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基于小波散射变换和Shuffle-PMDA的永磁同步电机故障识别
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作者 毕贵红 李玉洪 +2 位作者 赵四洪 陈仕龙 张靖超 《电工技术学报》 北大核心 2025年第19期6223-6241,6256,共20页
针对永磁同步电机(PMSM)早期同相匝间短路和绕组间短路故障信号特征微弱、故障程度难以区分,以及基于深度学习的故障诊断模型参数量大、计算成本高、难以挖掘深层次隐藏特征等问题,该文提出一种基于小波散射变换(WST)和轻量化卷积网络Sh... 针对永磁同步电机(PMSM)早期同相匝间短路和绕组间短路故障信号特征微弱、故障程度难以区分,以及基于深度学习的故障诊断模型参数量大、计算成本高、难以挖掘深层次隐藏特征等问题,该文提出一种基于小波散射变换(WST)和轻量化卷积网络Shuffle模块与并行多尺度注意力机制(PMDA)组合的新型故障识别方法。WST能够增强匝间短路和绕组间短路故障信号的微弱特征,并在一定程度上减少数据维度,同时保持各故障程度的可区分性。轻量化卷积网络Shuffle模块与PMDA组合模型能够深入挖掘和学习输入样本的故障信息特征,通过引入多尺度注意力机制对特征进行权重划分,重点关注重要信息,实现特征的重要性区分。实测数据实验表明,所提方法在故障特征最微弱的不同程度绕组间短路故障情况下仍取得了显著的识别效果,为实现高效轻量化、可现场部署的实时故障诊断模型提供了基础。 展开更多
关键词 永磁同步电机 故障识别 小波散射变换 深度学习 shuffle-PMDA模型
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基于Shuffle Attention相似目标检测——以SA-YOLOv7为例
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作者 任昱臻 樊中奎 +1 位作者 冯振营 朱梅 《现代信息科技》 2025年第11期106-113,共8页
YOLOv7在目标检测中取得了优异的效果,但对相似物体的检测仍存在误检率较高的问题,其主要原因是YOLOv7对细粒度特征的提取能力不足。为解决上述问题,该研究提出SA-YOLOv7目标检测网络,即在不改变ELAN(Extend Efficient Layer Aggregatio... YOLOv7在目标检测中取得了优异的效果,但对相似物体的检测仍存在误检率较高的问题,其主要原因是YOLOv7对细粒度特征的提取能力不足。为解决上述问题,该研究提出SA-YOLOv7目标检测网络,即在不改变ELAN(Extend Efficient Layer Aggregation Networks)整体结构的前提下,将注意力模块SA(Shuffle Attention)与之融合,形成SA-ELAN模块,以获取更多通道和空间特征信息,进而提高相似物体的检测精确度。模型在公共的手和手套相似物体数据集上开展了大量对比实验,探究了SA加入YOLOv7网络中的数量及位置对结果的影响,揭示了SA发挥作用的底层原理,深化了对注意力机制的理解。实验结果显示:SA-YOLOv7相较于YOLOv7,检测精度提升了7.7%,mAP@0.5:0.95提高了1.8%,与最新的YOLOv11相比,也具有0.9%的检测精度优势。SA-YOLOv7的研究为相似物体检测技术的发展提供了助力。 展开更多
关键词 深度学习 YOLOv7 shuffle Attention 相似目标检测
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融合多分组归并的券商数据Shuffle和数据倾斜算法
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作者 曹亚坤 唐小勇 《大数据》 2025年第6期123-142,共20页
在证券行业,用户数据处理和分析是核心技术,对业务决策和风险控制具有重要的影响。然而,证券公司庞大的用户数据规模和复杂的数据关系导致大数据计算面临Shuffle操作和数据倾斜问题。现有的Shuffle和数据倾斜优化方法或依赖于硬件升级,... 在证券行业,用户数据处理和分析是核心技术,对业务决策和风险控制具有重要的影响。然而,证券公司庞大的用户数据规模和复杂的数据关系导致大数据计算面临Shuffle操作和数据倾斜问题。现有的Shuffle和数据倾斜优化方法或依赖于硬件升级,或存在领域局限性,难以针对性解决该问题。为此,基于证券行业用户数据的特点,提出了一种基于用户关系的多分组归并算法(multi group merging algorithm,MGMA)。该算法通过有效分组和优化处理策略,显著提升计算效率,并降低计算资源消耗。实验表明,相较于无优化对照组,MGMA算法的数据倾斜率为20%,内存占用为72%,计算用时为61%,且上述3项指标均优于其他4种对比优化方法。 展开更多
关键词 shuffle操作 数据倾斜 预处理 券商数据
