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题名谷子RAB家族基因功能挖掘
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作者
林伟
祁东梅
周雪峰
史慎奎
姚华萌
王春芳
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机构
河北民族师范学院生物与食品科学学院
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出处
《贵州师范学院学报》
2025年第6期52-59,共8页
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基金
承德市基础研究项目“谷子NF-Y基因调控抗旱节水机制研究”(202305B093)
河北民族师范学院博士科研启动基金项目“谷子RAB基因家族抗逆功能研究”(DR2024017)
河北民族师范学院团队培育基金项目“冀北地区优质动植物资源开发与利用”(TD2024005)。
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文摘
RAB蛋白家族是重要的一类参与囊泡运输过程的小G蛋白,在调节植物生长发育以及适应生物与非生物胁迫中发挥作用。为了全面解析谷子RAB基因家族的信息并探究SiRAB的功能,根据系统进化关系将43个SiRAB基因划分为7个亚家族。利用谷子的基因组数据对家族成员的理化性质进行分析,结果显示这些基因分布在8条染色体上,内含子数量在0~9个不等,编码的氨基酸在164~336个。启动子顺式作用元件分析结果表明,该家族有24个基因含有干旱胁迫响应元件。亚细胞定位的结果显示,该基因家族蛋白主要集中在质膜或细胞质中,少量蛋白则定位于液泡。基于谷子的转录组数据,在干旱处理后,根部组织中RABE1F和RABG1A表达量显著升高。这些结果表明RAB家族基因可能与响应干旱胁迫相关。
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关键词
谷子
干旱胁迫
RAB
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Keywords
setaria itlica
Drought stress
RAB
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分类号
S515
[农业科学—作物学]
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题名油葵—饲用谷子复种栽培技术规程的编制
被引量：1
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作者
刘环
侯升林
周新建
魏志敏
袁淑红
周汉章
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机构
河北省深泽县农业局
河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心河北省杂粮研究实验室
河北省石家庄市农业局
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出处
《畜牧与饲料科学》
2016年第6期34-39,共6页
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基金
农业部公益性行业科研专项"牧区饲草饲料资源开发利用技术研究与示范"(20120304201)
河北省地方标准制修订项目"青刈饲用谷子
高粱高产栽培技术规程"(NY201550)
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文摘
根据多年的试验总结,研究油葵—饲用谷子复种栽培的要求,以及油葵栽培、饲用谷子栽培等技术要求,明确了该技术规程的具体措施与技术指标,旨在提供油葵—饲用谷子复种栽培规范化、标准化、产业化、市场化的技术支撑。
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关键词
油葵
饲用谷子
复种
栽培技术
规程
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Keywords
Helianthus annuus
setaria itlica
multiple cropping
cultivation technique
regulation
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分类号
S515.01
[农业科学—作物学]
S565.5
[农业科学—作物学]
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题名谷子AP基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
被引量：5
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作者
邢媛
宋健
李俊怡
郑婷婷
刘思辰
乔治军
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机构
山西农业大学农学院
山西农业大学农业基因资源研究中心农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室
山西农业大学农业经济作物研究所
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期238-251,共14页
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基金
山西省重点研发计划项目(201903D221087)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-14.5-A16)
+2 种基金
中央引导地方科技发展资金项目(YDZJSX20231A040)
山西农业大学校科技创新提升工程(CXGC2023094)
山西省吕梁市科技局农业攻关(2022NYGG012)。
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文摘
天冬氨酸蛋白酶(AP)是一类重要的水解酶,在植物生长发育及抵御生物和非生物胁迫方面发挥着重要作用。谷子(Setaria italica)作为禾本科C4植物抗逆研究的模式作物,目前关于天冬氨酸蛋白酶家族基因功能的研究较少。为深入探究AP基因家族在谷子中的功能作用,本研究基于AP保守Pfam序列全基因组筛选鉴定谷子AP基因家族的成员,并通过生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、基因结构、保守结构域、系统进化发育、启动子顺式作用元件及共线性等分析,同时利用荧光定量PCR技术对其在非生物胁迫下的表达模式进行了研究。结果表明,谷子基因组中共有AP基因家族成员58个;系统进化树显示该基因家族可分为5个亚家族,其中Group B编码非典型天冬氨酸蛋白酶,其他亚家族编码类nucellin天冬氨酸蛋白酶;基因结构和保守基序分析表明,谷子AP家族同一亚家族成员具有较高的保守性;共线性分析结果显示,谷子AP基因家族与水稻(Oryza sativa)和玉米(Zea mays)AP基因家族成员之间存在大量的同源基因对;启动子顺式作用元件分析表明,SiAPs基因家族中大部分成员含有与非生物胁迫和生物激素响应相关的顺式元件,如响应干旱和低温胁迫的顺式作用元件、水杨酸有关的应答元件等。进一步RT-q PCR结果发现,SiAPs基因家族成员在谷子根、茎、叶、穗中差异表达;在低温胁迫下,SiAP3、SiAP9、SiAP48基因表达量显著升高;在干旱胁迫和水杨酸处理下,部分基因表达的变化趋势基本一致。SiAPs对谷子响应非生物胁迫起重要的调控作用,本研究结果可为SiAPs的抗逆功能分析提供参考。
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关键词
谷子
天冬氨酸蛋白酶
水杨酸响应
干旱响应
低温胁迫
生物信息学
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Keywords
foxtail millet(setaria itlica)
aspartate protease
salicylic acid response
drought response
low-temperature stress
bioinformatics
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分类号
S515
[农业科学—作物学]
Q943.2
[生物学—植物学]
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