目的:运用网络药理学的研究方法分析山慈菇–夏枯草治疗乳腺增生的潜在作用靶点和机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选山慈菇–夏枯草的有效活性成分及其对应的作用靶点,利用人类基因卡片数据库(GeneCards)、人...目的:运用网络药理学的研究方法分析山慈菇–夏枯草治疗乳腺增生的潜在作用靶点和机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选山慈菇–夏枯草的有效活性成分及其对应的作用靶点,利用人类基因卡片数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传在线数据库(OMIM)检索获得乳腺增生疾病靶点。将药物作用靶点和疾病靶点取交集,并绘制韦恩图。分别运用Cytoscape 3.9.2软件和STRING数据库构建“药物有效成分–作用靶点”网络图和蛋白质–蛋白质相互作用网络图。应用R软件对交集基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用AutoDock 1.5.6软件进行分子对接,PyMOL 3.0.3软件进行可视化分析。结果:共获得中药有效成分13种、有效活性成分靶点193个、疾病靶点5088个,药物–疾病共同靶点162个。通过蛋白质–蛋白质相互作用网络分析获得44个核心靶点。主要有效成分为槲皮素、β–谷甾醇、豆甾醇、木犀草素、2–甲氧基–9,10–二氢菲–4,5–二醇等,作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Protein Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)–6、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等核心靶点,通过调控等晚期糖基化终末产物(Advanced Glycosylation End Product,AGE)–AGE受体(Receptor of AGE,RAGE)信号通路、TNF信号通路、IL–17信号通路等提高细胞应对氧化应激能力、调节激素水平、抑制血管生成、抗炎性反应等治疗乳腺增生。分子对接显示,主要有效成分与疾病靶点具有较好的结合能力。结论:山慈菇–夏枯草通过多成分、多靶点、多通路治疗乳腺增生,本研究为临床治疗和实验探索提供了理论依据和参考。展开更多
文摘目的:运用网络药理学的研究方法分析山慈菇–夏枯草治疗乳腺增生的潜在作用靶点和机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选山慈菇–夏枯草的有效活性成分及其对应的作用靶点,利用人类基因卡片数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传在线数据库(OMIM)检索获得乳腺增生疾病靶点。将药物作用靶点和疾病靶点取交集,并绘制韦恩图。分别运用Cytoscape 3.9.2软件和STRING数据库构建“药物有效成分–作用靶点”网络图和蛋白质–蛋白质相互作用网络图。应用R软件对交集基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用AutoDock 1.5.6软件进行分子对接,PyMOL 3.0.3软件进行可视化分析。结果:共获得中药有效成分13种、有效活性成分靶点193个、疾病靶点5088个,药物–疾病共同靶点162个。通过蛋白质–蛋白质相互作用网络分析获得44个核心靶点。主要有效成分为槲皮素、β–谷甾醇、豆甾醇、木犀草素、2–甲氧基–9,10–二氢菲–4,5–二醇等,作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Protein Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)–6、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等核心靶点,通过调控等晚期糖基化终末产物(Advanced Glycosylation End Product,AGE)–AGE受体(Receptor of AGE,RAGE)信号通路、TNF信号通路、IL–17信号通路等提高细胞应对氧化应激能力、调节激素水平、抑制血管生成、抗炎性反应等治疗乳腺增生。分子对接显示,主要有效成分与疾病靶点具有较好的结合能力。结论:山慈菇–夏枯草通过多成分、多靶点、多通路治疗乳腺增生,本研究为临床治疗和实验探索提供了理论依据和参考。
