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S-DABO类逆转录酶抑制剂的Topomer CoMFA及分子对接
被引量:
1
1
作者
仝建波
王洋
+1 位作者
雷珊
秦尚尚
《陕西科技大学学报》
CAS
2018年第6期63-70,92,共9页
采用Topomer CoMFA方法对21个6-(1-萘甲基)取代S-DABO类化合物进行三维定量构效关系研究,建立了3D-QSAR模型,所得优化模型的主要参数分别为N=3,q^2=0.659,r^2=0.917,F=44.418,SEE=0.222,q_(stderr)~2=0.45,r_(stderr)~2=0.22.结果表明,...
采用Topomer CoMFA方法对21个6-(1-萘甲基)取代S-DABO类化合物进行三维定量构效关系研究,建立了3D-QSAR模型,所得优化模型的主要参数分别为N=3,q^2=0.659,r^2=0.917,F=44.418,SEE=0.222,q_(stderr)~2=0.45,r_(stderr)~2=0.22.结果表明,该模型具有良好的稳定性及预测能力.采用Topomer search在ZINC分子数据库中进行R基团的虚拟筛选,设计了8个活性优于模板分子的新化合物.借助Surflex-dock分子对接研究了新化合物与HIV-1逆转录酶作用模式与机制.结果显示,新化合物与HIV-1逆转录酶的LYS101、LYS103、TYR318位点作用显著.
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关键词
Topomer
COMFA
6-(1-萘甲基)取代S-DABO
3D-QSAR
Topomer
SEARCH
Surflex-dock
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职称材料
题名
S-DABO类逆转录酶抑制剂的Topomer CoMFA及分子对接
被引量:
1
1
作者
仝建波
王洋
雷珊
秦尚尚
机构
陕西科技大学化学与化工学院陕西省轻化工助剂重点实验室
出处
《陕西科技大学学报》
CAS
2018年第6期63-70,92,共9页
基金
国家自然科学基金项目(21275094
21475081)
陕西科技大学研究生创新基金项目
文摘
采用Topomer CoMFA方法对21个6-(1-萘甲基)取代S-DABO类化合物进行三维定量构效关系研究,建立了3D-QSAR模型,所得优化模型的主要参数分别为N=3,q^2=0.659,r^2=0.917,F=44.418,SEE=0.222,q_(stderr)~2=0.45,r_(stderr)~2=0.22.结果表明,该模型具有良好的稳定性及预测能力.采用Topomer search在ZINC分子数据库中进行R基团的虚拟筛选,设计了8个活性优于模板分子的新化合物.借助Surflex-dock分子对接研究了新化合物与HIV-1逆转录酶作用模式与机制.结果显示,新化合物与HIV-1逆转录酶的LYS101、LYS103、TYR318位点作用显著.
关键词
Topomer
COMFA
6-(1-萘甲基)取代S-DABO
3D-QSAR
Topomer
SEARCH
Surflex-dock
Keywords
Topomer CoMFA
6 napthylmethyl substituted S DABO
3D QSAR
Topomer search
surflexdock
分类号
TQ015.9 [化学工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
S-DABO类逆转录酶抑制剂的Topomer CoMFA及分子对接
仝建波
王洋
雷珊
秦尚尚
《陕西科技大学学报》
CAS
2018
1
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