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甘蔗野生种割手密的PIF基因家族鉴定与表达分析 被引量：1
1
作者 王郑 王文治 +5 位作者 王鹏 孙婷婷 熊国如 张树珍 何美丹 沈林波 《热带作物学报》 北大核心 2026年第1期32-42,共11页
光敏色素作用因子(phytochrome interacting factors,PIFs)是调控植物光形态建成的关键转录因子,在植物生长发育及逆境响应过程中具有重要作用。目前,PIF基因已在多种植物中得到鉴定,但尚无关于甘蔗近缘野生种割手密(Saccharum spontane... 光敏色素作用因子(phytochrome interacting factors,PIFs)是调控植物光形态建成的关键转录因子,在植物生长发育及逆境响应过程中具有重要作用。目前,PIF基因已在多种植物中得到鉴定,但尚无关于甘蔗近缘野生种割手密(Saccharum spontaneum L.)SsPIF基因家族成员的系统鉴定与分析的报道。本研究对甘蔗近缘野生种割手密SsPIF基因家族进行鉴定,系统分析SsPIF家族基因的蛋白理化性质、染色体定位、物种内及物种间共线性比较及启动子顺式作用元件等特征,并利用荧光定量PCR技术(qRT-PCR)分析SsPIF基因在甘蔗不同组织及3种植物激素处理下的表达模式。结果显示:从割手密全基因组中鉴定出12个SsPIF基因,编码的氨基酸数量在435~765之间,分子质量范围为48.14~83.91 kDa;等电点(pI)在5.59~6.97之间,大多数等电点接近中性,少数偏向酸性或碱性;亚细胞定位发现所有SsPIF蛋白均定位在细胞核;染色体定位分析显示SsPIF不均匀地分布在10条染色体上;多序列比对结果表明SsPIF家族成员均存在bHLH和APB保守结构域,其中SsPIF3亚组存在特有的APA结构域;物种间共线性显示SsPIF在水稻中存在14对同源基因;启动子区域分析表明SsPIF基因富含光响应、激素响应与逆境响应元件;SsPIF基因的表达具有组织特异性,与割手密的生长发育相关。本研究结果为进一步探究SsPIF基因家族在割手密的生长发育调控和信号转导通路中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 割手密 sspif 基因家族 生物信息学 表达分析
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