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拟南芥SUMO蛋白酶Desi3A的原核表达、鉴定与酶活性分析
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作者 李梦瑶 张远 +1 位作者 庞佳 韩永峰 《河北师范大学学报(自然科学版)》 2026年第2期186-193,共8页
SUMO(small ubiquitin-like modifier,SUMO)化修饰动态可逆,在真核生物中广泛存在并发挥重要功能.SUMO蛋白酶负责底物蛋白的去SUMO化(异肽酶活性)和前体SUMO分子的成熟(内肽酶活性),对于SUMO化循环的正常运行和底物蛋白的功能发挥不可或... SUMO(small ubiquitin-like modifier,SUMO)化修饰动态可逆,在真核生物中广泛存在并发挥重要功能.SUMO蛋白酶负责底物蛋白的去SUMO化(异肽酶活性)和前体SUMO分子的成熟(内肽酶活性),对于SUMO化循环的正常运行和底物蛋白的功能发挥不可或缺.近年来在小鼠和人类中新发现了一类隶属于Desi家族的SUMO蛋白酶,前人通过同源序列比对在拟南芥中发现了8个Desi蛋白,目前,仅有Desi3A的功能被报道,且该功能与其异肽酶活性直接相关,然而Desi3A是否具有内肽酶活性以及其他7个成员的酶活性仍不明确.从酶活性入手对Desi功能进行研究是个有效策略,因此本研究以Desi3A为例,将其构建到pGEX-6P-1原核表达载体上,通过诱导、表达、纯化后进行体外检测.CBB染色和WB实验证实,GST-Desi3A能够在BL21(DE3)中正常表达.将纯化后的GST-Desi3A与preSUMO1-EBS分别孵育不同时间,发现在1、3、5 h这3个时间点时,Desi3A均未能将preSUMO1-EBS切开,而阳性对照GST-ESD4在1 h内能将preSUMO1-EBS完全切开,表明Desi3A可能不具备切割前体SUMO分子的内肽酶活性,或者是活性太低,需要延长孵育时间或优化条件才能被检测到.该研究不仅为Desi家族的原核表达和蛋白纯化提供了方法上的参考,而且为研究其酶活性和功能奠定了基础. 展开更多
关键词 sumo sumo蛋白酶 DESI 原核表达 内肽酶活性 异肽酶活性
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植物SUMO E3连接酶研究进展
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作者 方玉洁 刘宽 +1 位作者 崔寒冰 王幼平 《生物技术通报》 北大核心 2025年第12期1-15,共15页
SUMO化修饰作为真核生物中一种重要的可逆蛋白翻译后修饰形式,通过调控蛋白质的稳定性、亚细胞定位和活性参与植物的多种生命活动过程。SUMO化修饰过程由一系列酶促级联反应介导,其中SUMO E3连接酶在靶蛋白选择中具有决定性作用。近年... SUMO化修饰作为真核生物中一种重要的可逆蛋白翻译后修饰形式,通过调控蛋白质的稳定性、亚细胞定位和活性参与植物的多种生命活动过程。SUMO化修饰过程由一系列酶促级联反应介导,其中SUMO E3连接酶在靶蛋白选择中具有决定性作用。近年研究发现,SUMO E3连接酶通过介导对多类靶蛋白的SUMO化修饰,在植物的生长发育与逆境适应中发挥关键调控作用。本文系统综述了植物中SUMO E3连接酶的结构特征、功能分化及其在多种生理过程中的调控网络,重点梳理其在非生物胁迫响应、生长发育以及免疫应答调控中的分子机制及信号整合途径,旨在为深入解析植物SUMO化修饰的调控网络与生物学功能提供理论参考,并为作物抗性改良与高产育种提供潜在靶点。 展开更多
关键词 sumo化修饰 sumo E3连接酶 植物胁迫响应 生长发育
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SUMO特异性蛋白酶1在铁死亡中的潜在作用 被引量:1
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作者 谢滨 白蒙 +3 位作者 吴妍 沃璐璐 黄莺 张晶 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期11-19,共9页
