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马铃薯StACSs基因家族成员序列特征及表达分析
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作者 吴玉 易若兰 +6 位作者 李子涵 吴玉琴 郑声皓 王雨婷 萧燕梅 郑虚 邓英毅 《分子植物育种》 北大核心 2026年第4期1075-1084,共10页
ACS是植物体内乙烯合成途径的限速酶基因,研究马铃薯ACSs基因家族成员的序列特征及其在马铃薯休眠与发芽中的表达模式,可为进一步研究该基因的功能及调控提供依据。通过RNA-Seq数据获得马铃薯16个ACSs基因家族成员序列,并利用生物信息... ACS是植物体内乙烯合成途径的限速酶基因,研究马铃薯ACSs基因家族成员的序列特征及其在马铃薯休眠与发芽中的表达模式,可为进一步研究该基因的功能及调控提供依据。通过RNA-Seq数据获得马铃薯16个ACSs基因家族成员序列,并利用生物信息学分析其序列特征与表达模式。16个StACSs定位于7条染色体上,其中Chr5染色体上分布最多,其g DNA长度为354~4841 bp,内含子数量为0~3个。16个St ACSs蛋白的氨基酸数为117~486 aa,均为亲水性蛋白,不含信号肽和跨膜结构。16个StACS蛋白中有4个为稳定蛋白,8个呈酸性,8个呈碱性,11个位于细胞质,4个位于细胞核,1个位于内质网。磷酸化位点数依次为丝氨酸>苏氨酸>酪氨酸,糖基化位点为0~4个;蛋白质二级结构是以α-螺旋和无规卷曲为主。系统发育进化分析表明StACSs与番茄的遗传距离较近,与拟南芥的分类一致,分为3类,其中9个属于Type 1,4个属于Type 2,3个属于Type 3;StACS6和StACS7与AtACS7、StACS5与SlACS6、StACS2-1与SlACS2的亲缘关系较近。它们的启动子中含有大量与光、激素、胁迫、生长发育响应相关的顺式元件。StACS4-2和StACS5的表达量在块茎休眠阶段显著高于发芽阶段,而StACS2-1、StACS2-2和StACS8的表达量在休眠阶段低于发芽阶段。本研究结果有助于深入解析StACS家族参与乙烯合成的调控机制,也为调控马铃薯块茎休眠与萌发提供了理论基础。 展开更多
关键词 马铃薯 stacss 休眠 序列特征 表达模式
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