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Development of Split-Protein Systems: From Binary to Ternary System
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作者 Shengyi Shen 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2021年第3期78-94,共17页
Tens of thousands of protein-protein interactions (PPIs) have been found in human cells and many of these macromolecular partnerships could determine the cell growth and death. Thus there is a need to develop the meth... Tens of thousands of protein-protein interactions (PPIs) have been found in human cells and many of these macromolecular partnerships could determine the cell growth and death. Thus there is a need to develop the methods to catalogue these macromolecules by detecting their interactions, modifications, and cellular locations. It will be helpful for scientists to compare the difference between a diseased cellular state and its normal state and to find the potential therapy treatment to intervene this status. One technology called split-protein reassembly or protein fragment complementation has been developed in the last two decades. This technology makes use of appropriate fragmentation of some protein reporters and the refolding of these reports could be detected by their function to confirm the interaction of interest. This system has been set up in cell-free systems, </span><i><span style="font-family:Verdana;">E.</span></i></span><i><span style="font-family:""> </span></i><i><span style="font-family:Verdana;">coli</span></i><span style="font-family:""><span style="font-family:Verdana;">, yeast, mammalian cells, plants and live animals. Herein, I present the development in fluorescence- and bioluminescence-based split-protein biosensors in both binary and ternary systems. In addition, some people developed the split-protein system by combining it with chemical inducer of dimerization strategy (CID). This has been applied for identifying the enzyme inhibitors and regulating the activity of protein kinases and phosphatases. With effort from many laboratories from the world, a variety of split-protein systems have been developed for studying the PPI </span><i><span style="font-family:Verdana;">in vitro</span></i><span style="font-family:Verdana;"> and </span><i><span style="font-family:Verdana;">in vivo</span></i><span style="font-family:Verdana;">, monitoring the biological process, and controlling the activity of the enzyme of interest. 展开更多