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Fast Attack Algorithm for JPEG Image Encryption with Block Position Shuffle
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作者 LI Shanshan GUO Yali +1 位作者 HUANG Jiaxin GAO Ruoyun 《Journal of Shanghai Jiaotong university(Science)》 2025年第5期976-987,共12页
For traditional JPEG image encryption,block position shuffling can achieve a better encryption effect and is resistant to non-zero counting attack.However,the numbers of non-zero coefficients in the 8×8 sub-block... For traditional JPEG image encryption,block position shuffling can achieve a better encryption effect and is resistant to non-zero counting attack.However,the numbers of non-zero coefficients in the 8×8 sub-blocks are unchanged using block position shuffle.For this defect,this paper proposes a fast attack algorithm for JPEG image encryption based on inter-block shuffle and non-zero quantization discrete cosine transformation coefficient attack.The algorithm analyzes the position mapping relationship before and after encryption of image blocks by detecting the pixel values of an image by the designed plaintext image.Then the preliminary attack result of the image blocks can be obtained from the inverse mapping relationship.Finally,the final attack result of the algorithm is generated according to the numbers of non-zero coefficients in each 8×8 block of the preliminary attack result.Every 8×8 block position is related with its number of non-zero discrete cosine transform coefficients in the designed plaintext.It is verified that the main content of the original image could be obtained without knowledge of the encryption algorithm and keys in a relatively short time. 展开更多
关键词 JPEG image inter-block shuffle discrete cosine transform coefficients non-zero coefficients fast attack
原文传递
An Adaptive Cooperated Shuffled Frog-Leaping Algorithm for Parallel Batch Processing Machines Scheduling in Fabric Dyeing Processes
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作者 Lianqiang Wu Deming Lei Yutong Cai 《Computers, Materials & Continua》 2025年第5期1771-1789,共19页