目的:探究SUMO特异性蛋白酶1(SUMO-specific peptidase 1,SENP1)在铁死亡中的潜在作用。方法:通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析SENP1基因与铁死亡相关基因酰基辅酶A合成酶长链家族成员4(acyl-CoA synthetase... 目的:探究SUMO特异性蛋白酶1(SUMO-specific peptidase 1,SENP1)在铁死亡中的潜在作用。方法:通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析SENP1基因与铁死亡相关基因酰基辅酶A合成酶长链家族成员4(acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4)和谷胱甘肽过氧化物酶4(glutathione peroxidase 4,GPX4)表达的相关性。使用铁死亡诱导剂RSL3(RAS-selective lethal 3)诱导人纤维素瘤细胞HT1080、鼠纤维素瘤细胞MCA-205和人胚胎肾细胞293T发生铁死亡,通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和Western blotting检测SENP1的表达。在293T细胞中通过免疫沉淀-质谱联用技术检测SENP1在铁死亡过程中的相互作用蛋白。在293T细胞中瞬转Flag-SENP1过表达质粒,并通过RT-qPCR和Western blotting实验检测SENP1的过表达效率以及铁死亡相关基因ACSL4和GPX4的表达水平。结果:TCGA数据库分析结果显示,在绝大多数的肿瘤组织中,SENP1和ACSL4的表达呈正相关,与GPX4的表达呈负相关。RT-qPCR和Western blotting结果显示,RSL3处理HT1080、MCA-205和293T细胞一段时间后,SENP1的表达水平均发生明显下调。免疫沉淀-质谱联用技术鉴定结果显示,SENP1在细胞铁死亡过程中富集SUMO分子。Western blotting结果显示,SENP1过表达后ACSL4蛋白水平上升,GPX4蛋白水平无明显变化;RT-qPCR结果显示,SENP1过表达后,ACSL4和GPX4 mRNA水平均无明显变化。结论:SENP1基因表达在铁死亡过程中发生下调,并可能参与调控铁死亡相关蛋白ACSL4的稳定性。 展开更多
关键词 铁死亡 sumo特异性蛋白酶1 酰基辅酶A合成酶长链家族成员4 谷胱甘肽过氧化物酶4 小分子泛素相关修饰物蛋白
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SUMO化修饰对NF-κB信号通路的调控 被引量:7
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作者 高阳 陈思娇 宋今丹 《细胞生物学杂志》 CSCD 2008年第6期701-706,共6页
小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)经由一系列酶介导的生化级联反应共价结合于靶蛋白的赖氨酸残基上,稳定靶蛋白免受降解的过程称为SUMO化修饰(SUMOylation)。核转录因子κB(nuclear factors κB,NF-κB)是公认... 小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)经由一系列酶介导的生化级联反应共价结合于靶蛋白的赖氨酸残基上,稳定靶蛋白免受降解的过程称为SUMO化修饰(SUMOylation)。核转录因子κB(nuclear factors κB,NF-κB)是公认的炎症和免疫反应的重要调节因子,并与糖尿病的发生发展密切相关。近年来研究发现,不仅NF-κB抑制蛋白(inhibitor of NF-κB,IκB)的SUMO化修饰参与NF-κB信号通路的调节,而且SUMO酶可以直接调节NF-κB对靶基因的转录。现就SUMO亚型及结构,SUMO化修饰与去SUMO化修饰过程,SUMO、SUMO酶对NF-κB的转录调控及其与糖尿病相关性的最新研究进展作以综述。 展开更多
关键词 sumo sumo化修饰 sumo NF-ΚB 糖尿病
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蛋白质多聚SUMO化修饰及其功能 被引量:1
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作者 刘文栋 庞朋沙 伍会健 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期977-982,共6页
