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马铃薯StPGIP基因克隆、生物信息学特征及差异表达分析 被引量:1
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作者 吴玉 彭杰椿 +7 位作者 郑声皓 易若兰 范斗文 黄雅 萧燕梅 韦荣昌 郑虚 邓英毅 《分子植物育种》 北大核心 2025年第2期362-370,共9页
以‘桂农薯1号’马铃薯块茎为试材,克隆马铃薯多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因StPGIP的CDS序列,并研究其生物信息学特征和块茎休眠与发芽过程中的特异性表达。结果表明StPGIP基因的CDS全长为1005 bp,编码335个氨基酸,是位于线粒体或细胞... 以‘桂农薯1号’马铃薯块茎为试材,克隆马铃薯多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因StPGIP的CDS序列,并研究其生物信息学特征和块茎休眠与发芽过程中的特异性表达。结果表明StPGIP基因的CDS全长为1005 bp,编码335个氨基酸,是位于线粒体或细胞核分泌途径的信号肽蛋白,剪切位点位于第25和26氨基酸之间;其蛋白质二级结构中含有无规卷曲(57.49%)、α-螺旋(24.55%)、β-折叠(2.40%)和延伸链(15.57%),三级结构是由α-螺旋和β-折叠形成的一个保守的马蹄形结构;启动子序列中存在光、水杨酸、脱落酸等响应元件。StPGIP基因与野生无薯系马铃薯(Solanum brevidens Fill)、辣椒(Capsicum annuum L.)、野生潘那利番茄(Solanum pennellii Correll)进化关系较近。RT-qPCR分析表明块茎StPGIP基因表达量在低温贮藏的休眠期内呈下降趋势,萌芽后极显著上升,马铃薯StPGIP基因对马铃薯休眠与发芽有重要影响。研究结果为今后深入挖掘该基因的功能及调控提供了理论依据。 展开更多
关键词 马铃薯 stpgip 基因克隆 生物信息学特征 差异表达 休眠
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Cloning and Characterization of a PGIP-Encoding Gene from Solanum torvum 被引量:6
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作者 ZHANG Fan WANG Zhong +2 位作者 HUANG Quan-sheng HUANG Le-ping YANG Qing 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2010年第6期921-927,共7页
Verticillium wilt is a severe disease in eggplant caused by Verticillium dahliae.Polygalacturonase-inhibiting proteins (PGIPs) have been shown to be involved in preventing the invasion of fungus including V.dahliae.... Verticillium wilt is a severe disease in eggplant caused by Verticillium dahliae.Polygalacturonase-inhibiting proteins (PGIPs) have been shown to be involved in preventing the invasion of fungus including V.dahliae.Cloning genes encoding PGIPs is quite valuable for plant resistance breeding to Verticillium wilt.In this study,a cDNA encoding the polygalacturonase-inhibiting protein was isolated from Solanum torvum by RT-PCR and RACE,designated StPGIP (accession no.FJ943498).The cDNA sequence of StPGIP was 1 097 bp long and contained an open reading frame of 990 bp.The predicted amino acid sequence of the gene consisted of 329 amino acids and had conserved LRRs.The StPGIP protein had a high identity with PGIPs from other species.Analysis of StPGIP expression at the mRNA level by RT-PCR showed that the gene was expressed in all organs and could be induced to increase expression by V.erticillium dahliae infection. 展开更多
关键词 Solanum torvum stpgip CLONING EXPRESSION
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