Fabric dyeing is a critical production process in the clothing industry and heavily relies on batch processing machines(BPM).In this study,the parallel BPM scheduling problem with machine eligibility in fabric dyeing ... Fabric dyeing is a critical production process in the clothing industry and heavily relies on batch processing machines(BPM).In this study,the parallel BPM scheduling problem with machine eligibility in fabric dyeing is considered,and an adaptive cooperated shuffled frog-leaping algorithm(ACSFLA)is proposed to minimize makespan and total tardiness simultaneously.ACSFLA determines the search times for each memeplex based on its quality,with more searches in high-quality memeplexes.An adaptive cooperated and diversified search mechanism is applied,dynamically adjusting search strategies for each memeplex based on their dominance relationships and quality.During the cooperated search,ACSFLA uses a segmented and dynamic targeted search approach,while in non-cooperated scenarios,the search focuses on local search around superior solutions to improve efficiency.Furthermore,ACSFLA employs adaptive population division and partial population shuffling strategies.Through these strategies,memeplexes with low evolutionary potential are selected for reconstruction in the next generation,while thosewithhighevolutionarypotential are retained to continue their evolution.Toevaluate the performance of ACSFLA,comparative experiments were conducted using ACSFLA,SFLA,ASFLA,MOABC,and NSGA-CC in 90 instances.The computational results reveal that ACSFLA outperforms the other algorithms in 78 of the 90 test cases,highlighting its advantages in solving the parallel BPM scheduling problem with machine eligibility. 展开更多
关键词 Batch processing machine parallel machine scheduling shuffled frog-leaping algorithm fabric dyeing process machine eligibility
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一种交叠的Shuffled-BP LDPC译码算法 被引量:4
6
作者 范亚楠 王丽冲 +1 位作者 姚秀娟 孟新 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第11期2908-2915,共8页
Shuffled-BP(SBP)译码算法是一种基于变量节点的串行消息传递译码算法,其收敛速度快于原有的置信度传播译码算法,然而由于实际工程实现中的半并行化处理,其收敛速度和误码性能均有所降低。为了进一步提高SBP算法的性能,该文提出一种交叠... Shuffled-BP(SBP)译码算法是一种基于变量节点的串行消息传递译码算法,其收敛速度快于原有的置信度传播译码算法,然而由于实际工程实现中的半并行化处理,其收敛速度和误码性能均有所降低。为了进一步提高SBP算法的性能,该文提出一种交叠的Shuffled-BP(Overlapped Shuffled-BP,OSBP)译码算法。该算法采用若干个相同的子译码器以不同的更新顺序同时进行更新,对于每个变量节点,在每次迭代更新后选取最可靠的信息参与下一次迭代,以此提高迭代的收敛速度。理论分析和仿真实验均表明,在不增加额外存储空间的条件下,OSBP算法相比于SBP算法有着更优的误码性能以及更快的收敛速度。此外,提出的OSBP算法对于规则和不规则LDPC码均有效。 展开更多
