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家猪核DNA多态标记的克隆与序列分析
被引量：
1
1
作者
陈建琴
常青
+2 位作者
周开亚
掌子凯
曹霄
《南京师大学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2002年第4期95-99,共5页
在太湖猪各类群遗传多样性RAPD分析的基础上,对太湖猪类群间或与其他猪品种间有差异的核DNA标记位点SANDX 1、SANDX 2及SANDX 3进行了克隆,并对SANDX 2、SANDX 3位点的序列进行了测定及e PCR、BLAST分析.
关键词
家猪
核DNA序列变异
ndna
核基因组
分子标记
克隆
遗传多样性
太湖猪
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职称材料
猪乳脂肪球表面因子8的克隆与表达分布
2
作者
武宇晓
王伟杰
+5 位作者
张志强
林茂旺
王静
韩立强
王艳玲
杨国宇
《江西农业学报》
CAS
2008年第12期6-8,27,共4页
基于电子延伸序列,本试验成功克隆了猪乳脂肪球表面因子8(MFGE8)基因(GenBank登录号:EU559724)并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了MFGE8基因的组织分布规律。序列分析结果表明MFGE8开放读码框全长为1296 bp,编码431个氨基酸残...
基于电子延伸序列,本试验成功克隆了猪乳脂肪球表面因子8(MFGE8)基因(GenBank登录号:EU559724)并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了MFGE8基因的组织分布规律。序列分析结果表明MFGE8开放读码框全长为1296 bp,编码431个氨基酸残基的多肽链,克隆的MFGE8基因与人、大鼠、小鼠、牛的同源性分别为71.9%、78.7%、79.1%、87.7%,推测的氨基酸序列的同源性分别为65.7%、74.0%、74.0%、84.5%。氨基酸序列N端含有Notch样"EGF"结构,C端含有FA58C结构域。构建的系统发育树显示猪与牛的亲缘关系最近。组织表达分析结果表明MFGE8在乳腺中表达最高,在大脑中表达量最低。
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关键词
猪
MFGE8
克隆
序列分析
半定量RT-PCR
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职称材料
猪NLRC5基因克隆及序列特征分析
被引量：
7
3
作者
杨琦玥
陈通
+2 位作者
李键
黄勇
兰道亮
《西南民族大学学报（自然科学版）》
CAS
2016年第1期39-46,共8页
为了解猪天然免疫受体NLRC5基因特征,用人类、小鼠等物种NLRC5基因已知片段设计分段扩增的引物,同时运用RACE技术,克隆该序列并进行序列生物信息学分析.基因序列分析表明,克隆得到猪NLRC5基因c DNA全长为6638bp,基因开放阅读框为5538bp...
为了解猪天然免疫受体NLRC5基因特征,用人类、小鼠等物种NLRC5基因已知片段设计分段扩增的引物,同时运用RACE技术,克隆该序列并进行序列生物信息学分析.基因序列分析表明,克隆得到猪NLRC5基因c DNA全长为6638bp,基因开放阅读框为5538bp,共编码1846个氨基酸.蛋白质预测结果显示,NLRC5编码蛋白质整体表现为亲水性,蛋白质结构域分析结果显示,NLRC5具有典型的NACHT区及20个LRRs.同源性分析表明猪与牛、绵羊、猕猴、人等物种具有较高同源性,达到了80%左右,遗传进化树分析表明与牛和绵羊进化关系最近.进一步组织表达分析表明NLRC5基因除在淋巴结、脾脏等系统免疫器官中具有较高表达量,在肠淋巴结、胃、肺等黏膜器官中也有较高的转录水平.本研究结果说明猪NLRC5基因在长期进化中较为保守,尤其在哺乳动物间具有较高的保守性,在免疫反应中可能扮演着重要的角色.猪NLRC5基因序列的成功克隆为后续NLRC5在机体内免疫系统中的功能研究奠定了理论基础.
