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题名谷子SiSAP8基因的克隆及dCAPS标记开发
被引量：1
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作者
王亦学
郝曜山
张欢欢
董艳辉
王晓清
孙毅
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机构
山西省农业科学院生物技术研究中心
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第15期4997-5002,共6页
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基金
山西省农业科学院农业科技创新研究课题(YCX2018425)资助。
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文摘
谷子是中国北方重要的耐旱杂粮作物。胁迫相关蛋白是一类具有A20和(或) AN1结构域的锌指蛋白,广泛参与植物对非生物胁迫的响应。本研究从‘晋谷20’中克隆得到谷子SiSAP8基因,该基因编码区513 bp,编码170个氨基酸,分子量为18.20 kD,等电点为8.28,包含1个A20和1个AN1结构域。在对该基因序列进行多态性分析,共发现5个SNP位点和1个InDel,其中编码区有1处核苷酸变异位点(G/T)为非同义突变,使得缬氨酸变成了苯丙氨酸。利用第81位的SNP位点(A/G)开发了dCAPS标记,命名为‘SNP-81’,该标记的开发为后期功能鉴定及关联分析提供了依据。
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关键词
谷子(Setaria
italica)
sisap8
多态性
dCAPS标记开发
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Keywords
Foxtail millet(Setaria italica)
sisap8
Polymorphism
Development of dCAPS marker
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分类号
S515
[农业科学—作物学]
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