关键词 LDPC码 收敛速度 译码算法 shuffled-BP 交叠的shuffled-BP
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PDM-Shuffle:基于被动分离式内存的数据混洗系统设计
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作者 程丽云 吴婧雅 +2 位作者 卢文岩 钟浪辉 鄢贵海 《高技术通讯》 北大核心 2025年第4期370-384,共15页
利用存算分离架构,可以将数据混洗的计算和存储过程解耦,从而提高分布式数据处理应用的可扩展性。然而,将混洗数据传输到远端存储节点的过程增加了额外网络开销,存储节点将成为新的通信瓶颈。为应对引入存算分离架构后数据混洗过程面临... 利用存算分离架构,可以将数据混洗的计算和存储过程解耦,从而提高分布式数据处理应用的可扩展性。然而,将混洗数据传输到远端存储节点的过程增加了额外网络开销,存储节点将成为新的通信瓶颈。为应对引入存算分离架构后数据混洗过程面临的新挑战,本文提出一种基于被动分离式内存的数据混洗(passive disaggregated memoryshuffle,PDM-Shuffle)系统,利用新型一致性总线互连协议计算快速链接(compute express link,CXL)直连共享内存设备存储并交换混洗中间数据,避免了数据的硬盘存储及传输控制协议/网际协议(transmission control protocol/Internet protocol,TCP/IP)的传输过程。鉴于内存设备仅支持被动数据写入,本文采用了内存预分区和元数据控制节点分配内存地址等方法来保证同分区数据的预聚合和共享内存的一致性访问管理。实验结果表明,在处理大规模数据集时,与传统的集中式架构相比,PDM-Shuffle系统可将排序和图计算的综合类应用程序Terasort和PageRank的单个作业完成时间分别减少49%和65%,相对于存算分离架构下已有的优化方案Zeus,分别提升了36%和18%。 展开更多
关键词 数据混洗 存算分离 分离式内存系统 计算快速链接 内存一致性 预聚合
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应用DNA shuffling及T7噬菌体展示技术定向进化并筛选鉴定sCD74突变体 被引量:2
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作者 臧家涛 李淑慧 +2 位作者 李鹏 陈安 胡川闽 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期694-697,共4页
目的利用DNA shuffling技术,结合T7噬菌体表面展示技术,定向进化MIF受体sCD74,以获得高亲和力突变体基因。方法定点突变的牛、小鼠、人CD74胞外同源区基因以DNaseⅠ消化,回收25—50bp片段进行DNA shuffling;将500bp shuffling产物... 目的利用DNA shuffling技术,结合T7噬菌体表面展示技术,定向进化MIF受体sCD74,以获得高亲和力突变体基因。方法定点突变的牛、小鼠、人CD74胞外同源区基因以DNaseⅠ消化,回收25—50bp片段进行DNA shuffling;将500bp shuffling产物经限制性酶切后与T7噬菌体DNA连接,与T7 package extracts组建噬菌体文库;采用竞争淘洗方法进行5轮筛选,富集得到高亲和力结合MIF的噬菌体;挑取20株噬菌体单克隆进行基因克隆并测序,对测序结果进行生物信息学分析,同时以竞争ELISA初步鉴定进化效果。结果20株噬菌体单克隆具有相同的sCD74突变基因,为相同克隆,将此克隆命名为sHCD74m,其基因命名为sHCD74mD;竞争性ELISA分析显示其MIF结合力提高。结论得到了与MIF高亲和力结合的sCD74突变体基因sHCD74mD。 展开更多
关键词 DNA shufflING 巨噬细胞移动抑制因子 CD74 噬菌体展示技术 MHC Ⅱ恒定链
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DNA shuffling技术及其在基因工程疫苗中的应用 被引量:2
9
作者 张毅 王红宁 +2 位作者 黄勇 徐永莉 余协中 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第3期85-88,共4页
DNA shuffling技术是一项全新的体外人工进化模式,它通过基因在分子水平上的重组,再定向筛选具有预期性状的突变体,获得同时具有多个亲本基因的特征的突变基因。该文介绍DNA shuffling技术的基本原理,并列举了由该技术发展而来的新技术... DNA shuffling技术是一项全新的体外人工进化模式,它通过基因在分子水平上的重组,再定向筛选具有预期性状的突变体,获得同时具有多个亲本基因的特征的突变基因。该文介绍DNA shuffling技术的基本原理,并列举了由该技术发展而来的新技术及其在基因工程疫苗领域的应用,展望了DNAshuffling技术的发展方向。 展开更多