关键词 split-protein Reassembly Protein Fragment Complementation Chemical In-ducer of Dimerization (CID) Protein-Protein Interaction (PPI)
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瓜蒌皮提取物通过AMPK/mTOR通路调控线粒体分裂与自噬改善心力衰竭的作用机制
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作者 居羚 周瑜湉 史伦 《中西医结合心脑血管病杂志》 2025年第10期1482-1487,共6页
目的:探讨瓜蒌皮提取物(FTPE)通过腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)通路调控线粒体分裂与自噬改善心力衰竭的机制。方法:将58只大鼠分为正常对照组、假手术组、模型组、阳性对照组(卡托普利片13.5 mg/kg)和FTPE组... 目的:探讨瓜蒌皮提取物(FTPE)通过腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)通路调控线粒体分裂与自噬改善心力衰竭的机制。方法:将58只大鼠分为正常对照组、假手术组、模型组、阳性对照组(卡托普利片13.5 mg/kg)和FTPE组(瓜蒌皮注射液4 mL/kg),干预时间8周。分别行心脏彩超检查[左室射血分数(LVEF)、左室短轴缩短率(LVFS)和左室舒张末期容积(LVEDV)]、心肌组织病理检测、线粒体腺苷三磷酸(ATP)和活性氧(ROS)含量检测、蛋白免疫印迹法(Western Blot)检测各组大鼠AMPK/mTOR通路及线粒体分裂、自噬相关蛋白表达水平。结果:4周后,与假手术组比较,模型组大鼠LVEF、LVFS降低,LVEDV升高,差异有统计学意义(P<0.05)。12周后,与假手术组比较,模型组大鼠LVEF、LVFS、线粒体ATP及磷酸化AMPK(p-AMPK)/AMPK蛋白表达量降低,LVEDV、ROS及心肌线粒体分裂蛋白1(Fis1)、动力蛋白相关蛋白1(Drp1)、自噬相关基因1(Beclin1)、微管相关蛋白1轻链3(LC3)表达升高,磷酸化mTOR(p-mTOR)/mTOR蛋白表达量增多(P<0.05)。与模型组比较,阳性对照组和FTPE组LVEF、LVFS、线粒体ATP及p-AMPK/AMPK蛋白表达量升高,LVEDV、ROS及心肌Fis1、Drp1、Beclin1、LC3表达减少,p-mTOR/mTOR蛋白表达量降低(P<0.05)。结论:瓜蒌皮提取物通过激活AMPK/mTOR通路调控线粒体分裂与自噬,改善心力衰竭大鼠心脏功能。 展开更多
关键词 心力衰竭 瓜蒌皮提取物 线粒体 分裂 自噬 腺苷酸活化蛋白激酶/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白通路 大鼠 实验研究
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基于分裂绿色荧光蛋白技术建立布鲁氏菌分泌蛋白鉴定系统
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作者 王坤鹏 尹伊 +9 位作者 杨新梅 刘津月 李梦思 李娜 王少辉 鲍衍清 张广冻 祁晶晶 黄勇 田明星 《微生物学通报》 北大核心 2025年第9期4303-4315,共13页
【背景】布鲁氏菌(Brucella)作为一种兼性胞内寄生菌,可通过分泌效应蛋白修饰宿主细胞多重信号通路帮助其完成胞内增殖。因此,分泌效应蛋白的鉴定对于阐明布鲁氏菌致病机制至关重要。细菌分泌效应蛋白的鉴定方法通常有融合标签法和酶标... 【背景】布鲁氏菌(Brucella)作为一种兼性胞内寄生菌,可通过分泌效应蛋白修饰宿主细胞多重信号通路帮助其完成胞内增殖。因此,分泌效应蛋白的鉴定对于阐明布鲁氏菌致病机制至关重要。细菌分泌效应蛋白的鉴定方法通常有融合标签法和酶标记技术,但其操作步骤烦琐、成本昂贵。【目的】基于双分子荧光互补技术开发一种简单便捷的质粒系统,用来鉴定布鲁氏菌的分泌效应蛋白。【方法】基于分裂绿色荧光蛋白(split green fluorescent protein,split-GFP)技术,首先,构建真核表达质粒pMAX-sfGFP_(1-10)-IRES-NLS-tagBFP,该质粒能在转染的细胞中表达sfGFP_(1-10)蛋白片段,同时具有核定位信号的BFP蛋白能指示转染成功的细胞;之后,构建能在布鲁氏菌中融合表达4×GFP_(11)蛋白的pMCRt-mCherry-P31-4×GFP_(11)-Flag质粒。最后,通过布鲁氏菌分泌效应蛋白BspA和BPE123以及阴性蛋白GST验证split-GFP系统的可行性。【结果】荧光显微镜观察转染pMAX-sfGFP_(1-10)-IRES-NLS-tagBFP质粒的HeLa细胞,表明tagBFP和sfGFP_(1-10)蛋白成功表达;蛋白免疫印迹试验证明布鲁氏菌BspA、BPE123及GST成功与4×GFP_(11)-Flag融合表达;细胞感染和荧光显微镜观察结果表明split-GFP能成功指示BspA和BPE123的分泌活性,而阴性分泌蛋白GST无分泌活性。【结论】本研究基于split-GFP技术构建的双质粒系统能成功验证布鲁氏菌效应蛋白的分泌活性,为布鲁氏菌分泌蛋白的鉴定提供了一种新的工具。 展开更多
关键词 分裂绿色荧光蛋白 布鲁氏菌 分泌蛋白 鉴定
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基于Split-GFP系统定量分析大肠杆菌中异源表达的类胶原蛋白Scl2
4
作者 色依德·斯马依 赵晨旭 +3 位作者 张轶群 刘业学 王稳航 李玉 《天津科技大学学报》 2025年第1期13-19,27,共8页
