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Sigma54依赖性转录起始
被引量：
2
1
作者
洪婷
梅子青
王丰
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期237-248,共12页
作为细菌RNA聚合酶(RNAP)的组成型辅助因子,sigma70和sigma54分别参与了原核细胞不同类型基因的转录起始调控。sigma70负责管家基因的自发转录起始;而sigma54负责应激信号相关的基因转录起始。sigma54与RNAP形成复合物后,会通过空间阻...
作为细菌RNA聚合酶(RNAP)的组成型辅助因子,sigma70和sigma54分别参与了原核细胞不同类型基因的转录起始调控。sigma70负责管家基因的自发转录起始;而sigma54负责应激信号相关的基因转录起始。sigma54与RNAP形成复合物后,会通过空间阻滞的方式阻碍DNA进入RNAP中,抑制基因转录起始。当细胞环境变化后,特定应激信号会通过细菌增强子结合蛋白(bEBP)诱发sigma54的构象发生变化,解除sigma54对RNAP的抑制,启动sigma54依赖的基因转录。最近的结构生物学研究揭示了sigma54依赖性转录起始的若干复合物结构,包括全酶、封闭式复合物、2个中间状态复合物及开放式复合物。通过分析这些转录起始复合物的结构,本文阐述了转录起始过程中复合物的结构变化。描述并分析了sigma54和bEBP在转录起始过程中所发挥的功能。本文有助于了解转录起始分子水平的变化,为深入理解sigma54和bEBP促进转录起始的分子机制提供了参考。
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关键词
转录调控
sigma54
细菌增强子激活蛋白质
转录起始复合物
RNA聚合酶
原文传递
苏云金芽胞杆菌Sigma54和CcpA共同调控的基因鉴定
被引量：
3
2
作者
程海舰
彭琦
+1 位作者
张杰
宋福平
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期380-390,共11页
【目的】通过综合分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)HD73菌株Sigma54缺失突变体的转录组数据和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)ATCC 14579菌株CcpA缺失突变体的转录组数据,并进行启动子与CcpA蛋白的体外结合验证,明确Bt HD73...
【目的】通过综合分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)HD73菌株Sigma54缺失突变体的转录组数据和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)ATCC 14579菌株CcpA缺失突变体的转录组数据,并进行启动子与CcpA蛋白的体外结合验证,明确Bt HD73菌株中Sigma54和CcpA共同调控的基因,丰富了对微生物的代谢调控网络的认识。【方法】以转录组测序结果为基础,通过基因同源性的比对在Bt HD73菌株中寻找受Sigma54和CcpA共同调控的基因,在这些基因中找到具有cre序列的启动子,通过凝胶阻滞验证这些启动子与CcpA蛋白的结合。【结果】Bt HD73菌株中有31个基因受Sigma54和CcpA共同调控,其中14个基因的启动子序列包含cre序列,这些启动子都可以与CcpA蛋白发生体外结合。【结论】Bt HD73菌株中有14个基因直接受CcpA的调控,同时其转录受Sigma54的控制。
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关键词
苏云金芽胞杆菌
sigma54
CCPA
转录调控
原文传递
苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控
被引量：
3
3
作者
王冠男
彭琦
+3 位作者
郑庆云
李杰
张杰
宋福平
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1129-1137,共9页
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控和bkdR突变体的表型特征,明确bkdR所在基因簇的转录调控机制和对Cry蛋白产量的影响。【方法】通过生物信息学方法分析bkdR所在基因簇的结构,RT-PCR分析基因簇的转录单元,采用同源重...