关键词 DNA shufflING 基因工程疫苗 定向进化
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Genome shuffling育种技术应用研究进展 被引量:4
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作者 孟国庆 陆震 +1 位作者 赵林 刘新利 《山东轻工业学院学报(自然科学版)》 CAS 2010年第2期6-11,共6页
本文综述了一种高效育种技术Genome shuffling(基因组重组)技术及其在细菌、真菌及放线菌的菌种选育方面的应用研究进展。与传统育种技术相比,Genome shuffling技术是一种全基因组重排的高效定向育种技术。菌株经过多轮递归原生质体融合... 本文综述了一种高效育种技术Genome shuffling(基因组重组)技术及其在细菌、真菌及放线菌的菌种选育方面的应用研究进展。与传统育种技术相比,Genome shuffling技术是一种全基因组重排的高效定向育种技术。菌株经过多轮递归原生质体融合,使正向突变的不同基因重组到同一个融合子中,大幅提高菌种的正突变性,打破在菌种改良过程中的诸多局限性,在现代菌种选育中得以广泛应用。 展开更多
关键词 GENOME shuffling技术 菌种选育 原生质体融合 高通量筛选
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一种Spark集群下的shuffle优化机制 被引量:3
11
作者 熊安萍 夏玉冲 杨方方 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2018年第4期72-76,共5页
Spark是基于内存的分布式数据处理框架,其shuffle过程中大量数据需要通过网络传输,已成为Spark最主要的瓶颈之一。针对shuffle过程中存在的数据分布不均造成不同节点网络I/O负载不均的问题,设计了基于task本地性等级的重启策略,进一步... Spark是基于内存的分布式数据处理框架,其shuffle过程中大量数据需要通过网络传输,已成为Spark最主要的瓶颈之一。针对shuffle过程中存在的数据分布不均造成不同节点网络I/O负载不均的问题,设计了基于task本地性等级的重启策略,进一步提出了均衡的调度策略来平衡各节点的网络I/O负载。最后通过实验验证了优化机制能够减少计算任务的执行时间,提升整个shuffle过程的执行效率。 展开更多
关键词 Spark集群 shuffle过程 数据传输 本地性 调度策略
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引入易错PCR和DNA-shuffling技术构建单链抗体库 被引量:1
12
作者 杨浩 杨青平 +1 位作者 查成喜 韩跃武 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2012年第1期56-60,共5页
目的引入易错PCR和DNA-shuffling技术构建高库容量的单链抗体库。方法收集不同年龄、性别、健康状态的人的静脉血各5 mL,提取单个核细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增VH和VL基因,应用易错PCR对VH和VL基因进行突变,同时用DNA-shuffling技... 目的引入易错PCR和DNA-shuffling技术构建高库容量的单链抗体库。方法收集不同年龄、性别、健康状态的人的静脉血各5 mL,提取单个核细胞总RNA,反转录为cDNA,PCR扩增VH和VL基因,应用易错PCR对VH和VL基因进行突变,同时用DNA-shuffling技术对全长单链抗体基因进行体外改组,获得的分子与T载体连接,转化E.coli DH5α,选取阳性克隆,经菌落PCR后酶切鉴定抗体库多样性,计算分析单链抗体库容量。结果成功构建了库容量为4.37×1013的单链抗体库,经酶切鉴定,初步判定抗体库多样性良好。结论引入易错PCR和DNA-shuf-fling技术,成功构建了单链抗体库,为后续筛选高亲和力抗体奠定了实验基础。 展开更多
关键词 易错PCR DNA-shuffling 单链抗体库
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Genome shuffling技术在微生物育种中的应用 被引量:1
13
作者 杜云平 周庆丰 +3 位作者 余国莲 李小军 梁健良 刘建忠 《现代农业科学》 2008年第11期24-24,27,共2页
介绍了Genome shuffling技术的特点及作用,提出了在微生物育种中的广泛应用,推动了经典诱变方法的发展。
关键词 GENOME shuffling技术 微生物 育种