利用大肠杆菌(Escherichia coli)表达类胶原蛋白Scl2,并通过Split-GFP系统建立一种简便、快速且可定量检测Scl2的方法。结果表明,Scl2在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中成功表达,并通过His亲和标签纯化得到较高纯度的Scl2。圆二... 利用大肠杆菌(Escherichia coli)表达类胶原蛋白Scl2,并通过Split-GFP系统建立一种简便、快速且可定量检测Scl2的方法。结果表明,Scl2在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中成功表达,并通过His亲和标签纯化得到较高纯度的Scl2。圆二色光谱和差示扫描量热仪分析发现,Scl2的二级结构和热稳定性与动物源Ⅰ型胶原蛋白相似,并且GFP11的融合对其几乎没有影响。GFP1-10和Scl2-GFP11结合的前20 h的结合速度较高,达到最大相对荧光强度需要约70 h。当两者结合1 h时,Scl2-GFP11蛋白质量浓度与相对荧光强度之间能够形成较好的线性关系,相关系数R2为0.9995,重复性良好。本研究利用Split-GFP系统建立了体外检测并定量分析Scl2的方法,为下一步高通量筛选研究提供了快速、简便的工具。 展开更多
关键词 大肠杆菌 异源表达 类胶原蛋白Scl2 Split-GFP 蛋白定量分析
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施肥量和播种方式对甘肃高寒阴湿区猫尾草新品系生产性能的影响
5
作者 张文轩 李瑞珍 +1 位作者 杜文华 田新会 《草业科学》 北大核心 2025年第2期387-395,共9页
为筛选甘肃高寒阴湿区猫尾草(Phleum pretense)新品系比较适宜的施肥量和播种方式,以不同施肥量[施纯氮量0(F_(1))、90(F_(2))、180(F_(3))、360 kg·hm^(-2)(F_(4))]和不同播种方式[条播(S_(1))、撒播(S_(2))、点播(S_(3))]研究二... 为筛选甘肃高寒阴湿区猫尾草(Phleum pretense)新品系比较适宜的施肥量和播种方式,以不同施肥量[施纯氮量0(F_(1))、90(F_(2))、180(F_(3))、360 kg·hm^(-2)(F_(4))]和不同播种方式[条播(S_(1))、撒播(S_(2))、点播(S_(3))]研究二者对生长第2年和第3年猫尾草新品系生产性能和营养成分的影响。结果表明:从施肥量看,生长第2年和第3年施肥量为90 kg·hm^(-2)时,猫尾草新品系的平均干草产量均最高,平均粗蛋白含量均较高。从播种方式看,猫尾草新品系在点播处理下的平均株高、粗蛋白和粗脂肪含量均高于条播和撒播。施肥量×播种方式互作效用表明,播种方式不同,猫尾草新品系生长发育所需的施肥量不同;点播,生长第2年和第3年施用90 kg·hm^(-2)氮肥的猫尾草新品系模式,具有用种量和用肥量少、产量高、营养好的特点,属于低投入、高产出的一种种植方式,适宜在甘肃高寒阴湿区推广。 展开更多
关键词 高寒阴湿 猫尾草 裂区 点播 干草产量 粗蛋白 粗脂肪
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基于片段互补策略的Split-TurboID体系构建及其在细胞间通信研究中的应用
6
作者 耿丹丹 张心如 +2 位作者 韩毅 赵章婷 安利伟 《同济大学学报(医学版)》 2025年第3期311-318,共8页
目的基于片段互补策略构建Split-TurboID技术体系,实现对细胞间相互作用蛋白的高效、特异性标记。方法构建基于分泌型和可介导细胞间直接互作的N-TurboID和C-TurboID非活性片段,并验证其在细胞中的表达和定位。通过Western印迹法、免疫... 目的基于片段互补策略构建Split-TurboID技术体系,实现对细胞间相互作用蛋白的高效、特异性标记。方法构建基于分泌型和可介导细胞间直接互作的N-TurboID和C-TurboID非活性片段,并验证其在细胞中的表达和定位。通过Western印迹法、免疫荧光法和流式细胞术评估Split-TurboID技术的标记能力。结果成功构建并验证了自发诱导与诱饵蛋白互作诱导的Split-TurboID技术体系。Western印迹法、免疫荧光法和流式细胞术结果表明,N-TurboID和C-TurboID片段在靠近时彼此具有高亲和力,可重新组成具有活性的TurboID酶,再通过生物素标记后,可实现探究分泌型蛋白质互作和细胞间直接相互作用。结论Split-TurboID技术为细胞间相互作用的研究提供了高效、灵活且特异性强的生物素标记方法,为探索细胞间通信提供了有力的技术支持。 展开更多
关键词 片段互补策略 Split-TurboID 邻近标记技术 蛋白质相互作用 细胞间通信
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槲皮素通过恢复免疫平衡对类风湿性关节炎大鼠的保护作用
7
作者 杨昊若 唐今扬 +2 位作者 张伊婷 郭红灵 杨斌 《世界中医药》 北大核心 2025年第16期2870-2877,共8页