泛素(ubiquitin,Ub)是一类高度保守的小蛋白,可与靶蛋白的赖氨酸残基共价连接,形成多聚泛素链行使功能.类似于泛素化修饰过程,小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)也可以共价修饰靶蛋白的赖氨酸残基,从而影响靶蛋... 泛素(ubiquitin,Ub)是一类高度保守的小蛋白,可与靶蛋白的赖氨酸残基共价连接,形成多聚泛素链行使功能.类似于泛素化修饰过程,小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)也可以共价修饰靶蛋白的赖氨酸残基,从而影响靶蛋白的定位、稳定性以及蛋白间的相互作用,发挥重要的生理功能.尽管在多数情况下,靶蛋白发生的是单SUMO化修饰,但最近研究发现,SUMO依赖自身的赖氨酸也可以形成多聚链.与单SUMO化修饰不同的是,多聚SUMO化修饰的靶蛋白可以进一步被泛素化修饰,进而诱导靶蛋白的降解.这是一种新的、特殊的化学修饰形式,弄清它的生理功能,对于了解细胞的生长、分化以及凋亡等生理过程将具有重要的意义.本文将就此方面的最新研究进展做一综述. 展开更多
关键词 泛素 小泛素相关修饰物(sumo) 多聚sumo化修饰 多聚sumo
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蛋白质SUMO化修饰与肿瘤调控 被引量:2
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作者 蔡蓉 程金科 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2022年第4期531-538,共8页
SUMO化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式,在细胞周期调控、细胞代谢、基因转录、DNA损伤和修复等众多细胞生物学过程中,对底物蛋白质的表达、定位和活性进行调控。蛋白质SUMO化修饰是动态可逆的过程,去SUMO化修饰由SUMO特异性蛋白... SUMO化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰方式,在细胞周期调控、细胞代谢、基因转录、DNA损伤和修复等众多细胞生物学过程中,对底物蛋白质的表达、定位和活性进行调控。蛋白质SUMO化修饰是动态可逆的过程,去SUMO化修饰由SUMO特异性蛋白酶(SENPs)家族成员所催化。由于受到SUMO化修饰的底物蛋白种类众多、功能多样,SUMO化修饰能够在整体和特定蛋白质修饰层面,参与调控肿瘤的发生发展,并且这种调控机制非常复杂,比如调控细胞周期的进程、DNA损伤和基因组不稳定性、肿瘤代谢与生长、抗肿瘤免疫等。SENPs家族成员是底物蛋白质SUMO化修饰程度的决定者,该研究团队对SENPs家族成员在肿瘤中的作用开展了系列研究,因此该文也将以SENP1和SENP3为例,对SENPs在肿瘤进程中的作用及其作用机制展开介绍。 展开更多
关键词 蛋白质sumo化修饰 蛋白质去sumo化修饰 sumo特异性蛋白酶 肿瘤
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朊病毒感染的细胞及小鼠模型中SUMO1修饰的变化及与朊蛋白相互作用的研究
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作者 李纯洁 张卫卫 +6 位作者 高利萍 王远 梁冬林 肖康 陈操 董小平 石琦 《病毒学报》 北大核心 2025年第5期1376-1384,共9页
SUMO化修饰作为关键的蛋白质翻译后修饰,在神经退行性疾病的病理进程中发挥重要作用。朊病毒病是一类由朊蛋白错误折叠引起的致死性神经退行性疾病,其发病机制尚未完全阐明。本研究以朊病毒感染的SMB-S15细胞模型及139A/ME7毒株感染的... SUMO化修饰作为关键的蛋白质翻译后修饰,在神经退行性疾病的病理进程中发挥重要作用。朊病毒病是一类由朊蛋白错误折叠引起的致死性神经退行性疾病,其发病机制尚未完全阐明。本研究以朊病毒感染的SMB-S15细胞模型及139A/ME7毒株感染的小鼠模型为研究对象,系统探讨了SUMO化修饰在朊病毒病进程中的动态变化及其与朊蛋白的相互作用机制。通过Western blot、免疫荧光和免疫组化分析发现,朊病毒感染终末期小鼠脑组织及SMB-S15细胞中SUMO1修饰蛋白水平显著降低,而SUMO1的mRNA表达水平却呈现升高趋势。免疫共沉淀实验证实,朊蛋白与SUMO1存在相互作用,且病毒感染后二者的结合显著增强。同时,在不同感染阶段的小鼠脑组织中,SUMO1修饰蛋白水平在朊病毒感染后不同时间点呈先下降,再上升,再下降的趋势。本研究首次揭示朊病毒感染可导致SUMO1修饰蛋白失衡,SUMO1与朊蛋白的异常相互作用可能在朊病毒病的发病机制中发挥关键作用,为深入理解朊病毒病的分子机制提供了新的实验依据和治疗靶点。 展开更多
关键词 朊病毒病 sumo化修饰 朊蛋白 蛋白质相互作用 神经退行性疾病
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串联双SUMO融合促进重组CRM197蛋白在大肠杆菌中高效可溶表达及其纯化与表征