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利用DNA shuffling技术鉴定草甘膦N-乙酰转移酶抗性相关位点
14
作者 金丹 陈明 +2 位作者 马瑞强 杨志荣 陈建 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2007年第5期110-114,共5页
为研究高抗草甘膦N-乙酰转移酶(glyphosate N-acetyltransferase,GAT)的草甘膦抗性相关位点,以高抗草甘膦的gat1基因和不具草甘膦抗性的gat2基因为出发基因,通过一轮双基因DNA shuffling,获得了抗性较野生型gat1下降的突变体14个:10个... 为研究高抗草甘膦N-乙酰转移酶(glyphosate N-acetyltransferase,GAT)的草甘膦抗性相关位点,以高抗草甘膦的gat1基因和不具草甘膦抗性的gat2基因为出发基因,通过一轮双基因DNA shuffling,获得了抗性较野生型gat1下降的突变体14个:10个单位点突变,3个双位点突变,1个3位点突变。其中,MTGAT3(H41Q)、MTGAT5(S52P)、MTGAT6(I53M)、MTGAT7(F56L)、MTGAT8(R82G)、MTGAT11(I19T/P22L)和MTGAT14(Y70H/L98P/K119E)7个突变体的草甘膦抗性几乎丧失。本工作为深入研究GAT1蛋白分子结构与功能之间的关系奠定了基础。 展开更多
关键词 草甘膦 草甘膦N-乙酰转移酶 DNA shufflING 点突变
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融合Shufflenet-V2的Yolov5轻量化目标检测方法 被引量:3
15
作者 夏长权 汪李超 +3 位作者 韩一帆 徐思韵 时壮壮 陆文峰 《信息技术与信息化》 2023年第3期100-104,共5页
选取目标检测领域中常见的城市道路车辆作为识别目标,针对如今日益增长的目标检测网络模型计算量与移动端设备匮乏的计算资源相冲突的问题,提出了一种将Shuffl enet-V2轻量级神经网络模型融合进Yolov5目标检测框架中的方法,修改网络头... 选取目标检测领域中常见的城市道路车辆作为识别目标,针对如今日益增长的目标检测网络模型计算量与移动端设备匮乏的计算资源相冲突的问题,提出了一种将Shuffl enet-V2轻量级神经网络模型融合进Yolov5目标检测框架中的方法,修改网络头部卷积层,加入注意力机制SE-Layer层,并将激活函数修改为H-Swish函数。实验选取UA-DETRAC公开数据集,结果表明,模型大小达到了1.53 M,在同等平均准确率的模型中达到最低,为目标检测模型在计算资源有限的移动端设备中的应用与部署提供了有效的参考。 展开更多
关键词 目标检测 shuffl eNet-V2 轻量级神经网络 Yolov5 H-Swish函数
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Genome shuffling筛选ε-聚赖氨酸高产菌及其对代谢流量分配的影响 被引量:8
16
作者 李双 颜鹏 +3 位作者 曾晨 张宏建 毛忠贵 唐蕾 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2568-2577,共10页
【目的】从代谢流量分配的角度,探讨Genome shuffling导致链霉菌ε-聚赖氨酸合成量提升的原因。【方法】从葡萄糖耐受型的亲本菌株Streptomyces sp.AS32和ε-聚赖氨酸耐受型的亲本菌株Streptomyces albulus F15出发,进行三轮Genome shuf... 【目的】从代谢流量分配的角度,探讨Genome shuffling导致链霉菌ε-聚赖氨酸合成量提升的原因。【方法】从葡萄糖耐受型的亲本菌株Streptomyces sp.AS32和ε-聚赖氨酸耐受型的亲本菌株Streptomyces albulus F15出发,进行三轮Genome shuffling,筛选得到ε-聚赖氨酸产量提高的链霉菌株Streptomyces sp.AF3-44,采用通量分析方法构建链霉菌ε-聚赖氨酸合成代谢网络,并对上述3株菌的代谢通量进行比较。【结果】AF3-44的ε-聚赖氨酸摇瓶产量为3.1 g/L,较AS32和F15分别提高了34%和29%。3株菌株中AS32三羧酸循环(TCA)的代谢通量最高;F15磷酸戊糖途径(PPP)代谢通量最高;AF3-44流向赖氨酸合成前体天冬氨酸以及ε-聚赖氨酸的通量最高,TCA和PPP通量位于两亲本菌株的中间水平,其中TCA中流向异柠檬酸的通量分别为AS32和F15的77%和116%,PPP中流向5-磷酸核酮糖的通量分别为AS32和F15的149%和92%。【结论】Genome shuffling导致了代谢流的重新分布,流向前体赖氨酸和ε-聚赖氨酸通量的增加,以及PPP和TCA通量配比的改变是链霉菌ε-聚赖氨酸合成量增加的重要因素。 展开更多
关键词 GENOME shufflING 代谢通量 代谢网络 Ε-聚赖氨酸
原文传递