目的:研究槲皮素对类风湿性关节炎大鼠免疫平衡影响及治疗作用,并初步探究潜在机制。方法:Ⅱ型胶原诱导法制备类风湿性关节炎(CIA)模型大鼠,各给药组按相应药物剂量干预。观察大鼠足肿胀度并测定关节炎临床积分;检测大鼠血清抗环瓜氨酸... 目的:研究槲皮素对类风湿性关节炎大鼠免疫平衡影响及治疗作用,并初步探究潜在机制。方法:Ⅱ型胶原诱导法制备类风湿性关节炎(CIA)模型大鼠,各给药组按相应药物剂量干预。观察大鼠足肿胀度并测定关节炎临床积分;检测大鼠血清抗环瓜氨酸肽抗体(A-CCP)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及白细胞介素(IL-6、IL-10、IL-17)水平;观察关节组织形态变化;免疫组织化学法(IHC)及实时荧光定量PCR法(RT-qPCR)检测果蝇双翅边缘缺刻同源基因1(Notch1)、发状分裂相关增强子1(Hes1)、维甲酸相关孤儿受体转录因子(RORγt)、叉头状/翅膀状螺旋转录因子(Foxp3)蛋白及mRNA表达。结果:与对照组比较,模型组大鼠关节肿胀畸形,关节炎评分增加,关节组织病理改变显著,血清IL-17、A-CCP、MMP-9、TNF-α、IL-6水平上升,IL-10水平降低;关节Notch1、Hes1、RORγt蛋白及mRNA表达增强,Foxp3蛋白及mRNA表达降低(P<0.01)。与模型组比较,槲皮素高、低剂量组大鼠关节肿胀减轻,关节炎评分减少,关节病理改变明显缓解,血清IL-17、A-CCP、MMP-9、TNF-α、IL-6水平降低,IL-10水平上升,关节Notch1、Hes1、RORγt蛋白及mRNA表达均下调,Foxp3蛋白及mRNA表达上调(P<0.05)。结论:槲皮素可缓解CIA大鼠关节损伤,其机制可能与恢复免疫平衡有关。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 槲皮素 辅助性T细胞17 调节性T细胞 免疫细胞平衡 果蝇双翅边缘缺刻同源基因1 发状分裂相关增强子1 大鼠
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氟中毒对神经细胞损伤及自噬的影响 被引量:1
8
作者 王正薇 高霄 +5 位作者 蔡娜 何雯雯 唐智 齐晓岚 官志忠 肖雁 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第5期625-635,共11页
目的探讨氟中毒对小鼠小胶质细胞株BV2和小鼠来源神经母细胞瘤细胞株N2a及小鼠大脑皮质神经细胞损伤及自噬的影响。方法8周龄清洁级雄性C57BL/6J野生型小鼠,随机分为对照组(饮水含氟量<0.5 mg/L)、低氟组(饮水含氟量10.0 mg/L)和高氟... 目的探讨氟中毒对小鼠小胶质细胞株BV2和小鼠来源神经母细胞瘤细胞株N2a及小鼠大脑皮质神经细胞损伤及自噬的影响。方法8周龄清洁级雄性C57BL/6J野生型小鼠,随机分为对照组(饮水含氟量<0.5 mg/L)、低氟组(饮水含氟量10.0 mg/L)和高氟组(饮水含氟量50.0 mg/L),每组10只喂养12周;BV2及N2a正常培养后分对照组、低氟组(培养基含氟量1.0 mmol/L)和高氟组(培养基含氟量1.5 mmol/L);采用CCK8检测不同浓度氟处理下BV2和N2a细胞增殖活力变化,氟离子选择电极法检测造模小鼠尿、血、骨氟含量变化;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测BV2、小鼠大脑皮质中小胶质细胞活化标志物离子钙结合衔接分子1(Iba-1)的表达变化及N2a细胞、BV2细胞和小鼠大脑皮质中自噬相关微管相关蛋白1轻链3(LC3)及自噬受体蛋白P62蛋白(SQSTM1/P62)的表达水平;线粒体动力学及自噬融合分裂相关蛋白线粒体融合蛋白1(Mfn1)、线粒体融合蛋白2(Mfn2)、动力相关蛋白1(Drp1)、张力蛋白同源物诱导的假定激酶1(Pink1)及E3泛素连接酶(Parkin)的表达水平。结果CCK8结果显示,1.5 mmol/LNaF处理的BV2、N2a细胞增殖活力明显下降(P<0.001,);低氟组小鼠氟斑牙发生率为60%,高氟组小鼠氟斑牙发生率为80%;与对照组比较,染氟组小鼠尿、血、骨氟含量明显上升(P<0.001);蛋白免疫印迹结果显示,与对照组比较,高氟组的小鼠大脑皮质和BV2的小胶质细胞活化标志物Iba-1表达水平显著升高(P<0.001,P<0.01),高氟组的小鼠大脑皮质和BV2及N2a细胞自噬相关蛋白LC3、Parkin、Pink1表达量显著增加(P<0.05)、P62水平显著下降(P<0.01);线粒体融合蛋白Mfn1、Mfn2水平显著增加(P<0.001),分裂蛋白Drp1无明显变化。结论氟中毒可导致线粒体损伤、破坏线粒体融合分裂平衡并引起细胞自噬,为阐明氟中毒神经系统损伤与细胞自噬之间相互关系提供新思路。 展开更多
关键词 氟中毒 细胞自噬 线粒体分裂融合 线粒体自噬 小胶质细胞 小鼠
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分裂相关增强子1、细胞分裂周期蛋白25同源蛋白C在直肠癌组织中的表达及其临床意义
9
作者 张景旭 李德舫 +1 位作者 于渌 张玉田 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第1期21-26,共6页
目的探讨分裂相关增强子1(Hairy and enhancer of split related protein 1,HESR-1)、细胞分裂周期蛋白25同源蛋白C(Cell division cycle 25C,CDC25C)在直肠癌组织中的表达及其临床意义。方法选择166例行根治性手术的直肠癌患者为研究对... 目的探讨分裂相关增强子1(Hairy and enhancer of split related protein 1,HESR-1)、细胞分裂周期蛋白25同源蛋白C(Cell division cycle 25C,CDC25C)在直肠癌组织中的表达及其临床意义。方法选择166例行根治性手术的直肠癌患者为研究对象,采用免疫组织化学法检测癌组织及癌旁组织中HESR-1和CDC25C的表达,收集患者临床病理参数并进行随访,分析HESR-1和CDC25C表达对直肠癌患者临床病理参数及预后的影响。结果肠癌组织中CDC25C、HESR-1的阳性率均高于癌旁组织(46.9%vs 12.6%,41.6%vs 7.6%),差异有统计学意义(P<0.05)。在癌组织中,CDC25C mRNA与HESR-1 mRNA的表达呈正相关(r=0.862,P=0.003)。癌组织CDC25C及HESR-1表达阳性患者的肿瘤直径和淋巴结转移率均高于表达阴性者(P<0.05)。Cox多因素分析结果显示,肿瘤直径、淋巴结转移、CDC25C阳性及HESR-1阳性是影响直肠癌患者预后的独立危险因素(P<0.05)。结论HESR-1和CDC25C在直肠癌组织中表达升高,且与患者预后密切相关。 展开更多
