。 展开更多
关键词 二三叉神经 面神经 微血管减压术 双激发式稳态自由进动序列 增强t1高分辨率各向同性容积激发序列
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