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控和bkdR突变体的表型特征,明确bkdR所在基因簇的转录调控机制和对Cry蛋白产量的影响。【方法】通过生物信息学方法分析bkdR所在基因簇的结构,RT-PCR分析基因簇的转录单元,采用同源重组技术敲除苏云金芽胞杆菌HD73菌株的bkdR基因,利用启动子融合lacZ的方法分析启动子的转录活性。利用总蛋白定量确定Cry1Ac蛋白产量。【结果】bkd基因簇由8个基因组成,其中ptb-bkdB7个基因组成1个转录单元。ptb基因的启动子转录活性在sigL和bkdR突变体中均明显降低。bkdR基因的缺失对菌体生长、芽胞形成率和Cry1Ac蛋白产量无影响,但使运动能力减弱。【结论】bkd操纵子受Sigma 54控制,并由BkdR激活,bkdR基因的缺失对Cry蛋白产量无影响,对菌株的运动能力有影响。
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关键词
苏云金芽胞杆菌
增强子结合蛋白(Enhancer
BINDING
Proteins
简称EBPs)
bkdR基因
转录起始因子
sigma54
原文传递
题名
Sigma54依赖性转录起始
被引量：
2
1
作者
洪婷
梅子青
王丰
机构
北京理工大学生命学院
北京科技大学化学与生物工程学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期237-248,共12页
基金
国家自然科学基金(No.31870791)资助。
文摘
作为细菌RNA聚合酶(RNAP)的组成型辅助因子,sigma70和sigma54分别参与了原核细胞不同类型基因的转录起始调控。sigma70负责管家基因的自发转录起始;而sigma54负责应激信号相关的基因转录起始。sigma54与RNAP形成复合物后,会通过空间阻滞的方式阻碍DNA进入RNAP中,抑制基因转录起始。当细胞环境变化后,特定应激信号会通过细菌增强子结合蛋白(bEBP)诱发sigma54的构象发生变化,解除sigma54对RNAP的抑制,启动sigma54依赖的基因转录。最近的结构生物学研究揭示了sigma54依赖性转录起始的若干复合物结构,包括全酶、封闭式复合物、2个中间状态复合物及开放式复合物。通过分析这些转录起始复合物的结构,本文阐述了转录起始过程中复合物的结构变化。描述并分析了sigma54和bEBP在转录起始过程中所发挥的功能。本文有助于了解转录起始分子水平的变化,为深入理解sigma54和bEBP促进转录起始的分子机制提供了参考。
关键词
转录调控
sigma54
细菌增强子激活蛋白质
转录起始复合物
RNA聚合酶
Keywords
transcriptional regulation
sigma54
bacterial enhancer binding protein(bEBP)
transcriptional initiation complex
RNA polymerase(RNAP)
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
苏云金芽胞杆菌Sigma54和CcpA共同调控的基因鉴定
被引量：
3
2
作者
程海舰
彭琦
张杰
宋福平
机构
东北农业大学生命科学学院
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期380-390,共11页
基金
国家自然科学基金(31530095)
文摘
【目的】通过综合分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)HD73菌株Sigma54缺失突变体的转录组数据和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)ATCC 14579菌株CcpA缺失突变体的转录组数据,并进行启动子与CcpA蛋白的体外结合验证,明确Bt HD73菌株中Sigma54和CcpA共同调控的基因,丰富了对微生物的代谢调控网络的认识。【方法】以转录组测序结果为基础,通过基因同源性的比对在Bt HD73菌株中寻找受Sigma54和CcpA共同调控的基因,在这些基因中找到具有cre序列的启动子,通过凝胶阻滞验证这些启动子与CcpA蛋白的结合。【结果】Bt HD73菌株中有31个基因受Sigma54和CcpA共同调控,其中14个基因的启动子序列包含cre序列,这些启动子都可以与CcpA蛋白发生体外结合。【结论】Bt HD73菌株中有14个基因直接受CcpA的调控,同时其转录受Sigma54的控制。
关键词
苏云金芽胞杆菌
sigma54
CCPA
转录调控
Keywords
Bacillus thuringiensis,
sigma54
, CcpA, transcriptional regulation
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控
被引量：
3
3
作者
王冠男
彭琦
郑庆云
李杰
张杰
宋福平
机构
东北农业大学生命科学学院
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1129-1137,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31270111)~~
文摘
【目的】通过分析苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控和bkdR突变体的表型特征,明确bkdR所在基因簇的转录调控机制和对Cry蛋白产量的影响。【方法】通过生物信息学方法分析bkdR所在基因簇的结构,RT-PCR分析基因簇的转录单元,采用同源重组技术敲除苏云金芽胞杆菌HD73菌株的bkdR基因,利用启动子融合lacZ的方法分析启动子的转录活性。利用总蛋白定量确定Cry1Ac蛋白产量。【结果】bkd基因簇由8个基因组成,其中ptb-bkdB7个基因组成1个转录单元。ptb基因的启动子转录活性在sigL和bkdR突变体中均明显降低。bkdR基因的缺失对菌体生长、芽胞形成率和Cry1Ac蛋白产量无影响,但使运动能力减弱。【结论】bkd操纵子受Sigma 54控制,并由BkdR激活,bkdR基因的缺失对Cry蛋白产量无影响,对菌株的运动能力有影响。
关键词
苏云金芽胞杆菌
增强子结合蛋白(Enhancer
BINDING
Proteins
简称EBPs)
bkdR基因
转录起始因子
sigma54
Keywords
Bacillus thuringiensis,enhancer binding proteins(EBPs),bkdR gene,transcriptioninitiation factor Sigma 54
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Sigma54依赖性转录起始
洪婷
梅子青
王丰
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
2
苏云金芽胞杆菌Sigma54和CcpA共同调控的基因鉴定
程海舰
彭琦
张杰
宋福平
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
原文传递
3
苏云金芽胞杆菌bkd基因簇的转录调控
王冠男
彭琦
郑庆云
李杰
张杰
宋福平
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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