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作者 黄靖倍 汪欣 +4 位作者 郑永祥 余蓉 刘永东 孟奂 张纯 《中国生物工程杂志》 北大核心 2025年第5期40-48,共9页
白喉毒素突变体蛋白(cross-reacting material 197, CRM197)是一种常用的多糖结合疫苗载体,其在大肠杆菌体系中往往以包涵体形式表达。为了改善通过包涵体复性来制备CRM197而导致的收率低、操作烦琐等不足,研究设计了一种基于SUMO标签... 白喉毒素突变体蛋白(cross-reacting material 197, CRM197)是一种常用的多糖结合疫苗载体,其在大肠杆菌体系中往往以包涵体形式表达。为了改善通过包涵体复性来制备CRM197而导致的收率低、操作烦琐等不足,研究设计了一种基于SUMO标签串联的策略,改善重组CRM197的可溶性,同时使用Origami B (DE3)大肠杆菌宿主,成功使重组CRM197蛋白上清液可溶比例提高至95%以上。同时简化了CRM197蛋白的获取途径,经两步Ni亲和层析和一步酶切除去融合标签等手段建立了从破菌上清液中纯化CRM197的方法,获得纯度高于98%的CRM197且收率大于80%。通过圆二色光谱及荧光发射光谱分析等证实纯化所得CRM197空间结构折叠正确。抗原性ELISA实验结果表明所制得的CRM197蛋白与CRM197标准品蛋白抗原性相当。研究结果表明串联双SUMO标签对重组CRM197在大肠杆菌中高效、可溶表达具有促进作用,并建立了快速纯化体系,获得了具有较好免疫原性的CRM197蛋白,为改善重组蛋白在原核表达体系的可溶表达设计提供了新思路。 展开更多
关键词 CRM197蛋白 原核表达体系 胞内可溶表达 串联双sumo标签
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基于SUMO及高通量测序的Bardenpho污水处理工艺模拟与优化
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作者 郑家星 王鹤 +2 位作者 吴明松 李阳 汪凌睿 《给水排水》 北大核心 2025年第4期139-144,共6页
针对东北某Bardenpho工艺污水处理厂的目前TN指标超标的问题,对照分析高通量测序和各工艺段微生物丰度,采用SUMO模拟软件的SUMO4N模型建模,并进行模拟调试运行。结果表明厌氧段微生物分布异常,生长状况差,好氧段DO过高,碳源消耗过多。... 针对东北某Bardenpho工艺污水处理厂的目前TN指标超标的问题,对照分析高通量测序和各工艺段微生物丰度,采用SUMO模拟软件的SUMO4N模型建模,并进行模拟调试运行。结果表明厌氧段微生物分布异常,生长状况差,好氧段DO过高,碳源消耗过多。最终优化方案为调整一段缺氧区、一段好氧区、二段缺氧区和二段好氧区的溶解氧为0.20、2.00、0.20、2.50 mg/L;内回流比250%;外回流比90%。此时,主要出水指标的稳态模拟结果COD、TN、TP、氨氮、硝酸盐氮分别为12.31、8.23、0.11、2.63、3.15 mg/L,动态模拟结果COD、TN的去除率提高了56.32%、44.84%。 展开更多
关键词 水厂模拟 sumo 调试优化 高通量测序 TN Bardenpho工艺
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杜仲EuSUMO2基因克隆及其对开花基因的表达调控
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作者 晏甜甜 赵丹 赵德刚 《植物生理学报》 北大核心 2025年第12期1672-1682,共11页
杜仲(Eucommia ulmoides)是我国名贵的药用植物,开花时间的调控对杜仲新品种选育有特别重要的意义。FLC是植物重要的开花抑制因子,而FLK可通过抑制FLC的表达,控制开花时间。SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)化修饰会影响蛋白的活性... 杜仲(Eucommia ulmoides)是我国名贵的药用植物,开花时间的调控对杜仲新品种选育有特别重要的意义。FLC是植物重要的开花抑制因子,而FLK可通过抑制FLC的表达,控制开花时间。SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)化修饰会影响蛋白的活性、结构、定位和蛋白间相互作用等,但其对植物开花基因表达的调控还未完全明确。本研究通过c DNA末端快速扩增技术(RACE)从杜仲中克隆SUMO蛋白编码基因,命名为EuSUMO2。EuSUMO2 c DNA长656 bp,编码序列(CDS)长303 bp,编码99个氨基酸残基多肽。