关键词 直肠癌 分裂相关增强子1 细胞分裂周期蛋白25同源蛋白C
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CTAB对流感病毒的裂解作用 被引量:6
10
作者 戚凤春 薄洪 +6 位作者 王敏文 辛忠 赵大鹏 范宇红 李晓波 盛军 张艳 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2003年第2期23-25,共3页
观察流感病毒膜蛋白 血凝素 (HA)和神经氨酸酶 (NA)在裂解剂CTAB作用下的裂解情况。流感病毒加入一定量的保护剂 ,一定时间后加入裂解剂CTAB ,在 5~ 8℃温度下 ,作用 2个h ,超速离心 ,提取上清液。经电镜观察、SDS PAGE电泳检测 ,表... 观察流感病毒膜蛋白 血凝素 (HA)和神经氨酸酶 (NA)在裂解剂CTAB作用下的裂解情况。流感病毒加入一定量的保护剂 ,一定时间后加入裂解剂CTAB ,在 5~ 8℃温度下 ,作用 2个h ,超速离心 ,提取上清液。经电镜观察、SDS PAGE电泳检测 ,表明流感病毒膜蛋白在裂解剂浓度为 4 0 0mg/L的条件下 ,裂解比较完全 ,形态比较完整。CTAB作为流感病毒膜蛋白的裂解剂 ,效果较好 ,浓度为 4 0 0mg/L可作为实际工作的使用浓度。 展开更多
关键词 CTAB 流感病毒 裂解作用 裂解剂 流感疫苗
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替代方法评价两种检测系统测定糖化血清蛋白结果的一致性 被引量:1
11
作者 黄永富 曹兴建 《检验医学》 CAS 2012年第12期1058-1061,共4页
目的评价德灵和奥林巴斯2种生化检测系统间糖化血清蛋白(GSP)测定结果的一致性。方法分别校准用于测定GSP的德灵和奥林巴斯2种检测系统,并在该分析批内确认室内质控在控。根据美国临床实验室标准化协会(CLSI)GP29-A文件要求分割实验样本... 目的评价德灵和奥林巴斯2种生化检测系统间糖化血清蛋白(GSP)测定结果的一致性。方法分别校准用于测定GSP的德灵和奥林巴斯2种检测系统,并在该分析批内确认室内质控在控。根据美国临床实验室标准化协会(CLSI)GP29-A文件要求分割实验样本,收集患者血清后一分为二,在2种检测系统上分别对室间质评中不能提供能力验证(PT)的检测项目GSP进行双份测定,分析浓度尽可能分布于检测项目方法的整个检测范围内,最后计算2种检测系统检测结果的均值(x珋)、均值的差值(d)及允许差异值(D),判断2种检测系统是否能得出一致性的结果。结果奥林巴斯检测系统上GSP检测结果均落在德灵检测系统的允许差异值范围(x珋±D)内。2种检测系统在1.0~16.0 mmol/L范围内测定GSP的相关性良好,其结果一致性可以接受。结论德灵和奥林巴斯2种检测系统测定GSP的结果基本一致,临床上可任选1种用于GSP测定。对于目前暂没开展室间质评计划的项目,根据CLSI GP29-A文件进行样本分割实验(SST)并评价检测结果的一致性,是一种评价2种检测系统结果一致性方便而快捷的手段。 展开更多
关键词 糖化血清蛋白 样本分割实验 检测系统 结果一致性
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丛枝菌根真菌对中性紫色土土壤团聚体特征的影响 被引量:22
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作者 彭思利 申鸿 +2 位作者 袁俊吉 魏朝富 郭涛 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期498-505,共8页
利用分根装置研究了接种丛枝菌根真菌对中性紫色土土壤团聚体数量、大小和稳定性的影响,分析了土壤团聚体数量、分布和分形维数,并运用通径分析对不同影响因子进行了分析。结果表明:接种G.intraradices和G.m osseae的菌根室土壤有机质... 利用分根装置研究了接种丛枝菌根真菌对中性紫色土土壤团聚体数量、大小和稳定性的影响,分析了土壤团聚体数量、分布和分形维数,并运用通径分析对不同影响因子进行了分析。结果表明:接种G.intraradices和G.m osseae的菌根室土壤有机质和总球囊霉素相关土壤蛋白含量有增加的趋势;湿筛条件下菌根室土壤的平均重量直径(MWD)和几何平均直径(GMD)均显著高于根室土壤,而且降低了土壤分形维数,显示了丛枝菌根真菌提升土壤结构特征的作用。通径分析的结果表明,在影响MWD的众多因子中,菌丝密度对MWD有最大的直接作用。两种菌种对土壤结构均有不同程度的改良作用,反映了丛枝菌根真菌功能的多样性。 展开更多
关键词 分根装置 菌丝 球囊霉素相关土壤蛋白 平均重量直径 几何平均直径 通径分析
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拟南芥液泡分拣蛋白AtVPS25调控植物生长素响应的功能分析 被引量:4