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关键词
NLRC5基因
猪
基因克隆
序列分析
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职称材料
猪乳头瘤病毒基因1型全基因组的克隆及序列分析
被引量：
1
4
作者
李玉莹
黄海鑫
+6 位作者
张杰
兰添
汪伟
鲁会军
郑敏
孙文超
金宁一
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期88-91,共4页
猪乳头瘤(SsP)是由猪乳头瘤病毒(SsPV)引起的一种猪传染性肿瘤。为了解SsPV中国流行株基因组信息,本研究对采集自广西的56份猪皮肤组织样品进行PCR检测,对检测为阳性的样品进行SsPV全基因组的克隆及序列分析。结果显示,56份广西猪皮肤...
猪乳头瘤(SsP)是由猪乳头瘤病毒(SsPV)引起的一种猪传染性肿瘤。为了解SsPV中国流行株基因组信息,本研究对采集自广西的56份猪皮肤组织样品进行PCR检测,对检测为阳性的样品进行SsPV全基因组的克隆及序列分析。结果显示,56份广西猪皮肤组织样品中共检测出1份阳性样品,属于SsPV1,克隆序列拼接获得1株SsPV1全基因组序列,命名为SsPV1/GX12(MT078972)。SsPV1/GX12基因组全长为7260 bp,编码7个主要开放阅读框。序列分析显示,SsPV1/GX12与参考株SsPV1a(EF395818)、SsPV1b(EF395819)、SsPV2(KY817993)核苷酸同源性分别为99.9%、99.2%、66.1%,与其他哺乳动物乳头瘤病毒核苷酸同源性为62.9%~69.5%。进化分析表明GX12属于SsPV1型。本研究首次获得中国SsPV分离株的全基因组信息,为开展SsP病原生物学、流行病学以及防控技术研究提供科学依据。
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关键词
猪乳头瘤病毒基因
全基因组序列
序列分析
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职称材料
题名
家猪核DNA多态标记的克隆与序列分析
被引量：
1
1
作者
陈建琴
常青
周开亚
掌子凯
曹霄
机构
南京师范大学生命科学学院
江苏省农林厅畜牧局
出处
《南京师大学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2002年第4期95-99,共5页
基金
江苏省教育委员会自然科学基金项目(1996SWX0010S13).
文摘
在太湖猪各类群遗传多样性RAPD分析的基础上,对太湖猪类群间或与其他猪品种间有差异的核DNA标记位点SANDX 1、SANDX 2及SANDX 3进行了克隆,并对SANDX 2、SANDX 3位点的序列进行了测定及e PCR、BLAST分析.
关键词
家猪
核DNA序列变异
ndna
核基因组
分子标记
克隆
遗传多样性
太湖猪
Keywords
sus scrofa
,
ndna
,
sequence analysis
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
猪乳脂肪球表面因子8的克隆与表达分布
2
作者
武宇晓
王伟杰
张志强
林茂旺
王静
韩立强
王艳玲
杨国宇
机构
河南农业大学动物生理生化实验室
出处
《江西农业学报》
CAS
2008年第12期6-8,27,共4页
基金
河南省重点科技攻关项目(0523010500)
文摘
基于电子延伸序列,本试验成功克隆了猪乳脂肪球表面因子8(MFGE8)基因(GenBank登录号:EU559724)并进行了序列分析,同时利用RT-PCR方法分析了MFGE8基因的组织分布规律。序列分析结果表明MFGE8开放读码框全长为1296 bp,编码431个氨基酸残基的多肽链,克隆的MFGE8基因与人、大鼠、小鼠、牛的同源性分别为71.9%、78.7%、79.1%、87.7%,推测的氨基酸序列的同源性分别为65.7%、74.0%、74.0%、84.5%。氨基酸序列N端含有Notch样"EGF"结构,C端含有FA58C结构域。构建的系统发育树显示猪与牛的亲缘关系最近。组织表达分析结果表明MFGE8在乳腺中表达最高,在大脑中表达量最低。
关键词
猪
MFGE8
克隆
序列分析
半定量RT-PCR
Keywords
sus scrofa
MFGE8
cDNA cloning
sequence analysis
Semi - quantitative RT - PCR
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
猪NLRC5基因克隆及序列特征分析
被引量：
7
3
作者
杨琦玥