EuSUMO2编码蛋白具有Ubl_Smt3_like保守结构域,在C端具有双甘氨酸结构;三级结构预测发现EuSUMO2蛋白呈现“β-抓取”折叠,具有类泛素化蛋白SUMO蛋白典型序列结构。进化分析表明Eu SUMO2蛋白与其他物种的SUMO蛋白同源性较高,与高等植物中的SUMO蛋白亲缘关系较近。低温和长日照处理下,Eu SUMO2表达水平降低。Eu SUMO2基因过表达载体遗传转化杜仲,转基因杜仲中Eu FLK1、Eu FT1、EuSOC1和Eu LFY2表达水平提高,暗示Eu SUMO2蛋白不仅提高了转录因子Eu FLK1基因的表达,还通过SUMO化修饰EuFLK1蛋白,从而抑制EuFLC基因的表达,提高杜仲开花基因EuFT1、EuSOC1和EuLFY2基因的表达。预测分析表明,EuFLK1序列具有SUMO化位点ψKxE,杜仲EuFLK1基因编码蛋白可能通过SUMO化,稳定抑制EuFLC基因表达,进而提高了开花基因FT、SOC、LFY的表达水平。研究结果显示杜仲开花基因存在SUMO化调控途径。 展开更多
关键词 杜仲 sumo化修饰 开花基因 开花时间调控
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SUMO化修饰在植物与病原互作中的功能研究进展
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作者 李文亮 冯汉青 赖建彬 《植物学报》 北大核心 2025年第5期749-758,共10页
SUMO化修饰是植物中重要的翻译后修饰,通过介导底物蛋白的功能、免疫信号的激活与转导以及激素信号网络,在植物免疫调控中发挥关键作用。该文从SUMO化修饰系统的酶联反应机制、SUMO化修饰参与植物免疫调控以及病原体效应蛋白对SUMO化系... SUMO化修饰是植物中重要的翻译后修饰,通过介导底物蛋白的功能、免疫信号的激活与转导以及激素信号网络,在植物免疫调控中发挥关键作用。该文从SUMO化修饰系统的酶联反应机制、SUMO化修饰参与植物免疫调控以及病原体效应蛋白对SUMO化系统的干扰等方面,系统综述了SUMO化修饰在植物与病原互作中的功能最新研究进展,旨在解析SUMO化介导的植物免疫调控网络,为开发基于SUMO化修饰的作物抗病新策略提供参考。 展开更多
关键词 sumo化修饰 病原体 免疫信号 激素信号 效应蛋白
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黄颡鱼去SUMO化修饰关键基因senp8启动子的功能分析及其与脂质代谢的关系
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作者 段芙萱 郝志伟 +4 位作者 刘涛 宋长春 张天华 仲崇超 谭肖英 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第4期607-616,I0007,I0008,共12页
该文以黄颡鱼为研究对象,采用双荧光素酶报告实验和凝胶阻滞实验对启动子活性进行分析,同时结合活体养殖实验,探讨去SUMO化修饰关键基因senp8启动子的功能及其与脂质代谢的关系。结果显示,2045 bp序列的senp 8启动子序列上有SP1、TATA-... 该文以黄颡鱼为研究对象,采用双荧光素酶报告实验和凝胶阻滞实验对启动子活性进行分析,同时结合活体养殖实验,探讨去SUMO化修饰关键基因senp8启动子的功能及其与脂质代谢的关系。结果显示,2045 bp序列的senp 8启动子序列上有SP1、TATA-Box、CCAAT-Box、SREBP1、PPARα和PPARγ等关键转录因子结合位点;发现senp8启动子中SREBP1(-901/-910 bp)、PPARα(-1291/-1308 bp)和PPARγ(-1292/-1306 bp)的结合位点正向调控其活性,且油酸或棕榈酸促进这种结合。同时,高脂饲养促进黄颡鱼肝中senp8基因及其蛋白质表达,油酸或棕榈酸处理显著增强了senp8启动子的活性,且这种增强效应可以通过SREBP1、PPARα和PPARγ这些响应元件的调控作用来实现。此外,高脂饲喂能够影响黄颡鱼肝中去SUMO化修饰相关基因的mRNA和蛋白质表达水平。本研究为理解去SUMO化修饰与脂质代谢调控的关系提供新的见解。 展开更多
关键词 黄颡鱼 sumo化修饰 启动子 脂质代谢 转录调控
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基于SUMO1-Drp1轴探讨脊髓伤方含药血清对缺氧/复氧诱导的脊髓神经元线粒体稳态的影响
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作者 刘春志 卜献忠 +4 位作者 张鼎 杨汉立 钟远鸣 汤立蓉 许伟 《中药材》 北大核心 2025年第9期2318-2325,共8页