13
作者 郭萌萌 陈明 +4 位作者 刘荣榜 马有志 李连成 徐兆师 张小红 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第17期3501-3512,共12页
【目的】鉴定生长素胁迫条件下纯合突变体vps25的表型,获得拟南芥液泡分选蛋白AtVPS25的互作蛋白,并分析AtVPS25和其互作蛋白在生长素响应过程中的功能及其分子机制。【方法】根据"三引物法"鉴定突变体;通过观察拟南芥vps25... 【目的】鉴定生长素胁迫条件下纯合突变体vps25的表型,获得拟南芥液泡分选蛋白AtVPS25的互作蛋白,并分析AtVPS25和其互作蛋白在生长素响应过程中的功能及其分子机制。【方法】根据"三引物法"鉴定突变体;通过观察拟南芥vps25突变体在外加生长素的培养基上的表型,鉴定AtVPS25的功能;以AtVPS25为诱饵蛋白,采用泛素分离系统筛选在拟南芥中与其互作的蛋白;利用酵母互作试验和双分子荧光互补试验(BiFC)验证AtVPS25与AtAIR12(for Auxin-Induced in Root cultures)的互作关系;鉴定AtVPS25和AtAIR12蛋白在植物细胞中的定位情况;采用Real-time PCR方法,分析在生长素处理条件下,部分生长素运输相关基因在拟南芥vps25突变体中的表达变化。【结果】Real-time PCR结果显示,10μmol·L-1 IAA处理条件下,在野生型拟南芥(WT)中,AtVPS25的表达量随着胁迫时间的增长而增高,并在12 h达到最高,约为0 h的40倍,证明AtVPS25受生长素处理的诱导表达。利用泛素分离系统筛库获得AtVPS25的互作蛋白AtAIR12、AtVPS25与AtAIR12全长蛋白序列的酵母双杂交试验证明AtVPS25与AtAIR12互作。亚细胞定位试验证明AtVPS25定位在细胞膜和细胞质中,AtAIR12定位在细胞膜及叶绿体膜上。BiFC(双分子荧光互补)试验结果显示,AtVPS25蛋白与AtAIR12蛋白互作,并且互作位点在细胞膜和细胞质中。突变体鉴定获得纯合突变体vps25。vps25在0.1 mg·L-1 IAA条件下生长,表现为主根伸长受到抑制,并且相对同一条件下的WT的主根长度差异极显著(P<0.01),而同时侧根数无明显差异,这与已报道的air12-1突变体在生长素处理条件下的表型相似。10μmol·L-1 IAA处理时,在WT背景条件下,AtAIR12的表达量对IAA响应明显,并且随着胁迫时间的增长而增高,在12 h时达到最高,约为0 h的80倍,证明10μmol·L-1 IAA处理条件下,WT中AtAIR12表达量的变化趋势与AtVPS25完全相同。同时在vps25突变体背景条件下,AtAIR12的表达相对于WT受到抑制,在0-24 h表达量无明显变化。此外,在vps25突变体背景条件下,生长素输出载体基因AtPIN2相对于WT中表达量降低,生长素输入载体基因AtLAX2相对于WT中表达量提高。【结论】拟南芥液泡分拣蛋白基因AtVPS25受IAA诱导表达,参与调控植物主根的发育,AtVPS25可以与生长素响应蛋白AtAIR12在细胞质和细胞膜上互作,AtVPS25调控部分生长素相关基因的表达,AtVPS25通过调控这些下游基因的表达影响生长素在根部的响应。AtVPS25与AtAIR12的调控机制需要进一步深入研究。 展开更多
关键词 拟南芥 生长素运输 内体分选复合物 蛋白互作 泛素分离系统 双分子荧光互补试验
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TMD2前断裂CFTR翻译后的连接及氯离子通道功能 被引量:1
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作者 朱甫祥 宫贤弟 +3 位作者 刘泽隆 杨树德 屈慧鸽 迟晓艳 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1710-1716,共7页
CFTR基因突变导致一种常染色体隐性遗传疾病——囊性纤维化(CF)。利用split Ssp DnaB intein的蛋白质反式剪接技术的真核细胞双载体转CFTR基因,旨在研究翻译后水平CFTR的连接,以及由其建立的氯离子通道功能。于CFTR膜内第2个跨膜结构域(... CFTR基因突变导致一种常染色体隐性遗传疾病——囊性纤维化(CF)。利用split Ssp DnaB intein的蛋白质反式剪接技术的真核细胞双载体转CFTR基因,旨在研究翻译后水平CFTR的连接,以及由其建立的氯离子通道功能。于CFTR膜内第2个跨膜结构域(TMD2)前的Glu838密码子后将其cDNA断裂为N端和C端两部分,与具有蛋白质反式剪接作用的split Ssp DnaB intein编码序列融合,分别插入到载体pEGFP-N1和pEYFP-N1,构建一对真核表达载体pEGFP-NInt和pEYFP-IntC。用脂质体将这对载体共转染至幼年仓鼠肾细胞(BHK),瞬时表达实验用Western blotting观察CFTR蛋白质的连接,并用膜片钳技术记录Cl-通道电流。结果显示,基因共转染细胞呈现完整的CFTR蛋白条带,膜片钳记录到全细胞Cl-电流和单个Cl-通道开放活性。结果表明split Ssp DnaB intein的蛋白质反式剪接技术可用于双载体共转移CFTR基因,为CF基因治疗应用双腺相关病毒载体(AAV)转运CFTR基因,克服AAV的容量限制提供了依据。 展开更多
关键词 CFTR Cl-通道 SPLIT SSP DNAB INTEIN 蛋白质反式剪接 双载体基因转移
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拟南芥G蛋白α亚基GPA1互作蛋白铜离子结合蛋白AtBCB的鉴定及功能分析