陈通
李键
黄勇
兰道亮
机构
西南民族大学生命科学与技术学院
西南民族大学青藏高原研究院
出处
《西南民族大学学报（自然科学版）》
CAS
2016年第1期39-46,共8页
基金
国家自然科学青年基金(31302074)
文摘
为了解猪天然免疫受体NLRC5基因特征,用人类、小鼠等物种NLRC5基因已知片段设计分段扩增的引物,同时运用RACE技术,克隆该序列并进行序列生物信息学分析.基因序列分析表明,克隆得到猪NLRC5基因c DNA全长为6638bp,基因开放阅读框为5538bp,共编码1846个氨基酸.蛋白质预测结果显示,NLRC5编码蛋白质整体表现为亲水性,蛋白质结构域分析结果显示,NLRC5具有典型的NACHT区及20个LRRs.同源性分析表明猪与牛、绵羊、猕猴、人等物种具有较高同源性,达到了80%左右,遗传进化树分析表明与牛和绵羊进化关系最近.进一步组织表达分析表明NLRC5基因除在淋巴结、脾脏等系统免疫器官中具有较高表达量,在肠淋巴结、胃、肺等黏膜器官中也有较高的转录水平.本研究结果说明猪NLRC5基因在长期进化中较为保守,尤其在哺乳动物间具有较高的保守性,在免疫反应中可能扮演着重要的角色.猪NLRC5基因序列的成功克隆为后续NLRC5在机体内免疫系统中的功能研究奠定了理论基础.
关键词
NLRC5基因
猪
基因克隆
序列分析
Keywords
NLRC5
sus scrofa
gene cloning
sequence analysis
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
在线阅读
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职称材料
题名
猪乳头瘤病毒基因1型全基因组的克隆及序列分析
被引量：
1
4
作者
李玉莹
黄海鑫
张杰
兰添
汪伟
鲁会军
郑敏
孙文超
金宁一
机构
温州大学病毒学研究所
军事科学院军事医学研究院军事兽医研究所
广西动物疫病预防控制中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期88-91,共4页
基金
温州市基础性科研项目(N20190005、N20180010)。
文摘
猪乳头瘤(SsP)是由猪乳头瘤病毒(SsPV)引起的一种猪传染性肿瘤。为了解SsPV中国流行株基因组信息,本研究对采集自广西的56份猪皮肤组织样品进行PCR检测,对检测为阳性的样品进行SsPV全基因组的克隆及序列分析。结果显示,56份广西猪皮肤组织样品中共检测出1份阳性样品,属于SsPV1,克隆序列拼接获得1株SsPV1全基因组序列,命名为SsPV1/GX12(MT078972)。SsPV1/GX12基因组全长为7260 bp,编码7个主要开放阅读框。序列分析显示,SsPV1/GX12与参考株SsPV1a(EF395818)、SsPV1b(EF395819)、SsPV2(KY817993)核苷酸同源性分别为99.9%、99.2%、66.1%,与其他哺乳动物乳头瘤病毒核苷酸同源性为62.9%~69.5%。进化分析表明GX12属于SsPV1型。本研究首次获得中国SsPV分离株的全基因组信息,为开展SsP病原生物学、流行病学以及防控技术研究提供科学依据。
关键词
猪乳头瘤病毒基因
全基因组序列
序列分析
Keywords
sus scrofa
papillomavirus 1
complete genome
sequence
sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家猪核DNA多态标记的克隆与序列分析
陈建琴
常青
周开亚
掌子凯
曹霄
《南京师大学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2002
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
猪乳脂肪球表面因子8的克隆与表达分布
武宇晓
王伟杰
张志强
林茂旺
王静
韩立强
王艳玲
杨国宇
《江西农业学报》
CAS
2008
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
猪NLRC5基因克隆及序列特征分析
杨琦玥
陈通
李键
黄勇
兰道亮
《西南民族大学学报（自然科学版）》
CAS
2016
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
猪乳头瘤病毒基因1型全基因组的克隆及序列分析
李玉莹
黄海鑫
张杰
兰添
汪伟
鲁会军
郑敏
孙文超
金宁一
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
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