目的:探讨脊髓伤方含药血清对缺氧/复氧(Oxygen and glucose deprivation/reoxygenation,OGD/R)诱导脊髓神经元线粒体功能的影响。方法:提取原代脊髓神经元并鉴定,制备脊髓伤方含药血清并筛选最佳干预浓度。将脊髓神经元随机分为正常对... 目的:探讨脊髓伤方含药血清对缺氧/复氧(Oxygen and glucose deprivation/reoxygenation,OGD/R)诱导脊髓神经元线粒体功能的影响。方法:提取原代脊髓神经元并鉴定,制备脊髓伤方含药血清并筛选最佳干预浓度。将脊髓神经元随机分为正常对照组、模型组、空白血清组、Mdivi-1(Drp1抑制剂)组、脊髓伤方含药血清组,除正常对照组外其余各组通过OGD/R诱导脊髓神经元损伤,各组予对应干预刺激后收集细胞,试剂盒检测细胞上清中LDH、ATP水平;流式细胞术检测细胞凋亡;免疫荧光检测SUMO1、Drp1表达;qRT-PCR和Western Blot检测SUMO1、SENP3、Drp1、OPA1、Mfn1、Mfn2、Fis1 mRNA和蛋白表达。结果:与正常对照组比较,模型组神经元培养上清液LDH水平和神经元凋亡率显著升高,ATP水平显著降低,SUMO1、SENP3、Drp1、Fis1 mRNA和蛋白表达显著升高,OPA1、Mfn1、Mfn2 mRNA和蛋白表达显著降低(P<0.0001)。与模型组比较,脊髓伤方含药血清组和Mdivi-1组神经元培养上清液LDH水平和神经元凋亡率显著降低,ATP水平显著升高,SUMO1、SENP3、Drp1、Fis1 mRNA和蛋白表达显著降低,OPA1、Mfn1、Mfn2 mRNA和蛋白表达显著升高(P<0.0001)。结论:脊髓伤方含药血清可通过调控SUMO1-Drp1轴减轻OGD/R诱导的脊髓神经元损伤,恢复线粒体分裂融合平衡,从而缓解神经元凋亡,发挥保护作用。 展开更多
关键词 脊髓伤方 脊髓型颈椎病 脊髓神经元 sumo1-Drp1轴 线粒体分裂融合
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基于SUMO在线仿真的交通事故拥堵影响分析 被引量:1
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作者 严敏 邱晓东 +1 位作者 周伟健 陈嘉豪 《上海公路》 2025年第2期109-113,118,M0007,M0008,共8页
依托高速公路的实际路段特征和路侧采集的交通流数据,利用开源SUMO仿真,对交通事故场景下的事故不同持续时间、事故占用不同封闭车道数和不同交通流量特征产生的交通拥堵影响进行分析研究。同时,引入拥堵排队长度、平均时间延误以及断... 依托高速公路的实际路段特征和路侧采集的交通流数据,利用开源SUMO仿真,对交通事故场景下的事故不同持续时间、事故占用不同封闭车道数和不同交通流量特征产生的交通拥堵影响进行分析研究。同时,引入拥堵排队长度、平均时间延误以及断面交通流三大指标来评估交通拥堵的严重程度。研究表明,基于代表性的实际高速大流量路段场景在流量高峰期发生交通事故,当事故持续时间为30 min时,对平均延误时间的影响超过1倍;当封闭3条车道时,对交通拥堵的影响较为严重,排队长度增加2倍,平均延误时间超过3倍,且交通流量波动较大,安全隐患风险增加。该结论能够有效支撑高速公路运营管理者进行交通管控决策,优化高速公路事故处理机制,提升交通事故场景下的安全通行效率。 展开更多
关键词 高速公路 sumo 在线仿真 拥堵分析
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基于RanBP2介导的TRPV1 SUMO化修饰探讨芩百清肺浓缩丸抑制气道神经源性炎症的机制
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作者 贾维刚 周迎春 +2 位作者 曲龙 袁星星 冯丽辉 《中医药信息》 2025年第11期9-15,共7页
目的:观察芩百清肺浓缩丸对RanBP2介导的TRPV1 SUMO化修饰的影响,从而阐明其抑制气道神经源性炎症的分子机制。方法:选择人神经母细胞瘤细胞株(SH-SY5Y),采用缓激肽和辣椒素联合诱导构建PIC细胞模型,给予芩百清肺浓缩丸含药血清和RanBP... 目的:观察芩百清肺浓缩丸对RanBP2介导的TRPV1 SUMO化修饰的影响,从而阐明其抑制气道神经源性炎症的分子机制。方法:选择人神经母细胞瘤细胞株(SH-SY5Y),采用缓激肽和辣椒素联合诱导构建PIC细胞模型,给予芩百清肺浓缩丸含药血清和RanBP2抑制剂干预。光学显微镜观察SH-SY5Y形态的变化,ELISA法检测神经肽SP和CGRP的含量,免疫荧光染色检测RanBP2和TRPV1蛋白的表达,免疫共沉淀检测TRPV1蛋白的SUMO化修饰。