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作者 张小红 许鹏博 +4 位作者 郭萌萌 徐兆师 李连城 陈明 马有志 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1952-1961,共10页
拟南芥G蛋白复合体(异源三聚体包括α、β、γ亚基)参与植物多个信号转导途径,G蛋白复合体通过膜上的G蛋白偶联受体(GPCR)接受胞外信号后通过3个亚基将信号传递给下游效应器。目前,有关植物G蛋白复合体的效应器及其信号传递途径的报道较... 拟南芥G蛋白复合体(异源三聚体包括α、β、γ亚基)参与植物多个信号转导途径,G蛋白复合体通过膜上的G蛋白偶联受体(GPCR)接受胞外信号后通过3个亚基将信号传递给下游效应器。目前,有关植物G蛋白复合体的效应器及其信号传递途径的报道较少,寻找新的G蛋白的效应器有助于阐明G蛋白复合体相关的信号传导途径。本研究以拟南芥G蛋白α亚基GPA1为诱饵蛋白,利用泛素分离系统筛选拟南芥cDNA文库,获得一个与GPA1互作的铜离子结合蛋白AtBCB。荧光双分子杂交(BiFC)试验证明,GPA1与AtBCB的互作发生在细胞膜上。基因表达特性分析结果显示,GPA1和AtBCB受金属铝胁迫的诱导表达。进一步以野生型拟南芥(WT)、GPA1拟南芥突变体gpa1-4和AtBCB拟南芥突变体bcb为材料,研究该基因对植物耐金属铝胁迫的功能,结果显示,在无胁迫情况下,2个突变体和WT根部的丙二醛含量无显著差异;在100μmol L–1Al3+处理下,gpa1-4突变体根部丙二醛含量显著(P<0.05)低于WT低;bcb根部丙二醛含量极显著(P<0.01)高于WT。对3个铝胁迫响应基因(苹果酸转运体基因AtALMT1、半类型ABC转运蛋白基因ALS1和ABC转运蛋白基因ALS3)的表达进行Real-time PCR分析,比较它们在突变体和野生型之间的表达差异,发现在有铝和无铝处理情况下,ALS1和ALS3的表达水平在突变体和WT间均无显著差异;在铝处理下,gpa1-4中AtALMT1的表达量极显著高于WT;在bcb中的表达量显著低于WT。以上结果表明,植物通过细胞膜上的G蛋白α亚基GPA1和铜离子结合蛋白AtBCB的相互作用调控下游基因AtALMT1的表达,参与植物对铝胁迫的响应,其中GPA1对铝胁迫耐受起负向作用,AtBCB对铝胁迫耐受起正向作用。 展开更多
关键词 G蛋白 泛素分离系统 蛋白互作 铝离子胁迫 双分子荧光互补
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利用酵母双杂交系统研究桑脉带相关病毒核外壳蛋白自身相互作用 被引量:4
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作者 张璐 朱丽玲 +2 位作者 潘瑞兰 陈保善 蒙姣荣 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2428-2435,共8页
桑脉带相关病毒(mulberry vein banding-associated virus,Mu VBa V)属布尼安病毒科番茄斑萎病毒属,是广西桑树病毒病的主要病原。为研究其核外壳蛋白(nucleocapsid protein,N)的自身相互作用,本研究利用分离泛素酵母双杂交膜系统构建了... 桑脉带相关病毒(mulberry vein banding-associated virus,Mu VBa V)属布尼安病毒科番茄斑萎病毒属,是广西桑树病毒病的主要病原。为研究其核外壳蛋白(nucleocapsid protein,N)的自身相互作用,本研究利用分离泛素酵母双杂交膜系统构建了N蛋白的诱饵表达质粒和猎物表达质粒并转化酵母菌株NMY51。诱饵表达质粒p BT3-SUC-Mu VBa V-N或p DHB1-Mu VBa V-N和阳性对照质粒p Ost1-Nub I共转化的酵母菌在筛选性营养缺陷型培养基上SD-trp-leu-his-ade(SD-AHLW)均能正常生长,而与阴性对照质粒p PR3-N共转化的酵母在营养缺陷型SD-AHLW平板上不能正常生长,表明N蛋白诱饵质粒的表达产物没有自我激活活性,对酵母细胞也没有毒性。N蛋白诱饵表达质粒及其猎物表达质粒共转化的酵母也可以在SD-AHLW培养基上正常生长,说明N蛋白在酵母细胞中可发生自我相互作用。本研究结果为今后研究Mu VBa V N蛋白的功能以及通过筛选桑c DNA文库获得互作寄主因子奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 桑脉带病毒 核外壳蛋白 自身相互作用 分离泛素酵母双杂交膜系统
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N端无半胱氨酸断裂蛋白质内含子的构建
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作者 李佳 孟清 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期30-34,共5页
在体内或体外对目标蛋白进行标记或修饰,是研究蛋白质结构和功能的重要手段之一。目前的蛋白质修饰手段存在很多不足之处,尤其会对蛋白质的结构和功能产生影响。为了避免或降低这些影响,借助断裂蛋白质内含子反式剪接技术进行修饰是一... 在体内或体外对目标蛋白进行标记或修饰,是研究蛋白质结构和功能的重要手段之一。目前的蛋白质修饰手段存在很多不足之处,尤其会对蛋白质的结构和功能产生影响。为了避免或降低这些影响,借助断裂蛋白质内含子反式剪接技术进行修饰是一个有效可行的方法。可是因为天然存在的断裂蛋白质非常少,使该技术的应用受到了限制。因此通过数据库筛选、定点突变、WesternBlot等技术成功获得了2个有活性的体内断裂蛋白质内含子和1个有活性的N端无半胱氨酸的断裂蛋白质内含子。为后续可控的和特异的蛋白N端标记及应用提供了可行的生物学工具。 展开更多
