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谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析
被引量:
27
1
作者
刘宝玲
张莉
+6 位作者
孙岩
薛金爱
高昌勇
苑丽霞
王计平
贾小云
李润植
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期473-487,共15页
bZIP蛋白是植物转录因子中最大和最保守的一类转录因子,参与调控植物生长发育等多种生命活动。谷子(Setaria italica)是一种重要的C4杂粮作物,其b ZIP基因家族与功能报道较少。利用生物信息学工具,从谷子全基因组中鉴定出73个Sib ZIP转...
bZIP蛋白是植物转录因子中最大和最保守的一类转录因子,参与调控植物生长发育等多种生命活动。谷子(Setaria italica)是一种重要的C4杂粮作物,其b ZIP基因家族与功能报道较少。利用生物信息学工具,从谷子全基因组中鉴定出73个Sib ZIP转录因子,划分为A、B、C、D、E、G、H、I和X等亚家族。与已测序的禾谷类作物相比,谷子Sib ZIP基因家族在进化中发生缩减。在谷子Sib ZIP蛋白中检测到25种不同的保守氨基酸基序。RNA-seq和定量PCR检测结果表明,在干旱和盐胁迫条件下,多数Sib ZIPs基因不同程度地被诱导表达,预示着部分Sib ZIP成员在谷子干旱和盐胁迫响应中起重要作用。共表达关联性分析进一步揭示19个谷子Sib ZIP转录因子可通过与蛋白激酶或NPR1相关调节蛋白等互作介导谷子胁迫响应。研究结果为全面解析谷子Sib ZIPs基因结构与生物学功能、抗旱分子机制以及分子育种提供了新信息。
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关键词
谷子
sibzip
全基因组鉴定
干旱和盐胁迫
表达分析
原文传递
题名
谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析
被引量:
27
1
作者
刘宝玲
张莉
孙岩
薛金爱
高昌勇
苑丽霞
王计平
贾小云
李润植
机构
山西农业大学分子农业与生物能源研究所
山西农业大学生命科学学院
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期473-487,共15页
基金
国家948项目(No.2014-Z39)
山西省煤基重点科技攻关项目(No.FT-2014-01)
+3 种基金
山西省回国留学人员科研基金(No.2015-064)
国家自然科学基金(No.31401430
No.31201266
No.31501323)
文摘
bZIP蛋白是植物转录因子中最大和最保守的一类转录因子,参与调控植物生长发育等多种生命活动。谷子(Setaria italica)是一种重要的C4杂粮作物,其b ZIP基因家族与功能报道较少。利用生物信息学工具,从谷子全基因组中鉴定出73个Sib ZIP转录因子,划分为A、B、C、D、E、G、H、I和X等亚家族。与已测序的禾谷类作物相比,谷子Sib ZIP基因家族在进化中发生缩减。在谷子Sib ZIP蛋白中检测到25种不同的保守氨基酸基序。RNA-seq和定量PCR检测结果表明,在干旱和盐胁迫条件下,多数Sib ZIPs基因不同程度地被诱导表达,预示着部分Sib ZIP成员在谷子干旱和盐胁迫响应中起重要作用。共表达关联性分析进一步揭示19个谷子Sib ZIP转录因子可通过与蛋白激酶或NPR1相关调节蛋白等互作介导谷子胁迫响应。研究结果为全面解析谷子Sib ZIPs基因结构与生物学功能、抗旱分子机制以及分子育种提供了新信息。
关键词
谷子
sibzip
全基因组鉴定
干旱和盐胁迫
表达分析
Keywords
foxtail millet
Sib ZIP
genome-wide characterization
drought and salt stresses
expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析
刘宝玲
张莉
孙岩
薛金爱
高昌勇
苑丽霞
王计平
贾小云
李润植
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
27
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参考文献
引证文献
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