在此基础上,通过Transwell将SH-SY5Y与人原代气道平滑肌细胞(HTSMC)共培养;光学显微镜观察HTSMC形态的变化,细胞划痕实验检测细胞迁移水平,ELISA法检测IL-6、IL-8的含量。结果:与模型组比较,芩百清肺浓缩丸能够显著抑制SH-SY5Y细胞SP和CGRP的分泌,下调RanBP2蛋白的表达和TRPV1蛋白的SUMO化修饰(P<0.01);能够显著抑制HTSMC的迁移率以及IL-6、IL-8分泌(P<0.01)。结论:芩百清肺浓缩丸能够通过抑制RanBP2调控TRPV1蛋白的SUMO化修饰,实现抑制PIC气道神经源性炎症的作用。 展开更多
关键词 芩百清肺浓缩丸 Ran结合蛋白2 瞬时受体电位香草素受体1 sumo化修饰 气道神经源性炎症
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利用SUMO融合系统高效表达可溶性重组蛋白的研究 被引量:22
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作者 姜媛媛 尹成凯 +3 位作者 李晋南 任桂萍 张薇 李德山 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2008年第10期57-62,共6页
利用pSUMO表达载体在大肠杆菌中高效可溶性表达若干种外源蛋白,如鼠源成纤维细胞生长因子(FGF)-21、人源FGF-21、人源白细胞介素(IL)-1β,并与pET-30a(+)及pTYB11表达系统作比较。将鼠源FGF-21、人源FGF-21及人源IL-1β基因分别亚克隆至... 利用pSUMO表达载体在大肠杆菌中高效可溶性表达若干种外源蛋白,如鼠源成纤维细胞生长因子(FGF)-21、人源FGF-21、人源白细胞介素(IL)-1β,并与pET-30a(+)及pTYB11表达系统作比较。将鼠源FGF-21、人源FGF-21及人源IL-1β基因分别亚克隆至pSUMO表达载体上,在大肠杆菌Rosetta(DE3)中诱导表达,并用镍离子螯合柱(Ni-NTA)纯化重组蛋白,透析后利用SUMO蛋白酶I切割融合蛋白,获得纯度较高的成熟蛋白。上述基因在pET-30a(+)及pTYB11中表达量极低,考马斯亮蓝染色几乎检测不到。在pSUMO表达体系中这些基因均以可溶形式表达,且可被SUMO蛋白酶I有效的切割,获得纯度较高的成熟蛋白。上述蛋白可在pSUMO表达系统中获得高效可溶性表达。 展开更多
关键词 sumo sumo蛋白酶 分子伴侣 pTYB11 pET-30a(+) 表达
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蛋白质SUMO化修饰研究进展 被引量:13
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作者 韦玮 张浩 +1 位作者 毛建平 叶棋浓 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期122-126,共5页
SUMO(small ubiquitin-related modifier)是类泛素蛋白家族的重要成员之一,可与多种蛋白结合发挥相应的功能,其分子结构及SUMO化反应途径都与泛素类似,但二者功能完全不同。SUMO化修饰可参与转录调节、核转运、维持基因组完整性及信号... SUMO(small ubiquitin-related modifier)是类泛素蛋白家族的重要成员之一,可与多种蛋白结合发挥相应的功能,其分子结构及SUMO化反应途径都与泛素类似,但二者功能完全不同。SUMO化修饰可参与转录调节、核转运、维持基因组完整性及信号转导等多种细胞内活动,是一种重要的多功能的蛋白质翻译后修饰方式。SUMO化修饰功能的失调可能导致某些疾病的发生。 展开更多
关键词 sumo sumo 蛋白修饰 UBC9 PIAS
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SUMO融合系统高效表达可溶性鼠源FGF-21及其活性的研究 被引量:7
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作者 任桂萍 姜媛媛 +3 位作者 刘铭瑶 孙国鹏 叶贤龙 李德山 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期62-67,共6页