关键词 N端无半胱氨酸断裂蛋白质内含子 蛋白质N端标记 蛋白质剪接
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MALToma Ig重链蛋白、IgH基因重排/断裂检测的临床意义 被引量:3
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作者 王红霞 陈昊 +3 位作者 林海月 聂艳红 齐冬雪 江亚军 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期902-906,共5页
目的探讨Ig重链蛋白、IgH基因重排/断裂在黏膜相关淋巴组织淋巴瘤(mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma,MALToma)诊断中的应用价值。方法选取40例MALToma作为实验组,15例反应性淋巴组织增生(reactive lymphoid hyperplasia,RLH... 目的探讨Ig重链蛋白、IgH基因重排/断裂在黏膜相关淋巴组织淋巴瘤(mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma,MALToma)诊断中的应用价值。方法选取40例MALToma作为实验组,15例反应性淋巴组织增生(reactive lymphoid hyperplasia,RLH)作为对照组,应用免疫组化、PCR、FISH技术分别检测两组中Ig重链蛋白、IgH基因重排、IgH基因断裂情况。结果(1)Ig重链蛋白表达根据免疫组化结果可分为三种模式:单种Ig重链蛋白表达(模式Ⅰ)、Ig重链蛋白全阴性(模式Ⅱ)、多种Ig重链蛋白表达(模式Ⅲ)。实验组模式Ⅰ/Ⅱ的阳性率(87.5%)显著高于对照组(0)(P<0.01)。(2)实验组IgH基因重排、IgH基因断裂的阳性率分别为72.5%(29/40)、32.5%(13/40),而对照组未检出IgH基因重排、IgH基因断裂(P<0.01,P<0.05)。(3)Ig重链蛋白模式Ⅰ/Ⅱ和IgH基因重排联合检测以及Ig重链蛋白模式Ⅰ/Ⅱ、IgH基因重排和IgH基因断裂联合检测的阳性率均高达97.5%。(4)在Ig重链蛋白模式Ⅱ中,有9例检出IgH基因断裂(90%);在模式Ⅰ/Ⅲ中,仅有4例检出IgH基因断裂(13.3%),两组相比差异有统计学意义(P<0.01)。Ig重链蛋白表达和IgH基因断裂呈正相关(r s=0.323,P<0.05)。结论联合检测Ig重链蛋白表达模式和IgH基因重排可有效辅助鉴别MALToma和RLH;IgH基因断裂可能与Ig重链蛋白表达缺失高度相关。 展开更多
关键词 淋巴瘤 MALToma Ig重链蛋白 IGH基因重排 IgH基因断裂
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植物蛋白相互作用的研究方法
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作者 周峰 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第5期34-37,共4页
蛋白的相互作用是生命科学研究中的一个重要领域,对于研究未知蛋白的功能与作用具有重要意义,是目前研究的热点领域。文章介绍了非目标蛋白及目标蛋白相互作用的研究方法,讨论了这些研究方法在植物蛋白相互作用上的应用,并展望了研究蛋... 蛋白的相互作用是生命科学研究中的一个重要领域,对于研究未知蛋白的功能与作用具有重要意义,是目前研究的热点领域。文章介绍了非目标蛋白及目标蛋白相互作用的研究方法,讨论了这些研究方法在植物蛋白相互作用上的应用,并展望了研究蛋白相互作用的前景。 展开更多
关键词 植物蛋白 相互作用 分裂泛素化 酵母双杂交 蛋白质芯片
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神经节苷脂GM-1对大鼠缺血性脑损伤保护作用的实验研究
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作者 韩雪梅 陈佳俊 邵延坤 《吉林医学》 CAS 2004年第2期35-37,共3页
目的:研究神经节苷脂GM-1对大鼠脑缺血再灌注损伤的保护作用及Fas、Bcl-2表达的影响。方法:建立全脑缺血再灌注模型,应用二苯胺法和免疫组织化学方法观察脑缺血后3h、6h、24h脑组织DNA裂解率变化及Fas、Bcl-2表达,以及GM-1给药后的变化... 目的:研究神经节苷脂GM-1对大鼠脑缺血再灌注损伤的保护作用及Fas、Bcl-2表达的影响。方法:建立全脑缺血再灌注模型,应用二苯胺法和免疫组织化学方法观察脑缺血后3h、6h、24h脑组织DNA裂解率变化及Fas、Bcl-2表达,以及GM-1给药后的变化。结果:随着再灌注时间的延长,DNA裂解率变化明显增加,24h达高峰,Fas蛋白表达于再灌注6h达高峰,Bcl-2表达于再灌注3h达高峰,以后逐渐呈下降趋势;GM-1给药组相应时间点的DNA裂解率及Fas蛋白表达明显减少,Bcl-2表达增加。结论:GM-1能抑制脑缺血再灌注后细胞凋亡的发生,对脑缺再灌注损伤具有明显的保护作用。 展开更多
关键词 神经节苷脂 GM-1 缺血性脑损伤 保护作用 实验研究
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