MapReduce中shuffle优化与重构 被引量:8
17
作者 彭辅权 金苍宏 +1 位作者 吴明晖 应晶 《中国科技论文》 CAS 北大核心 2012年第4期241-245,共5页
详细介绍了MapReduce编程框架,具体分析了MapReduce中shuffle阶段流程。分别从Map端数据压缩、重构远程数据拷贝传输协议、Reduce端内存分配优化三方面来优化和重构Shuffle。最后通过搭建Hadoop集群,运用MapReduce分布式算法测试实验数... 详细介绍了MapReduce编程框架,具体分析了MapReduce中shuffle阶段流程。分别从Map端数据压缩、重构远程数据拷贝传输协议、Reduce端内存分配优化三方面来优化和重构Shuffle。最后通过搭建Hadoop集群,运用MapReduce分布式算法测试实验数据。实验结果证明优化重构后的shuffle能显著提高MapReduce计算性能。 展开更多
关键词 云计算 HADOOP MAPREDUCE shufflE
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MapReduce Shuffle性能改进 被引量:5
18
作者 熊倩 张 +1 位作者 郭明 徐婕 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2017年第A01期58-62,67,共6页
针对Reduce端从Map端拷贝大量结果数据耗时长的问题,提出一种新方案即对Map节点上同一个作业的多个Map任务所产生的大量临时结果数据进行合并,以取代原有Map Reduce架构对单个Map任务的结果数据作合并的机制。该方案减少了Map节点的输... 针对Reduce端从Map端拷贝大量结果数据耗时长的问题,提出一种新方案即对Map节点上同一个作业的多个Map任务所产生的大量临时结果数据进行合并,以取代原有Map Reduce架构对单个Map任务的结果数据作合并的机制。该方案减少了Map节点的输出结果数据量,能减少整个集群的网络传输数据量,节省Reduce端拷贝Map端输出数据的时间,从而减少了Map Reduce作业执行时间,提升了Map Reduce的执行性能。 展开更多
关键词 HADOOP MAPREDUCE shufflE 性能
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分段DNA shuffling:一种大分子海藻糖合酶有效的定向进化方法 被引量:2
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作者 刘艳超 王宇凡 +4 位作者 钱柯帆 张峻 肖辰鹏 邢来君 李明春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期362-372,共11页
【目的】红色亚栖热菌(Meiothermus ruber)海藻糖合酶(Trehalose synthase,M-TreS)将麦芽糖转化生成海藻糖只需一步反应,且具有很好的热稳定性及pH耐受性,是潜在的工业生产海藻糖的酶源。为了提高该酶的性能,有必要对其进行定向进化。... 【目的】红色亚栖热菌(Meiothermus ruber)海藻糖合酶(Trehalose synthase,M-TreS)将麦芽糖转化生成海藻糖只需一步反应,且具有很好的热稳定性及pH耐受性,是潜在的工业生产海藻糖的酶源。为了提高该酶的性能,有必要对其进行定向进化。【方法】M-TreS基因(M-treS)大小为2 889 bp。该蛋白质分子本身具有很大的进化空间,但是却不宜进行全长基因Shuffling。分段DNA shuffling是为大分子蛋白质(基因≥2 000 bp)的进化而设计的一种方法。该方法分为三步:(1)用两对引物分别扩增目的基因的上游片段和下游片段;(2)上下游片段各自进行Shuffling;(3)利用重叠延伸PCR连接上下游突变群,建立完整基因的突变文库。【结果】结合易错PCR,通过该方法经一轮进化获得一株酶活力是野生型1.6倍、催化效率是野生型2倍的突变株。序列分析表明,该突变株共有6个位点发生了氨基酸的替代,其中一个来自易错突变,2个来自同源重组,3个为随机突变。【结论】分段DNA shuffling是进化大分子蛋白质的有效方法。 展开更多
关键词 红色亚栖热菌 海藻糖合酶 定向进化 易错PCR 分段DNA shufflING
原文传递
GENOME SHUFFLING技术优化及其应用进展
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作者 付婕琴 胡昌华 《广西轻工业》 2010年第4期10-11,共2页
Genomeshuffling作为一种新型的育种方法,与传统方法相比更加高效快捷,近年来不断被应用于制药、食品制品、环境工程等众多领域的菌种改良中。对genome shuffling近年来技术的优化及其应用进展进行综述。
关键词 GENOME shufflING 基因组重排 菌种改良
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