利用SUMO表达载体在大肠杆菌中高效可溶性表达鼠源成纤维细胞生长因子(FGF-21)成熟蛋白,并研究其调节血糖的功能。将鼠源FGF-21成熟蛋白基因亚克隆至SUMO表达载体上,在大肠杆菌Rosetta(DE3)中诱导表达,并用镍离子螯合柱(Ni-NTA)纯化重... 利用SUMO表达载体在大肠杆菌中高效可溶性表达鼠源成纤维细胞生长因子(FGF-21)成熟蛋白,并研究其调节血糖的功能。将鼠源FGF-21成熟蛋白基因亚克隆至SUMO表达载体上,在大肠杆菌Rosetta(DE3)中诱导表达,并用镍离子螯合柱(Ni-NTA)纯化重组蛋白,透析后利用SUMO蛋白酶I切割融合蛋白,获得纯度较高的成熟蛋白。将3T3-L1成纤维细胞分化成脂肪细胞,经微量化的GOD-POD法检测培养基中葡萄糖含量,统计学分析葡萄糖消耗率。结果表明,在SUMO表达体系中鼠源FGF-21成熟蛋白基因以可溶形式表达,且可被SUMO蛋白酶I有效地切割,获得纯度较高的成熟蛋白。与未经处理的脂肪细胞对照组相比,经鼠源FGF-21成熟蛋白处理后脂肪细胞对葡萄糖的摄取利用显著增加,残存在培养基中的葡萄糖含量明显减少;两样本比较的t检验,P<0.001,差异极显著。 展开更多
关键词 sumo sumo蛋白酶I 分子伴侣 鼠源FGF-21 葡萄糖吸收
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sumo化及sumo化修饰酶对糖尿病肾病NF-κB信号通路的调控 被引量:4
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作者 王统彩 陈思娇 宋今丹 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2013年第1期85-89,共5页
核转录因子(nuclear factorκb,NF-κB)是公认的炎症和免疫反应的调节因子,与糖尿病肾病的发生发展密切相关。小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,sumo)参与了NF-κB信号通路的调控,NF-κB抑制蛋白(inhibitor ofnf-κB,... 核转录因子(nuclear factorκb,NF-κB)是公认的炎症和免疫反应的调节因子,与糖尿病肾病的发生发展密切相关。小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,sumo)参与了NF-κB信号通路的调控,NF-κB抑制蛋白(inhibitor ofnf-κB,IκB)等NF-κB通路中重要的蛋白因子均可被小泛素相关修饰物修饰,进而调控NF-κB信号通路。sumo化修饰酶在该调控中发挥极其重要的作用,其中sumo结合酶E2(即ubc9蛋白)和sumo连接酶E3成员之一的信号转导和转录激活子(signal transducer and activator of transcription,STAT)抑制蛋白(protein inhibitor of activated STAT,PIAS)家族是近年来的研究热点。文中综述sumo化、sumo化修饰酶及其对糖尿病肾病NF-κb信号通路的调控作用。 展开更多
关键词 sumo sumo化修饰酶 NF-ΚB信号通路 糖尿病肾病
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一种新型SUMO E3连接酶CBX4的化学修饰作用 被引量:3
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作者 朱玥荃 王文恭 薛丽香 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期115-122,共8页
多梳蛋白家族(polycomb group proteins,Pc G)是一类在染色质水平上通过表观遗传修饰抑制靶基因转录的调节因子,它在调节细胞周期、DNA修复、细胞分化、衰老和死亡中起到重要作用。CBX4作为Pc G家族中唯一具有SUMO E3连接酶活性的成员,... 多梳蛋白家族(polycomb group proteins,Pc G)是一类在染色质水平上通过表观遗传修饰抑制靶基因转录的调节因子,它在调节细胞周期、DNA修复、细胞分化、衰老和死亡中起到重要作用。CBX4作为Pc G家族中唯一具有SUMO E3连接酶活性的成员,可以作用于多种底物,包括HIPK2、SIP1、Ct BP、CTCF、Dnmt3a和HIF-1α等。底物的SUMO化修饰依赖于特定的结构基础,而且SUMO化的底物功能也会相应发生改变。同时,CBX4还可以被其它分子,如HIPK2,SENP2等进行磷酸化以及去SUMO化等修饰。本篇综述详细阐述了CBX4对底物的SUMO化修饰、自身被修饰及其生物学功能的变化。 展开更多
关键词 CBX4 sumo E3连接酶活性 sumo化修饰
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